CuGenDBv2

Gene ID	MS021277
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	ARM repeat superfamily protein
Genome location	scaffold358:676941..688045
RNA-Seq Expression	MS021277
Synteny	MS021277
Gene Ontology terms	GO:0043248 - proteasome assembly (biological process)
InterPro domains	IPR011989 - Armadillo-like helical IPR016024 - Armadillo-type fold IPR019538 - 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6607893.1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_022981236.1 uncharacterized protein LOC111480433 [Cucurbita maxima]

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A0A1S3CKC0 uncharacterized protein LOC103501781 isoform X1

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A0A6J1CFN3 uncharacterized protein LOC111010386 isoform X1

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A0A6J1FJQ7 uncharacterized protein LOC111446360

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        KTVT LLEE+D    LA QLI+DY IYPLL+ECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGME+IFPTN+TEATHLGT+ASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVS 
Subjt:  KTVTFLLEESDNDAVLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEVIFPTNETEATHLGTLASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSR

Query:  SVASAIYNSNLLNLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDESCVRILI
        SVASA+YNSNLLNLLESEI+NSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGT FLPRTS LQLLSSIISN S ESILRSRAMVISGRLLSKEN++ LVDESCVRILI
Subjt:  SVASAIYNSNLLNLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDESCVRILI

Query:  SAIDEALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGSTNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNICGETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIA
        SAIDE LGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGS+  GATLLLSS+ TCVK +I+AAFDRHEHGKQLAAMHALGNI GETRSENDIMLND AEENLRDL+YQ A
Subjt:  SAIDEALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGSTNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNICGETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIA

Query:  SRSSKIMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCMAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQE
        SRS K+ PSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQ+IINIV+DASTETTKIGMEARYNCC+AIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQE
Subjt:  SRSSKIMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCMAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQE

Query:  AVRNGPYLTRRNFETQPAVMTAERF
        AV+NGPYL+RR  ETQPA+MTAERF
Subjt:  AVRNGPYLTRRNFETQPAVMTAERF

A0A6J1IVZ7 uncharacterized protein LOC111480433

3.2e-255

87.81

Show/hide

Query:  MEEFAVDDPTQLLEAAADFASYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAETPGLENTLVACLDRIFKTKYGASFIPHFMPFIQVGLRADSQTVRDLAC
        MEEFAVDDPTQLLEAAADFA+YPGVRTD SVKEF  RFPLPV+INALQ KAE PGLENTLVACLDRIFKTKYGAS IPH+MPF+QVGL+ADSQ VR LAC
Subjt:  MEEFAVDDPTQLLEAAADFASYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAETPGLENTLVACLDRIFKTKYGASFIPHFMPFIQVGLRADSQTVRDLAC

Query:  KTVTFLLEESDNDAVLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEVIFPTNETEATHLGTLASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSR
        KTVT LLEE+D    LA QLI+DY IYPLL+ECLLNGNEQVANSSMDA+KKLAAFPKGME+IFPTN+TEATHLGT+ASTCSSLGRVRVMAL+VKLFSVS 
Subjt:  KTVTFLLEESDNDAVLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEVIFPTNETEATHLGTLASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSR

Query:  SVASAIYNSNLLNLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDESCVRILI
        SVASA+YNSNLLNLLESEI+NSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGT FLPRTS LQLLSSIISN S ESILRSRAMVISGRLLSKEN++ LVDESCVRILI
Subjt:  SVASAIYNSNLLNLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDESCVRILI

Query:  SAIDEALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGSTNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNICGETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIA
        S+IDE LGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGS+  GATLLLSS+ TCVK +I+AAFDRHEHGKQLAAMHALGNI GETRSENDIMLND AEENL DL+YQ A
Subjt:  SAIDEALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGSTNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNICGETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIA

Query:  SRSSKIMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCMAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQE
        SRS KI PSGL LAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQ+IINIV+DASTETTKIGMEARYNCC+AIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQE
Subjt:  SRSSKIMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCMAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQE

Query:  AVRNGPYLTRRNFETQPAVMTAERF
        AV+NGPYL+RR  ETQPA+MTAERF
Subjt:  AVRNGPYLTRRNFETQPAVMTAERF

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G15180.1 ARM repeat superfamily protein

3.3e-167

57.69

Show/hide

Query:  VDDPTQLLEAAADFASYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAETPGLENTLVACLDRIFKTKYGASFIPHFMPFIQVGLRADSQTVRDLACKTVTF
        ++D  QL +AA +FA YPG + + SVKEFLDRFPLPVI NALQT  + PG ENTLV CL+R+FKTKYGAS IP +MP +QVGL+ADS  V+ LACKTV  
Subjt:  VDDPTQLLEAAADFASYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAETPGLENTLVACLDRIFKTKYGASFIPHFMPFIQVGLRADSQTVRDLACKTVTF

Query:  LLEESDNDAVLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEVIFPTNETEATHLGTLASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSRSVASA
        LLE+ D + V ++QL+++ GIYPLLL+ ++N +++VAN++ + IK LA FP  M VIFP+   + THL  LA+ CSSL RVRV++L+VKLFS+SR VAS 
Subjt:  LLEESDNDAVLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEVIFPTNETEATHLGTLASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSRSVASA

Query:  IYNSNLLNLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDESCVRILISAIDE
        +  S LL+LLE+E+  + DTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS++QLL SIIS +ST    + RAM+ISGRLLSKEN+Y +V+E+ V+ LISAID 
Subjt:  IYNSNLLNLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDESCVRILISAIDE

Query:  ALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGSTNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNICGETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIASRSSK
        +L S E  D +  E+A +ALGQ+GST +GA L+LS+     + ++ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI GETR +++ +++  AEE+LR L+Y  A++S+K
Subjt:  ALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGSTNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNICGETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIASRSSK

Query:  IMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCMAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNG
        + PSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K+EIINIVTDA+TET KI MEARYNCC AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+G
Subjt:  IMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCMAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNG

Query:  PYLTRRNFETQPAVMTAERF
        PY+++++   +P VMT E F
Subjt:  PYLTRRNFETQPAVMTAERF

AT3G15180.2 ARM repeat superfamily protein

2.2e-163

54.53

Show/hide

Query:  VDDPTQLLEAAADFASYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAETPGLENTLVACLDRIFKTKYGASFIPHFMPFIQVGLRADSQTVRDLACKTVTF
        ++D  QL +AA +FA YPG + + SVKEFLDRFPLPVI NALQT  + PG ENTLV CL+R+FKTKYGAS IP +MP +QVGL+ADS  V+ LACKTV  
Subjt:  VDDPTQLLEAAADFASYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAETPGLENTLVACLDRIFKTKYGASFIPHFMPFIQVGLRADSQTVRDLACKTVTF

Query:  LLEESDNDAVLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEVIFPTNETEATHLGTLASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSRSVASA
        LLE+ D + V ++QL+++ GIYPLLL+ ++N +++VAN++ + IK LA FP  M VIFP+   + THL  LA+ CSSL RVRV++L+VKLFS+SR VAS 
Subjt:  LLEESDNDAVLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEVIFPTNETEATHLGTLASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSRSVASA

Query:  IYNSNLLNLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDES-----------
        +  S LL+LLE+E+  + DTLV L+VLEL YEL+E+EH ++F+P+TS++QLL SIIS +ST    + RAM+ISGRLLSKEN+Y +V+E+           
Subjt:  IYNSNLLNLLESEINNSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDES-----------

Query:  ---------------------CVRILISAIDEALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGSTNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIC
                             CV+ LISAID +L S E  D +  E+A +ALGQ+GST +GA L+LS+     + ++ +AFDR+ HGKQLAA+HAL NI 
Subjt:  ---------------------CVRILISAIDEALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGSTNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNIC

Query:  GETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIASRSSKIMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCM
        GETR +++ +++  AEE+LR L+Y  A++S+K+ PSGLFL+VLQQ SEIRLA YR +T LVARPWCL+EI +K+EIINIVTDA+TET KI MEARYNCC 
Subjt:  GETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIASRSSKIMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCLMEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCM

Query:  AIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLTRRNFETQPAVMTAERF
        AIH+AF+ S     DP       KLQEAVR+GPY+++++   +P VMT E F
Subjt:  AIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLTRRNFETQPAVMTAERF

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGAATTTGCAGTGGATGATCCCACTCAACTGCTCGAAGCAGCTGCGGACTTCGCAAGCTACCCCGGTGTTCGGACTGATGCCTCGGTGAAGGAATTTCTCGACCG
TTTTCCTCTCCCCGTCATCATCAATGCTTTACAAACAAAAGCAGAAACTCCTGGTCTGGAAAACACGTTGGTTGCTTGTCTCGACAGGATATTCAAAACCAAATATGGTG
CTTCCTTTATCCCACATTTTATGCCTTTTATACAGGTTGGACTGCGAGCAGATTCTCAAACAGTTAGAGATCTAGCTTGTAAAACGGTCACTTTCCTTTTAGAGGAGTCT
GATAATGATGCGGTTTTGGCCATACAACTAATTATTGACTATGGAATTTATCCACTTTTGCTCGAGTGCCTTCTGAATGGTAATGAACAAGTTGCTAACTCATCAATGGA
TGCAATAAAGAAATTGGCTGCATTTCCAAAGGGAATGGAAGTTATCTTCCCAACAAATGAAACGGAAGCAACTCACCTAGGAACTCTAGCTTCAACATGTTCATCTCTGG
GAAGAGTTCGAGTTATGGCACTGGTAGTGAAACTATTTTCTGTTTCTAGATCTGTGGCATCAGCAATATACAATTCAAATTTACTAAATCTACTGGAAAGTGAAATCAAC
AACTCAAATGACACACTTGTAACTTTAAGCGTGTTGGAACTCTTGTACGAGTTAGTGGAGATTGAACATGGTACAAAGTTCTTGCCAAGGACCAGCATTCTCCAACTACT
AAGTTCTATAATCAGCAACTCATCAACGGAGTCTATCTTAAGGTCAAGAGCAATGGTCATCAGTGGAAGACTTCTATCAAAAGAGAATATGTACTTGCTTGTAGATGAAT
CTTGCGTAAGGATTCTAATATCTGCTATAGATGAAGCTCTTGGGTCATCAGAAGGTCAAGATGTAAATGTATGTGAATCTGCATTTGAAGCACTGGGTCAAATAGGGTCA
ACTAATCGGGGAGCTACTTTACTGCTGTCAAGTTTCTCAACTTGTGTGAAGCTTTTAATTCATGCAGCATTTGATCGGCATGAACATGGTAAACAGCTGGCAGCCATGCA
TGCTCTTGGCAATATCTGTGGAGAAACCCGATCTGAGAATGATATTATGCTGAATGATATGGCAGAAGAAAATTTGCGGGACTTGATGTATCAAATTGCATCCAGAAGTT
CAAAAATTATGCCATCAGGCCTTTTTCTAGCTGTCCTTCAGCAGGACTCTGAGATTCGACTGGCGAGTTATAGAATGATAACTGGGTTGGTGGCTCGACCTTGGTGCCTT
ATGGAAATCTGCTCGAAACAAGAAATAATAAATATAGTGACTGATGCAAGTACTGAGACTACGAAAATAGGAATGGAAGCTAGATATAATTGTTGTATGGCTATCCACAA
GGCCTTCATGTCTTCAACTAGGCTTACTGGCGATCCTGCCCTTGCAGGAATAGCTTCGAAGTTGCAGGAAGCTGTTAGAAATGGTCCATATCTTACTAGGAGGAATTTTG
AAACTCAACCAGCAGTTATGACAGCTGAGAGATTT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEEFAVDDPTQLLEAAADFASYPGVRTDASVKEFLDRFPLPVIINALQTKAETPGLENTLVACLDRIFKTKYGASFIPHFMPFIQVGLRADSQTVRDLACKTVTFLLEES
DNDAVLAIQLIIDYGIYPLLLECLLNGNEQVANSSMDAIKKLAAFPKGMEVIFPTNETEATHLGTLASTCSSLGRVRVMALVVKLFSVSRSVASAIYNSNLLNLLESEIN
NSNDTLVTLSVLELLYELVEIEHGTKFLPRTSILQLLSSIISNSSTESILRSRAMVISGRLLSKENMYLLVDESCVRILISAIDEALGSSEGQDVNVCESAFEALGQIGS
TNRGATLLLSSFSTCVKLLIHAAFDRHEHGKQLAAMHALGNICGETRSENDIMLNDMAEENLRDLMYQIASRSSKIMPSGLFLAVLQQDSEIRLASYRMITGLVARPWCL
MEICSKQEIINIVTDASTETTKIGMEARYNCCMAIHKAFMSSTRLTGDPALAGIASKLQEAVRNGPYLTRRNFETQPAVMTAERF

MS021277 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome