; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS020752 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS020752
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionpentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial
Genome locationscaffold487:186827..187023
RNA-Seq ExpressionMS020752
SyntenyMS020752
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF3438617.1 hypothetical protein FNV43_RR21380 [Rhamnella rubrinervis]4.5e-1263.77Show/hide
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RXH77572.1 hypothetical protein DVH24_039543 [Malus domestica]4.5e-1263.77Show/hide
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        I YFCD GE+E  LNVFEK    DCLP   TY  LI AMF+RKK   DL+V GKLL+EM+DR FLPR F
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XP_019434549.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Lupinus angustifolius]2.7e-1266.67Show/hide
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XP_022137741.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Momordica charantia]4.1e-1368.12Show/hide
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        I YFCD G++E GL+VFEK    DCLP   TY  LI AMF+RKK S+DLVV GKLLLEMIDR FLPR F
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XP_038894755.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial [Benincasa hispida]3.5e-1265.22Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1J7GMZ2 Uncharacterized protein1.3e-1266.67Show/hide
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A0A498I5U6 Uncharacterized protein2.2e-1263.77Show/hide
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        I YFCD GE+E  LNVFEK    DCLP   TY  LI AMF+RKK   DL+V GKLL+EM+DR FLPR F
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A0A6A4Q4H8 Putative pentatricopeptide2.2e-1265.22Show/hide
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        I YFCD G++E GLN+FEK     CLP   TY  LI AMF+RKK S+DLVV GKLL+EMIDR FLPR F
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A0A6J1C7J3 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial2.0e-1368.12Show/hide
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A0A6P4A419 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial2.2e-1262.32Show/hide
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        + YFCD GE+E GLN FEK    +CLP   TY  LI AMF+RKK S+DL+V GKLL+EM+DR FLPR F
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9S7R4 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74900, mitochondrial6.8e-1155.07Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAGGAAAAAAAGATCTAATGATTTAGTGGTTTTTGGAAAGCTATTGCTTGAAATGATTGATAGAAGATTTCTCCCTCGAAATTTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTGGGTATTTTTGTGATGGTGAGGTAGAAAATGGGTTGAATGTGTTTGAGAAGACGCACTGGTGGGATTGTTTACCGACGTATAAAGCTTTGATTAGGGCAATGTTTAT
GAGGAAAAAAAGATCTAATGATTTAGTGGTTTTTGGAAAGCTATTGCTTGAAATGATTGATAGAAGATTTCTCCCTCGAAATTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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