; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS024698 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS024698
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionserine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1
Genome locationscaffold92:2394275..2396600
RNA-Seq ExpressionMS024698
SyntenyMS024698
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601030.1 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.9e-11975.49Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDV GSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR
        GR                                            RGSYSRSPSPRR  GRSRSRSYSRGRSYSRSRSP+KRERSLERS+KRSRSPRGR
Subjt:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR

Query:  PSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRG-----------RSRSPRGRSRSPRGRSRSPRG--------------RSRSPRGRSR
         SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPDERSPEEAR S SPGNRDSPRG           RSRSPRGRS SPRGRSRSPRG              RSRSP  RSR
Subjt:  PSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRG-----------RSRSPRGRSRSPRGRSRSPRG--------------RSRSPRGRSR

Query:  SPMDEAEDFD-GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        SPMDE EDF+ GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREE SP+NDEDNNG+PRGGSESA
Subjt:  SPMDEAEDFD-GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

XP_022139066.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Momordica charantia]1.2e-13886.59Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR
        GR                                            RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR
Subjt:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR

Query:  PSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRS
        PSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRS
Subjt:  PSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRS

Query:  PSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        PSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
Subjt:  PSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

XP_022942535.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.1e-11879.94Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG---SREYLGRGP
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG   SREYLGRGP
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG---SREYLGRGP

Query:  PGTGR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSP
        PGTGR                                            RGSYSRSPSPRR  GRSRSRSYSRGRSYSRSRSP+KR+RSLERSEKRSRSP
Subjt:  PGTGR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSP

Query:  R-GRPSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFD-GGSRNYRREE
        R GR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPD RSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS   RSRSPRGRSRS   RSRSPRGRSRSPMDEAEDF+ GGSRNYR+EE
Subjt:  R-GRPSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFD-GGSRNYRREE

Query:  NGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        NGYSRSPSPLPREERSP+NDED NG+PRGGSESA
Subjt:  NGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

XP_022956473.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X3 [Cucurbita moschata]2.1e-11775.28Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDV GSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR
        GR                                            RGSYSRSPSPRR  GRSRSRSYSRG SYSRSRSP+KRERSLERS+KRSRSPRGR
Subjt:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR

Query:  PSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRG--------------------RSRSPRG--RSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPM
         SPKRHSLSPPP KAMKRS TPDERSPEEAR S SPGNRDSPRG                    RSRSPRG  RSRSPRGRSRSPRGRSRSP  RSRSPM
Subjt:  PSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRG--------------------RSRSPRG--RSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPM

Query:  DEAEDFD-GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        DE EDF+ GGS+NYRREENGYSRSPSPLPREE SP+NDEDNNG+PRG SESA
Subjt:  DEAEDFD-GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

XP_023541883.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.4e-11979.18Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG---SREYLGRGP
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG   SREYLGRGP
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG---SREYLGRGP

Query:  PGTGR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSP
        PGTGR                                            RGSYSRSPSPRR  GRSRSRSYSRGRSYSRSRSP+KR+RSLERSEKRSRSP
Subjt:  PGTGR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSP

Query:  R-GRPSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS---PRGRSRSPRG--RSRSPRG--RSRSPRGRSRSPMDEAEDFD-GGS
        R GR SPKRHSLSPPP KA+KRSPTPD RSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS    R RSRSPRG  RSRSPRG  RSRSPRGRSRSPMDEAEDF+ GGS
Subjt:  R-GRPSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS---PRGRSRSPRG--RSRSPRG--RSRSPRGRSRSPMDEAEDFD-GGS

Query:  RNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        RNYR+EENGYSRSPSPLPREERSP+NDED NG+PRGGSESA
Subjt:  RNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BDJ7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X28.4e-11776.97Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR
        GR                                            RGSYSRSPSPRR  GRSRSRSYSRGRSYSRSRSP+KR+RSLERS+KRSRSPRGR
Subjt:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR

Query:  PSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFD-GGSRNYRREENGYS
         SPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEE ARRS SPGNRD                   SRSPRGRSRSPRGRSRSPMDE EDF+ GGSRNYRREENGYS
Subjt:  PSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEE-ARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFD-GGSRNYRREENGYS

Query:  RSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        RSPSPLPREERSP+NDEDNNG+PRGGSESA
Subjt:  RSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

A0A6J1CBV7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X22.2e-11784.98Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGR---------------------------------
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGR                                 
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGR---------------------------------

Query:  -----------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSP
                   RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSP
Subjt:  -----------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSP

Query:  GNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        GNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
Subjt:  GNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

A0A6J1CET7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X16.0e-13986.59Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR
        GR                                            RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR
Subjt:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR

