; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS023349 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS023349
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionsmall GTPase LIP1-like
Genome locationscaffold378:275397..281766
RNA-Seq ExpressionMS023349
SyntenyMS023349
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022157744.1 small GTPase LIP1 isoform X1 [Momordica charantia]7.3e-16999.03Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHG---SIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST
        RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHG   SIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHG---SIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST

Query:  RSKRSDINV
        RSKRSDINV
Subjt:  RSKRSDINV

XP_022157745.1 small GTPase LIP1 isoform X2 [Momordica charantia]1.7e-170100Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
        RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK

Query:  RSDINV
        RSDINV
Subjt:  RSDINV

XP_022947826.1 small GTPase LIP1-like [Cucurbita moschata]1.3e-15489.87Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSS SC SQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIAT+GTFSAPLGSGGPGGLPVP+IVIGNK DIAAK+G RGSSGNLVD ARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPG GGL+AAAKEARYDKEAVTKFFR LI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
        RRRYFSDSLP  NTWS+S V  SVQRLD+G+SD+DQSYS  S+ +ETYKYN LP LPAQRNLTPPPTLYPQQPFS SENY+LPKFALS SQE+NNSTRSK
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK

Query:  RSDINV
        RSDINV
Subjt:  RSDINV

XP_023007041.1 small GTPase LIP1-like [Cucurbita maxima]4.6e-15590.2Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSS SC SQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIAT+GTFSAPLGSGGPGGLPVP+IVIGNK DIAAK+G RGSSGNLVD ARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPG GGL+AAAKEARYDKEAVTKFFR LI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
        RRRYFSDSLP  NTWS+S V  SVQRLD+G+SD+DQSYS  S+ +ETYKYN LP LPAQRNLTPPPTLYPQQPFS SENY+LPKFALSASQE+NNSTRSK
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK

Query:  RSDINV
        RSDINV
Subjt:  RSDINV

XP_038901123.1 small GTPase LIP1 [Benincasa hispida]4.6e-15590.85Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNG+S SCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNK DIAAK+G RGSSGNLVDVARQWVEKQGLL FSEEIPLTESFPG GGLLAAAKEARYDKEAVTKFFR LI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
        RRRYFSD+LPA NTWSISPV  +VQRLD+ +SD++QSYS  S  SETY YN LP LPAQRNLTPPPTLYPQQPFS SENYSLPKFALS+SQE+NNSTRSK
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK

Query:  RSDINV
        RSDINV
Subjt:  RSDINV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3CQH6 Putative GTP-binding protein8.4e-15590.85Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSS S PSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGH+RYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIAT+GTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAK+G RGSSGNLVDVARQWVEKQGLL FSEEIPLTESFPG GGLLAAAKEARYDKEAVT FFR+LI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
        RRRYFSDSLPA  TWS+SPV  SVQRLD+ +SD++QSYS  S  SETYKYN LP LPAQRNLTPPPTLYPQQPFS SENYSLPKFALSASQEMNNS+RSK
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK

Query:  RSDINV
        RSDINV
Subjt:  RSDINV

A0A6J1DTZ0 small GTPase LIP1 isoform X28.4e-171100Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
        RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK

Query:  RSDINV
        RSDINV
Subjt:  RSDINV

A0A6J1DXF4 small GTPase LIP1 isoform X13.5e-16999.03Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHG---SIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST
        RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHG   SIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHG---SIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST

Query:  RSKRSDINV
        RSKRSDINV
Subjt:  RSKRSDINV

A0A6J1G7J8 small GTPase LIP1-like6.4e-15589.87Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSS SC SQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIAT+GTFSAPLGSGGPGGLPVP+IVIGNK DIAAK+G RGSSGNLVD ARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPG GGL+AAAKEARYDKEAVTKFFR LI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
        RRRYFSDSLP  NTWS+S V  SVQRLD+G+SD+DQSYS  S+ +ETYKYN LP LPAQRNLTPPPTLYPQQPFS SENY+LPKFALS SQE+NNSTRSK
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK

Query:  RSDINV
        RSDINV
Subjt:  RSDINV

A0A6J1KZF8 small GTPase LIP1-like2.2e-15590.2Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLIVNGSS SC SQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        EIAT+GTFSAPLGSGGPGGLPVP+IVIGNK DIAAK+G RGSSGNLVD ARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPG GGL+AAAKEARYDKEAVTKFFR LI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK
        RRRYFSDSLP  NTWS+S V  SVQRLD+G+SD+DQSYS  S+ +ETYKYN LP LPAQRNLTPPPTLYPQQPFS SENY+LPKFALSASQE+NNSTRSK
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNTWSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSK

Query:  RSDINV
        RSDINV
Subjt:  RSDINV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4KFD8 Small GTPase-like protein LIP22.4e-11470.23Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGK+SLVHLIV GSS   PSQTIGCTVGVKH+TY +  SSSS IKGD+ERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQR TK++LQKWA 
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        E++  G FSAPL SGGPGGLPVPYIVIGNK DIAAK G  GSSGNLVD AR WVEKQGLLP S+E+PL+ESFP + GL+ AAKEARYDKEA+TK F  LI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNT-WSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSI-ISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST-
        RRRYFSD LP+P++ WS+S   +  QRLDEG SD+DQ Y   S+   + YKYN LP    Q NL   PTLYPQQP     NY++P+F+LS+ +E +N   
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNT-WSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSI-ISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST-

Query:  RSKRSDINV
        RSKR DINV
Subjt:  RSKRSDINV

Q5HYI8 Rab-like protein 37.4e-1533.1Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGH----ERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQ
        GVGK+SLVHL+        PS T+GC+V V+   Y              E+ +++ELWDV G        K  R++FY+ +NG+IFVHDL+ +++  +L+
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGH----ERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQ

Query:  KWAVEIATIGTFSAPLGSGGPGG---------LPVPYIVIGNKVD
        +W++E   +     P G     G           +P +VIG K+D
Subjt:  KWAVEIATIGTFSAPLGSGGPGG---------LPVPYIVIGNKVD

Q6TNS7 Rab-like protein 31.6e-1434.48Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGH----ERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQ
        GVGK+SLVHL+        PS T+GC+V V+   Y              E+ F++ELWDV G        K  R++FY+ +NG+I VHDL+ +++  +L 
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGH----ERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQ

Query:  KWAVEIATIGTFSAPLG---SGGP------GGLPVPYIVIGNKVD
        +W++E   +   S+P G   S G           VP ++IG K D
Subjt:  KWAVEIATIGTFSAPLG---SGGP------GGLPVPYIVIGNKVD

Q9C5J9 Small GTPase LIP11.0e-12875.88Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLI  GSS   P QTIGCTVGVKHITYG+  SSSSSI+GD+ERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTK+SLQKWA 
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLP-FSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSL
        E+A  GTFSAPL SGGPGGLPVPYIV+GNK DIAAK+G +GSSGNLVD AR WVEKQGLLP  SE++PL ESFPG+GGL+AAAKE RYDKEA+ KFFR L
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLP-FSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSL

Query:  IRRRYFSDSLPAPNTWSISPV-SNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKY-NVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEM--NN
        IRRRYFSD LPA + WSISPV ++S QRLDE  SDDDQ Y   S   + YKY N +P LPAQRNLTPPPTLYPQQP S  +NY++P+++LS+ QE   N 
Subjt:  IRRRYFSDSLPAPNTWSISPV-SNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKY-NVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEM--NN

Query:  STRSKRSDINV
        S RSKR DINV
Subjt:  STRSKRSDINV

Q9D4V7 Rab-like protein 31.3e-1431.72Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGH----ERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQ
        GVGK+SLVHL+ +      PS T+GC+V ++   Y              E+ +++ELWDV G        K  R++FY+ +NG+I VHDL+ +++  +L 
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGH----ERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQ

Query:  KWAVEIATIGTFSAPLGSGGPGG---------LPVPYIVIGNKVD
        +W++E+  +   + P G     G           +P +VIG K+D
Subjt:  KWAVEIATIGTFSAPLGSGGPGG---------LPVPYIVIGNKVD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G09910.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.7e-11570.23Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGK+SLVHLIV GSS   PSQTIGCTVGVKH+TY +  SSSS IKGD+ERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQR TK++LQKWA 
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI
        E++  G FSAPL SGGPGGLPVPYIVIGNK DIAAK G  GSSGNLVD AR WVEKQGLLP S+E+PL+ESFP + GL+ AAKEARYDKEA+TK F  LI
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLI

Query:  RRRYFSDSLPAPNT-WSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSI-ISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST-
        RRRYFSD LP+P++ WS+S   +  QRLDEG SD+DQ Y   S+   + YKYN LP    Q NL   PTLYPQQP     NY++P+F+LS+ +E +N   
Subjt:  RRRYFSDSLPAPNT-WSISPVSNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSI-ISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNST-

Query:  RSKRSDINV
        RSKR DINV
Subjt:  RSKRSDINV

AT5G64813.1 Ras-related small GTP-binding family protein7.1e-13075.88Show/hide
Query:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV
        GVGKTSLVHLI  GSS   P QTIGCTVGVKHITYG+  SSSSSI+GD+ERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTK+SLQKWA 
Subjt:  GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAV

Query:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLP-FSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSL
        E+A  GTFSAPL SGGPGGLPVPYIV+GNK DIAAK+G +GSSGNLVD AR WVEKQGLLP  SE++PL ESFPG+GGL+AAAKE RYDKEA+ KFFR L
Subjt:  EIATIGTFSAPLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLP-FSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSL

Query:  IRRRYFSDSLPAPNTWSISPV-SNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKY-NVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEM--NN
        IRRRYFSD LPA + WSISPV ++S QRLDE  SDDDQ Y   S   + YKY N +P LPAQRNLTPPPTLYPQQP S  +NY++P+++LS+ QE   N 
Subjt:  IRRRYFSDSLPAPNTWSISPV-SNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKY-NVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEM--NN

Query:  STRSKRSDINV
        S RSKR DINV
Subjt:  STRSKRSDINV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
GGTGTGGGGAAAACTTCTCTTGTTCATCTAATTGTAAACGGTTCTTCCACTTCTTGCCCTTCTCAAACTATTGGTTGTACAGTTGGTGTTAAGCATATCACTTATGGAAA
TGCTGGTAGCTCATCAAGTAGTATAAAAGGTGATGCCGAGAGAGATTTCTTTGTTGAACTTTGGGATGTGTCAGGCCATGAGCGCTACAAAGACTGCCGCTCTCTCTTCT
ATTCTCAGATTAATGGTGTCATTTTTGTTCATGATCTTTCCCAGAGGAGGACAAAATCAAGCCTACAGAAGTGGGCAGTAGAAATTGCAACAATTGGGACATTTTCAGCT
CCCCTAGGATCTGGAGGCCCTGGTGGCCTTCCTGTGCCTTATATTGTTATTGGTAACAAAGTGGATATTGCTGCTAAAGATGGTGCAAGAGGAAGTAGCGGTAATCTAGT
TGATGTTGCTCGCCAATGGGTTGAGAAGCAGGGTCTGCTTCCCTTTAGTGAGGAAATTCCATTAACTGAAAGTTTTCCTGGCAGCGGAGGACTTCTTGCTGCTGCCAAAG
AAGCGAGATATGACAAGGAAGCTGTGACGAAATTTTTTCGCTCGCTCATCCGAAGAAGATATTTCTCAGATAGTTTACCTGCACCGAACACTTGGTCAATTTCTCCAGTT
TCAAATTCTGTACAGCGTCTTGACGAGGGTGTCAGTGACGACGACCAGTCATACAGCCATGGAAGTATAATCAGCGAAACATACAAGTACAACGTGCTTCCCTCACTCCC
AGCACAGCGCAATCTTACTCCGCCTCCGACGCTTTATCCCCAGCAGCCATTTTCGGTCTCTGAAAACTACAGCCTTCCAAAATTTGCTCTTTCAGCCTCCCAGGAGATGA
ACAATTCTACCAGATCGAAGCGCTCGGATATAAACGTA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGTGTGGGGAAAACTTCTCTTGTTCATCTAATTGTAAACGGTTCTTCCACTTCTTGCCCTTCTCAAACTATTGGTTGTACAGTTGGTGTTAAGCATATCACTTATGGAAA
TGCTGGTAGCTCATCAAGTAGTATAAAAGGTGATGCCGAGAGAGATTTCTTTGTTGAACTTTGGGATGTGTCAGGCCATGAGCGCTACAAAGACTGCCGCTCTCTCTTCT
ATTCTCAGATTAATGGTGTCATTTTTGTTCATGATCTTTCCCAGAGGAGGACAAAATCAAGCCTACAGAAGTGGGCAGTAGAAATTGCAACAATTGGGACATTTTCAGCT
CCCCTAGGATCTGGAGGCCCTGGTGGCCTTCCTGTGCCTTATATTGTTATTGGTAACAAAGTGGATATTGCTGCTAAAGATGGTGCAAGAGGAAGTAGCGGTAATCTAGT
TGATGTTGCTCGCCAATGGGTTGAGAAGCAGGGTCTGCTTCCCTTTAGTGAGGAAATTCCATTAACTGAAAGTTTTCCTGGCAGCGGAGGACTTCTTGCTGCTGCCAAAG
AAGCGAGATATGACAAGGAAGCTGTGACGAAATTTTTTCGCTCGCTCATCCGAAGAAGATATTTCTCAGATAGTTTACCTGCACCGAACACTTGGTCAATTTCTCCAGTT
TCAAATTCTGTACAGCGTCTTGACGAGGGTGTCAGTGACGACGACCAGTCATACAGCCATGGAAGTATAATCAGCGAAACATACAAGTACAACGTGCTTCCCTCACTCCC
AGCACAGCGCAATCTTACTCCGCCTCCGACGCTTTATCCCCAGCAGCCATTTTCGGTCTCTGAAAACTACAGCCTTCCAAAATTTGCTCTTTCAGCCTCCCAGGAGATGA
ACAATTCTACCAGATCGAAGCGCTCGGATATAAACGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
GVGKTSLVHLIVNGSSTSCPSQTIGCTVGVKHITYGNAGSSSSSIKGDAERDFFVELWDVSGHERYKDCRSLFYSQINGVIFVHDLSQRRTKSSLQKWAVEIATIGTFSA
PLGSGGPGGLPVPYIVIGNKVDIAAKDGARGSSGNLVDVARQWVEKQGLLPFSEEIPLTESFPGSGGLLAAAKEARYDKEAVTKFFRSLIRRRYFSDSLPAPNTWSISPV
SNSVQRLDEGVSDDDQSYSHGSIISETYKYNVLPSLPAQRNLTPPPTLYPQQPFSVSENYSLPKFALSASQEMNNSTRSKRSDINV