; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS022333 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS022333
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionCalcium-binding EF-hand family protein
Genome locationscaffold47:2628127..2628540
RNA-Seq ExpressionMS022333
SyntenyMS022333
Gene Ontology termsGO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647336.1 hypothetical protein Csa_003380 [Cucumis sativus]6.2e-5988.32Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVED+ AF AFIRDRFAHLDTN DGLLSY+EML EL +LRVFE HFGIDVKPDPDELS+VYSSLFLQFD DSSG VDLDEF+AETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA
        MMLA ANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET I AA
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA

XP_008449396.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491294 [Cucumis melo]5.6e-6089.05Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVED+ AF AFIRDRFAHLDTNHDGLLSY+EML EL +LRVFE HFGIDVKPDP+ELS+VYSSLFLQFDHDSSG VDLDEFKAETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA
        MML  ANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET I AA
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA

XP_011657544.1 uncharacterized protein LOC105435869 [Cucumis sativus]6.2e-5988.32Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVED+ AF AFIRDRFAHLDTN DGLLSY+EML EL +LRVFE HFGIDVKPDPDELS+VYSSLFLQFD DSSG VDLDEF+AETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA
        MMLA ANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET I AA
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA

XP_022135623.1 uncharacterized protein LOC111007532 [Momordica charantia]6.6e-69100Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAAS
        MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAAS
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAAS

XP_038888297.1 uncharacterized protein LOC120078146 [Benincasa hispida]5.6e-6089.78Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVED+ AF AFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEML EL +LRVFE HFGIDVKPDPDELS+VYSSLFLQFD DSSG VDLDEF AETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA
        MML  ANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET IMAA
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHT7 Uncharacterized protein3.0e-5988.32Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVED+ AF AFIRDRFAHLDTN DGLLSY+EML EL +LRVFE HFGIDVKPDPDELS+VYSSLFLQFD DSSG VDLDEF+AETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA
        MMLA ANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET I AA
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA

A0A1S3BLY5 uncharacterized protein LOC1034912942.7e-6089.05Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVED+ AF AFIRDRFAHLDTNHDGLLSY+EML EL +LRVFE HFGIDVKPDP+ELS+VYSSLFLQFDHDSSG VDLDEFKAETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA
        MML  ANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET I AA
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA

A0A5D3E445 Calcium-binding EF-hand family protein2.7e-6089.05Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVED+ AF AFIRDRFAHLDTNHDGLLSY+EML EL +LRVFE HFGIDVKPDP+ELS+VYSSLFLQFDHDSSG VDLDEFKAETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA
        MML  ANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET I AA
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAA

A0A6J1C5B4 uncharacterized protein LOC1110075323.2e-69100Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAAS
        MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAAS
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAAS

A0A6J1JN55 uncharacterized protein LOC1114861981.8e-5686.67Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        MSVEILDSATIVNFVEDEAAF AFI DRFAHLDTNHDGLLSY+EML+ELQSLRV E  FGIDVKPDPDELS+VYSS+FLQFD +SSG VDLDEFKAE KR
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIM
        MMLA ANG+G LPVQMVLEEGSFLMKAVERE  IM
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G54530.1 Calcium-binding EF hand family protein2.8e-0930.47Show/hide
Query:  ILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKRMMLA
        ++ S T++ F+ D  +F++   D F  LD + +G+LS +E+ + L ++   E     +V P  DE   VY+++F +F  D   K     F+     ++ A
Subjt:  ILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKRMMLA

Query:  TANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET
         A G+G  PV MV+     +MKAV  E+
Subjt:  TANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAVERET

AT2G44310.1 Calcium-binding EF-hand family protein7.1e-2944.44Show/hide
Query:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR
        M V ++D +T+ +FV+DE  F   + +RFA LD N DG+LS +E+ +  +S+R+ E HFG+DV    DEL+ +Y S+F +FD D SG VDL+EF++E K+
Subjt:  MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKR

Query:  MMLATANGMGFLPVQMVL--EEGSFLMKAVERETT
        ++LA A+G+G  P+ MVL  ++ +FL KA + E +
Subjt:  MMLATANGMGFLPVQMVL--EEGSFLMKAVERETT

AT4G38810.2 Calcium-binding EF-hand family protein2.5e-1029.6Show/hide
Query:  EILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKRMML
        ++LD + IV  VE+E  FD F+  +F  LD + DG LS TE+   +  +       G+  +    +   +YS +  +F H S  KV   EFK     ++L
Subjt:  EILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKRMML

Query:  ATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAV
          A G+   P+ ++  +G  L + V
Subjt:  ATANGMGFLPVQMVLEEGSFLMKAV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGTGGAAATATTGGACAGTGCCACCATTGTCAACTTCGTCGAAGATGAGGCGGCCTTTGATGCCTTCATCAGAGACCGTTTTGCTCACCTCGACACCAACCATGA
CGGTCTCCTTTCCTACACTGAGATGTTGAGGGAGTTACAGAGTCTCAGAGTCTTCGAGATCCATTTCGGAATCGATGTGAAGCCTGATCCAGATGAGCTTTCTACTGTCT
ATAGTTCTCTGTTTTTGCAGTTTGATCATGACTCGAGTGGAAAGGTTGATCTTGATGAGTTTAAGGCTGAGACCAAGAGGATGATGCTGGCTACGGCTAATGGGATGGGA
TTCTTGCCTGTTCAGATGGTGCTAGAAGAGGGCAGCTTCTTGATGAAGGCTGTTGAGAGAGAAACCACCATAATGGCTGCTTCA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTGTGGAAATATTGGACAGTGCCACCATTGTCAACTTCGTCGAAGATGAGGCGGCCTTTGATGCCTTCATCAGAGACCGTTTTGCTCACCTCGACACCAACCATGA
CGGTCTCCTTTCCTACACTGAGATGTTGAGGGAGTTACAGAGTCTCAGAGTCTTCGAGATCCATTTCGGAATCGATGTGAAGCCTGATCCAGATGAGCTTTCTACTGTCT
ATAGTTCTCTGTTTTTGCAGTTTGATCATGACTCGAGTGGAAAGGTTGATCTTGATGAGTTTAAGGCTGAGACCAAGAGGATGATGCTGGCTACGGCTAATGGGATGGGA
TTCTTGCCTGTTCAGATGGTGCTAGAAGAGGGCAGCTTCTTGATGAAGGCTGTTGAGAGAGAAACCACCATAATGGCTGCTTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVEILDSATIVNFVEDEAAFDAFIRDRFAHLDTNHDGLLSYTEMLRELQSLRVFEIHFGIDVKPDPDELSTVYSSLFLQFDHDSSGKVDLDEFKAETKRMMLATANGMG
FLPVQMVLEEGSFLMKAVERETTIMAAS