Query:  PSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRS
        PSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRS
Subjt:  PSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRS

Query:  PSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        PSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
Subjt:  PSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

A0A6J1FWH1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X15.3e-11979.94Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG---SREYLGRGP
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG   SREYLGRGP
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG---SREYLGRGP

Query:  PGTGR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSP
        PGTGR                                            RGSYSRSPSPRR  GRSRSRSYSRGRSYSRSRSP+KR+RSLERSEKRSRSP
Subjt:  PGTGR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSP

Query:  R-GRPSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFD-GGSRNYRREE
        R GR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPD RSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS   RSRSPRGRSRS   RSRSPRGRSRSPMDEAEDF+ GGSRNYR+EE
Subjt:  R-GRPSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFD-GGSRNYRREE

Query:  NGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        NGYSRSPSPLPREERSP+NDED NG+PRGGSESA
Subjt:  NGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

A0A6J1GWY2 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X31.0e-11775.28Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
        MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDV GSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGT

Query:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR
        GR                                            RGSYSRSPSPRR  GRSRSRSYSRG SYSRSRSP+KRERSLERS+KRSRSPRGR
Subjt:  GR--------------------------------------------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGR

Query:  PSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRG--------------------RSRSPRG--RSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPM
         SPKRHSLSPPP KAMKRS TPDERSPEEAR S SPGNRDSPRG                    RSRSPRG  RSRSPRGRSRSPRGRSRSP  RSRSPM
Subjt:  PSPKRHSLSPPP-KAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRG--------------------RSRSPRG--RSRSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPM

Query:  DEAEDFD-GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA
        DE EDF+ GGS+NYRREENGYSRSPSPLPREE SP+NDEDNNG+PRG SESA
Subjt:  DEAEDFD-GGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10021 Probable splicing factor, arginine/serine-rich 54.4e-1440.27Show/hide
Query:  RLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS--RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRRGSYSRS
        RLY+G++    R RD++     YG++ ++ MK  +AFV+F D RDA+DA + L+G+ + GS  R++VE+A+G PR              G  R G  SRS
Subjt:  RLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGS--RIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRRGSYSRS

Query:  PSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEAR-----RSPSPGNRDSPRGRSRSP
        P  R    R RSR+  R RS SR R   +R RS  RS  RSRSP      +  S SP PK   +      RSP  A+     RS SP      R RS S 
Subjt:  PSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEAR-----RSPSPGNRDSPRGRSRSP

Query:  RGRSRSPRGRSRSPRGRSRSP
        RGRS S  G +RS    SRSP
Subjt:  RGRSRSPRGRSRSPRGRSRSP

Q16629 Serine/arginine-rich splicing factor 79.9e-1440.78Show/hide
Query:  MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG
        M RY  RYGG T++YVG L +     +L+  FS YG +R V + R+   +AFVEF DPRDA+DA   L+G+ + GSR+ VE++ G+PR     R    R 
Subjt:  MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG

Query:  PP-----------GTGRRGSYS----RSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRS---PRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPD
        P              G +G Y+    R    RR   RSRS S SRGR YSRSRS  +  RS   S +RSRS    R R +  R S S   K  +      
Subjt:  PP-----------GTGRRGSYS----RSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRS---PRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPD

Query:  ERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPR-GRSRSPRGRSRSPRGRSRSP
         +SP  +R      +R     R RS R +SRSP   RSRSP G   SPR RS SP
Subjt:  ERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPR-GRSRSPRGRSRSPRGRSRSP

Q3T106 Serine/arginine-rich splicing factor 73.4e-1439.84Show/hide
Query:  MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG
        M RY  RYGG T++YVG L +     +L+  FS YG +R V + R+   +AFVEF DPRDA+DA   L+G+ + GSR+ VE++ G+PR     R    R 
Subjt:  MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG

Query:  PP-----------GTGRRGSYS----RSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERS
        P              G +G Y+    R    RR   RSRS S SRGR YSRSRS  +  RS   S +RSRS                 +++RS +   R 
Subjt:  PP-----------GTGRRGSYS----RSPSPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERS

Query:  PEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS-PRGRSRSPRGRSRSPR-GRSRSPRG---RSRSP
           +R     G+R   R RSRS    R RS R +SRSP   RSRSP G   RS SP
Subjt:  PEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS-PRGRSRSPRGRSRSPR-GRSRSPRG---RSRSP

Q8VYA5 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z331.7e-3747.88Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG
        MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG

Query:  TGR------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRG------RSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPT-PDERSPEEAR
         GR       G ++R  +     G  +++ Y  G      R+   S   ++R  S  RS  RSRSPR R SP R        +  RSP    ERS EE  
Subjt:  TGR------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRG------RSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPT-PDERSPEEAR

