; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS022056 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS022056
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationscaffold47:326966..329376
RNA-Seq ExpressionMS022056
SyntenyMS022056
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-10096.72Show/hide
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XP_022931623.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita moschata]1.1e-10096.72Show/hide
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XP_023530137.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-10197.27Show/hide
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XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]1.0e-10197.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K481 UBC core domain-containing protein1.6e-10096.72Show/hide
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A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.6e-10096.72Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.2e-103100Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like5.5e-10196.72Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like5.5e-10196.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.7e-6563.93Show/hide
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        MIKLF +K++++E       K   KK SA +LR+QKDI+ELNLPKTC ISF +  DDL+NF++ I PDEG+Y  G F+FSF+V   YPH+PPKVKC+T V
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.6e-6563.93Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.6e-6563.93Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc122.1e-8985.87Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like8.2e-8682.7Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein5.8e-8782.7Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 112.4e-2438.52Show/hide
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         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
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AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 112.4e-2438.52Show/hide
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         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 11.5e-9085.87Show/hide
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        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPKLFE+NVRRAM GGYVGQTFF RC+
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 11.5e-9085.87Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTAAGCTTTTTAAGGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGGAAACCCCCTGTCAAGAAGCAAAGTGCAGGAGAGTTGCGTCTTCAAAAAGA
TATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAG
GTGGTACGTTTCTATTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAAGGTGTATCATCCTAATATTGACTTGGAAGGAAAT
GTCTGCCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTATTTCATCTTTTCACGCAACCAAATCATGAAGATCCCCTCAA
TCATGATGCCGCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCCAAGTTGTTCGAATCCAATGTGAGAAGAGCCATGGCTGGGGGCTACGTTGGGCAGACTTTCTTCACACGTTGCATG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATTAAGCTTTTTAAGGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATTGCAGAGAATGCCAATGGGAAACCCCCTGTCAAGAAGCAAAGTGCAGGAGAGTTGCGTCTTCAAAAAGA
TATCAGTGAATTGAACCTACCGAAAACGTGTAGTATATCATTTCCTAATGGCAAGGATGACTTGATGAACTTTGAGGTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VCLNILREDWKPVLNINTIIYGLFHLFTQPNHEDPLNHDAAAVLRDNPKLFESNVRRAMAGGYVGQTFFTRCM