CuGenDBv2

Gene ID	MS024788
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Extensin like
Genome location	scaffold564:54922..55599
RNA-Seq Expression	MS024788
Synteny	MS024788
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAF5955086.1 hypothetical protein HYC85_007942 [Camellia sinensis]

1.2e-16

50.9

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        G  S+MA L+  VL+AV+SL  P  T   Y +Y +PPPP     PP         PPPPPVHYSPP         PPPPPVY      PPPPP Y   +P
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           PPPP  K  + +SPPPP    KSPPPP      ++ PPPPPKK     SPPPPP K K+PPP         PPPP K P   S PPPPP K  SPPP
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        PP   K+KSPPPPPP K           Y+YKSPPPPPP  Y+YKSPPPP         PPP  YEYKSPPPPP  Y Y
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KAF9855548.1 hypothetical protein H0E87_006947 [Populus deltoides]

2.0e-14

51.17

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        SSMA L+  +LVA +SL  PS T+  Y  Y +PPPP     PP         PPPPPVH  PP        SPPPPP              Y SPPPPP 
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        +SP  P+       PPPP P     + PPPPKK       PPPP++   PPPPPK     KSPPPP  K K+PPPPPP  K  S PPPPP K  SPPPP 
Subjt:  YSPHAPT-----DYPPPPSPKKNEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPPK-----KSPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPP

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           K+KSPPPPP   Y+YKSPPPPP   Y+YKSPPPPPP   Y+YKSPPPPP   Y
Subjt:  KKNKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYY

PSS19487.1 Extensin like [Actinidia chinensis var. chinensis]

8.1e-16

52.19

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        G    MA L+  +LVA++SL  P  T   Y  Y+  PPP     P  S  PPPPP HY  P       PPPPPV+YSPPP P Y   +P   PPPP   K
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Query:  NEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPPK----KSPPPPPPKK----KTPPP---------PPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKS
         +   PPPPKK       PPPP++   PPPPP     KSPPPPPPKK     +PPP         PPPP K+P   S PPPPP K  SPPPPP   K+KS
Subjt:  NEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPPK----KSPPPPPPKK----KTPPP---------PPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKS

Query:  PPPPPPTK-YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
        PPPPPP K Y+Y SPPPPP   Y+YKSPPPPPP   Y+YKSPPPPP P++Y
Subjt:  PPPPPPTK-YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY

XP_022039692.1 extensin-3-like [Helianthus annuus]

1.6e-16

51.67

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        G+ S +  L++ +LV ++SL FPS T   Y  Y +PPPP+    PP +        PPPPPV+ SPP          SPPPPP    +Y SPPPPP    
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        H     PPPP PKK+ E  SPPPP        KSPPPP        ++ PPPPPK     KSPPPPPPKK    K+PPPPPP    +   PPPPPKK   
Subjt:  HAPTDYPPPPSPKKN-EDNSPPPPK-------KSPPPP------WRRTRPPPPPK-----KSPPPPPPKK----KTPPPPPPPKK-RPSRPPPPPKKR--

Query:  ---PSPPPPPKKNKHKSPPPPPP-TKYEYKSPPPPPPTK-YEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
           P PPPP K  ++KSPPPPPP T Y+YKSPPPPPP K YEYKSPPPPPP   YEYKSPPPPP   +Y
Subjt:  ---PSPPPPPKKNKHKSPPPPPP-TKYEYKSPPPPPPTK-YEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY

XP_028060313.1 extensin-like [Camellia sinensis]

1.2e-16

50.9

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        G  S+MA L+  VL+AV+SL  P  T   Y +Y +PPPP     PP         PPPPPVHYSPP         PPPPPVY      PPPPP Y   +P
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Query:  TDYPPPPSPKKNEDNSPPPPK---KSPPPP----WRRTRPPPPPKK-----SPPPPPPKKKTPPP---------PPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPP
           PPPP  K  + +SPPPP    KSPPPP      ++ PPPPPKK     SPPPPP K K+PPP         PPPP K P   S PPPPP K  SPPP
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Query:  PPKKNKHKSPPPPPPTK-----------YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPP---------PPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
        PP   K+KSPPPPPP K           Y+YKSPPPPPP  Y+YKSPPPP         PPP  YEYKSPPPPP  Y Y
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A2R6R2L8 Extensin like

