; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS021676 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS021676
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionS5A_REDUCTASE domain-containing protein
Genome locationscaffold348:254025..256990
RNA-Seq ExpressionMS021676
SyntenyMS021676
Gene Ontology termsGO:0006629 - lipid metabolic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016627 - oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors (molecular function)
InterPro domainsIPR001104 - 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, C-terminal
IPR010721 - Protein of unknown function DUF1295


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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AT1G18180.1 Protein of unknown function (DUF1295)4.8e-12167.95Show/hide
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AT1G73650.1 Protein of unknown function (DUF1295)2.9e-8666.52Show/hide
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          P   YG+LP WFK +FLFEFPFYSRNLP
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AT1G73650.2 Protein of unknown function (DUF1295)2.1e-12470.83Show/hide
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        + +L IFW                           +QAVWVWTVSLP+T+VNAS+   SL+PADVIGW MW  G +IEA ADQQKL+FKNS ENRGKWC+
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Query:  VGLWKVSRHPNYFGEILLWWGIFVASTPVLEDAEWLVIFGPIFLTLLLLFVSGIPLLEESADKKFGTVTEYVLYKRMTSPLIPLPTATYGSLPSWFKKIF
        VG+WK SRHPNYFGE+LLWWGIFVA++PVLE AE+LVIFGP+FLTLLLLFVSGIPLLE SADKK G    Y  YK+ TSPLI  P   YG+LP WFK +F
Subjt:  VGLWKVSRHPNYFGEILLWWGIFVASTPVLEDAEWLVIFGPIFLTLLLLFVSGIPLLEESADKKFGTVTEYVLYKRMTSPLIPLPTATYGSLPSWFKKIF

Query:  LFEFPFYSRNLP
        LFEFPFYSRNLP
Subjt:  LFEFPFYSRNLP

AT1G73650.3 Protein of unknown function (DUF1295)2.1e-12470.83Show/hide
Query:  MGTVIDSHFLALTAIVTIGYQLLFFAITALLKFDKVTDFAGSTNFVILAVLTLVLKGSWHFRQVVLSLLVVAWGLRLAFFLLMRILQWGEDRRFDEMRSN
        MGTV+DSHFLALTAIVT+ YQ +FF ITAL KFD+VTDFAGSTNFVILAVLTLVLK SWHFRQ+VL+LLVV WGLRL  FLLMRILQWGEDRRFDE R N
Subjt:  MGTVIDSHFLALTAIVTIGYQLLFFAITALLKFDKVTDFAGSTNFVILAVLTLVLKGSWHFRQVVLSLLVVAWGLRLAFFLLMRILQWGEDRRFDEMRSN

Query:  LGKLAIFWIFQVDWIILLKFHFAFLEVISSSPFHLIQAVWVWTVSLPVTVVNASNHNPSLRPADVIGWIMWFVGVVIEAMADQQKLAFKNSSENRGKWCN
        + +L IFW                           +QAVWVWTVSLP+T+VNAS+   SL+PADVIGW MW  G +IEA ADQQKL+FKNS ENRGKWC+
Subjt:  LGKLAIFWIFQVDWIILLKFHFAFLEVISSSPFHLIQAVWVWTVSLPVTVVNASNHNPSLRPADVIGWIMWFVGVVIEAMADQQKLAFKNSSENRGKWCN

Query:  VGLWKVSRHPNYFGEILLWWGIFVASTPVLEDAEWLVIFGPIFLTLLLLFVSGIPLLEESADKKFGTVTEYVLYKRMTSPLIPLPTATYGSLPSWFKKIF
        VG+WK SRHPNYFGE+LLWWGIFVA++PVLE AE+LVIFGP+FLTLLLLFVSGIPLLE SADKK G    Y  YK+ TSPLI  P   YG+LP WFK +F
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Query:  LFEFPFYSRNLP
        LFEFPFYSRNLP
Subjt:  LFEFPFYSRNLP

AT1G73650.4 Protein of unknown function (DUF1295)2.9e-8666.52Show/hide
Query:  MRILQWGEDRRFDEMRSNLGKLAIFWIFQVDWIILLKFHFAFLEVISSSPFHLIQAVWVWTVSLPVTVVNASNHNPSLRPADVIGWIMWFVGVVIEAMAD
        MRILQWGEDRRFDE R N+ +L IFW                           +QAVWVWTVSLP+T+VNAS+   SL+PADVIGW MW  G +IEA AD
Subjt:  MRILQWGEDRRFDEMRSNLGKLAIFWIFQVDWIILLKFHFAFLEVISSSPFHLIQAVWVWTVSLPVTVVNASNHNPSLRPADVIGWIMWFVGVVIEAMAD

Query:  QQKLAFKNSSENRGKWCNVGLWKVSRHPNYFGEILLWWGIFVASTPVLEDAEWLVIFGPIFLTLLLLFVSGIPLLEESADKKFGTVTEYVLYKRMTSPLI
        QQKL+FKNS ENRGKWC+VG+WK SRHPNYFGE+LLWWGIFVA++PVLE AE+LVIFGP+FLTLLLLFVSGIPLLE SADKK G    Y  YK+ TSPLI
Subjt:  QQKLAFKNSSENRGKWCNVGLWKVSRHPNYFGEILLWWGIFVASTPVLEDAEWLVIFGPIFLTLLLLFVSGIPLLEESADKKFGTVTEYVLYKRMTSPLI

Query:  PLPTATYGSLPSWFKKIFLFEFPFYSRNLP
          P   YG+LP WFK +FLFEFPFYSRNLP
Subjt:  PLPTATYGSLPSWFKKIFLFEFPFYSRNLP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAACTGTGATCGATTCCCATTTCTTGGCGCTCACTGCCATCGTCACTATTGGGTATCAACTACTGTTCTTTGCAATCACAGCTCTTCTCAAGTTTGACAAGGTCAC
CGATTTTGCAGGTAGCACGAATTTTGTCATACTAGCTGTTTTGACTCTAGTTCTTAAGGGCAGCTGGCATTTCAGACAGGTTGTTCTGTCTTTGCTTGTAGTAGCATGGG
GTCTTCGCCTTGCTTTTTTCTTGTTGATGAGGATTTTGCAGTGGGGAGAGGATCGGCGTTTTGATGAAATGCGTAGTAATTTGGGAAAATTAGCAATTTTCTGGATTTTT
CAGGTGGATTGGATTATTCTTTTAAAATTTCATTTTGCCTTCCTCGAGGTCATTTCTAGCTCACCATTTCATTTAATTCAGGCTGTCTGGGTCTGGACTGTAAGTTTACC
TGTCACAGTGGTCAATGCAAGCAATCACAATCCATCTCTCCGACCTGCAGACGTAATTGGGTGGATTATGTGGTTTGTGGGTGTTGTAATTGAAGCTATGGCTGATCAAC
AAAAATTGGCATTTAAGAACTCTTCAGAAAATAGGGGGAAGTGGTGCAATGTTGGACTTTGGAAGGTTTCTCGTCATCCTAATTACTTTGGTGAGATCTTGCTTTGGTGG
GGAATCTTCGTTGCTTCCACACCCGTTCTTGAAGATGCTGAGTGGCTTGTGATATTTGGGCCAATATTCCTCACATTGTTGCTTCTTTTTGTCAGTGGGATTCCACTACT
GGAGGAATCAGCAGATAAGAAGTTTGGGACTGTGACCGAATACGTGCTTTATAAAAGAATGACTAGCCCCCTGATCCCACTGCCTACAGCTACATATGGAAGCCTGCCCT
CATGGTTCAAGAAAATTTTTCTATTTGAATTTCCTTTTTACAGCCGCAATCTTCCCTTGGACGACCAAAAC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAACTGTGATCGATTCCCATTTCTTGGCGCTCACTGCCATCGTCACTATTGGGTATCAACTACTGTTCTTTGCAATCACAGCTCTTCTCAAGTTTGACAAGGTCAC
CGATTTTGCAGGTAGCACGAATTTTGTCATACTAGCTGTTTTGACTCTAGTTCTTAAGGGCAGCTGGCATTTCAGACAGGTTGTTCTGTCTTTGCTTGTAGTAGCATGGG
GTCTTCGCCTTGCTTTTTTCTTGTTGATGAGGATTTTGCAGTGGGGAGAGGATCGGCGTTTTGATGAAATGCGTAGTAATTTGGGAAAATTAGCAATTTTCTGGATTTTT
CAGGTGGATTGGATTATTCTTTTAAAATTTCATTTTGCCTTCCTCGAGGTCATTTCTAGCTCACCATTTCATTTAATTCAGGCTGTCTGGGTCTGGACTGTAAGTTTACC
TGTCACAGTGGTCAATGCAAGCAATCACAATCCATCTCTCCGACCTGCAGACGTAATTGGGTGGATTATGTGGTTTGTGGGTGTTGTAATTGAAGCTATGGCTGATCAAC
AAAAATTGGCATTTAAGAACTCTTCAGAAAATAGGGGGAAGTGGTGCAATGTTGGACTTTGGAAGGTTTCTCGTCATCCTAATTACTTTGGTGAGATCTTGCTTTGGTGG
GGAATCTTCGTTGCTTCCACACCCGTTCTTGAAGATGCTGAGTGGCTTGTGATATTTGGGCCAATATTCCTCACATTGTTGCTTCTTTTTGTCAGTGGGATTCCACTACT
GGAGGAATCAGCAGATAAGAAGTTTGGGACTGTGACCGAATACGTGCTTTATAAAAGAATGACTAGCCCCCTGATCCCACTGCCTACAGCTACATATGGAAGCCTGCCCT
CATGGTTCAAGAAAATTTTTCTATTTGAATTTCCTTTTTACAGCCGCAATCTTCCCTTGGACGACCAAAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGTVIDSHFLALTAIVTIGYQLLFFAITALLKFDKVTDFAGSTNFVILAVLTLVLKGSWHFRQVVLSLLVVAWGLRLAFFLLMRILQWGEDRRFDEMRSNLGKLAIFWIF
QVDWIILLKFHFAFLEVISSSPFHLIQAVWVWTVSLPVTVVNASNHNPSLRPADVIGWIMWFVGVVIEAMADQQKLAFKNSSENRGKWCNVGLWKVSRHPNYFGEILLWW
GIFVASTPVLEDAEWLVIFGPIFLTLLLLFVSGIPLLEESADKKFGTVTEYVLYKRMTSPLIPLPTATYGSLPSWFKKIFLFEFPFYSRNLPLDDQN