; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS022475 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS022475
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionmultiprotein bridging factor 1B
Genome locationscaffold47:3671041..3673595
RNA-Seq ExpressionMS022475
SyntenyMS022475
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572392.1 Sec1 family domain-containing protein MIP3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-6495.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_022148069.1 multiprotein-bridging factor 1a [Momordica charantia]5.4e-66100Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_022952433.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita moschata]2.9e-6495.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_023532017.1 multiprotein-bridging factor 1a [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-6496.48Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_038888605.1 multiprotein-bridging factor 1b [Benincasa hispida]3.8e-6496.48Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENL HDRVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D2X2 multiprotein-bridging factor 1a2.6e-66100Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1EWB8 multiprotein-bridging factor 1a4.1e-6495.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1GKJ7 multiprotein-bridging factor 1b-like1.4e-6495.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1HZG6 multiprotein-bridging factor 1b-like5.4e-6495.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIET +KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1JEK2 multiprotein-bridging factor 1a4.1e-6495.77Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+H++VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5ZMC0 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog2.7e-2857.14Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P+AA  K ++AV AA+R G ++ET KK  AG NK      + NT KLD ETE L HDRVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        PQVI +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q6GPQ6 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog1.2e-2856.39Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P AA  K ++A+ AA+R G E+ET KK +AG NK    + + NT KLD ETE L HDRVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        PQVI +YE GKAIPN Q++ K+ER +G KLRGK
Subjt:  PQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q9LV58 Multiprotein-bridging factor 1c1.1e-2949.64Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R+G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    DRV  E++  I +AR +KK++Q+ LA
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        + INE+ QV+QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b4.6e-6085.92Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARRSGA+IET++K NAG+NKAASS TSLNT+KLDD+TENL+HDRVPTELKKAIMQAR +KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LA LINEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a2.7e-6086.62Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARRSGA+IET++K NAGTNKAASS TSLNT+ LDD+TENLTH+RVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A1.9e-6186.62Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARRSGA+IET++K NAGTNKAASS TSLNT+ LDD+TENLTH+RVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQ+INEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C7.8e-3149.64Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R+G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    DRV  E++  I +AR +KK++Q+ LA
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        + INE+ QV+QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C4.0e-1142.7Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQAR
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R+G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    DRV  E++  + + R
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQAR

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B3.2e-6185.92Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARRSGA+IET++K NAG+NKAASS TSLNT+KLDD+TENL+HDRVPTELKKAIMQAR +KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LA LINEKPQVIQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQVIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGGGATTGGACCGATTTCACAGGATTGGGAACCCGTTGTCATCAGGAAGAAGGCACCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAAGCCGTAAACGCTGCTCGCCG
CTCCGGCGCCGAGATCGAAACCTTAAAGAAATCTAATGCTGGGACAAACAAAGCTGCTTCAAGCAGTACTAGTTTGAATACCAGGAAGTTGGATGATGAGACAGAAAATC
TTACTCATGATCGGGTACCAACTGAGCTGAAGAAGGCAATTATGCAGGCCCGTACCGACAAGAAGCTTACGCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATTAATGAGAAGCCACAA
GTGATTCAGGAGTATGAGTCTGGGAAAGCCATTCCAAATCAACAAATAATTACCAAGCTTGAGAGAGCTCTTGGAACTAAACTTCGTGGAAAAAAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTGGGATTGGACCGATTTCACAGGATTGGGAACCCGTTGTCATCAGGAAGAAGGCACCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAAGCCGTAAACGCTGCTCGCCG
CTCCGGCGCCGAGATCGAAACCTTAAAGAAATCTAATGCTGGGACAAACAAAGCTGCTTCAAGCAGTACTAGTTTGAATACCAGGAAGTTGGATGATGAGACAGAAAATC
TTACTCATGATCGGGTACCAACTGAGCTGAAGAAGGCAATTATGCAGGCCCGTACCGACAAGAAGCTTACGCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATTAATGAGAAGCCACAA
GTGATTCAGGAGTATGAGTCTGGGAAAGCCATTCCAAATCAACAAATAATTACCAAGCTTGAGAGAGCTCTTGGAACTAAACTTCGTGGAAAAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRSGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHDRVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEKPQ
VIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK