| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6596659.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.3e-96 | 89.57 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RS SPR GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++DP+DAADAKYELDG
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QVLLGRELTVVFAEENRKRPE+MRARDSSR GRSY+YRRSPL+YS+SP + RKYS SPEYYSPA+S RYSRSISPRDRRYRERSYSRSPYDSR R YSRS
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RSRS SRSYSR
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| XP_008443002.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 [Cucumis melo] | 1.5e-96 | 91.55 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RSPSPR RGGR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVD ADAADAKYELDG
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RSRSRSYSRSYSR
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| XP_022151394.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 [Momordica charantia] | 4.2e-107 | 97.63 | Show/hide |
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RSRSYSRSY R
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| XP_022948454.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X1 [Cucurbita moschata] | 1.3e-95 | 89.2 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RS SPR GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++DP+DAADAKYELDG
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QVLLGRELTVVFAEENRKRPE+MRARDSS GRSY+YRRSPL+YS+SP + RKYS SPEYYSPA+SGRYSRSISPRDRRYRERSYSRSPYDSR R Y S
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RSRSRSYSRSYSR
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| XP_022948463.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 [Cucurbita moschata] | 1.3e-95 | 89.2 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RS SPR GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++DP+DAADAKYELDG
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QVLLGRELTVVFAEENRKRPE+MRARDSS GRSY+YRRSPL+YS+SP + RKYS SPEYYSPA+SGRYSRSISPRDRRYRERSYSRSPYDSR R Y S
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RSRSRSYSRSYSR
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3B7U0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 7.2e-97 | 91.55 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RSPSPR RGGR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVD ADAADAKYELDG
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QVLLG ELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSR GRSY+Y R SPLRYSRSPHYDRKYS SPEYYSPA+S RYSR SPR RRYRE+SYSRSPYD RGRSYS
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RSRSRSYSRSYSR
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|
| A0A6J1DCY5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 2.0e-107 | 97.63 | Show/hide |
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RSRSYSRSY R
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|
|
| A0A6J1G9D2 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 | 6.1e-96 | 89.2 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RS SPR GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++DP+DAADAKYELDG
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QVLLGRELTVVFAEENRKRPE+MRARDSS GRSY+YRRSPL+YS+SP + RKYS SPEYYSPA+SGRYSRSISPRDRRYRERSYSRSPYDSR R Y S
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RSRSRSYSRSYSR
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|
|
| A0A6J1G9Y1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X3 | 6.1e-96 | 89.2 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RS SPR GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++DP+DAADAKYELDG
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QVLLGRELTVVFAEENRKRPE+MRARDSS GRSY+YRRSPL+YS+SP + RKYS SPEYYSPA+SGRYSRSISPRDRRYRERSYSRSPYDSR R Y S
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RSRSRSYSRSYSR
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|
|
| A0A6J1G9Y3 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X1 | 6.1e-96 | 89.2 | Show/hide |
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MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RS SPR GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++DP+DAADAKYELDG
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QVLLGRELTVVFAEENRKRPE+MRARDSS GRSY+YRRSPL+YS+SP + RKYS SPEYYSPA+SGRYSRSISPRDRRYRERSYSRSPYDSR R Y S
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RSRSRSYSRSYSR
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 10 | 4.9e-26 | 43.39 | Show/hide |
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TSL VRN+ D R EDLR FGR+GP+ D+Y+P D+Y+ PRGF +VQF D DA DA + LD + + GR++ + FA+ +RK P +M+A++ SSR
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Query: LGRSYNYRRSPLR-------YSRSPHYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDR-RYRERSYSRSPYDSRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
YRRS R SRS Y+ + S+SP P R SRS S DR ++R RS+SRS +SR RS S+ + ++S SR
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|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.3e-31 | 44.92 | Show/hide |
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R RS SYSP SPPR R PS RD G P+ LL+RNL D RP DLR F RFGPLKDIYLPR+YY+GEPRGFGFV++ DA
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A+A ++ +V+ GRE+ +VFAEENRK P+EMR + + GR +Y+R+ R R + S SP + YSP + R SRS PR+
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Query: RRYRERSYSRSPYDS------RGRSYSRSRSRSYSR
R + RSP + R R SRSRSRS SR
Subjt: RRYRERSYSRSPYDS------RGRSYSRSRSRSYSR
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 4.3e-30 | 43.05 | Show/hide |
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MR S Y P R YG R RSP P GGR SLLVRN+ DCRPE+LR F RFGP++D+Y+PRDYYSG+PRGF FV+FVD D
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Query: AADAKYELDGQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRLGRSYNYRRSPLRYSRSPHYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDRRYRERSYSRSPY
A +A+ ++ + GRE+TVV A E+RKRPEEMR + +R SR P R SH R R S RYR RSYS +P
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Query: ----DSRGRSYSRSRSRSYSRSY
RG RSYS Y
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|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 4.7e-61 | 65.91 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R G R DLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGF+QF+DPADAA+AK+++
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DG +LLGRELTVVFAEENRK+P EMR RD R R + RRSP RYSRSP R S S Y SP SRS+SP+DRRY +ERSYSRSP
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Query: SRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
SR RS S R +S+SRS R
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|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 6.1e-61 | 66.67 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+DPADAADAK+ +D
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G +LLGRELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR+P RY SRS P R S S +YYSP + RSISPR+ RY RSYSRSP
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Query: SRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
SRGRS + R +SRS S S R
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|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 4.4e-62 | 66.67 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+DPADAADAK+ +D
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Query: GQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRLGRSYNYRRSPLRY---SRS--PHYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDRRY-RERSYSRSPYD--
G +LLGRELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR+P RY SRS P R S S +YYSP + RSISPR+ RY RSYSRSP
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Query: SRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
SRGRS + R +SRS S S R
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|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 3.3e-62 | 66.82 | Show/hide |
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MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+DPADAADAK+ +D
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Query: GQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRLGRSYNYRRSPLRY---SRS--PHYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDRRY-RERSYSRSPYD--
G +LLGRELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR+P RY SRS P R S S +YYSP + RSISPR+ RY RSYSRSP
Subjt: GQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRLGRSYNYRRSPLRY---SRS--PHYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDRRY-RERSYSRSPYD--
Query: SRGRSYSRSRSRSYSRS
SRGRS + R +S S S
Subjt: SRGRSYSRSRSRSYSRS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 1.2e-59 | 62.82 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRHRSPSPRDR-GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG------------EPRGFGFVQFVD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G +PRGFGFVQF+D
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Query: PADAADAKYELDGQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRLGRSYNYRRSPLRY---SRS--PHYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDRRY-R
PADAADAK+ +DG +LLGRELTVVFAEENRK+P EMRAR+ R + RR+P RY SRS P R S S +YYSP + RSISPR+ RY
Subjt: PADAADAKYELDGQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRLGRSYNYRRSPLRY---SRS--PHYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDRRY-R
Query: ERSYSRSPYD--SRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
RSYSRSP SRGRS + R +SRS S S R
Subjt: ERSYSRSPYD--SRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 3.3e-62 | 65.91 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRHRSPSPRDR--GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDPADAADAKYEL
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R G R DLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGF+QF+DPADAA+AK+++
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRHRSPSPRDR--GGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDPADAADAKYEL
Query: DGQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARD-SSRLGRSYNYRRSPLRYSRSP---HYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDRRY-RERSYSRSP--YD
DG +LLGRELTVVFAEENRK+P EMR RD R R + RRSP RYSRSP R S S Y SP SRS+SP+DRRY +ERSYSRSP
Subjt: DGQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARD-SSRLGRSYNYRRSPLRYSRSP---HYDRKYSHSPEYYSPAQSGRYSRSISPRDRRY-RERSYSRSP--YD
Query: SRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
SR RS S R +S+SRS R
Subjt: SRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 9.5e-33 | 44.92 | Show/hide |
Query: RGRSYSYSP-----SPPRSY-----GRRHRSPSPRDRGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDPADA
R RS SYSP SPPR R PS RD G P+ LL+RNL D RP DLR F RFGPLKDIYLPR+YY+GEPRGFGFV++ DA
Subjt: RGRSYSYSP-----SPPRSY-----GRRHRSPSPRDRGGRGRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDPADA
Query: ADAKYELDGQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRLGRSYNYRRSPLRYSRSPHYDRKYSHSP-------------EYYSPAQSGR-YSRSISPRD
A+A ++ +V+ GRE+ +VFAEENRK P+EMR + + GR +Y+R+ R R + S SP + YSP + R SRS PR+
Subjt: ADAKYELDGQVLLGRELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRLGRSYNYRRSPLRYSRSPHYDRKYSHSP-------------EYYSPAQSGR-YSRSISPRD
Query: RRYRERSYSRSPYDS------RGRSYSRSRSRSYSR
R + RSP + R R SRSRSRS SR
Subjt: RRYRERSYSRSPYDS------RGRSYSRSRSRSYSR
|
|
