; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS020307 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS020307
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUbiquitin-specific protease family C19-related protein
Genome locationscaffold665:903201..903344
RNA-Seq ExpressionMS020307
SyntenyMS020307
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581765.1 putative membrane protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-0772.92Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GGS +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
XP_022956311.1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like [Cucurbita moschata]1.5e-0772.92Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GGS +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
XP_022980606.1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like [Cucurbita maxima]1.5e-0772.92Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GGS +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
XP_023526996.1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-0772.92Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GGS +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
XP_038894482.1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like [Benincasa hispida]1.5e-0772.92Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GGS +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D4X9 uncharacterized membrane protein At1g16860-like1.6e-0770.83Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIP+DG KSKK GPI GGS +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
A0A6J1GA20 uncharacterized membrane protein At1g16860-like isoform X21.6e-0770.83Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GG+ +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
A0A6J1GAR9 uncharacterized membrane protein At1g16860-like isoform X11.6e-0770.83Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GG+ +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
A0A6J1GVZ4 uncharacterized membrane protein At1g16860-like7.1e-0872.92Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GGS +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
A0A6J1IU17 uncharacterized membrane protein At1g16860-like7.1e-0872.92Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
        IKKS E GKMFDIPVDG KSKK GPI GGS +SGSFGG VAS+ G ++
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FZ45 Uncharacterized membrane protein At1g168601.7e-0660Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYG
        IK+S E GKMFDIP DG KS+K GPI G   +SGSF G   S  G
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYG
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16860.1 Ubiquitin-specific protease family C19-related protein1.2e-0760Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYG
        IK+S E GKMFDIP DG KS+K GPI G   +SGSF G   S  G
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYG
AT1G78880.1 Ubiquitin-specific protease family C19-related protein4.1e-0862.22Show/hide
Query:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYG
        IKKS E GKMFDIP DG KS+K GPI GGS +SG+  G V +  G
Subjt:  IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYG

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATCAAGAAATCAGTAGAGCAGGGGAAGATGTTCGATATTCCTGTGGATGGTTTCAAGTCCAAGAAGTTGGGACCTATAATTGGTGGCTCCTTTAAGTCTGGATCTTTCGG
AGGTCATGTTGCATCTAATTATGGACTACTCTTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCAAGAAATCAGTAGAGCAGGGGAAGATGTTCGATATTCCTGTGGATGGTTTCAAGTCCAAGAAGTTGGGACCTATAATTGGTGGCTCCTTTAAGTCTGGATCTTTCGG
AGGTCATGTTGCATCTAATTATGGACTACTCTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
IKKSVEQGKMFDIPVDGFKSKKLGPIIGGSFKSGSFGGHVASNYGLLL