; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS023196 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS023196
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionPeptidyl-tRNA hydrolase family protein
Genome locationscaffold78:898077..900784
RNA-Seq ExpressionMS023196
SyntenyMS023196
Gene Ontology termsGO:0004045 - aminoacyl-tRNA hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001328 - Peptidyl-tRNA hydrolase
IPR018171 - Peptidyl-tRNA hydrolase, conserved site
IPR036416 - Peptidyl-tRNA hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022988207.1 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial isoform X1 [Cucurbita maxima]1.3e-11692.2Show/hide
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XP_038880695.1 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial isoform X1 [Benincasa hispida]9.3e-11893.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LWX1 Uncharacterized protein2.3e-11492.17Show/hide
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A0A1S3BPZ7 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial isoform X18.5e-11792.63Show/hide
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A0A6J1D205 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial1.5e-126100Show/hide
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A0A6J1HDR5 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial isoform X11.3e-11793.12Show/hide
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A0A6J1JLL3 peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial isoform X16.5e-11792.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5ZCL8 Chloroplastic group IIB intron splicing facilitator CRS2, chloroplastic4.9e-6156.77Show/hide
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Q6NLS8 Peptidyl-tRNA hydrolase, mitochondrial3.5e-9172.69Show/hide
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Q9FKN4 Chloroplastic group IIB intron splicing facilitator CRS2-A, chloroplastic2.0e-6258.33Show/hide
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Q9LF14 Chloroplastic group IIB intron splicing facilitator CRS2-B, chloroplastic8.9e-6357.81Show/hide
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Q9M5P4 Chloroplastic group IIB intron splicing facilitator CRS2, chloroplastic1.6e-6458.16Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G16140.1 Peptidyl-tRNA hydrolase family protein6.3e-6457.81Show/hide
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AT5G16140.2 Peptidyl-tRNA hydrolase family protein6.3e-6457.81Show/hide
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AT5G19830.1 Peptidyl-tRNA hydrolase family protein2.5e-9272.69Show/hide
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AT5G38290.1 Peptidyl-tRNA hydrolase family protein1.4e-6358.33Show/hide
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        RL+P GGH  HNGLK+V  H  G R + RL IGIG PPG MD KAFLLQKF+   R+++D  L +GV  +K L+  G S+S  RFN  QKYK
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AT5G38290.2 Peptidyl-tRNA hydrolase family protein1.4e-6358.33Show/hide
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        PWL VGLGNPG K+ GTRHN+GFEMID  A +  I +N +  KAL G G VG++P+ L KPQ YMN SGES GPLAAYY++PL  +L+ +DDM L  GVL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AACTTGCCATGCGGGGTGCTTCGCCTTCGACCCGATGGAGGGCACGACTACCACAATGGGCTGAAGAGTGTCATTTATCATTTTCGAGGGAACAGAGAATTTGCTAGGTT
AAGAATTGGCATTGGAAGGCCACCTGGTCAAATGGATCCCAAAGCATTCTTGCTTCAAAAGTTCAACAACACTGCTCGAGAACGAATCGACACTGCATTGCTCGAGGGGG
TTGGTGCATTGAAGGACCTACTGTCTCTTGGTTTATCGGAGAGTGCGAGACGCTTCAACCATGAACAGAAATACAAGCATATAAGGTTGCAGACGATGCCAACA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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