; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS020313 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS020313
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationscaffold665:932833..937136
RNA-Seq ExpressionMS020313
SyntenyMS020313
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057418.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.1e-15190.45Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA+LTAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE VIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL

Query:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK
        LTTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK
Subjt:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK

Query:  ELENFTKSLKSALS
         LENFTKSLKSALS
Subjt:  ELENFTKSLKSALS

XP_004145375.1 tryptophan synthase alpha chain isoform X1 [Cucumis sativus]1.7e-15291.03Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDI  NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA+LTAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TIKDAGVRGLV+PDVPLEETEILRKEAVKH IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LENFTKSL SAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

XP_008449352.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]1.3e-15290.73Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA+LTAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_022145935.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Momordica charantia]1.1e-16799.04Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAA+TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ENFMMTIKDAGV+GLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_038888258.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Benincasa hispida]2.3e-15492.01Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDI+FNSSRLLRFNKIPTT LIFP H CKISVFQTKRF PMAALTAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST+GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLA GTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFMM IKDAGVRGLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGAR SV+++VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTK+LKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKV4 Tryptophan synthase8.1e-15391.03Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDI  NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA+LTAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TIKDAGVRGLV+PDVPLEETEILRKEAVKH IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSAL
        LENFTKSL SAL
Subjt:  LENFTKSLKSAL

A0A1S3BMG6 Tryptophan synthase6.2e-15390.73Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA+LTAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A5A7UQL8 Tryptophan synthase1.5e-15190.45Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA+LTAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE VIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL

Query:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK
        LTTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK
Subjt:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK

Query:  ELENFTKSLKSALS
         LENFTKSLKSALS
Subjt:  ELENFTKSLKSALS

A0A5D3E1Z9 Tryptophan synthase6.2e-15390.73Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MD   NSSRL +FNKIPTT LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA+LTAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLST GSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A6J1CVV7 Tryptophan synthase5.2e-16899.04Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
        MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAA+TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRG+ENFMMTIKDAGV+GLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain3.0e-8057.85Show/hide
Query:  LSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+ F  L+++ + A IP+ITAGDPDL TTA+AL++L   G+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L RG     ++ ++KEV PE+  PI LF+YYN
Subjt:  LSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVT
        PI  RGVE F+  +K AGV+GLV+PD+PLEE E L K A +  I + LL  PT+P +R++AI   S+GFIYLVS  GVTG R+ V++RV+ LL  ++  T
Subjt:  PILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        +KP+ VGFGISKPEH  QV  WGAD VIVGSA+VK L E  +PEEGLK +  F + LK AL
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL

O22765 Tryptophan synthase alpha chain1.6e-11881.34Show/hide
Query:  TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF +LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLL
        ALF+YYNPIL+RGVEN+M  IK+AGV GL++PDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGFIYLVSSVGVTG R SV+ +VQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGVIVGSA+VK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic3.7e-8658.67Show/hide
Query:  AALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELS
        AA    R+  +S+T   L  +GK AFIPYITAGDPDL+TTAEAL++L   G+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA GT   A++ ML+EV PELS
Subjt:  AALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELS

Query:  CPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQ
        CP+ L SYY PI+ R     +  +K+AGV GL++PD+P      L  EA  +++ELVLLTTP  P+DRMK I +ASEGF+YLVS  GVTG RA+V+ RV+
Subjt:  CPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQ

Query:  TLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        +L++E+K+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADGVI+GSA+V+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  TLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL

Q10W95 Tryptophan synthase alpha chain7.9e-8158.11Show/hide
Query:  VGLSETFNKLK-EQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFS
        + +S+ F  L+    + A IP+ITAGDPDL TTA+AL+VL   G+++IELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGT   +++ +++ V P+L  PI LF+
Subjt:  VGLSETFNKLK-EQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFS

Query:  YYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIK
        YYNPIL RGVENF+  I D G RGLV+PD+PLEE +IL + A    IEL LL  PT+PK+R+KAI   S+GFIYLVS  GVTG RA +  RV+ LL +++
Subjt:  YYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIK

Query:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSALS
        EVT+KP+ VGFGIS+PE   QV  WG+D VIVGSA+VK L E  SP+EGLK +  F ++LK+A++
Subjt:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSALS

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic2.3e-12072.2Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAL-TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELG
        M IAF S   + F + P + + F   +   S    KRF PMA+L T+S  +GL++TF +LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELG
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAL-TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELG

Query:  VPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL
        VPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I+ ML +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+  FM +I+  GV+GLV+PDVPLEETE+LRKEA+ +DIELVL
Subjt:  VPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL

Query:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK
        LTTPTTP +RMK IV+ASEGFIYLVSS+GVTGAR+SVS +VQ+LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+AGWGADGVIVGSA+VKLLG+AKSP EGLK
Subjt:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK

Query:  ELENFTKSLKSAL
        ELE  TKSLKSAL
Subjt:  ELENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain1.6e-12172.2Show/hide
Query:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAL-TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELG
        M IAF S   + F + P + + F   +   S    KRF PMA+L T+S  +GL++TF +LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELG
Subjt:  MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAAL-TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELG

Query:  VPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL
        VPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I+ ML +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+  FM +I+  GV+GLV+PDVPLEETE+LRKEA+ +DIELVL
Subjt:  VPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVL

Query:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK
        LTTPTTP +RMK IV+ASEGFIYLVSS+GVTGAR+SVS +VQ+LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ+AGWGADGVIVGSA+VKLLG+AKSP EGLK
Subjt:  LTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLK

Query:  ELENFTKSLKSAL
        ELE  TKSLKSAL
Subjt:  ELENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein1.2e-11981.34Show/hide
Query:  TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF +LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLL
        ALF+YYNPIL+RGVEN+M  IK+AGV GL++PDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGFIYLVSSVGVTG R SV+ +VQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFIYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGVIVGSA+VK+LGE++SPE+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGAGGTTACTTCGCTTCAACAAAATACCCACTACTCCGCTCATCTTTCCCCCTCATACTTGTAAGATTTCAGTATTCCAAACCAAGCG
GTTCGCTCCAATGGCTGCCCTTACAGCCTCCCGTGCTGTTGGACTGTCCGAAACATTTAACAAGTTGAAGGAACAAGGCAAGGTTGCATTCATCCCCTACATCACTGCTG
GTGATCCTGATCTTTCTACCACGGCTGAAGCGTTGAAGGTTCTTTCCACTTATGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCGTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGCCCT
GTTATACAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAGGGGGACAAACTTTAGTGCAATAATTTCTATGCTGAAGGAGGTGATTCCTGAACTATCTTGCCCAATTGCCCTTTT
TTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCGTTGAGAACTTCATGATGACAATTAAAGATGCTGGTGTACGGGGGCTTGTTATTCCGGATGTTCCTCTTGAGGAGACTG
AAATTTTGAGAAAGGAAGCTGTGAAGCACGATATTGAATTGGTACTGTTAACTACACCGACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGCCATTGTGGAAGCTTCGGAGGGATTC
ATATATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTCACCGGTGCCCGTGCATCAGTGAGTAATAGGGTTCAAACTCTCCTAGAGGAAATTAAAGAGGTAACAGAAAAACCAGTAGCAGT
AGGTTTCGGTATCTCGAAACCTGAGCACGTGAAACAGGTGGCTGGCTGGGGGGCAGATGGTGTCATCGTTGGCAGTGCTATAGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCAAGTCTC
CTGAAGAAGGATTGAAGGAATTAGAAAACTTCACCAAATCCCTAAAATCTGCACTCTCA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACATTGCTTTCAATTCTTCGAGGTTACTTCGCTTCAACAAAATACCCACTACTCCGCTCATCTTTCCCCCTCATACTTGTAAGATTTCAGTATTCCAAACCAAGCG
GTTCGCTCCAATGGCTGCCCTTACAGCCTCCCGTGCTGTTGGACTGTCCGAAACATTTAACAAGTTGAAGGAACAAGGCAAGGTTGCATTCATCCCCTACATCACTGCTG
GTGATCCTGATCTTTCTACCACGGCTGAAGCGTTGAAGGTTCTTTCCACTTATGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCGTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGCCCT
GTTATACAGGCTGCAGCTACTCGGTCCTTGGCTAGGGGGACAAACTTTAGTGCAATAATTTCTATGCTGAAGGAGGTGATTCCTGAACTATCTTGCCCAATTGCCCTTTT
TTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCGTTGAGAACTTCATGATGACAATTAAAGATGCTGGTGTACGGGGGCTTGTTATTCCGGATGTTCCTCTTGAGGAGACTG
AAATTTTGAGAAAGGAAGCTGTGAAGCACGATATTGAATTGGTACTGTTAACTACACCGACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGCCATTGTGGAAGCTTCGGAGGGATTC
ATATATCTTGTGAGCTCCGTTGGAGTCACCGGTGCCCGTGCATCAGTGAGTAATAGGGTTCAAACTCTCCTAGAGGAAATTAAAGAGGTAACAGAAAAACCAGTAGCAGT
AGGTTTCGGTATCTCGAAACCTGAGCACGTGAAACAGGTGGCTGGCTGGGGGGCAGATGGTGTCATCGTTGGCAGTGCTATAGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCAAGTCTC
CTGAAGAAGGATTGAAGGAATTAGAAAACTTCACCAAATCCCTAAAATCTGCACTCTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIAFNSSRLLRFNKIPTTPLIFPPHTCKISVFQTKRFAPMAALTASRAVGLSETFNKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSTYGSDIIELGVPYSDPLADGP
VIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGVENFMMTIKDAGVRGLVIPDVPLEETEILRKEAVKHDIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGF
IYLVSSVGVTGARASVSNRVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGVIVGSAIVKLLGEAKSPEEGLKELENFTKSLKSALS