; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS020727 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS020727
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionCytochrome b
Genome locationscaffold178:237282..237356
RNA-Seq ExpressionMS020727
SyntenyMS020727
Gene Ontology termsGO:0022904 - respiratory electron transport chain (biological process)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR016174 - Di-haem cytochrome, transmembrane


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ABK91486.1 apocytochrome b, partial [Trichopus zeylanicus]1.2e-0596Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
ABS10734.1 apocytochrome b, partial [Humiria balsamifera]1.2e-0596Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
ACV71598.1 apocytochrome b, partial [Elatine hexandra]1.2e-0596Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
QKO26573.1 apocytochrome b [Cyclanthus bipartitus]1.2e-0596Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
YP_002608212.1 apocytochrome b [Carica papaya]1.2e-0596Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0X8GIV6 Cytochrome b5.9e-0696Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
A0A5A7VP81 Cytochrome b5.9e-0696Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
A0A7D6J266 Cytochrome b5.9e-0696Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
B9U3N1 Cytochrome b5.9e-0696Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
Q7YH73 Cytochrome b5.9e-0696Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAGLCLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
SwissProt top hitse value%identityAlignment
P09843 Cytochrome b2.3e-0788Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF  LAG+CLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
P0C524 Cytochrome b2.3e-0788Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF  LAG+CLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
P42792 Cytochrome b2.7e-0892Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAG+CLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
P49390 Cytochrome b (Fragment)2.7e-0892Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAG+CLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
Q9ZZT8 Cytochrome b2.3e-0788Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF  LAG+CLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07718.1 Cytochrome b/b6 protein5.4e-0473.68Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLV
        PSNLSYWWGF PLAG  ++
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLV
AT2G07727.1 Di-haem cytochrome, transmembrane;Cytochrome b/b6, C-terminal1.9e-0992Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAG+CLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
ATMG00220.1 apocytochrome b1.9e-0992Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
        PSNLSYWWGF PLAG+CLVIQIVTG
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG
ATMG00590.1 Cytochrome b/b6 protein5.4e-0473.68Show/hide
Query:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLV
        PSNLSYWWGF PLAG  ++
Subjt:  PSNLSYWWGFDPLAGLCLV

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CCGAGCAATCTTAGTTATTGGTGGGGGTTCGATCCGTTAGCAGGTCTTTGTTTAGTCATTCAGATAGTTACTGGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCGAGCAATCTTAGTTATTGGTGGGGGTTCGATCCGTTAGCAGGTCTTTGTTTAGTCATTCAGATAGTTACTGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
PSNLSYWWGFDPLAGLCLVIQIVTG