CuGenDBv2

Gene ID	MS023579
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	VARLMGL domain-containing protein
Genome location	scaffold1258:365302..366635
RNA-Seq Expression	MS023579
Synteny	MS023579
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAA0031834.1 transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]

2.7e-134

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        EG DSYIL+GLIEEFVEQ
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XP_004153325.1 uncharacterized protein LOC101223236 [Cucumis sativus]

1.7e-131

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        EG DS IL+GLIEEFVE Q+ DL
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XP_008457365.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497072 [Cucumis melo]

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        D MPEMK N N + RSQSMNS+EH YK+L+ KHQ++RST SFRE+PTFLELENEDYFILSFEGE +SKEF+PK      R S  FKQR E+E++CK+ GS
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        EG DSYIL+GLIEEFVEQ
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XP_022150887.1 uncharacterized protein LOC111018930 [Momordica charantia]

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        APSS DAASSSSPTHPRRKLSPELEISQSPSPRNDDDLIINEVKIAKAKGGGDGTQQERWEEEICRMTETELAESNWKFSKICEEHEDFGGIIEGFDSYI
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        LQGLIEEFVEQLNDLRPK
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XP_038896059.1 uncharacterized protein LOC120084230 [Benincasa hispida]

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        EQ S  KTKKK+  DPEE+K+FV IDLKE+KKSR+R S NK TS+ISTK+ RH               GRK+TR+VESDCSSDE SPVSVLD +QFLRD 
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              S  A+S+SP + RRKLS ELEI ++PS RNDDDLIIN  KIAK K   DG Q+ER+E+EIC++TE EL ESNWK+SKICEEHE+F  GGIIEGF
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        DSYIL+GLIEEFVEQ+ DL
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LY94 VARLMGL domain-containing protein

8.0e-132

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A0A1S3C6M1 uncharacterized protein LOC103497072

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A0A5A7SKY9 Transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2

1.3e-134

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A0A5D3BBU9 Transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2

1.7e-134

68.9

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A0A6J1DBZ9 uncharacterized protein LOC111018930

5.4e-221

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        PEMKLNQNLISRSQSMNSLEHFYKHLEGKHQRIRSTLSFREIPTFLELENEDYFILSFEGESRSKEFRPKERRRSERRSGEFKQRKEEEERCKNGGSNKT
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        EQLSASKTKKKKTLDPEEAKEFVLIDLKEQKKSRRRVSNKRTSKISTKEHRHGRLR GGSVPERVTNGRKATRRVESDCSSDESSPVSVLDCSQFLRDSG
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        APSS DAASSSSPTHPRRKLSPELEISQSPSPRNDDDLIINEVKIAKAKGGGDGTQQERWEEEICRMTETELAESNWKFSKICEEHEDFGGIIEGFDSYI
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        LQGLIEEFVEQLNDLRPK
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G58630.1 unknown protein

1.0e-22

32.13

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Query:  MKLLPSPSCSSSSSFSTSTFDANVCNPRATPSCLSGILRRILCSGSLPTHPSDQITEEANSVKSDSDKVLQVKDVSAIKATNEGKPSAGIVARLMGLDPM
        MK  PSP+ S S    T +F            C+S IL+R LCSG+  T+PSD ITE   S KS        +D         G    G VARLMGLD +
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Query:  PEMKLNQNLISRSQSMNSLEHFYKHLEGKHQRIRSTLSFREIPTFLELENEDYFILSFEGESRSKEFRPKERRRSERRSGEFKQRKEEEERCKNGGSNKT
        P +      +SRS S+N L+     ++GKH+R++STL       ++ELE++D+FILSFE +   KE     R   +RR     Q K E++    G  N  
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Query:  EQLSASKTKKKKTLDPEEAKEFVLIDLKEQKKSRRRVSNKRTSKISTKEHRHGRLRRGG--SVPERVTNGRKATRRVESDCSS-DESSPVSVLDCSQFLR
          ++ S  +++  +        ++   KE++KSRR+   ++ +K+     +   ++  G  S  E + N    + + E +C S D+SSPVSVLD  ++  
Subjt:  EQLSASKTKKKKTLDPEEAKEFVLIDLKEQKKSRRRVSNKRTSKISTKEHRHGRLRRGG--SVPERVTNGRKATRRVESDCSS-DESSPVSVLDCSQFLR

Query:  DSGAPSSDAASSSSPTHPRRKLSPELEISQ-SPSPRNDDDLIINEVKIAKAKGGGDGTQQERWEEEICRMTETELAESNWKFSKICEEHEDFGGII-EGF
            PS    S       RR+LS ELE S+ + +   D   + +  K  + +  G    QE W   IC++T ++L  S+W F+    + ED  GII E  
Subjt:  DSGAPSSDAASSSSPTHPRRKLSPELEISQ-SPSPRNDDDLIINEVKIAKAKGGGDGTQQERWEEEICRMTETELAESNWKFSKICEEHEDFGGII-EGF

Query:  DSYILQGLIEEFVEQLN
         S IL  L+EE +  L+
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Sequences

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ATGAAGTTGTTGCCTTCTCCTTCTTGCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCCACTTCCACTTTCGATGCCAATGTCTGCAACCCCAGAGCTACACCCAGCTGCCTTTCGGGAAT
TCTCCGTCGAATTCTCTGCTCCGGCAGCCTCCCAACGCACCCGTCCGACCAGATCACGGAAGAAGCTAACTCAGTGAAGTCTGATAGTGACAAGGTTCTTCAAGTCAAGG
ATGTGAGTGCCATCAAGGCAACAAATGAGGGCAAGCCCAGTGCTGGAATTGTGGCGAGGTTGATGGGTTTGGATCCCATGCCAGAGATGAAGCTGAATCAGAATTTGATA
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GCTTGAAAATGAGGATTACTTCATCCTTAGCTTTGAGGGAGAAAGCAGAAGCAAAGAATTCAGACCCAAAGAAAGAAGAAGAAGCGAAAGGAGGAGTGGAGAATTCAAGC
AAAGAAAGGAAGAGGAAGAGAGATGTAAGAACGGGGGAAGCAACAAAACAGAGCAGCTTTCAGCGAGCAAGACGAAGAAGAAGAAGACACTGGATCCAGAAGAAGCCAAA
GAGTTTGTTCTAATAGATTTGAAAGAACAGAAGAAATCAAGAAGGAGAGTCTCCAATAAACGTACCTCCAAAATTTCAACGAAGGAGCACCGCCATGGGAGACTCCGACG
CGGAGGATCAGTACCTGAAAGAGTCACCAATGGCAGAAAAGCAACCAGAAGAGTAGAATCAGACTGCAGTTCCGACGAATCAAGCCCGGTTTCAGTTCTCGATTGCAGTC
AATTCCTCAGAGATTCCGGAGCCCCATCATCAGACGCTGCTTCAAGCTCCTCCCCCACACACCCGAGAAGGAAACTATCGCCGGAGCTCGAAATTTCTCAGAGCCCATCT
CCTCGAAACGACGATGATTTGATAATCAACGAAGTAAAAATTGCGAAGGCGAAAGGGGGCGGCGATGGAACGCAGCAAGAAAGATGGGAAGAAGAGATTTGCAGGATGAC
TGAGACTGAATTGGCCGAGTCGAATTGGAAATTCAGCAAAATTTGTGAAGAACACGAAGATTTTGGAGGTATAATTGAAGGCTTTGACTCGTATATTCTTCAAGGATTGA
TTGAGGAGTTTGTAGAACAATTGAATGATCTTCGACCAAAG

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SRSQSMNSLEHFYKHLEGKHQRIRSTLSFREIPTFLELENEDYFILSFEGESRSKEFRPKERRRSERRSGEFKQRKEEEERCKNGGSNKTEQLSASKTKKKKTLDPEEAK
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PRNDDDLIINEVKIAKAKGGGDGTQQERWEEEICRMTETELAESNWKFSKICEEHEDFGGIIEGFDSYILQGLIEEFVEQLNDLRPK

MS023579 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome