; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS020868 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS020868
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionMYB transcription factor
Genome locationscaffold382:146854..146997
RNA-Seq ExpressionMS020868
SyntenyMS020868
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592163.1 Transcription factor CSA, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-1485.42Show/hide
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XP_022153715.1 transcription factor MYB52-like [Momordica charantia]9.1e-1895.83Show/hide
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XP_022936691.1 transcription factor MYB117-like [Cucurbita moschata]2.7e-1485.42Show/hide
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XP_022975017.1 transcription factor CSA-like [Cucurbita maxima]6.1e-1485.42Show/hide
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XP_030465386.1 transcription factor LAF1-like [Syzygium oleosum]1.4e-1384Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A059BTH1 Uncharacterized protein1.5e-1382Show/hide
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A0A6J1DHL3 transcription factor MYB52-like4.4e-1895.83Show/hide
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A0A6J1F870 transcription factor MYB117-like1.3e-1485.42Show/hide
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A0A6J1IBV4 transcription factor CSA-like3.0e-1485.42Show/hide
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K7KUM6 Uncharacterized protein1.5e-1380.85Show/hide
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        S+ G+D K+ PRGHWRPAEDEKLR+LV+Q+GAQNWNSIAEKLQGRSG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5NBM8 Transcription factor CSA1.5e-1070.45Show/hide
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        G  GK   RGHWRPAED KL+ LV Q+G QNWN IAEKL GRSG
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Q6R0C4 Transcription factor MYB523.9e-1180.56Show/hide
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Q9FX36 Transcription factor MYB541.6e-0975Show/hide
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Q9LQX5 Transcription factor MYB1171.2e-0977.78Show/hide
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Q9SEZ4 Transcription factor MYB1059.5e-1074.36Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17950.1 myb domain protein 522.7e-1280.56Show/hide
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AT1G26780.1 myb domain protein 1178.8e-1177.78Show/hide
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AT1G26780.2 myb domain protein 1178.8e-1177.78Show/hide
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AT1G69560.1 myb domain protein 1056.8e-1174.36Show/hide
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AT1G73410.1 myb domain protein 541.2e-1075Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCCATCGCTGAGAAGCTCCAAGGAAGATCAGGC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTTCCACTCCCGGGGACGACGGGAAGTCGTCCCCACGGGGTCATTGGCGGCCGGCCGAGGACGAGAAACTCCGACGACTCGTTCAACAGTTTGGTGCCCAAAACTGGAA
CTCCATCGCTGAGAAGCTCCAAGGAAGATCAGGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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