; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS023175 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS023175
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1
Genome locationscaffold78:682018..686248
RNA-Seq ExpressionMS023175
SyntenyMS023175
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023531642.1 transcription factor Pur-alpha 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-14891.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein1.2e-14891.8Show/hide
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A0A1S3BPW8 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X21.3e-14791.15Show/hide
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A0A6J1D0R2 transcription factor Pur-alpha 12.2e-15595.08Show/hide
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A0A6J1EUL9 transcription factor Pur-alpha 1-like5.8e-14890.82Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like7.6e-14891.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O35295 Transcriptional activator protein Pur-beta8.4e-1128.91Show/hide
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        G  GGGG G GG         GG  G GG     EL  K L +++K FY D+K+N +GR+LKI+E     ++S + +  +    F D    +I       
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha9.3e-1028.06Show/hide
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        SGGGG G GG         GG +GGGGGG          EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I  
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                  QL      D             SE  V  NR   +    + R      F  I   +N    L         LP Q   E  + +  L DD
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         G                           +++   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q6PAC9 Transcriptional activator protein Pur-beta-A1.1e-1027.17Show/hide
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        +   G                   G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Q8AVS4 Transcriptional activator protein Pur-beta-B4.9e-1127.27Show/hide
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        GG +GG  G +          EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  +    F D    +I        S   Q+   +  
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        D  G          SE  V  NR   +    + R      F  I   IN               ++ +   LP Q   E  + +  L DD G     G  
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          SG +                 G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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Sequences Show/hide sequences
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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