; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS021296 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS021296
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4
Genome locationscaffold358:842100..842807
RNA-Seq ExpressionMS021296
SyntenyMS021296
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039828 - VQ motif-containing protein 33


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK20262.1 VQ motif-containing protein 4 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-9379.76Show/hide
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XP_038896819.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]1.9e-9278.52Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L3E4 VQ domain-containing protein9.9e-9580.16Show/hide
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A0A1S3BTW1 VQ motif-containing protein 41.7e-9480.16Show/hide
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A0A5A7VAR6 VQ motif-containing protein 41.7e-9480.16Show/hide
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A0A5D3D9L9 VQ motif-containing protein 44.9e-9479.76Show/hide
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A0A6J1CC93 VQ motif-containing protein 46.6e-123100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 131.9e-2646.41Show/hide
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Q5M750 VQ motif-containing protein 42.1e-4654Show/hide
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          + EE+A+ E+GFYLHPSP  TP   E P+LL LFP TSPRVSGSSS+S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 331.3e-3549.41Show/hide
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        ME+S+SS S   E+ +NP    SSP   P   S        PH+     +  SNPYPTTFVQAD+S FK VVQMLTGSS           PS  +     
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         SF+IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL       +    G  +   +  FSPRN+      +LSPS+LDFP L L SPVTPL  ND
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Query:  DPLFEKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPETSP
        DP F KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR ++ P LL LFP  SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 311.0e-1134.81Show/hide
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        TTFVQ D++ F+ +VQ LTG              P +++ + A P    IKTA +K+ + KL+ERR  ++  L I  + P  +    G    + S     
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Query:  ILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFEKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPETSPRVSG
        + SP  +  PS   S ++ +  +P     S + ++    EEE+AI E+ FYLHPSP + P   E P+LL+LFP TSP  SG
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 191.0e-4354.59Show/hide
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        E + + P++S +S S+S   G L H+  ++ RS+   YPTTFVQADSS+FK VVQMLTGSS     DSP+PP   S        +F IPPIKTA PKK  
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Query:  SFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFAGVGAGAGAGAFSPRNAEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFEKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFY
          KLYERR+H      LKNSLMINTL+      G GAG+  FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL       +      +   SEEER IA+KG+Y
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Query:  LHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPETSPRVS
        LH SP++TPR +E PQLL LFP TSPR+S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.5e-4754Show/hide
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        +S R  E      SP  +NS NS   S+S+     P  P   +  RSES NPYPTTFVQAD+S+FK VVQMLTGS++ PK      P P+ H  DP  + 
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Query:  KSFAIPPIKTAPKKQQS------FKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFAGVGAGAGAGAFSPRNAEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFEKSSSSPSLG
         SF+IPPIK  P K+QS      F+LYERRN +KN L IN L P F  V +     AFSPR  EILSPSILDFPSL LSPVTPL  DP     SS+ S  
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          + EE+A+ E+GFYLHPSP  TP   E P+LL LFP TSPRVSGSSS+S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.9e-4553.28Show/hide
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AT2G33780.1 VQ motif-containing protein1.3e-2746.41Show/hide
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        Y TTF++ D S+FK VVQ+LTG   +P   P     PF S     IPPIK    K+Q  SF+L ERRN +K+ L IN   P  +G               
Subjt:  YPTTFVQADSSNFKHVVQMLTGSSDSPKPPPPSSHDPFQSSKSFAIPPIKTAPKKQQ--SFKLYERRNHLKNSLMINTLIPNFAGVGAGAGAGAFSPRNA

Query:  EILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFEKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPET
        EIL+P+IL+FP+L LSP TPL  DP +   S S S   S      ++ER+I EKGFYL PSP  TPR  E P+LLSLFP T
Subjt:  EILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFEKSSSSPSLGSS-----SEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPET

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein7.1e-4554.59Show/hide
Query:  EKNPSSPNNSPNSFSASNNGGLLPHNPKLLPRSESNPYPTTFVQADSSNFKHVVQMLTGSS-----DSPKPPPPSSHDPFQSSKSFAIPPIKTA-PKKQQ
        E + + P++S +S S+S   G L H+  ++ RS+   YPTTFVQADSS+FK VVQMLTGSS     DSP+PP   S        +F IPPIKTA PKK  
Subjt:  EKNPSSPNNSPNSFSASNNGGLLPHNPKLLPRSESNPYPTTFVQADSSNFKHVVQMLTGSS-----DSPKPPPPSSHDPFQSSKSFAIPPIKTA-PKKQQ

Query:  SFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFAGVGAGAGAGAFSPRNAEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFEKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFY
          KLYERR+H      LKNSLMINTL+      G GAG+  FSPRN EILSPS LDFP LAL SPVTPL       +      +   SEEER IA+KG+Y
Subjt:  SFKLYERRNH------LKNSLMINTLIPNFAGVGAGAGAGAFSPRNAEILSPSILDFPSLAL-SPVTPLNDDPLFEKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFY

Query:  LHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPETSPRVS
        LH SP++TPR +E PQLL LFP TSPR+S
Subjt:  LHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPETSPRVS

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein9.3e-3749.41Show/hide
Query:  MEISSSSSSRLHEREKNP----SSPNNSPNSFSASNNGGLLPHNPKLLPRSESNPYPTTFVQADSSNFKHVVQMLTGSSDSPKP----PPPSSHDPFQSS
        ME+S+SS S   E+ +NP    SSP   P   S        PH+     +  SNPYPTTFVQAD+S FK VVQMLTGSS           PS  +     
Subjt:  MEISSSSSSRLHEREKNP----SSPNNSPNSFSASNNGGLLPHNPKLLPRSESNPYPTTFVQADSSNFKHVVQMLTGSSDSPKP----PPPSSHDPFQSS

Query:  KSFAIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-------IPNFAGVGAGAGAGAFSPRNAE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTPL--ND
         SF+IPPI    KK  SFKLYERR +      KN LMINTL       +    G  +   +  FSPRN+      +LSPS+LDFP L L SPVTPL  ND
Subjt:  KSFAIPPIKTAPKKQQSFKLYERRNH-----LKNSLMINTL-------IPNFAGVGAGAGAGAFSPRNAE-----ILSPSILDFPSLAL-SPVTPL--ND

Query:  DPLFEKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPETSP
        DP F KSS   SLG+SSEE++AIA+KGFYLHPSP++TPR ++ P LL LFP  SP
Subjt:  DPLFEKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAAEPPQLLSLFPETSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAATCTCTTCCTCTTCCTCCTCAAGACTCCATGAGAGGGAAAAAAACCCTTCTTCCCCAAATAACTCTCCCAACAGCTTCAGCGCCTCCAACAATGGCGGCCTTCT
CCCCCACAACCCTAAACTCCTCCCCAGATCTGAATCCAACCCTTACCCCACCACTTTCGTTCAGGCCGATTCCTCCAATTTCAAGCACGTCGTTCAAATGCTCACCGGTT
CTTCCGATTCCCCCAAGCCTCCGCCGCCGTCGTCTCACGACCCCTTTCAATCCTCCAAGAGCTTCGCTATTCCTCCGATCAAGACGGCGCCCAAGAAACAGCAGAGCTTC
AAGCTCTACGAGCGCCGGAATCACCTCAAGAACAGCCTCATGATCAATACCCTGATTCCTAATTTCGCCGGCGTCGGTGCCGGTGCCGGTGCAGGCGCGTTTTCTCCTCG
GAACGCGGAGATTCTGTCGCCGAGCATCCTTGATTTCCCGTCTCTGGCGCTGAGCCCAGTGACGCCGTTGAACGACGACCCCTTGTTCGAGAAATCCTCGTCGTCGCCGT
CGCTCGGGAGCTCGTCAGAGGAGGAGAGGGCGATCGCCGAGAAGGGGTTTTACTTGCATCCGTCGCCGATGAACACGCCGAGGGCGGCGGAGCCGCCGCAGCTTCTCTCT
CTGTTCCCCGAGACATCGCCTAGGGTTTCCGGGTCGTCGTCTTCCTCG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAATCTCTTCCTCTTCCTCCTCAAGACTCCATGAGAGGGAAAAAAACCCTTCTTCCCCAAATAACTCTCCCAACAGCTTCAGCGCCTCCAACAATGGCGGCCTTCT
CCCCCACAACCCTAAACTCCTCCCCAGATCTGAATCCAACCCTTACCCCACCACTTTCGTTCAGGCCGATTCCTCCAATTTCAAGCACGTCGTTCAAATGCTCACCGGTT
CTTCCGATTCCCCCAAGCCTCCGCCGCCGTCGTCTCACGACCCCTTTCAATCCTCCAAGAGCTTCGCTATTCCTCCGATCAAGACGGCGCCCAAGAAACAGCAGAGCTTC
AAGCTCTACGAGCGCCGGAATCACCTCAAGAACAGCCTCATGATCAATACCCTGATTCCTAATTTCGCCGGCGTCGGTGCCGGTGCCGGTGCAGGCGCGTTTTCTCCTCG
GAACGCGGAGATTCTGTCGCCGAGCATCCTTGATTTCCCGTCTCTGGCGCTGAGCCCAGTGACGCCGTTGAACGACGACCCCTTGTTCGAGAAATCCTCGTCGTCGCCGT
CGCTCGGGAGCTCGTCAGAGGAGGAGAGGGCGATCGCCGAGAAGGGGTTTTACTTGCATCCGTCGCCGATGAACACGCCGAGGGCGGCGGAGCCGCCGCAGCTTCTCTCT
CTGTTCCCCGAGACATCGCCTAGGGTTTCCGGGTCGTCGTCTTCCTCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEISSSSSSRLHEREKNPSSPNNSPNSFSASNNGGLLPHNPKLLPRSESNPYPTTFVQADSSNFKHVVQMLTGSSDSPKPPPPSSHDPFQSSKSFAIPPIKTAPKKQQSF
KLYERRNHLKNSLMINTLIPNFAGVGAGAGAGAFSPRNAEILSPSILDFPSLALSPVTPLNDDPLFEKSSSSPSLGSSSEEERAIAEKGFYLHPSPMNTPRAAEPPQLLS
LFPETSPRVSGSSSSS