; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS024786 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS024786
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionextensin-like
Genome locationscaffold564:21958..22425
RNA-Seq ExpressionMS024786
SyntenyMS024786
Gene Ontology termsGO:0016043 - cellular component organization (biological process)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022143646.1 extensin-like [Momordica charantia]1.2e-2364.67Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRY-DYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKK-NEDKSPPPPSPKKSP---PPPPPK
        MGSSSLMASLVFA LV ALSF S+TSQ Y D S PPPVYYS PPP YYYTP PVYYSPPPPKNDYDYKSPPPP+K NEDKSPPPP P K P   PPPPPK
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRY-DYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKK-NEDKSPPPPSPKKSP---PPPPPK

Query:  ----------KSRPPPPPPKKSRPPPP------PKKSPPP--PPPKKSPPP----PPPKKSPPPPKET--DYKSPPPPPSPYYY
                  +  PPPP P+  R PPP      P++SPPP  P P++SPPP    P P++SPPPP       +SPPPPPSPYYY
Subjt:  ----------KSRPPPPPPKKSRPPPP------PKKSPPP--PPPKKSPPP----PPPKKSPPPPKET--DYKSPPPPPSPYYY

XP_022143647.1 extensin-like [Momordica charantia]4.8e-4479.35Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYDYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPPPKKSRPP
        MGSSSLMASLVFAALVVALSFRS+TSQ YDYS PPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPS                
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYDYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPPPKKSRPP

Query:  PPPPKKSRPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY
                    PKKSPPPPP KKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY
Subjt:  PPPPKKSRPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY

XP_022936365.1 extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita moschata]3.0e-2261.24Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNED----KSPPPPSPKKSPPPPPP
        M   S++  LV A  VVALS  S++++ YD  YS PPPVYYSP PP  Y +P PV YSPPPPK D +YKSPPPP   +     K+PPPP  KKSPPPPPP
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNED----KSPPPPSPKKSPPPPPP

Query:  KKSRPPPPPPKKSRPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETD----------------YKSPPPPPSPYYY
        +K  PPPP PKKS PPPPP KKSPPPP PKKSPPPPPPKKSPPPP +                  YKSPPPPPSPYYY
Subjt:  KKSRPPPPPPKKSRPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETD----------------YKSPPPPPSPYYY

XP_022936366.1 extensin-like isoform X2 [Cucurbita moschata]5.5e-2467.28Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNED----KSPPPPSPKKSPPPPPP
        M   S++  LV A  VVALS  S++++ YD  YS PPPVYYSP PP  Y +P PV YSPPPPK D +YKSPPPP   +     K+PPPP  KKSPPPPPP
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNED----KSPPPPSPKKSPPPPPP

Query:  KKSRPPPPPPKKSRPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY
        +K  PPPP PKKS PPPPP KKSPPPP PKKSPPPPPPKKSPPPP    YKSPPPPPSPYYY
Subjt:  KKSRPPPPPPKKSRPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY

XP_022976650.1 extensin-3-like [Cucurbita maxima]2.3e-2269.18Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPP-PKKS
        MG  S++  LV A  VVALS  S+T++ YD  YS PPPV YS PPP       P YYSPPPPK D +YKSPPPP+    KSPPPP P+K PPPPP PKKS
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPP-PKKS

Query:  RPPPPPPKKSRPPPPPKKSPPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY
         PPPPP KKS PPP PKKSPPPPPP KKSPPPPPPKKSPPPP    YKSPPPPPSPYYY
Subjt:  RPPPPPPKKSRPPPPPKKSPPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CQW9 extensin-like6.0e-2464.67Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRY-DYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKK-NEDKSPPPPSPKKSP---PPPPPK
        MGSSSLMASLVFA LV ALSF S+TSQ Y D S PPPVYYS PPP YYYTP PVYYSPPPPKNDYDYKSPPPP+K NEDKSPPPP P K P   PPPPPK
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRY-DYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKK-NEDKSPPPPSPKKSP---PPPPPK

Query:  ----------KSRPPPPPPKKSRPPPP------PKKSPPP--PPPKKSPPP----PPPKKSPPPPKET--DYKSPPPPPSPYYY
                  +  PPPP P+  R PPP      P++SPPP  P P++SPPP    P P++SPPPP       +SPPPPPSPYYY
Subjt:  ----------KSRPPPPPPKKSRPPPP------PKKSPPP--PPPKKSPPP----PPPKKSPPPPKET--DYKSPPPPPSPYYY

A0A6J1CRF7 extensin-like2.3e-4479.35Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYDYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPPPKKSRPP
        MGSSSLMASLVFAALVVALSFRS+TSQ YDYS PPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPS                
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYDYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPPPKKSRPP

Query:  PPPPKKSRPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY
                    PKKSPPPPP KKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY
Subjt:  PPPPKKSRPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY

A0A6J1F841 extensin-like isoform X22.7e-2467.28Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNED----KSPPPPSPKKSPPPPPP
        M   S++  LV A  VVALS  S++++ YD  YS PPPVYYSP PP  Y +P PV YSPPPPK D +YKSPPPP   +     K+PPPP  KKSPPPPPP
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNED----KSPPPPSPKKSPPPPPP

Query:  KKSRPPPPPPKKSRPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY
        +K  PPPP PKKS PPPPP KKSPPPP PKKSPPPPPPKKSPPPP    YKSPPPPPSPYYY
Subjt:  KKSRPPPPPPKKSRPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY

A0A6J1FDF6 extensin-3-like isoform X11.5e-2261.24Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNED----KSPPPPSPKKSPPPPPP
        M   S++  LV A  VVALS  S++++ YD  YS PPPVYYSP PP  Y +P PV YSPPPPK D +YKSPPPP   +     K+PPPP  KKSPPPPPP
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNED----KSPPPPSPKKSPPPPPP

Query:  KKSRPPPPPPKKSRPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETD----------------YKSPPPPPSPYYY
        +K  PPPP PKKS PPPPP KKSPPPP PKKSPPPPPPKKSPPPP +                  YKSPPPPPSPYYY
Subjt:  KKSRPPPPPPKKSRPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETD----------------YKSPPPPPSPYYY

A0A6J1IK20 extensin-3-like1.1e-2269.18Show/hide
Query:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPP-PKKS
        MG  S++  LV A  VVALS  S+T++ YD  YS PPPV YS PPP       P YYSPPPPK D +YKSPPPP+    KSPPPP P+K PPPPP PKKS
Subjt:  MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYD--YSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPP-PKKS

Query:  RPPPPPPKKSRPPPPPKKSPPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY
         PPPPP KKS PPP PKKSPPPPPP KKSPPPPPPKKSPPPP    YKSPPPPPSPYYY
Subjt:  RPPPPPPKKSRPPPPPKKSPPPPPP-KKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein2.3e-0459.56Show/hide
Query:  YDYSHPPP---VYYSPPPPSYYYTPLP----VYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPPPKKSRPPPPPPKKSRPPPPP--KKSPPP
        Y YS PPP   VY SPPPP Y Y   P    VY SPPPP   Y YKSPPPP       PPPP   KSPPPPP   S PPPPP   S PPPPP   KSPPP
Subjt:  YDYSHPPP---VYYSPPPPSYYYTPLP----VYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPPPKKSRPPPPPPKKSRPPPPP--KKSPPP

Query:  PPPKKSPPPPPP--KKSPPPPKETDYKSPPPPPSPY
        PP   SPPPPPP   +SPPPP    Y SPPPPP  Y
Subjt:  PPPKKSPPPPPP--KKSPPPPKETDYKSPPPPPSPY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTCTTCTTCTTTAATGGCCTCCCTTGTTTTTGCAGCTTTGGTGGTAGCTCTAAGCTTCCGATCCTCAACCTCTCAACGCTATGACTACTCTCATCCACCTCCGGT
TTATTATTCTCCTCCACCGCCAAGCTACTACTATACGCCACTGCCTGTTTATTACTCCCCTCCGCCTCCGAAGAATGACTACGACTACAAGTCTCCACCGCCACCAAAAA
AGAACGAAGATAAATCACCTCCACCACCGTCACCAAAGAAGTCACCTCCACCACCACCACCAAAGAAGTCCCGTCCTCCACCTCCGCCACCAAAGAAGTCCCGTCCTCCA
CCACCGCCAAAGAAGTCCCCTCCACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCCTCCTCCGCCACCACCAAAGAAGTCGCCACCACCACCAAAAGAAACCGATTACAAGTCGCCTCC
TCCCCCGCCGTCTCCTTACTACTATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTTCTTCTTCTTTAATGGCCTCCCTTGTTTTTGCAGCTTTGGTGGTAGCTCTAAGCTTCCGATCCTCAACCTCTCAACGCTATGACTACTCTCATCCACCTCCGGT
TTATTATTCTCCTCCACCGCCAAGCTACTACTATACGCCACTGCCTGTTTATTACTCCCCTCCGCCTCCGAAGAATGACTACGACTACAAGTCTCCACCGCCACCAAAAA
AGAACGAAGATAAATCACCTCCACCACCGTCACCAAAGAAGTCACCTCCACCACCACCACCAAAGAAGTCCCGTCCTCCACCTCCGCCACCAAAGAAGTCCCGTCCTCCA
CCACCGCCAAAGAAGTCCCCTCCACCACCGCCACCGAAGAAGTCGCCTCCTCCGCCACCACCAAAGAAGTCGCCACCACCACCAAAAGAAACCGATTACAAGTCGCCTCC
TCCCCCGCCGTCTCCTTACTACTATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSSSLMASLVFAALVVALSFRSSTSQRYDYSHPPPVYYSPPPPSYYYTPLPVYYSPPPPKNDYDYKSPPPPKKNEDKSPPPPSPKKSPPPPPPKKSRPPPPPPKKSRPP
PPPKKSPPPPPPKKSPPPPPPKKSPPPPKETDYKSPPPPPSPYYY