; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS021388 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS021388
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL19
Genome locationscaffold358:1623180..1626963
RNA-Seq ExpressionMS021388
SyntenyMS021388
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016937.1 Agamous-like MADS-box protein AGL19, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-8384.29Show/hide
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XP_038906882.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Benincasa hispida]8.7e-8987.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL191.2e-8886.32Show/hide
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A0A6J1DRG2 agamous-like MADS-box protein AGL193.0e-10399.52Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X11.7e-8283.33Show/hide
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X11.2e-8383.81Show/hide
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A0A6J1I349 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X22.9e-8283.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC11.6e-5359.52Show/hide
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL194.4e-5962.15Show/hide
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL142.7e-5660.28Show/hide
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL422.0e-4856.04Show/hide
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 501.3e-5057.99Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 201.1e-5459.52Show/hide
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 141.9e-5760.28Show/hide
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 193.1e-6062.15Show/hide
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AT5G62165.1 AGAMOUS-like 421.4e-4956.04Show/hide
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