Query:  RSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSP-RGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPL-------PREERSPIND--EDNNGT
        RS SP   D     S SPR R RSP      SP+    SP    +   +   D DGGS     ++NG +   SP+        +E+RSP++D  E N  +
Subjt:  RSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSP-RGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPL-------PREERSPIND--EDNNGT

Query:  PRGGSES
        PR GSES
Subjt:  PRGGSES

Q9FYB7 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z321.9e-4149.48Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG
        MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG

Query:  TGR-----------------------------------------------RGSYSRSP----SPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEK
        +GR                                                GSYSRSP    SPRR    SRSRSYSRGRSYSRSRSP++RE+S+   E 
Subjt:  TGR-----------------------------------------------RGSYSRSP----SPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEK

Query:  RSRSPRG-----RPSPKRHSLSPPPKAMKRSP--------TPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSR-SPRGRSRSP
        RSRSP+       P  +  SLSP  K +  SP        +P E        SP  G  +SP G +   R         SR SP+G S SP
Subjt:  RSRSPRG-----RPSPKRHSLSPPPKAMKRSP--------TPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSR-SPRGRSRSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37340.1 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 331.2e-3847.88Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG
        MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG

Query:  TGR------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRG------RSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPT-PDERSPEEAR
         GR       G ++R  +     G  +++ Y  G      R+   S   ++R  S  RS  RSRSPR R SP R        +  RSP    ERS EE  
Subjt:  TGR------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRG------RSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPT-PDERSPEEAR

Query:  RSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSP-RGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPL-------PREERSPIND--EDNNGT
        RS SP   D     S SPR R RSP      SP+    SP    +   +   D DGGS     ++NG +   SP+        +E+RSP++D  E N  +
Subjt:  RSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSP-RGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPL-------PREERSPIND--EDNNGT

Query:  PRGGSES
        PR GSES
Subjt:  PRGGSES

AT2G37340.2 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 332.8e-1139.53Show/hide
Query:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGR------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRG------RSYSRSRSP
        EF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG GR       G ++R  +     G  +++ Y  G      R+   S   
Subjt:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGR------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRG------RSYSRSRSP

Query:  IKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPT-PDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSP-RGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMD
        ++R  S  RS  RSRSPR R SP R        +  RSP    ERS EE  RS SP   D     S SPR R RSP      SP+    SP    +   +
Subjt:  IKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPT-PDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSP-RGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPMD

Query:  EAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPL-------PREERSPIND--EDNNGTPRGGSES
           D DGGS     ++NG +   SP+        +E+RSP++D  E N  +PR GSES
Subjt:  EAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPL-------PREERSPIND--EDNNGTPRGGSES

AT2G37340.3 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 333.7e-1641.35Show/hide
Query:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGR------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRG------R
        MKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR++  RG PPG GR       G ++R  +     G  +++ Y  G      R
Subjt:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGR------RGSYSRSPSPRRGGGRSRSRSYSRG------R

Query:  SYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPT-PDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSP-RGRSRSPRGRSRSPR
        +   S   ++R  S  RS  RSRSPR R SP R        +  RSP    ERS EE  RS SP   D     S SPR R RSP      SP+    SP 
Subjt:  SYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPT-PDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSP-RGRSRSPRGRSRSPR

Query:  GRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPL-------PREERSPIND--EDNNGTPRGGSES
           +   +   D DGGS     ++NG +   SP+        +E+RSP++D  E N  +PR GSES
Subjt:  GRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPL-------PREERSPIND--EDNNGTPRGGSES

AT3G53500.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain4.3e-2042.8Show/hide
Query:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGR--------------------------------------
        MKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG+GR                                      
Subjt:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGR--------------------------------------

Query:  ---------RGSYSRSP----SPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRG-----RPSPKRHSLSPPPKAMKRSP--------T
                  GSYSRSP    SPRR    SRSRSYSRGRSYSRSRSP++RE+S+   E RSRSP+       P  +  SLSP  K +  SP        +
Subjt:  ---------RGSYSRSP----SPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRG-----RPSPKRHSLSPPPKAMKRSP--------T

Query:  PDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSR-SPRGRSRSP
        P E        SP  G  +SP G +   R         SR SP+G S SP
Subjt:  PDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSR-SPRGRSRSP

AT3G53500.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain1.4e-4249.48Show/hide
Query:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG
        MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G PR   GSR+   RG PPG
Subjt:  MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRG-PPG

Query:  TGR-----------------------------------------------RGSYSRSP----SPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEK
        +GR                                                GSYSRSP    SPRR    SRSRSYSRGRSYSRSRSP++RE+S+   E 
Subjt:  TGR-----------------------------------------------RGSYSRSP----SPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEK

Query:  RSRSPRG-----RPSPKRHSLSPPPKAMKRSP--------TPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSR-SPRGRSRSP
        RSRSP+       P  +  SLSP  K +  SP        +P E        SP  G  +SP G +   R         SR SP+G S SP
Subjt:  RSRSPRG-----RPSPKRHSLSPPPKAMKRSP--------TPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSR-SPRGRSRSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTCGCTACGACGATCGATACGGTGGTACTCGGCTCTACGTTGGGCGCCTGTCTTCACGGACGAGGTCCCGTGATCTGGATGACCTGTTCAGTCGTTATGGAAGAGT
ACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTATGCATTTGTTGAGTTTAGTGATCCCCGAGATGCCGATGATGCAAGATATAGTTTAAATGGGAGGGATGTCCATGGAAGTCGAA
TCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCACGTGAATATCTTGGTCGAGGCCCTCCTGGAACTGGGCGGCGTGGAAGTTACTCACGTTCTCCT
AGCCCTCGCCGTGGTGGTGGTAGAAGTCGAAGTCGTAGTTACAGCAGAGGTCGTAGCTACAGTCGGTCGAGATCACCGATTAAAAGAGAGAGAAGTCTCGAACGATCAGA
AAAAAGATCGAGGAGCCCAAGAGGCAGGCCGAGCCCAAAGAGGCATAGTTTGTCACCTCCTCCTAAAGCTATGAAGCGTAGCCCCACTCCTGATGAGAGGAGTCCGGAAG
AAGCTAGACGTAGCCCATCCCCTGGAAATCGTGACAGTCCTAGAGGAAGGAGCAGAAGTCCAAGGGGAAGAAGCAGAAGTCCAAGGGGAAGGAGCAGAAGTCCAAGAGGA
AGAAGCAGAAGTCCAAGGGGAAGGAGCAGAAGTCCAATGGATGAAGCTGAGGACTTTGATGGTGGAAGTAGGAATTATCGGAGGGAGGAAAATGGCTACAGCCGCAGCCC
GAGTCCGTTGCCCAGAGAAGAAAGGAGCCCAATAAACGACGAAGATAACAACGGTACTCCAAGGGGTGGTAGCGAGTCTGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTCGCTACGACGATCGATACGGTGGTACTCGGCTCTACGTTGGGCGCCTGTCTTCACGGACGAGGTCCCGTGATCTGGATGACCTGTTCAGTCGTTATGGAAGAGT
ACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTATGCATTTGTTGAGTTTAGTGATCCCCGAGATGCCGATGATGCAAGATATAGTTTAAATGGGAGGGATGTCCATGGAAGTCGAA
TCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCACGTGAATATCTTGGTCGAGGCCCTCCTGGAACTGGGCGGCGTGGAAGTTACTCACGTTCTCCT
AGCCCTCGCCGTGGTGGTGGTAGAAGTCGAAGTCGTAGTTACAGCAGAGGTCGTAGCTACAGTCGGTCGAGATCACCGATTAAAAGAGAGAGAAGTCTCGAACGATCAGA
AAAAAGATCGAGGAGCCCAAGAGGCAGGCCGAGCCCAAAGAGGCATAGTTTGTCACCTCCTCCTAAAGCTATGAAGCGTAGCCCCACTCCTGATGAGAGGAGTCCGGAAG
AAGCTAGACGTAGCCCATCCCCTGGAAATCGTGACAGTCCTAGAGGAAGGAGCAGAAGTCCAAGGGGAAGAAGCAGAAGTCCAAGGGGAAGGAGCAGAAGTCCAAGAGGA
AGAAGCAGAAGTCCAAGGGGAAGGAGCAGAAGTCCAATGGATGAAGCTGAGGACTTTGATGGTGGAAGTAGGAATTATCGGAGGGAGGAAAATGGCTACAGCCGCAGCCC
GAGTCCGTTGCCCAGAGAAGAAAGGAGCCCAATAAACGACGAAGATAACAACGGTACTCCAAGGGGTGGTAGCGAGTCTGCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRRGSYSRSP
SPRRGGGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPIKRERSLERSEKRSRSPRGRPSPKRHSLSPPPKAMKRSPTPDERSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSPRGRSRSPRGRSRSPRG
RSRSPRGRSRSPMDEAEDFDGGSRNYRREENGYSRSPSPLPREERSPINDEDNNGTPRGGSESA