; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS024506 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS024506
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionapidaecins type 14-like isoform X1
Genome locationscaffold234:1371574..1372551
RNA-Seq ExpressionMS024506
SyntenyMS024506
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022133549.1 apidaecins type 14-like isoform X1 [Momordica charantia]2.2e-7566.13Show/hide
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XP_022133550.1 apidaecins type 73-like isoform X2 [Momordica charantia]2.2e-7568.97Show/hide
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        RK  EV +YHDP PN PTMFHPTKI +ASPPS RK IEVEDY DP PNR     P KIS+ASPPSPRK   VEDY DP PNRPTMF P KIS+ASP SP 
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        K I VEDY DP PNRP MF P KIS  SPPSPRK I VEDY DP PNRPTMFHP KIS+ASPPS  K IEVEDY DP PNRP MF PTKIS+ASPPSP K
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         IEV+++ DP PN  T+    K     PPP+V
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XP_022134005.1 extensin-like isoform X1 [Momordica charantia]1.7e-5995.93Show/hide
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XP_022134006.1 uncharacterized protein LOC111006390 isoform X2 [Momordica charantia]1.2e-4196.67Show/hide
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XP_031758591.1 mucin-4-like [Xenopus tropicalis]4.1e-1333.62Show/hide
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         D   +     PT   PT IS ASPP    TI+     D   +     PT   PT IS ASPP    T++     D   +     PT   PT IS ASPP
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            TI+     D   +     PT   PT IS ASPP    TI+     D   +    F     PT IS ASPP    TI+     D   +    F    
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         PT IS ASPP    TI+     D   +     PT + PT I    PPP++
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5C6P9N9 Zona pellucida sperm-binding protein 46.3e-0729.18Show/hide
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        DPRP  P+   P   SD  P  PS  KT    D        PRP  P+   PT  L  +P  P+K  +   +   DPRP +P+       SD  P +P  
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                 PRP  P+   PT +   +P  P++  +   +   DP+P +P+   P + SD  PP P          DPRP +P+   P + SD  PP P 
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                 DPRP +P+   P K SD  P  P   I          +   Y   +P    +    P  I D SP    +T+
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A0A6J1BVK3 apidaecins type 73-like isoform X21.1e-7568.97Show/hide
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        RK  EV +YHDP PN PTMFHPTKI +ASPPS RK IEVEDY DP PNR     P KIS+ASPPSPRK   VEDY DP PNRPTMF P KIS+ASP SP 
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        K I VEDY DP PNRP MF P KIS  SPPSPRK I VEDY DP PNRPTMFHP KIS+ASPPS  K IEVEDY DP PNRP MF PTKIS+ASPPSP K
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         IEV+++ DP PN  T+    K     PPP+V
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A0A6J1BWA5 apidaecins type 14-like isoform X11.1e-7566.13Show/hide
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        MF P KIS+ASP SP K I VEDY DP PNRP MF P KIS  SPPSPRK I VEDY DP PNRPTMFHP KIS+ASPPS  K IEVEDY DP PNRP M
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        F PTKIS+ASPPSP K IEV+++ DP PN  T+    K     PPP+V
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A0A6J1BWS1 uncharacterized protein LOC111006390 isoform X26.0e-4296.67Show/hide
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A0A6J1BWU2 extensin-like isoform X18.3e-6095.93Show/hide
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        PRPNRPTMLHPTKIPNIGPPPQV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTAAAGGTGATCCAAGACCTAATTGCCCTACAATGTTTCACCCTACAAAGATTTCAGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCA
TGATCCAAGACCTAATCGTCCTACAATGTTTCATCCTACAAAAAATTTGGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCATGATCCAAGAC
CTAATCGTCCTACCATGTTTCACCCTACAAAGATTTCGGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCATGATCCAAGACCTAATCGTCCT
ACCATGTTTCACCCTACAAAGATTTCGGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCATGATCCAAGACCTAATCGTCCTACCATGTTTCA
CCCTACAAAGATTTCGGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCATGATCCAAGACCTAATCGTCCTACCATGTTTCACCCTACAAAGA
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AGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCATGATCCAAGACCTAATCGTCCTACCATGTTTCACCCTACAAAGATTTCGGATGCTAGTCCTCCTTC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TGATCCAAGACCTAATCGTCCTACAATGTTTCATCCTACAAAAAATTTGGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCATGATCCAAGAC
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CCCTACAAAGATTTCGGATGCTAGTCCTCCTTCTCCAAGGAAGACGATTGAAGTTGAGGACTATCATGATCCAAGACCTAATCGTCCTACCATGTTTCACCCTACAAAGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SPPSPRKTIEVEDYHDPRPNRPTMFHPTKISDASPPSPRKTIEVEDYHDPRPNRPTMFHPTKISDASPPSPRKTIEVEDYHDPRPNRPTMLHPTKIPNIGPPPQV