| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6588073.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.8e-100 | 82.82 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
+APTQVAFG+GGTS+++R+YG KAGN+ RNEDGTLPS SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNE EFGEASE RTYDE+ TTPAMDLGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPETN+FFLQ+PPMVPVT+QSST EGM AA+S EQ+KGS+ Q CSLNE PSGSMGKLLVYRSGAVKLKLG+IVYDVSSGMDCGFAQ++AAINVEGK
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRA+LTPDVDSMLK+IE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| XP_004144123.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 [Cucumis sativus] | 3.3e-102 | 83.26 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFGSGG+S+T+RSYG+ KAGNRPRNEDGTLP+S SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNEEEFGEASEN TYDE+ TT AM+LGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
ENPE +V FLQ+PPMVP+ KQSS+VE M + +SSEQ+K S+ RQ CS+NELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQ+VAAINVEGK
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRAILTPDVDSMLK+IE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| XP_008450913.1 PREDICTED: DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 [Cucumis melo] | 4.7e-104 | 84.14 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFGSGG+S+T+RSYG+ KAGNRPRNEDGTLP+S SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNEEEFGEASEN TYDE+ TT AM+LGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
ENPET+VFFLQ+PPMVP+ KQSSTVE M + + SEQ+ S+TRQ CS+NELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQ+VAAIN+EGKH
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRAILTPDVDSML++IE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| XP_022147557.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc4 [Momordica charantia] | 3.8e-122 | 99.56 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| XP_038878504.1 uncharacterized protein LOC120070724 [Benincasa hispida] | 1.4e-105 | 86.34 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFGSGGTS+T+RSYG+ KAGNRPRNEDGTLPSS SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNEEEFGEASEN YDE+ TTPAMDLGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
ENPE +VFFLQ+PPMVP+ KQSSTVEG AA+S EQSKGS+ RQ C +NELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQDVAA+NVEGK
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRAILTPDVDS+LK+IE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LWX7 Uncharacterized protein | 1.6e-102 | 83.26 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFGSGG+S+T+RSYG+ KAGNRPRNEDGTLP+S SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNEEEFGEASEN TYDE+ TT AM+LGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
ENPE +V FLQ+PPMVP+ KQSS+VE M + +SSEQ+K S+ RQ CS+NELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQ+VAAINVEGK
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRAILTPDVDSMLK+IE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| A0A1S3BPR1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 2.3e-104 | 84.14 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFGSGG+S+T+RSYG+ KAGNRPRNEDGTLP+S SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNEEEFGEASEN TYDE+ TT AM+LGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
ENPET+VFFLQ+PPMVP+ KQSSTVE M + + SEQ+ S+TRQ CS+NELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGMDCGFAQ+VAAIN+EGKH
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRAILTPDVDSML++IE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| A0A6J1D2P1 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc4 | 1.8e-122 | 99.56 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| A0A6J1F0U0 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4-like | 7.5e-100 | 82.82 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFG+GGTS+++R+YG KAGN+ RNEDGTLPS SKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNE EFGEASE RTYDE+ TTPAMDLGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPETN+FFLQ+PPMVPVT+QSST EGM AA+S EQ+K S+ Q CSLNE PSGSMGKLLVYRSGAVKLKLG+IVYDVSSGMDCGFAQ++AAINVEGK
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRA+LTPDVDSMLK+IE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| A0A6J1HTZ8 uncharacterized protein LOC111467450 | 7.5e-100 | 81.94 | Show/hide |
Query: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
AAPTQVAFG+GGTS+++R++G KAGN+ RNEDGTLP S+EYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSG+PDSLNE EFGEASE+RTYDE+ TTPAMDLGLLE
Subjt: AAPTQVAFGSGGTSATIRSYGIPKAGNRPRNEDGTLPSSISKEYVEPWDYYSYYPVTLPLRRPYSGDPDSLNEEEFGEASENRTYDESMTTPAMDLGLLE
Query: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
+NPETN+FFLQ+PPMVPVT+QSST EGM AA+S EQ+K S+ Q CSLNE PSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQ++AAINVEGK
Subjt: ENPETNVFFLQIPPMVPVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH
Query: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
CCIVGELSKRA+LTPDVDSMLK+IE L
Subjt: CCIVGELSKRAILTPDVDSMLKDIEYL
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O74857 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc4 | 1.0e-05 | 26.9 | Show/hide |
Query: TYDESMTTPAMDLGLLEENPETNVFFLQIPPMVPV-----TKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNEL-------PSGSMGKLLVYRSGAVKLK
T E M D +L + P+ F+ + PV K+ E + K R N L L P+G +G L V++SG L+
Subjt: TYDESMTTPAMDLGLLEENPETNVFFLQIPPMVPV-----TKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNEL-------PSGSMGKLLVYRSGAVKLK
Query: LGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKHCCIVGELSKRAILTPD
+G + + V SG DC F Q++A ++ + K +G +R I++PD
Subjt: LGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKHCCIVGELSKRAILTPD
|
|
| P05423 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 6.9e-10 | 26.72 | Show/hide |
Query: ETNVFFLQIPPMV----------PVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAA
E + FLQ+P + P+ + +G V E+ + ++ +N C+L +L G +GKLL+ +SG V+L LG + DV+ G C F Q++ +
Subjt: ETNVFFLQIPPMV----------PVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAA
Query: INVEGK---HCCIVGELSKRAILTPDVDSML
+ + ++G + + + +PD +S+L
Subjt: INVEGK---HCCIVGELSKRAILTPDVDSML
|
|
| Q5E9Z7 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 5.3e-10 | 25.5 | Show/hide |
Query: DESMTTPAMDLGLLEENPETNVFFLQIPPMV----------PVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDI
D S+ +L L +E + FLQ+P + P+ + + +G + E+ + +R +N C+L +L G +GKLL+ +SG V+L LG +
Subjt: DESMTTPAMDLGLLEENPETNVFFLQIPPMV----------PVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDI
Query: VYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH---CCIVGELSKRAILTPDVDSML
DV+ G C F Q++ ++ + ++G + + + +P+ +S+L
Subjt: VYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGKH---CCIVGELSKRAILTPDVDSML
|
|
| Q8T1V7 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc4 | 3.9e-05 | 32.05 | Show/hide |
Query: SLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEG-----KHCCIVGELSKRAILTPDVDSM
S+ E+PSG +G L +Y+SG LK+G + YD+SSG F ++V +G C +G S+ + P + +
Subjt: SLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIVYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEG-----KHCCIVGELSKRAILTPDVDSM
|
|
| Q91WD1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4 | 4.1e-10 | 26.17 | Show/hide |
Query: DESMTTPAMDLGLLEENPETNVFFLQIPPMV----------PVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDI
D S+ +L L+++ + FLQ+P + PV + +G + E+ + +R +N C+L +L G +GKLL+ +SG V+L LG +
Subjt: DESMTTPAMDLGLLEENPETNVFFLQIPPMV----------PVTKQSSTVEGMVAASSSEQSKGSRTRQNFCSLNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDI
Query: VYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGK---HCCIVGELSKRAILTPDVDSML
DV+ G C F Q++ ++ + ++G + + + +PD +S+L
Subjt: VYDVSSGMDCGFAQDVAAINVEGK---HCCIVGELSKRAILTPDVDSML
|
|
