; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS022887 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS022887
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
Genome locationscaffold29:334995..335348
RNA-Seq ExpressionMS022887
SyntenyMS022887
Gene Ontology termsGO:0022900 - electron transport chain (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031966 - mitochondrial membrane (cellular component)
GO:0070469 - respirasome (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
GO:0048038 - quinone binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000440 - NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3
IPR038430 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AEN56123.1 NADH dehydrogenase subunit 3 [Cucumis melo subsp. melo]1.4e-5998.31Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLG+PFPFASNS+TYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

XP_038902187.1 LOW QUALITY PROTEIN: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3-like [Benincasa hispida]2.0e-5897.46Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPS DARSRFD +FYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

YP_004849330.1 NADH dehydrogenase subunit 3 [Cucumis sativus]1.4e-5998.31Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLG+PFPF+SNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

YP_009694647.1 NADH dehydrogenase subunit 3 [Prunus avium]7.6e-5897.46Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDP GDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKID FGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIG LYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

YP_009913613.1 NADH dehydrogenase subunit 3 [Luffa acutangula]2.8e-60100Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0B4L2A3 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 (Fragment)3.7e-5897.46Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDP GDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKID FGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIG LYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

A0A3Q9CSW0 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 36.7e-6098.31Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLG+PFPFASNS+TYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

A0A7D5XZ34 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 31.4e-60100Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

G3EIY2 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 36.7e-6098.31Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLG+PFPF+SNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

G3EU38 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 36.7e-6098.31Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLG+PFPFASNS+TYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O99869 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 39.7e-5691.53Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLG+PF F+SNSSTYPEK SAYECG DPSGDARSR DIRFYLVSILFII DPEVTFSFPWAVP NKID FGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIG LYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

P27062 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 32.7e-5894.92Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVIS LVSLIPLGVPFPFASNSSTYP+KLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFII DPEVTFSFPWAVP NKID FGSWSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIG LYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

P60159 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 31.0e-5289.83Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        M EFAPICIYLVIS LVSLI LGVPF FASNSSTYPEKLSAYECGFDP GDARSRFDIRFYLVSILFII D EVTF FPWAV LNKIDLFG WSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGA D E
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

P60160 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 31.0e-5289.83Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        M EFAPICIYLVIS LVSLI LGVPF FASNSSTYPEKLSAYECGFDP GDARSRFDIRFYLVSILFII D EVTF FPWAV LNKIDLFG WSMMAFLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGA D E
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

Q36664 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 31.0e-5288.14Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPICIYLVIS LV LIPLGVPF FASN STYPEKLSAYECGFDP GDARSRFDIRFYLVSILFII D EVTF FPWAV LNKIDLFG WSMM FLL
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWK+GA D E
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07751.1 NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 protein5.8e-5691.53Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPI IYLVIS LVSLI LGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILF+I D EVTF FPWAVP NKIDLFG WSMMAFL 
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE

ATCG00440.1 NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 protein6.5e-1536.11Show/hide
Query:  YLVIS---PLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLLILTIGF
        +L+IS   P+++ +  GV  P        PEKLS+YE G +P GDA  +F IR+Y+ +++F++ D E  F +PWA+  + + +        F+LIL +G 
Subjt:  YLVIS---PLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLLILTIGF

Query:  LYEWKRGA
        +Y W++GA
Subjt:  LYEWKRGA

ATMG00990.1 NADH dehydrogenase 35.8e-5691.53Show/hide
Query:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL
        MSEFAPI IYLVIS LVSLI LGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILF+I D EVTF FPWAVP NKIDLFG WSMMAFL 
Subjt:  MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLL

Query:  ILTIGFLYEWKRGASDRE
        ILTIGFLYEWKRGASDRE
Subjt:  ILTIGFLYEWKRGASDRE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGAATTTGCACCTATTTGTATCTATTTAGTGATCAGTCCGCTAGTTTCTTTGATCCCACTCGGTGTTCCTTTTCCATTTGCTTCCAATAGTTCAACCTATCCAGA
AAAATTATCGGCCTATGAATGTGGTTTCGATCCTTCCGGTGATGCCAGAAGTCGTTTCGATATACGATTTTATCTTGTTTCCATTTTATTTATTATCCTTGATCCGGAAG
TAACCTTTTCCTTTCCTTGGGCAGTACCTCTCAACAAGATTGATCTGTTTGGATCTTGGTCCATGATGGCCTTTTTATTGATTTTGACGATTGGATTTCTCTATGAATGG
AAAAGGGGTGCTTCGGATCGGGAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAGAATTTGCACCTATTTGTATCTATTTAGTGATCAGTCCGCTAGTTTCTTTGATCCCACTCGGTGTTCCTTTTCCATTTGCTTCCAATAGTTCAACCTATCCAGA
AAAATTATCGGCCTATGAATGTGGTTTCGATCCTTCCGGTGATGCCAGAAGTCGTTTCGATATACGATTTTATCTTGTTTCCATTTTATTTATTATCCTTGATCCGGAAG
TAACCTTTTCCTTTCCTTGGGCAGTACCTCTCAACAAGATTGATCTGTTTGGATCTTGGTCCATGATGGCCTTTTTATTGATTTTGACGATTGGATTTCTCTATGAATGG
AAAAGGGGTGCTTCGGATCGGGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEFAPICIYLVISPLVSLIPLGVPFPFASNSSTYPEKLSAYECGFDPSGDARSRFDIRFYLVSILFIILDPEVTFSFPWAVPLNKIDLFGSWSMMAFLLILTIGFLYEW
KRGASDRE