; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS021588 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS021588
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionSalivary gland secretion protein 4
Genome locationscaffold108:663485..663811
RNA-Seq ExpressionMS021588
SyntenyMS021588
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
MBM3135201.1 hypothetical protein [Chloroflexi bacterium]2.8e-1450.54Show/hide
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MBM3135681.1 hypothetical protein [Chloroflexi bacterium]2.1e-1447Show/hide
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        Q   CR QD G   QD  CR QD GC+ Q    R QD GC+ QD   R QD  CR Q   C+ QD   R QD G   QD  C+ QD  CR QD  C+ QD
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WP_202951377.1 hypothetical protein [Paenibacillus sp. A9]3.8e-1148.62Show/hide
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        QD   R QD
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XP_022143675.1 uncharacterized protein LOC111013520 isoform X1 [Momordica charantia]9.6e-3980.61Show/hide
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XP_022143676.1 uncharacterized protein LOC111013520 isoform X2 [Momordica charantia]9.6e-3980.61Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KB26 Uncharacterized protein4.1e-1140.37Show/hide
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        RYQ+   RYQ    RYQ+    YQ+   RYQ+   RYQ    RYQ+   RYQ+   RYQ+   RYQ    RYQ+   R Q+     Q+   RYQ+   RY
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        Q+   RYQ+
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A0A1D9G9S2 Uncharacterized protein2.2e-0946.34Show/hide
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A0A3B3RJN4 Uncharacterized protein6.7e-1451.9Show/hide
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A0A6J1CPF6 uncharacterized protein LOC111013520 isoform X14.6e-3980.61Show/hide
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A0A6J1CR02 uncharacterized protein LOC111013520 isoform X24.6e-3980.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CGCTACCAGGACCGAGGGTGCCGCTACCAGACCCTAGAGTGCCGCTACCAGGACCGAGGGTACCACTACCAGGACCCCGAGTGCCGCTACCAGGACCGAGGGTGCCGCTA
CCAGATCCTAGAGTGCCGCTACCAGGACCTCGGGTGCCGCTACCAGGACCCAGAGTGCCGCTACCAGGACCTCGAGTGCCGCTACCAGACCCCAGAGTGCCGCTACCAGG
ACCGAGGGTACCGCTGCCAGGACCGAGGGTACCACTGCCAGGACCCCGAGTGCCGCTACCAGGACCGAGGGTGCCGCTACCAGGACCCCGAGTGCCGCTACCAGGAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGCTACCAGGACCGAGGGTGCCGCTACCAGACCCTAGAGTGCCGCTACCAGGACCGAGGGTACCACTACCAGGACCCCGAGTGCCGCTACCAGGACCGAGGGTGCCGCTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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