; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS021613 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS021613
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationscaffold320:113796..117618
RNA-Seq ExpressionMS021613
SyntenyMS021613
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008465320.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]1.9e-14887.86Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MD+AFK S++LPLNK+P+ LIF P PC ISVSQ+KR APMAAL AA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA+TRSLAR+TNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM IKD GVRGL+VPDVP EETE+LRKEAVK+NIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPK+RMK IVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVSGRVQTLL E+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGII+GSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_022155957.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Momordica charantia]1.0e-16599.04Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA TRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQ LL EIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_022932801.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita moschata]5.9e-15089.46Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MD+AFKSS+ LPLNK+P+  I  P PCTISV QSKR AP+AALT ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA+TR+LAR+TNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTI+DAGVRGL+VPDVP EET +LR+EAVKYNIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPKDRMK+IVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQ+LL EIKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADG+IVGSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LE FTKSL+SALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_023528646.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.7e-15089.46Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MD+AFKSS+ LPLNK+P+  I  P PCTISV QSKR AP+AALT ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA+TR+L R+TNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTI+DAGVRGL+VPDVP EET +LR+EAVKYNIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPKDRMK+IVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQ+LL EIKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADG+IVGSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LE FTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_038906368.1 tryptophan synthase alpha chain-like [Benincasa hispida]4.7e-14788.82Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        M +AFKSS   PLNK+PS  IF P PC ISV +SKR APMA L AASP VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA+TRSLAR+TNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYN ILKRGIENF+M IKDAGVRGL+VPDVP EETEILRKEAVKYNIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPKDRMKDI EASEGFVYLVSSVGVTG RTSVSGRVQTLL E+KEVT KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGII+GSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD81 Tryptophan synthase6.6e-14787.22Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MD+AFKSS++LPLNK+P+ LIF P PC ISVSQSKR APMAAL AA P VGLSETF  LREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA+TRSLAR+TNFNAIISMLKGVIPELS P+SLF+YYNPILKRG+ENFMM IKD GVRGL+VPDVP EETE+LRKEAVK+NIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPK+RMK+IVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVS RVQTLL E+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGII+GSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFT+SLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A1S3CNL8 Tryptophan synthase9.2e-14987.86Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MD+AFK S++LPLNK+P+ LIF P PC ISVSQ+KR APMAAL AA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA+TRSLAR+TNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM IKD GVRGL+VPDVP EETE+LRKEAVK+NIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPK+RMK IVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVSGRVQTLL E+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGII+GSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A5D3E2H9 Tryptophan synthase9.2e-14987.86Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MD+AFK S++LPLNK+P+ LIF P PC ISVSQ+KR APMAAL AA P VGLSETF KLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA+TRSLAR+TNFNAIISMLKGVIPELSCP+SLF+YYNPILKRG+ENFMM IKD GVRGL+VPDVP EETE+LRKEAVK+NIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPK+RMK IVEASEGFVYLVSS+GVTG RTSVSGRVQTLL E+KEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADGII+GSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A6J1DQS1 Tryptophan synthase4.9e-16699.04Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA TRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQ LL EIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A6J1EXE2 Tryptophan synthase2.9e-15089.46Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV
        MD+AFKSS+ LPLNK+P+  I  P PCTISV QSKR AP+AALT ASPA GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS CGSDIIELGV
Subjt:  MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAA+TR+LAR+TNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTI+DAGVRGL+VPDVP EET +LR+EAVKYNIELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE
        TTPTTPKDRMK+IVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQ+LL EIKEVT+KPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADG+IVGSAMVKLLGEAQS EEGLKE
Subjt:  TTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKE

Query:  LENFTKSLKSALS
        LE FTKSL+SALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8HPH2 Tryptophan synthase alpha chain2.4e-7754.55Show/hide
Query:  VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSY
        V +S  F+ LR++ + ALIP+ITAGDP L  TA+AL+VL   G+D+IELGVPYSDPLADGP IQAA+TR+L + T  +A++ M+  V P L  P+ LF+Y
Subjt:  VGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSY

Query:  YNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKE
        YNPI  RG+E F+  +  AGV+GL+VPD+P EE + +  +A    IEL LL  PTTP+ R+  I E S+GF+YLVS+ GVTG R+ V GRV  LL E+++
Subjt:  YNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKE

Query:  VTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSALS
        VT KP+ VGFGIS+PEH +QV  WGAD  IVGSA VK L E  + E+GL  + +F +SLK+AL+
Subjt:  VTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSALS

O22765 Tryptophan synthase alpha chain4.9e-11577.29Show/hide
Query:  MAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPE
        M  L   S  VGLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAA+ RSL + TNFN+IISMLK VIP+
Subjt:  MAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPE

Query:  LSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGR
        LSCP++LF+YYNPIL+RG+EN+M  IK+AGV GL+VPDVP EETE LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM  IVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV+ +
Subjt:  LSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGR

Query:  VQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSAL
        VQ+LL +IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE++S E+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  VQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic8.2e-8657.75Show/hide
Query:  QSKRLAPMAALTAASPAV----GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNA
        Q+   AP+    AA+PA      +S+T   L  +GK A IPYITAGDPDL+TTAEAL++L  CG+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA  T  +A
Subjt:  QSKRLAPMAALTAASPAV----GLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNA

Query:  IISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVG
        ++ ML+ V PELSCPV L SYY PI+ R +      +K+AGV GLIVPD+P+     L  EA   N+ELVLLTTP  P+DRMK+I +ASEGFVYLVS  G
Subjt:  IISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVG

Query:  VTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSAL
        VTG R +V+ RV++L+ E+K+VT KPVAVGFGISKPEHVKQ+A WGADG+I+GSAMV+ LGEA S ++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  VTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSAL

Q10W95 Tryptophan synthase alpha chain3.1e-7755.09Show/hide
Query:  VGLSETFNKLR-EQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFS
        + +S+ F  LR    + ALIP+ITAGDPDL TTA+AL+VL   G+++IELGVPYSDPLADGPVIQAA+TRSL R T   +++ +++ V P+L  P+ LF+
Subjt:  VGLSETFNKLR-EQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFS

Query:  YYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIK
        YYNPIL RG+ENF+  I D G RGL+VPD+P EE +IL + A    IEL LL  PT+PK+R+K I   S+GF+YLVS  GVTG R  +  RV+ LL +++
Subjt:  YYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIK

Query:  EVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSALS
        EVT KP+ VGFGIS+PE   QV  WG+D +IVGSA+VK L E  S +EGLK +  F ++LK+A++
Subjt:  EVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSALS

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic1.8e-11769.52Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLL---PLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIE
        M +AFKS       P +++  R   PP+    S    KR  PMA+L+ +SP +GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIE
Subjt:  MDLAFKSSKLL---PLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIE

Query:  LGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIEL
        LGVPYSDPLADGPVIQAA+TRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCP+SLF+YYNPILKRG+  FM +I+  GV+GL+VPDVP EETE+LRKEA+  +IEL
Subjt:  LGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIEL

Query:  VLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEG
        VLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GVTGAR+SVSG+VQ+LL +IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQ+AGWGADG+IVGSAMVKLLG+A+S  EG
Subjt:  VLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEG

Query:  LKELENFTKSLKSAL
        LKELE  TKSLKSAL
Subjt:  LKELENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain1.3e-11869.52Show/hide
Query:  MDLAFKSSKLL---PLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIE
        M +AFKS       P +++  R   PP+    S    KR  PMA+L+ +SP +GL++TF +L++QGKVA IPYITAGDPDLSTTAEALKVL  CGSDIIE
Subjt:  MDLAFKSSKLL---PLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIE

Query:  LGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIEL
        LGVPYSDPLADGPVIQAA+TRSL R TN ++I+ ML  V+P++SCP+SLF+YYNPILKRG+  FM +I+  GV+GL+VPDVP EETE+LRKEA+  +IEL
Subjt:  LGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIEL

Query:  VLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEG
        VLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GVTGAR+SVSG+VQ+LL +IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQ+AGWGADG+IVGSAMVKLLG+A+S  EG
Subjt:  VLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEG

Query:  LKELENFTKSLKSAL
        LKELE  TKSLKSAL
Subjt:  LKELENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein3.5e-11677.29Show/hide
Query:  MAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPE
        M  L   S  VGLSETF +L+ QGKVALIPYITAGDPDLSTTA+ALKVL +CGSDIIELGVPYSDPLADGP IQAA+ RSL + TNFN+IISMLK VIP+
Subjt:  MAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPE

Query:  LSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGR
        LSCP++LF+YYNPIL+RG+EN+M  IK+AGV GL+VPDVP EETE LR EA K+ IELVLLTTPTTPK+RM  IVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV+ +
Subjt:  LSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGFVYLVSSVGVTGARTSVSGR

Query:  VQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSAL
        VQ+LL +IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQVA WGADG+IVGSAMVK+LGE++S E+GLKELE FTKSLKSAL
Subjt:  VQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTTGCTTTCAAATCTTCGAAGTTACTTCCCCTCAACAAGATGCCCTCTAGGCTCATCTTCCCTCCAAATCCTTGTACGATTTCAGTCTCGCAATCCAAGCGCTT
GGCTCCAATGGCTGCCCTTACTGCAGCCTCCCCTGCCGTTGGACTGTCTGAAACATTCAACAAGTTGAGAGAACAGGGCAAGGTCGCATTGATCCCCTACATCACTGCTG
GTGATCCTGATCTGTCGACCACAGCAGAAGCATTGAAGGTGCTTTCCAACTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCT
GTTATACAGGCTGCATCTACTCGGTCCTTGGCTAGGCAGACAAACTTTAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAGCTATCTTGTCCAGTTTCTCTTTT
TTCATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGCATTGAGAACTTCATGATGACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTATTGTTCCAGATGTTCCTTTTGAGGAGACTG
AAATTTTAAGAAAGGAAGCTGTAAAGTACAATATTGAACTGGTACTGTTAACTACACCAACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGACATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTT
GTATATCTTGTGAGCTCAGTTGGAGTTACCGGTGCTCGGACATCGGTGAGTGGTAGAGTTCAAACTCTCCTGGGGGAAATTAAAGAGGTTACGAAGAAACCAGTAGCAGT
TGGGTTCGGTATATCGAAACCGGAGCACGTGAAACAGGTGGCTGGGTGGGGGGCAGATGGGATCATTGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAATCTT
CAGAGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTCTCT
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCTTGCTTTCAAATCTTCGAAGTTACTTCCCCTCAACAAGATGCCCTCTAGGCTCATCTTCCCTCCAAATCCTTGTACGATTTCAGTCTCGCAATCCAAGCGCTT
GGCTCCAATGGCTGCCCTTACTGCAGCCTCCCCTGCCGTTGGACTGTCTGAAACATTCAACAAGTTGAGAGAACAGGGCAAGGTCGCATTGATCCCCTACATCACTGCTG
GTGATCCTGATCTGTCGACCACAGCAGAAGCATTGAAGGTGCTTTCCAACTGTGGATCAGATATAATTGAACTTGGTGTTCCATATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCT
GTTATACAGGCTGCATCTACTCGGTCCTTGGCTAGGCAGACAAACTTTAATGCAATCATTTCTATGCTGAAGGGGGTGATTCCTGAGCTATCTTGTCCAGTTTCTCTTTT
TTCATATTATAACCCAATTCTTAAACGTGGCATTGAGAACTTCATGATGACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTATTGTTCCAGATGTTCCTTTTGAGGAGACTG
AAATTTTAAGAAAGGAAGCTGTAAAGTACAATATTGAACTGGTACTGTTAACTACACCAACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGACATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTT
GTATATCTTGTGAGCTCAGTTGGAGTTACCGGTGCTCGGACATCGGTGAGTGGTAGAGTTCAAACTCTCCTGGGGGAAATTAAAGAGGTTACGAAGAAACCAGTAGCAGT
TGGGTTCGGTATATCGAAACCGGAGCACGTGAAACAGGTGGCTGGGTGGGGGGCAGATGGGATCATTGTTGGTAGTGCTATGGTGAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAATCTT
CAGAGGAAGGATTGAAGGAGCTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCACTCTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLAFKSSKLLPLNKMPSRLIFPPNPCTISVSQSKRLAPMAALTAASPAVGLSETFNKLREQGKVALIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNCGSDIIELGVPYSDPLADGP
VIQAASTRSLARQTNFNAIISMLKGVIPELSCPVSLFSYYNPILKRGIENFMMTIKDAGVRGLIVPDVPFEETEILRKEAVKYNIELVLLTTPTTPKDRMKDIVEASEGF
VYLVSSVGVTGARTSVSGRVQTLLGEIKEVTKKPVAVGFGISKPEHVKQVAGWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSSEEGLKELENFTKSLKSALS