; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS021013 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS021013
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionF-box protein
Genome locationscaffold290:535610..537133
RNA-Seq ExpressionMS021013
SyntenyMS021013
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004146154.1 F-box protein At4g35930 [Cucumis sativus]3.6e-13386.11Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
        MGKVF+NDR+ KKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALA+LRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLD GKTKRN V EDKVSD+SP+MLSPVKLVMHINHIGTP+TPR
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR

Query:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
        VE CESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLR TTPRPTEHWP
Subjt:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP

Query:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
        FV+KGDGKG  +PSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYE+ELCQAVAQNKL
Subjt:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL

XP_008448525.1 PREDICTED: F-box protein At4g35930 [Cucumis melo]4.6e-13386.11Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
        MGKVF+NDR+ KKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLD GK KRN V EDKVSD+SP+MLSPVKLVMHINHIGTP+TPR
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR

Query:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
        VE CESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLR TTPRPTEHWP
Subjt:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP

Query:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
        FV+KGDGKG  +PSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYE+ELCQAVAQNKL
Subjt:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL

XP_022145262.1 F-box protein At4g35930 [Momordica charantia]7.2e-14291.7Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
        MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR

Query:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
        VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRP+EHWP
Subjt:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP

Query:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKLL
        FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKLL
Subjt:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKLL

XP_022943859.1 F-box protein At4g35930 [Cucurbita moschata]8.5e-12782.7Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKR-NAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTP
        MG+ FSN+R+SKKLKRRRR+KGS GKYLKPGAL++LRCSKGSV KSCT LGRKRVAVLD GKTKR NA  EDKVSD+SP+MLSPVKLVMHINHI TPRTP
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKR-NAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTP

Query:  RVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHW
        RVE+CESESRLESLPMDLLVK+LCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VL+ARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHW
Subjt:  RVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHW

Query:  PFVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
        PFVSKGDGKG  +PSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQE+ FP RCMVPSVI KPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
Subjt:  PFVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL

XP_038903596.1 F-box protein At4g35930 [Benincasa hispida]2.7e-13386.11Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
        MGKVF++DR+ KKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLD GKTKRN V EDKVSD+SP+MLSPVKLVMHI+HI TPRTPR
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR

Query:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
        VE CESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
Subjt:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP

Query:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
        FV+KG+GKGLL+PSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSV+SKPLCKSLASNRVLFYE+ELCQAVAQNKL
Subjt:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L111 F-box domain-containing protein1.7e-13386.11Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
        MGKVF+NDR+ KKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALA+LRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLD GKTKRN V EDKVSD+SP+MLSPVKLVMHINHIGTP+TPR
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR

Query:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
        VE CESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLR TTPRPTEHWP
Subjt:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP

Query:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
        FV+KGDGKG  +PSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYE+ELCQAVAQNKL
Subjt:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL

A0A1S3BKS0 F-box protein At4g359302.3e-13386.11Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
        MGKVF+NDR+ KKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLD GK KRN V EDKVSD+SP+MLSPVKLVMHINHIGTP+TPR
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR

Query:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
        VE CESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLR TTPRPTEHWP
Subjt:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP

Query:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
        FV+KGDGKG  +PSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYE+ELCQAVAQNKL
Subjt:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL

A0A5A7UEK6 F-box protein2.3e-13386.11Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
        MGKVF+NDR+ KKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLD GK KRN V EDKVSD+SP+MLSPVKLVMHINHIGTP+TPR
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR

Query:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
        VE CESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLR TTPRPTEHWP
Subjt:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP

Query:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
        FV+KGDGKG  +PSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYE+ELCQAVAQNKL
Subjt:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL

A0A6J1CW37 F-box protein At4g359303.5e-14291.7Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
        MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPR

Query:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP
        VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRP+EHWP
Subjt:  VEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWP

Query:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKLL
        FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKLL
Subjt:  FVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKLL

A0A6J1FVG9 F-box protein At4g359304.1e-12782.7Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKR-NAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTP
        MG+ FSN+R+SKKLKRRRR+KGS GKYLKPGAL++LRCSKGSV KSCT LGRKRVAVLD GKTKR NA  EDKVSD+SP+MLSPVKLVMHINHI TPRTP
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKR-NAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTP

Query:  RVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHW
        RVE+CESESRLESLPMDLLVK+LCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKA                       VL+ARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHW
Subjt:  RVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHW

Query:  PFVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
        PFVSKGDGKG  +PSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQE+ FP RCMVPSVI KPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL
Subjt:  PFVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65416 F-box protein SKIP271.7e-0528.21Show/hide
Query:  GALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGK--TKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHD
        G   +L    GSV +    LGRKR+ +    +    R+AV    VS+  P+  S  +    I  + +       +   +SRLE LP DLL++++C + H+
Subjt:  GALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGK--TKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHD

Query:  QLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSR
         L+++  VS+ IR+A                        L+A+  HF YTTP ++R
Subjt:  QLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSR

Q5XF11 F-box protein At4g359302.3e-7449.42Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDT------GKTK---------RN-------------------
        MGKV   D DSK   R+++ K S  KYLKPGAL QL  SK S AKSC +LG+KRV V DT      GK +         RN                   
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDT------GKTK---------RN-------------------

Query:  ------------------AVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCL
                           V  +    KSP+MLSP+ +VM    + TP+TP+ + C SES+LESLPMDLLVKI+CHLHHDQL+AVFHVSQRIR A     
Subjt:  ------------------AVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCL

Query:  SVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWPFVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQ-ES
                           +LARQ+HFNYTTPDRSRQEMLR  TP P   WPF  +GDG   ++ SPHTPKAP+H PRPPSR K++EM+Q+ AVLFQ ++
Subjt:  SVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWPFVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQ-ES

Query:  AFPPRCMVPSVISKP-LCKSLASN--RVLFYEEELCQAVAQNKL
         FP RC+VPSV+ +P L K +A    RVLFYE+ELCQAVAQN L
Subjt:  AFPPRCMVPSVISKP-LCKSLASN--RVLFYEEELCQAVAQNKL

Q8GX77 F-box protein At1g613402.9e-0535Show/hide
Query:  ESESR-LESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRS
        E +SR LE LP+D+LV+I+C + H+ L+ +FHVS+ IR+A                        ++A+Q HF Y+TP ++
Subjt:  ESESR-LESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G61340.1 F-box family protein2.1e-0635Show/hide
Query:  ESESR-LESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRS
        E +SR LE LP+D+LV+I+C + H+ L+ +FHVS+ IR+A                        ++A+Q HF Y+TP ++
Subjt:  ESESR-LESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRS

AT4G05010.1 F-box family protein1.1e-0432.18Show/hide
Query:  RTPRVEACES-ESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDR
        + P  E  ES  S LE+L  D+L+++LCH+ H+ L  +  VS+ IRKA                       V+ A++ HF+Y+TP +
Subjt:  RTPRVEACES-ESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDR

AT4G21510.1 F-box family protein1.2e-0628.21Show/hide
Query:  GALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGK--TKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHD
        G   +L    GSV +    LGRKR+ +    +    R+AV    VS+  P+  S  +    I  + +       +   +SRLE LP DLL++++C + H+
Subjt:  GALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGK--TKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHD

Query:  QLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSR
         L+++  VS+ IR+A                        L+A+  HF YTTP ++R
Subjt:  QLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSR

AT4G35930.1 F-box family protein1.6e-7549.42Show/hide
Query:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDT------GKTK---------RN-------------------
        MGKV   D DSK   R+++ K S  KYLKPGAL QL  SK S AKSC +LG+KRV V DT      GK +         RN                   
Subjt:  MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDT------GKTK---------RN-------------------

Query:  ------------------AVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCL
                           V  +    KSP+MLSP+ +VM    + TP+TP+ + C SES+LESLPMDLLVKI+CHLHHDQL+AVFHVSQRIR A     
Subjt:  ------------------AVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRLESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCL

Query:  SVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWPFVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQ-ES
                           +LARQ+HFNYTTPDRSRQEMLR  TP P   WPF  +GDG   ++ SPHTPKAP+H PRPPSR K++EM+Q+ AVLFQ ++
Subjt:  SVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWPFVSKGDGKGLLMPSPHTPKAPRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQ-ES

Query:  AFPPRCMVPSVISKP-LCKSLASN--RVLFYEEELCQAVAQNKL
         FP RC+VPSV+ +P L K +A    RVLFYE+ELCQAVAQN L
Subjt:  AFPPRCMVPSVISKP-LCKSLASN--RVLFYEEELCQAVAQNKL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAAGGTGTTTTCGAATGATAGGGATTCGAAGAAATTGAAGAGGAGGAGACGATCGAAGGGCTCTGGTGGGAAGTATCTGAAGCCTGGTGCTCTAGCGCAGCTGCG
GTGTAGCAAGGGCTCGGTTGCTAAATCTTGTACTGATCTTGGGAGGAAGAGGGTCGCTGTGTTGGATACTGGGAAGACGAAGAGAAATGCGGTGCCTGAGGATAAAGTTT
CTGATAAAAGTCCTATGATGTTGTCGCCTGTGAAATTGGTGATGCATATAAATCATATTGGAACTCCAAGAACTCCTCGGGTTGAAGCCTGTGAATCAGAGTCGCGGCTG
GAATCTTTACCTATGGATCTACTGGTGAAAATACTTTGCCATTTACACCATGACCAACTAAGGGCGGTTTTCCATGTTTCTCAACGGATCAGAAAGGCTGTAAGTAGTTG
TCTATCTGTCCTTGAAATGAATCACATTTTTTGGAGGTTGATGATCCTTTTTAACCAGGTTTTGCTGGCAAGACAATTCCACTTTAATTACACAACTCCAGATCGATCCA
GACAGGAGATGTTGAGAACAACCACCCCTCGACCCACTGAACACTGGCCCTTTGTAAGCAAGGGAGATGGCAAAGGCTTGTTGATGCCAAGCCCTCACACTCCCAAGGCA
CCGAGACATGGTCCTCGTCCGCCATCTCGCCTCAAAGTTTCCGAGATGAGGCAGGTTGCTGCTGTTCTCTTTCAAGAATCAGCATTTCCTCCGAGATGCATGGTTCCATC
TGTTATATCCAAACCTCTCTGCAAATCCTTGGCTTCTAACCGGGTTCTGTTTTACGAGGAAGAGTTGTGCCAAGCTGTTGCTCAAAATAAACTTCTT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGAAGGTGTTTTCGAATGATAGGGATTCGAAGAAATTGAAGAGGAGGAGACGATCGAAGGGCTCTGGTGGGAAGTATCTGAAGCCTGGTGCTCTAGCGCAGCTGCG
GTGTAGCAAGGGCTCGGTTGCTAAATCTTGTACTGATCTTGGGAGGAAGAGGGTCGCTGTGTTGGATACTGGGAAGACGAAGAGAAATGCGGTGCCTGAGGATAAAGTTT
CTGATAAAAGTCCTATGATGTTGTCGCCTGTGAAATTGGTGATGCATATAAATCATATTGGAACTCCAAGAACTCCTCGGGTTGAAGCCTGTGAATCAGAGTCGCGGCTG
GAATCTTTACCTATGGATCTACTGGTGAAAATACTTTGCCATTTACACCATGACCAACTAAGGGCGGTTTTCCATGTTTCTCAACGGATCAGAAAGGCTGTAAGTAGTTG
TCTATCTGTCCTTGAAATGAATCACATTTTTTGGAGGTTGATGATCCTTTTTAACCAGGTTTTGCTGGCAAGACAATTCCACTTTAATTACACAACTCCAGATCGATCCA
GACAGGAGATGTTGAGAACAACCACCCCTCGACCCACTGAACACTGGCCCTTTGTAAGCAAGGGAGATGGCAAAGGCTTGTTGATGCCAAGCCCTCACACTCCCAAGGCA
CCGAGACATGGTCCTCGTCCGCCATCTCGCCTCAAAGTTTCCGAGATGAGGCAGGTTGCTGCTGTTCTCTTTCAAGAATCAGCATTTCCTCCGAGATGCATGGTTCCATC
TGTTATATCCAAACCTCTCTGCAAATCCTTGGCTTCTAACCGGGTTCTGTTTTACGAGGAAGAGTTGTGCCAAGCTGTTGCTCAAAATAAACTTCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGKVFSNDRDSKKLKRRRRSKGSGGKYLKPGALAQLRCSKGSVAKSCTDLGRKRVAVLDTGKTKRNAVPEDKVSDKSPMMLSPVKLVMHINHIGTPRTPRVEACESESRL
ESLPMDLLVKILCHLHHDQLRAVFHVSQRIRKAVSSCLSVLEMNHIFWRLMILFNQVLLARQFHFNYTTPDRSRQEMLRTTTPRPTEHWPFVSKGDGKGLLMPSPHTPKA
PRHGPRPPSRLKVSEMRQVAAVLFQESAFPPRCMVPSVISKPLCKSLASNRVLFYEEELCQAVAQNKLL