; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS023331 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS023331
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionReverse transcriptase domain-containing protein
Genome locationscaffold378:49158..49415
RNA-Seq ExpressionMS023331
SyntenyMS023331
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
BBN69746.1 VIRB2-interacting protein 2 [Prunus dulcis]1.8e-0845.57Show/hide
Query:  LTLNVSKTPLIGINHSD-EVSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        +T+N SK  L+GIN  D  V+       C   V P+ YLG PLGGN +A   WDPVV+KV N+    K   +SK G+LT
Subjt:  LTLNVSKTPLIGINHSD-EVSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

KAE8655416.1 hypothetical protein F3Y22_tig00117027pilonHSYRG00012 [Hibiscus syriacus]1.3e-0944.3Show/hide
Query:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        L LN+ KT L GIN  DE +  W +   C S  LP  YLG PLG  K    +W P+V+KVR++  + KG L+S  G++T
Subjt:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

KAE8664069.1 hypothetical protein F3Y22_tig00112857pilonHSYRG00229 [Hibiscus syriacus]9.6e-1044.3Show/hide
Query:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        L LN+ KT L GIN  DE +  W +   C S  LP  YLG PLG  K    +W P+V+KVR++  + KG L+S  G++T
Subjt:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

RVW44804.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Vitis vinifera]2.8e-0940.96Show/hide
Query:  QSYQLTLNVSKTPLIGINHSDEV-SSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        Q + LT+N+ K+ + GIN   EV SS  L+  C+    P++YLG PLGGN K    WDPVV+++  + D  K   +S  G++T
Subjt:  QSYQLTLNVSKTPLIGINHSDEV-SSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

VVA21938.1 Hypothetical predicted protein, partial [Prunus dulcis]1.8e-0845.57Show/hide
Query:  LTLNVSKTPLIGINHSD-EVSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        +T+N SK  L+GIN  D  V+       C   V P+ YLG PLGGN +A   WDPVV+KV N+    K   +SK G+LT
Subjt:  LTLNVSKTPLIGINHSD-EVSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A438EAV3 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein1.4e-0940.96Show/hide
Query:  QSYQLTLNVSKTPLIGINHSDEV-SSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        Q + LT+N+ K+ + GIN   EV SS  L+  C+    P++YLG PLGGN K    WDPVV+++  + D  K   +S  G++T
Subjt:  QSYQLTLNVSKTPLIGINHSDEV-SSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

A0A4Y1R3V4 VIRB2-interacting protein 28.8e-0945.57Show/hide
Query:  LTLNVSKTPLIGINHSD-EVSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        +T+N SK  L+GIN  D  V+       C   V P+ YLG PLGGN +A   WDPVV+KV N+    K   +SK G+LT
Subjt:  LTLNVSKTPLIGINHSD-EVSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

A0A6A2X0H9 Uncharacterized protein6.1e-1044.3Show/hide
Query:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        L LN+ KT L GIN  DE +  W +   C S  LP  YLG PLG  K    +W P+V+KVR++  + KG L+S  G++T
Subjt:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

A0A6A2XZ15 Uncharacterized protein4.7e-1044.3Show/hide
Query:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT
        L LN+ KT L GIN  DE +  W +   C S  LP  YLG PLG  K    +W P+V+KVR++  + KG L+S  G++T
Subjt:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT

A0A6A2YRD0 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1-like8.8e-0950Show/hide
Query:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSK
        L LN+ KT L GIN  D  VS W  L  C    LP  YLG PLG  K    +W P+VDKVRN+  T K
Subjt:  LTLNVSKTPLIGINHSDE-VSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
TCTTCATGGGATCAGAGCTATCAGCTAACTTTGAATGTGTCTAAAACTCCCCTTATTGGCATCAATCACAGTGATGAGGTTTCTTCGTGGGTGCTTTTGTGTCATTGTAA
ATCAGAAGTCCTACCAGTGAATTACTTGGGCTTCCCCCTCGGGGGTAATAAAAAGGCTGCATATCTTTGGGATCCAGTTGTAGACAAAGTCAGAAACAAGTTTGATACTT
CGAAAGGCCTTCTTATTTCCAAAAAGGGAAAACTTACC
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTTCATGGGATCAGAGCTATCAGCTAACTTTGAATGTGTCTAAAACTCCCCTTATTGGCATCAATCACAGTGATGAGGTTTCTTCGTGGGTGCTTTTGTGTCATTGTAA
ATCAGAAGTCCTACCAGTGAATTACTTGGGCTTCCCCCTCGGGGGTAATAAAAAGGCTGCATATCTTTGGGATCCAGTTGTAGACAAAGTCAGAAACAAGTTTGATACTT
CGAAAGGCCTTCTTATTTCCAAAAAGGGAAAACTTACC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
SSWDQSYQLTLNVSKTPLIGINHSDEVSSWVLLCHCKSEVLPVNYLGFPLGGNKKAAYLWDPVVDKVRNKFDTSKGLLISKKGKLT