; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS022812 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS022812
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionNADH dehydrogenase subunit 7
Genome locationscaffold29:61179..68923
RNA-Seq ExpressionMS022812
SyntenyMS022812
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0016651 - oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H (molecular function)
GO:0048038 - quinone binding (molecular function)
GO:0051287 - NAD binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001135 - NADH-quinone oxidoreductase, subunit D
IPR022885 - NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H
IPR029014 - [NiFe]-hydrogenase, large subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AEK01290.1 nad7 [Arabidopsis thaliana]1.3e-16893.19Show/hide
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PHT56427.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2 [Capsicum baccatum]2.0e-16995.61Show/hide
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QUV77366.1 NADH dehydrogenase subunit 7 [Markhamia cauda-felina]3.8e-16893.52Show/hide
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QUV77438.1 NADH dehydrogenase subunit 7 [Dolichandrone spathacea]3.8e-16893.52Show/hide
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A0A2G2XG25 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 29.7e-17095.61Show/hide
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A0A7D5Y489 NADH dehydrogenase subunit 71.8e-16893.81Show/hide
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G3EIY0 NADH dehydrogenase subunit 75.3e-16893.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O21270 NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit8.5e-13169.85Show/hide
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P93306 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 25.7e-15988.89Show/hide
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Q36450 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 29.6e-16791.64Show/hide
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Q37619 NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit4.8e-12668.71Show/hide
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        YVS M QEHA+S AVE+LLN   ++PLRAQYIRVLF EITRI NH LA+T HAMDVGA TPFLW FEEREKL+EFYERVSGARMHA++IRPGGVA DLPL
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Query:  GLCRDIDSFTQQFASRIDELEEMSTGNRIWKQRLVDIGTVTAQQAKDWGFSGVMLRGR-VCWDLRRAAPYDVHDQLDLDVPVGTRGDRYDRYCIRIEEMR
        GLC DI  F++QFASRIDE+EEM T NRIWKQRLVD+G V+A+QA DW FSGV+LRG  + WDLR+  PY+V+D++  ++PVGTRGD YDRY IR++EMR
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        +S+RI++Q +N+M  G+I+ DD    P        S+ S  IHHF+ YT GF VPA  TYTAVEAPKGEFGV+LVSNG+++PYR KIRAPG AH QGLD 
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        M+++HM ADVVTIIGTQDIV GEVDR
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Q9TC96 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 21.2e-13273.77Show/hide
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        YVS M QEHA+S AVE+LL+CEVP RAQYIRVLF EITRI NH LALTTHAMDVGA TPFLWAFEEREKL+EFYERVSG+RMHA++IRPGGVA DLP  L
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        C DI  F QQFASRIDE+EEM T NRIWKQRLVDIG VTA+ A  WGFSGV+LRG  V WDLR+  PYDV++++  DVPVGT+GD YDRY  R+EEMRQS
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        + II+QCLNQ+P GMIKADD  ++T  S S    S    IHHF+L+TEG++VP S TYT+VEAPKGEFGV+LVSNG+NRPYR KIRAPG  H QGLD MS
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        K+HM ADVVTIIGTQDIV GEVDR
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01110.1 NAD(P)H dehydrogenase subunit H2.1e-5536.02Show/hide
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        Y++TM  E    +  E+L N +VP RA YIRV+  E++RI++H L L     D+GA TPF + F ERE + + +E  +G RM  +F R GG+A DLP G 
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              F   F + + E +++ T N I+ +R+  +G +  ++A +WG SG MLR   + WDLR+   Y+ +D+ + ++    +GD   RY +R+ EM +S
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        ++II Q L  +P G  +  +        +  ++   + F  +  +  F +     Y  VEAPKGE G+FL+ + S  P+R KIR PG  + Q L  + K 
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           AD++TI+G+ DI+ GEVDR
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ATMG00510.1 NADH dehydrogenase subunit 72.1e-16992.59Show/hide
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        YVS MAQEHAHSSAVE+LLNCEVPLRAQYIRVLFREITRISNHSLALTTHAMDVGA TPFLWAFEEREKLLEFYERVSGARMHASFIRPGGVAQDLPLGL
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        CRDIDSFTQQFASRIDELEEMSTGNRIWKQRLVDIGTVTAQQAKDWGFSGVMLRG  VCWD RRAAPYDVHDQ DLDVPVGTRGDRYDRYCIRIEEMRQS
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Query:  VRIIVQCLNQMPSGMIKADD----PGQMTTGSSSVYSTSIHHFELYTEGFSVPASSTYTAVEAPKGEFGVFLVSNGSNRPYRRKIRAPGSAHSQGLDSMS
        +RIIVQCLNQMPSGMIKADD    P        S+ S SIHHFELYTEGFSVPASSTYTAVEAPKGEFGVFLVSNGSNRPYRRKIRAPGSAHSQGLDSMS
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        KHHMPADVVTIIGTQDIV GEVDR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AACTCGAATTTCAAATCATTCACTTGCTTTAACTACTCATGCTATGGATGTGGGAGCATCAACTCCGTTCCTGTGGGCTTTTGAGGAGCGGGAGAAATTATTGGAATTCT
ATGAAAGAGTCTCGGGAGCCAGGATGCATGCCAGTTTCATACGACCAGGTGGAGTGGCACAAGATCTGCCTCTTGGCTTATGTCGAGATATTGATTCCTTCACACAACAA
TTTGCTTCTCGTATCGACGAATTAGAAGAGATGTCAACCGGCAACCGTATCTGGAAACAACGATTAGTGGATATTGGTACTGTCACTGCACAGCAAGCAAAGGATTGGGG
ATTCAGTGGTGTAATGTTAAGAGGTCGGGTATGCTGGGATTTGCGAAGAGCAGCACCTTACGATGTTCATGACCAATTGGATCTTGACGTACCAGTAGGTACCAGAGGAG
ATCGCTATGATCGTTACTGTATCCGTATCGAAGAGATGCGACAAAGTGTTCGGATCATTGTGCAATGTCTTAATCAAATGCCTAGTGGCATGATCAAAGCCGATGATCCC
GGCCAAATGACTACAGGATCATCATCGGTCTACTCTACCTCAATTCACCATTTCGAACTTTATACAGAAGGTTTTTCCGTACCAGCTTCTTCTACCTATACCGCAGTGGA
AGCACCTAAAGGTGAATTTGGTGTCTTTCTGGTCAGTAATGGAAGCAATCGTCCCTACCGTCGTAAAATAAGAGCACCTGGCTCTGCCCATTCACAAGGACTCGATTCTA
TGTCCAAACATCACATGCCAGCAGATGTGGTCACCATCATAGGTACTCAAGATATTGTGTCTGGAGAGGTAGATAGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATTCAGTGGTGTAATGTTAAGAGGTCGGGTATGCTGGGATTTGCGAAGAGCAGCACCTTACGATGTTCATGACCAATTGGATCTTGACGTACCAGTAGGTACCAGAGGAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
YVSTMAQEHAHSSAVERLLNCEVPLRAQYIRVLFREITRISNHSLALTTHAMDVGASTPFLWAFEEREKLLEFYERVSGARMHASFIRPGGVAQDLPLGLCRDIDSFTQQ
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GQMTTGSSSVYSTSIHHFELYTEGFSVPASSTYTAVEAPKGEFGVFLVSNGSNRPYRRKIRAPGSAHSQGLDSMSKHHMPADVVTIIGTQDIVSGEVDR