3.9e-16

52.19

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        G    MA L+  +LVA++SL  P  T   Y  Y+  PPP     P  S  PPPPP HY  P       PPPPPV+YSPPP P Y   +P   PPPP   K
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Query:  NEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPPK----KSPPPPPPKK----KTPPP---------PPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKS
         +   PPPPKK       PPPP++   PPPPP     KSPPPPPPKK     +PPP         PPPP K+P   S PPPPP K  SPPPPP   K+KS
Subjt:  NEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPPK----KSPPPPPPKK----KTPPP---------PPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKS

Query:  PPPPPPTK-YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
        PPPPPP K Y+Y SPPPPP   Y+YKSPPPPPP   Y+YKSPPPPP P++Y
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A0A2R6R2M5 Extensin like

1.3e-14

51.85

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        G    MA L+  +LVA++SL  P  T   Y  Y+  PPP     P  S  PPPPP HY  P       PPPPPV+YSPP  P Y   +P   PPPP   K
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Query:  NEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPP--KKSPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP----------PP
         +   PPPPKK       PPPP++ + PPPPP   KSPPPPPP  K   PPPPP K+P   S PPPPP K  SPPPPP   K+KSPPP          PP
Subjt:  NEDNSPPPPKK------SPPPPWRRTRPPPPP--KKSPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP----------PP

Query:  PTKYEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPY
        P  Y+YKSPPPPPP  Y+YKSPPPPPP   Y+Y SPPPPP  Y
Subjt:  PTKYEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPY

A0A4U5PV85 Uncharacterized protein

1.3e-14

51.18

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Query:  SSMACLVMAVLVAVLSLRFPSTTAQGYEDYFTPPPPSVYDSPPD-----SDSPPPPPVHYSPPDSDS---DDSPPPPPV------------YYSPPPPPS
        SSMA L   +L+  +SL  PS T   YE Y +PPPP     PP         PPPPPVH  PP          PPPPPV            Y SPPPPP 
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Query:  YSPHAPT-----DYPPPPSPKKNEDNSPPPPK--KSPPPPWR-----RTRPPPPPKKSPPPPPPKKKTPPPPP-PPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKK-
        +SP  P+       PPPP P     + PPPP   KSPPPP +     ++ PPPP  KSPPPPPP  K+PPPPP  P K  S PPPPP  +  PPPPPKK 
Subjt:  YSPHAPT-----DYPPPPSPKKNEDNSPPPPK--KSPPPPWR-----RTRPPPPPKKSPPPPPPKKKTPPPPP-PPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKK-

Query:  NKHKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPPSPYY
         K+KSPPPPP   Y+YKSPPPPPP    +KSPPPPPP   Y+YKSPPPPP+P Y
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A0A4V3WQ10 Uncharacterized protein

6.0e-17

50.9

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        G  S+MA L+  VL+AV+SL  P  T   Y +Y +PPPP     PP         PPPPPVHYSPP         PPPPPVY      PPPPP Y   +P
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Query:  TDYPPPPSPKKNEDNSPPPPK---KSPPPP----WRRTRPPPPPKK-----SPPPPPPKKKTPPP---------PPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPP
           PPPP  K  + +SPPPP    KSPPPP      ++ PPPPPKK     SPPPPP K K+PPP         PPPP K P   S PPPPP K  SPPP
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Query:  PPKKNKHKSPPPPPPTK-----------YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPP---------PPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
        PP   K+KSPPPPPP K           Y+YKSPPPPPP  Y+YKSPPPP         PPP  YEYKSPPPPP  Y Y
Subjt:  PPKKNKHKSPPPPPPTK-----------YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPP---------PPPTKYEYKSPPPPPSPYYY

A0A7J7HSR1 Uncharacterized protein

6.0e-17

50.9

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        G  S+MA L+  VL+AV+SL  P  T   Y +Y +PPPP     PP         PPPPPVHYSPP         PPPPPVY      PPPPP Y   +P
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Query:  TDYPPPPSPKKNEDNSPPPPK---KSPPPP----WRRTRPPPPPKK-----SPPPPPPKKKTPPP---------PPPPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPP
           PPPP  K  + +SPPPP    KSPPPP      ++ PPPPPKK     SPPPPP K K+PPP         PPPP K P   S PPPPP K  SPPP
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Query:  PPKKNKHKSPPPPPPTK-----------YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPPP---------PPPTKYEYKSPPPPPSPYYY
        PP   K+KSPPPPPP K           Y+YKSPPPPPP  Y+YKSPPPP         PPP  YEYKSPPPPP  Y Y
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

P06599 Extensin

4.6e-06

47.95

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        S M+ L++++LV ++SL   S T   Y  Y +PPPP    SPP  +  PPPP HY  P       PPP PVY Y  PPPP +S       PPPP      
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Query:  DNSPPPPKKSPPPPW--RRTRPPPPPKKSPPPPPP-KKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSP--------PPPPK---------KNKHKSPPPPPPTK
          SPPPPK SPPPP    + + PPPPK SP P    K K+PPPP P  K  S  PPPPK  P+P        PPPPK         K K+KSPPPP P  
Subjt:  DNSPPPPKKSPPPPW--RRTRPPPPPKKSPPPPPP-KKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSP--------PPPPK---------KNKHKSPPPPPPTK

Query:  YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPP----PPPPTKYEYKSPPPPPSPY
        Y+YKSPPPP P  Y+YKSPPP    P P   Y+YKSPPPP   Y
Subjt:  YEYKSPPPPPPTKYEYKSPPP----PPPPTKYEYKSPPPPPSPY

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 3

3.3e-04

50.99

Show/hide

Query:  PPPPSVYDSPPDSDSPP---PPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPPSYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPKKSPPP
        PPP  ++ +PP   SPP   PPP  YSPP       PPPPP  YSPPPPP   P  P   PPPP P       PPPP  SPPPP     PPPPP  SPPP
Subjt:  PPPPSVYDSPPDSDSPP---PPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPPSYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPKKSPPP

Query:  PPPKKKTPP---PPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSP-----PPPPKKNKHKSPP----PPPPTKYEYKSPPPPPPTKYEYKSPPP-PPPPTKYEYKSPPPPP
        PPP    PP   PPPPP    S PPPPP   P+P     PPPP    H  PP    PPPP  Y Y SPPPP  +   +  PPP  PPP  Y Y SPPPPP
Subjt:  PPPKKKTPP---PPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSP-----PPPPKKNKHKSPP----PPPPTKYEYKSPPPPPPTKYEYKSPPP-PPPPTKYEYKSPPPPP

Query:  SP
        +P
Subjt:  SP

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein

6.6e-08

51.61

Show/hide

Query:  PPPPSVYDSPPDS----DSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPP---SYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPP---KKSPPPPWRRTRPPPP
        PPPP VY SPP       SPPPPP  YS P       PPPP +Y SPPPPP   S  P  P  Y  PP P     + PPPP   K  PPPP+    PPPP
Subjt:  PPPPSVYDSPPDS----DSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPP---SYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPP---KKSPPPPWRRTRPPPP

Query:  P--KKSPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP-----PPPTKYEYKSPPP-------PPPTKYEYKSPPPP------P
        P   KSPPPPP    +PPPPP   K    PPPPP    SPPPPP   K   PPP     PPP  Y YKSPPP       PPP  Y YKSPPPP      P
Subjt:  P--KKSPPPPPPKKKTPPPPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKSPPP-----PPPTKYEYKSPPP-------PPPTKYEYKSPPPP------P

Query:  PPTKYEYKSPPPPPSPY
        PP  Y YKSPPPPP  Y
Subjt:  PPTKYEYKSPPPPPSPY

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein

5.6e-07

44.74

Show/hide

Query:  SSSSMACLVMAVLVAVLSLRFPSTTAQGYEDYFTPPPPSVYDSPPD--SDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPP-------------SYSP
        +S +   L+M VL     + + S         ++P PP VY+SPP    +SP PPP  Y PP       PPPP VY SPPPPP             S  P
Subjt:  SSSSMACLVMAVLVAVLSLRFPSTTAQGYEDYFTPPPPSVYDSPPD--SDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPP-------------SYSP

Query:  HAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPP---KKSPPPPWRRTRPPPPP--KKSPPPPPPKKKTPPPPP----PPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKS
          P  Y  PP P     + PPPP   K  PPPP+  + PPPPP    SPPPPP   K+PPPPP    PP   P     PPPPP    SPPPPP   K   
Subjt:  HAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPP---KKSPPPPWRRTRPPPPP--KKSPPPPPPKKKTPPPPP----PPKKRP---SRPPPPPKKRPSPPPPPKKNKHKS

Query:  PPP-----PPPTKYEYKSPPP-------PPPTKYEYKSPPPP------PPPTKYEYKSPPPPPSPY
        PPP     PPP  Y YKSPPP       PPP  Y YKSPPPP      PPP  Y YKSPPPPP  Y
Subjt:  PPP-----PPPTKYEYKSPPP-------PPPTKYEYKSPPPP------PPPTKYEYKSPPPPPSPY

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein

2.3e-05

50.99

Show/hide

Query:  PPPPSVYDSPPDSDSPP---PPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPPSYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPKKSPPP
        PPP  ++ +PP   SPP   PPP  YSPP       PPPPP  YSPPPPP   P  P   PPPP P       PPPP  SPPPP     PPPPP  SPPP
Subjt:  PPPPSVYDSPPDSDSPP---PPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPPSYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPKKSPPP

Query:  PPPKKKTPP---PPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSP-----PPPPKKNKHKSPP----PPPPTKYEYKSPPPPPPTKYEYKSPPP-PPPPTKYEYKSPPPPP
        PPP    PP   PPPPP    S PPPPP   P+P     PPPP    H  PP    PPPP  Y Y SPPPP  +   +  PPP  PPP  Y Y SPPPPP
Subjt:  PPPKKKTPP---PPPPPKKRPSRPPPPPKKRPSP-----PPPPKKNKHKSPP----PPPPTKYEYKSPPPPPPTKYEYKSPPP-PPPPTKYEYKSPPPPP

Query:  SP
        +P
Subjt:  SP

AT5G19810.1 Proline-rich extensin-like family protein

4.0e-05

51.78

Show/hide

Query:  TPPPPSVYDS---PPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPP-SYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPKKSP
        +PPPP V  S   PP + SPPPPPV+ SPP    + SPPPPPV  SPPPPP   SP  P     PP P  N    PPP   SPPPP     PPPPP    
Subjt:  TPPPPSVYDS---PPDSDSPPPPPVHYSPPDSDSDDSPPPPPVYYSPPPPP-SYSPHAPTDYPPPPSPKKNEDNSPPPPKKSPPPPWRRTRPPPPPKKSP

Query:  PPPPPKKKTPPPPP----PPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNK--HKSPPPPPPTKY--EYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPP
        PPPPP   +PPPPP    PP    +RPPPPP    SPPPP  +    +K  PPPPP KY   Y  PPPPP     YK  PPPPPP+KY     PPPP
Subjt:  PPPPPKKKTPPPPP----PPKKRPSRPPPPPKKRPSPPPPPKKNK--HKSPPPPPPTKY--EYKSPPPPPPTKYEYKSPPPPPPPTKYEYKSPPPPP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGTTCTTCTTCTTCAATGGCCTGCCTTGTTATGGCAGTTTTGGTGGCAGTTTTAAGCTTAAGGTTTCCCTCCACAACTGCCCAAGGCTATGAGGATTACTTCACCCC
TCCACCGCCATCGGTCTACGACTCTCCTCCAGACTCCGACTCTCCTCCTCCACCTCCCGTTCATTACTCTCCTCCCGACTCCGACTCCGACGACTCTCCTCCTCCACCTC
CCGTTTATTACTCTCCTCCACCACCACCCTCCTACTCTCCTCATGCGCCTACTGATTATCCTCCTCCACCATCACCGAAGAAGAACGAAGACAATTCTCCTCCGCCACCA
AAGAAGTCACCTCCTCCACCATGGAGGAGAACACGTCCACCACCACCGCCAAAGAAGTCACCACCACCGCCACCGCCAAAGAAGAAGACACCTCCTCCGCCCCCGCCACC
AAAGAAGAGACCATCACGACCCCCACCCCCACCAAAGAAGAGGCCATCTCCACCTCCGCCACCAAAGAAAAACAAACACAAGTCGCCTCCACCGCCCCCACCGACAAAGT
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SPYYY

MS024788 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome