CuGenDBv2

Gene ID	MS021281
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Protein yippee-like
Genome location	scaffold358:704355..706797
RNA-Seq Expression	MS021281
Synteny	MS021281
Gene Ontology terms	GO:0000151 - ubiquitin ligase complex (cellular component) GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domains	IPR004910 - Yippee/Mis18/Cereblon IPR034751 - Yippee domain IPR039058 - Yippee family

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_004146051.1 protein yippee-like At5g53940 [Cucumis sativus]

2.1e-61

89.15

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FVVEREGRSYRC++CNTQLAL DDLASRAFHCRRGKAYLFN AINI  GALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGK+VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+DDIEFSTGF+ID+RS +SDSE+N
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

XP_016903088.1 PREDICTED: protein yippee-like At5g53940 [Cucumis melo]

9.5e-62

89.15

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FVVEREGRSYRC++CNTQLAL DDLASRAFHCRRGKAYLFN AINIS GALEERMMLSGLHTVADIFCC+CGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGK+VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+DDIEFSTGF+ID+RS +SDSE+N
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

XP_022139779.1 protein yippee-like At5g53940 [Momordica charantia]

4.0e-68

100

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

XP_023536603.1 protein yippee-like At5g53940 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

8.1e-61

88.37

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGRIFVVEREG SYRC+FCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFN AIN  LGALE+R+MLSG HTVADIFCC+CGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGK+VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+DDIEFSTGFY+D+RS +SDSEDN
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

XP_038899427.1 protein yippee-like At5g53940 [Benincasa hispida]

3.3e-62

89.92

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FVVEREGRSYRC++CNTQLAL DDLASRAFHCRRGKAYLFN AINIS GALEERMMLSGLHTVADIFCC+CGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGK+VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+DDIEFSTGF+ID+RS +SDSEDN
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0L050 Protein yippee-like

1.0e-61

89.15

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FVVEREGRSYRC++CNTQLAL DDLASRAFHCRRGKAYLFN AINI  GALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGK+VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+DDIEFSTGF+ID+RS +SDSE+N
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

A0A1S4E4C9 Protein yippee-like

4.6e-62

89.15

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FVVEREGRSYRC++CNTQLAL DDLASRAFHCRRGKAYLFN AINIS GALEERMMLSGLHTVADIFCC+CGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGK+VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+DDIEFSTGF+ID+RS +SDSE+N
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

A0A6J1CDY9 Protein yippee-like

1.9e-68

100

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

A0A6J1F692 Protein yippee-like

5.1e-61

88.37

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGRIFVVEREG SYRC+FCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFN AIN  LGALE+R+MLSG HTVADIFCC CGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGK+VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+DDIEFSTGFY+D+RS +SDSEDN
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

A0A6J1IP05 Protein yippee-like

3.9e-61

88.37

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGRIFVVEREG SYRC+FCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFN AIN  LGALE+R+MLSG HTVADIFCC+CGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGK+VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+DDIEFSTGFY+D+RS +SDSEDN
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P59234 Protein yippee-like

2.5e-36

54.69

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FV+  EG+ Y C+ C T LAL++++ S++FHC+ GKAYLF+  +N++ G +E RMM++G+HTVADIFC  CG IVGWKYE AHEKSQKYKEGK VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED
        ER +I            DT    SD++D
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED

Q9C777 Protein yippee-like At3g11230

9.6e-33

50.78

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+F+V  EG+SY C+ C T LAL DD+ S++F  R GKAYLF+  +N+  G  E+RMM++G+HTV DI+C  CG  VGWKYE A EK+QKYKEGK VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED
        ER ++      +     +  +G SD++D
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED

Q9FN32 Protein yippee-like At5g53940

2.4e-55

76.74

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGRIF VE EGRSYRCRFC T LAL DDL SR+FHCRRGKAYLFN ++NIS+G LEER+MLSG+HTVADIFCC CGQ VGWKYE+AHEK+QKYKEGKFVL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+D+I+ ST  YIDT    SD+ED+
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

Q9LY56 Protein yippee-like At3g55890

1.3e-32

58.1

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+F+V+ EG  Y C+ C T L+   D+ S++F C+ G+AYLFN  +N+S+G  E+RMM++GLH V DIFC  CG  VGWKYE AHEKSQKYKEGK VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRI
        E  +I
Subjt:  ERGRI

Q9SR97 Protein yippee-like At3g08990

1.2e-35

49.22

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FV++ EG  Y C++C T  A+ +D+ S++FHC+ G+AYLF+  +N+++G  E R+M++G HTVADIFC SCG +VGWKYE A++KSQKYKEGKF+L
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED
        ER +++    +  G+ ++    M+ S+D
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G40110.1 Yippee family putative zinc-binding protein

4.6e-38

64.76

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FVV  EG+ Y C+ C T LA  +D+ S++FHC+ GKAYLFN   N+S+G  EER+M++G HTVADIFC SCG IVGWKYE AHEK+QKYKEGK VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRI
        ER +I
Subjt:  ERGRI

AT2G40110.2 Yippee family putative zinc-binding protein

1.3e-37

65.69

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FVV  EG+ Y C+ C T LA  +D+ S++FHC+ GKAYLFN   N+S+G  EER+M++G HTVADIFC SCG IVGWKYE AHEK+QKYKEGK VL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ER
        ER
Subjt:  ER

AT3G08990.1 Yippee family putative zinc-binding protein

8.6e-37

49.22

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FV++ EG  Y C++C T  A+ +D+ S++FHC+ G+AYLF+  +N+++G  E R+M++G HTVADIFC SCG +VGWKYE A++KSQKYKEGKF+L
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED
        ER +++    +  G+ ++    M+ S+D
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED

AT3G08990.2 Yippee family putative zinc-binding protein

8.6e-37

49.22

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGR+FV++ EG  Y C++C T  A+ +D+ S++FHC+ G+AYLF+  +N+++G  E R+M++G HTVADIFC SCG +VGWKYE A++KSQKYKEGKF+L
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED
        ER +++    +  G+ ++    M+ S+D
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSED

AT5G53940.1 Yippee family putative zinc-binding protein

1.7e-56

76.74

Show/hide

Query:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL
        MGRIF VE EGRSYRCRFC T LAL DDL SR+FHCRRGKAYLFN ++NIS+G LEER+MLSG+HTVADIFCC CGQ VGWKYE+AHEK+QKYKEGKFVL
Subjt:  MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVL

Query:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN
        ERGRI+D+I+ ST  YIDT    SD+ED+
Subjt:  ERGRIIDDIEFSTGFYIDTRSGMSDSEDN

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGGCGGATTTTTGTTGTTGAAAGGGAAGGGAGGTCGTACAGATGCCGGTTCTGCAACACGCAGTTAGCTCTCGCCGACGACCTTGCCTCTCGGGCCTTTCATTGCCG
CCGTGGAAAAGCATACCTTTTCAATTATGCGATAAACATTTCATTGGGAGCATTGGAAGAGAGGATGATGCTCTCAGGATTGCATACTGTCGCAGACATATTTTGTTGCT
CATGTGGACAAATTGTCGGGTGGAAATATGAGGCAGCACATGAGAAGAGCCAGAAGTACAAGGAGGGCAAGTTCGTTCTTGAAAGGGGGAGGATAATCGACGACATTGAA
TTCTCAACTGGCTTCTACATAGACACTCGGTCTGGTATGAGTGATAGTGAAGATAAT

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGRIFVVEREGRSYRCRFCNTQLALADDLASRAFHCRRGKAYLFNYAINISLGALEERMMLSGLHTVADIFCCSCGQIVGWKYEAAHEKSQKYKEGKFVLERGRIIDDIE
FSTGFYIDTRSGMSDSEDN

MS021281 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome