; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS021414 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS021414
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionGlucan endo-1,3-beta-D-glucosidase
Genome locationscaffold358:1811351..1813280
RNA-Seq ExpressionMS021414
SyntenyMS021414
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
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A0A0A0M1B6 Hydrolase, hydrolyzing O-glycosyl compounds1.3e-15283.2Show/hide
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A0A1S3BQE9 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 41.2e-15082.48Show/hide
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A0A5A7U6N8 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 41.2e-15082.48Show/hide
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Q93V72 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 41.1e-2043.26Show/hide
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 13.0e-1839.36Show/hide
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Q9FZ86 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 31.6e-1947.14Show/hide
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         TPS   PTTT   N  P T+   T S+  G G+P    P
Subjt:  LTPSVPTPTTTAPINVPPTTVTNPTTSSPAGTGMPENGTP

Q9M069 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 71.3e-1848.51Show/hide
Query:  SPPATTNAPAIPGQSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNP-SPTSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVY
        S  + T +  +    WCV + GA+   LQ++LD+ACG  G DC  IQ GG+C+ PN + +HA++A N YFQK+P  PT CDF  +A VTS NPS  +CVY
Subjt:  SPPATTNAPAIPGQSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNP-SPTSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVY

Query:  P
        P
Subjt:  P

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.5e-5450.34Show/hide
Query:  TMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSVPLTTPISVPANSPLPLTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYP--APSGGVPVVTP
        T HD+ N P T+FPT P T+TPT  T P   PVT+TP++PA T   VP  T I  P  +P P+     P +T P   P+TNPVT YP   PSG VPV  P
Subjt:  TMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSVPLTTPISVPANSPLPLTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYP--APSGGVPVVTP

Query:  VTNPVPVSPPATTNAPAIPGQSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTSSNPS
        V     V+PP  +N+P++ GQSWCVA+ GAS+ +LQ ALDYACG   ADCSQ+QQGG+CY+P +LQ+HASFAFNSY+QKNPSP SCDFGG+A + ++NPS
Subjt:  VTNPVPVSPPATTNAPAIPGQSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTSSNPS

Query:  SGSCVYPLSSSSSTPASLTPSVPTPTTTAPINVPPTTVTNPTTSSPAGTGMPENGTPPTVFNTGNPA-------SSMGSTTGFGTEIPPSSSTSIS
        +GSC+Y   SS+STP +   + PTP+T   +N PP T    T   P G G+   GTPP +FN  NP        SS G   G+G +  P+ +   S
Subjt:  SGSCVYPLSSSSSTPASLTPSVPTPTTTAPINVPPTTVTNPTTSSPAGTGMPENGTPPTVFNTGNPA-------SSMGSTTGFGTEIPPSSSTSIS

AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein3.0e-2135.21Show/hide
Query:  STPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSVPLTTPISVPANSPLP-LTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYP-----APSGGVPVVTPVTNP-----------
        ST  ++ +  T+P+ V           +P+  P +   ++  P +T P  P +T PG    T P   YP      P+GG P +   T P           
Subjt:  STPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSVPLTTPISVPANSPLP-LTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYP-----APSGGVPVVTPVTNP-----------

Query:  ----VPVSPPA-------------------TTNAPAIPGQSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNP
             P                        T     +    WC+A++ AS T+LQ ALDYACG GGADC QIQQG +CY PNT+++HASFAFNSY+QK+P
Subjt:  ----VPVSPPA-------------------TTNAPAIPGQSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNP

Query:  SPTSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVYPLSS---SSSTPASLTP----SVPTPTTTAPINVPPTTVT--NPTTSSPAGTGMPENGT
           SC+FGG+A +TS++PS GSC +  SS   S+S P+ ++P    S P+ T   PI  P T +T   P       TG+P + T
Subjt:  SPTSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVYPLSS---SSSTPASLTP----SVPTPTTTAPINVPPTTVT--NPTTSSPAGTGMPENGT

AT1G69295.1 plasmodesmata callose-binding protein 47.8e-2243.26Show/hide
Query:  SWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVYPLSSSSSTPASLTP
        ++C+ + G +E  LQ A+DYACG  GADC+QIQ  G+CY PNT++NH   A NSY+QK  S   +CDF G+A  +++ PS+ S     SSSS TP + TP
Subjt:  SWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNPSP-TSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVYPLSSSSSTPASLTP

Query:  SVPTPTTTAPINVPPTTVTNPTTSSPAG----TGMPENGTPPTVFNTGNPASSMGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAAGL
        +  TPT+  P    PTT T PTT +P      +G P  GTP T  NTG P +S G  T   + + P ++   + + GL
Subjt:  SVPTPTTTAPINVPPTTVTNPTTSSPAG----TGMPENGTPPTVFNTGNPASSMGSTTGFGTEIPPSSSTSISMAAGL

AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.5e-2843Show/hide
Query:  TTPISVPANSPLPLTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYPAPSGGVPVVTPVTNPVPVSPPATTNAPAIPG-QSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADC
        T  I+ P      +T P+A         P T P T  P        V       P++ P++ +  A PG QSWCVAR   ++ ALQ+ALDYACG GGADC
Subjt:  TTPISVPANSPLPLTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYPAPSGGVPVVTPVTNPVPVSPPATTNAPAIPG-QSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADC

Query:  SQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVYPLSSSSSTPASLT-----------PSVPTPTTTAPINVPPTTVT
        S+IQ+GG+CYNPN+L+ HASFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  S++PS GSC +P +S+S +  ++T           PS PTP   A  +   T ++
Subjt:  SQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVYPLSSSSSTPASLT-----------PSVPTPTTTAPINVPPTTVT

AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.1e-2748Show/hide
Query:  TTPISVPANSPLPLTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYPAPSGGVPVVTPVTNPVPVSPPATTNAPAIPG-QSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADC
        T  I+ P      +T P+A         P T P T  P        V       P++ P++ +  A PG QSWCVAR   ++ ALQ+ALDYACG GGADC
Subjt:  TTPISVPANSPLPLTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYPAPSGGVPVVTPVTNPVPVSPPATTNAPAIPG-QSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADC

Query:  SQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTSSNPS
        S+IQ+GG+CYNPN+L+ HASFAFNSY+QKNP P+SC+F G+A+  S++PS
Subjt:  SQIQQGGSCYNPNTLQNHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTSSNPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCAAACAGCTTCCAAATGCATCTTCTTTTCCTTTCTGTCTCTCCTAGCCATCTGCTCTTCTGGTAGATTTGTTGGGTCGTATTTGGAAGTGGAAGAAAATGCTTC
CATGGAGTTGAGATGGGAAGAAGGCCGGAACCGGAAACTCACTGAGCGTGATCGGAGAACAATGCACGACATGACCAACTCGCCGACGACAATTTTTCCGACAACCCCTG
ATACCTCCACACCGACAATCATCACCGTTCCGGCAACCAACCCTGTGACTGTCACTCCGTCGAGCCCGGCTGCGACGCCGGTGTCCGTTCCTCTAACGACGCCCATCTCA
GTTCCGGCCAACTCTCCGTTACCGCTCACCAATCCGGTTGCGCCGCCAATTACAGTACCCGGAGCACAGCCCATAACGAACCCGGTGACCACTTATCCAGCTCCGTCAGG
CGGCGTTCCGGTGGTAACACCCGTCACAAATCCAGTGCCGGTATCCCCTCCGGCAACGACGAACGCGCCGGCGATTCCAGGACAGAGCTGGTGCGTGGCCAGGTCCGGCG
CATCGGAGACGGCTCTTCAGTCGGCGTTGGACTACGCCTGTGGCACTGGAGGAGCTGACTGTTCCCAAATCCAGCAAGGTGGAAGCTGTTACAACCCAAATACACTTCAA
AACCACGCTTCTTTTGCGTTCAATAGCTATTTTCAGAAGAATCCTTCCCCTACAAGCTGCGATTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAGCTCCAATCCAAGCAGTGGCTC
CTGCGTTTATCCATTATCATCCTCTTCTTCGACACCGGCATCGTTGACACCATCGGTTCCAACGCCGACAACGACAGCTCCGATCAATGTCCCGCCAACTACAGTTACAA
ACCCAACAACGTCTTCACCTGCAGGGACCGGCATGCCAGAAAATGGAACTCCTCCGACAGTCTTTAACACAGGCAACCCAGCTTCGAGTATGGGCAGCACAACAGGCTTT
GGAACGGAGATCCCACCAAGCTCAAGCACCTCGATATCCATGGCGGCTGGATTGAGAGTGAGACCCTTTACTTGCTGCATCACTCTGACCATGTCCTTGATCACACGAAG
AATAATTCTGGACTGG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCCAAACAGCTTCCAAATGCATCTTCTTTTCCTTTCTGTCTCTCCTAGCCATCTGCTCTTCTGGTAGATTTGTTGGGTCGTATTTGGAAGTGGAAGAAAATGCTTC
CATGGAGTTGAGATGGGAAGAAGGCCGGAACCGGAAACTCACTGAGCGTGATCGGAGAACAATGCACGACATGACCAACTCGCCGACGACAATTTTTCCGACAACCCCTG
ATACCTCCACACCGACAATCATCACCGTTCCGGCAACCAACCCTGTGACTGTCACTCCGTCGAGCCCGGCTGCGACGCCGGTGTCCGTTCCTCTAACGACGCCCATCTCA
GTTCCGGCCAACTCTCCGTTACCGCTCACCAATCCGGTTGCGCCGCCAATTACAGTACCCGGAGCACAGCCCATAACGAACCCGGTGACCACTTATCCAGCTCCGTCAGG
CGGCGTTCCGGTGGTAACACCCGTCACAAATCCAGTGCCGGTATCCCCTCCGGCAACGACGAACGCGCCGGCGATTCCAGGACAGAGCTGGTGCGTGGCCAGGTCCGGCG
CATCGGAGACGGCTCTTCAGTCGGCGTTGGACTACGCCTGTGGCACTGGAGGAGCTGACTGTTCCCAAATCCAGCAAGGTGGAAGCTGTTACAACCCAAATACACTTCAA
AACCACGCTTCTTTTGCGTTCAATAGCTATTTTCAGAAGAATCCTTCCCCTACAAGCTGCGATTTTGGAGGATCTGCCATGGTTACCAGCTCCAATCCAAGCAGTGGCTC
CTGCGTTTATCCATTATCATCCTCTTCTTCGACACCGGCATCGTTGACACCATCGGTTCCAACGCCGACAACGACAGCTCCGATCAATGTCCCGCCAACTACAGTTACAA
ACCCAACAACGTCTTCACCTGCAGGGACCGGCATGCCAGAAAATGGAACTCCTCCGACAGTCTTTAACACAGGCAACCCAGCTTCGAGTATGGGCAGCACAACAGGCTTT
GGAACGGAGATCCCACCAAGCTCAAGCACCTCGATATCCATGGCGGCTGGATTGAGAGTGAGACCCTTTACTTGCTGCATCACTCTGACCATGTCCTTGATCACACGAAG
AATAATTCTGGACTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAQTASKCIFFSFLSLLAICSSGRFVGSYLEVEENASMELRWEEGRNRKLTERDRRTMHDMTNSPTTIFPTTPDTSTPTIITVPATNPVTVTPSSPAATPVSVPLTTPIS
VPANSPLPLTNPVAPPITVPGAQPITNPVTTYPAPSGGVPVVTPVTNPVPVSPPATTNAPAIPGQSWCVARSGASETALQSALDYACGTGGADCSQIQQGGSCYNPNTLQ
NHASFAFNSYFQKNPSPTSCDFGGSAMVTSSNPSSGSCVYPLSSSSSTPASLTPSVPTPTTTAPINVPPTTVTNPTTSSPAGTGMPENGTPPTVFNTGNPASSMGSTTGF
GTEIPPSSSTSISMAAGLRVRPFTCCITLTMSLITRRIILDW