; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS024789 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS024789
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionExtensin
Genome locationscaffold564:114946..115656
RNA-Seq ExpressionMS024789
SyntenyMS024789
Gene Ontology termsGO:0009664 - plant-type cell wall organization (biological process)
GO:0005199 - structural constituent of cell wall (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592187.1 Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.8e-6679.34Show/hide
Query:  MGSS--SMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP--IYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP
        MG S  SMA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPPPP   YKSPPPPVYYSPPPP   Y SPPPPVYYSPPPPVY S  PPPPVY+SPPPPVYHSPPPP
Subjt:  MGSS--SMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP--IYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP

Query:  IYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYS
        +YHSPPPPVY SPPPPVY+SPPPP  KSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPP+Y+S
Subjt:  IYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYS

Query:  PPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPH
        PPPPVYHSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPP    Y SPPPP  H
Subjt:  PPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPH

XP_004139745.3 extensin-3 [Cucumis sativus]8.3e-6465.36Show/hide
Query:  SSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP----------------PPPPK----YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYY---------------SPP
        S MA LL  +LVA LSLPS  A  Y YSSPP                PPPPK    YKSPPPPVY+SPPPPIY SPPPPVY+               SPP
Subjt:  SSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP----------------PPPPK----YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYY---------------SPP

Query:  PPVYHSPP------PPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-----------------KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        PPVYHSPP      PPPPVYYSPPPPVYHSPPPP+Y SPPPPVYHSPPPPVY SPPPP                  KSPPPPVY+SPPPP+YHSPPPPVY
Subjt:  PPVYHSPP------PPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-----------------KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

Query:  YSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPP---------KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPP----
         SPPPP   SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPP          KSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVY SPPPP+Y+SPPPPKKYEY SPPP    
Subjt:  YSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPP---------KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPP----

Query:  -PPPHY
         PPP Y
Subjt:  -PPPHY

XP_022143630.1 extensin-1-like [Momordica charantia]4.6e-7882.63Show/hide
Query:  MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHS
        MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP+YPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHS
Subjt:  MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHS

Query:  PPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYH
        PPPPV                               YHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYS PPPVY+
Subjt:  PPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYH

Query:  SPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPHY
        SPPPPVYYSP       PPPPKKYEYSSPPPPPPHY
Subjt:  SPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPHY

XP_022936196.1 extensin-1-like [Cucurbita moschata]5.8e-6573.36Show/hide
Query:  MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP------------------------PPPPK--YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPP
        MA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPP                        PPPPK  YKSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVYYSPPPPVY S  PPP
Subjt:  MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP------------------------PPPPK--YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPP

Query:  PVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYY
        PVY+SPPPPVYHSPPPP+YHSPPPP+Y SPPPPVY+SPPPP  KSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVYY
Subjt:  PVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYY

Query:  SPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPH
        SPPPP  KSPPPP+Y+SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPP    Y SPPPP  H
Subjt:  SPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPH

XP_023536462.1 extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-6673.58Show/hide
Query:  MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP-----------------PPPPK----YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPP------PP
        MA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPP                 PPPPK    YKSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVY+SPPPPVYHSPP      PP
Subjt:  MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP-----------------PPPPK----YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPP------PP

Query:  PPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVY
        PPVY+SPPPPVY SPPPP+YHSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY
Subjt:  PPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVY

Query:  YSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYE-----YSSPPPPPPH
        YSPPPP  KSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVY+SPPPP+YHSPPPP  Y      Y SPPPP  H
Subjt:  YSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYE-----YSSPPPPPPH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CPB2 extensin-1-like2.2e-7882.63Show/hide
Query:  MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHS
        MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP+YPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHS
Subjt:  MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHS

Query:  PPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYH
        PPPPV                               YHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYS PPPVY+
Subjt:  PPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYH

Query:  SPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPHY
        SPPPPVYYSP       PPPPKKYEYSSPPPPPPHY
Subjt:  SPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPHY

A0A6J1F6U4 extensin-1-like2.8e-6573.36Show/hide
Query:  MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP------------------------PPPPK--YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPP
        MA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPP                        PPPPK  YKSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVYYSPPPPVY S  PPP
Subjt:  MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP------------------------PPPPK--YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPP

Query:  PVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYY
        PVY+SPPPPVYHSPPPP+YHSPPPP+Y SPPPPVY+SPPPP  KSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVYY
Subjt:  PVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYY

Query:  SPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPH
        SPPPP  KSPPPP+Y+SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPP    Y SPPPP  H
Subjt:  SPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPH

A0A6J1F7A8 extensin-1-like4.5e-6367.83Show/hide
Query:  SSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYS-----------------------SPP------PPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYH
        +SS+ASL+I +LV ALS+PS+ A  Y Y+                       SPP      PPPP YKSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVY SPPPP+Y 
Subjt:  SSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYS-----------------------SPP------PPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYH

Query:  SPP------PPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP---------KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPP
        SPP      PPPPVY+SPPPPVY SPPPP+Y SPPPPVY SPPPPVYYSPPPP          KSPPPPVYYSPPPP+YHSPPPPVY SPPPP   SPPP
Subjt:  SPP------PPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP---------KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPP

Query:  PVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPP------PPPPHY
        PVY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPP  KSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP+YHSPPPP    YSSPP      PPPP Y
Subjt:  PVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPP------PPPPHY

A0A6J1IER1 extensin-3-like2.0e-6369.26Show/hide
Query:  MGSS--SMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP----------------PPPPK----YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPP--
        MG S  SMA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPP                PPPPK    YKSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVY+SPPPPVYHS P  
Subjt:  MGSS--SMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPP----------------PPPPK----YKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPP--

Query:  -------------PPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP---------KK
                     PPPPVYYSPPPPVY SPPPP+YHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP  KSPPP VY+SPPPP+YHSPPPP+Y SPPPP          K
Subjt:  -------------PPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP---------KK

Query:  SPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPH
        SPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY+SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP+Y SPPPP    Y SPPPP  H
Subjt:  SPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPH

A0A6J1IP49 extensin-3-like6.0e-6070.63Show/hide
Query:  SSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYS---------------SPP------PPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPV
        +SSMASL+I VLV ALS+  + A  Y Y+               SPP      PPPP Y SPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVYYSPPPPVYHS  PPPPV
Subjt:  SSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYS---------------SPP------PPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPV

Query:  YYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSP
        YYSPPPPVY SPPPP+Y SPPPPVY+SPPPPVY SPPPP   SPPPPVYYSPPPP+Y SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SP
Subjt:  YYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSP

Query:  PPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKY-----EYSSPP------PPPPHY
        PPP   SPPPPVY SPPPPVY SPPPPVY SPPPP+Y SPPPP  Y      Y SPP      PPPP Y
Subjt:  PPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKY-----EYSSPP------PPPPHY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q38913 Extensin-11.4e-4567.66Show/hide
Query:  YSSPPP------PPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPP------PPPVYYSP--------PPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSP
        Y SPPP      PPP YKSPPPPV +  PPP+Y SPPPPV +  PPPVY SPPP      PPPVY SP        PPPVY SPPPP+ H  PPPVY SP
Subjt:  YSSPPP------PPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPP------PPPVYYSP--------PPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSP

Query:  PPPV-YYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPV-YYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPP-PKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV
        PPPV YYSPPP  KSPPPPV +  PPP+Y SPPPPV YYSPPP  KSPPPPV+YSPPP VY SPPPPV+YSPPP    SPPPPV+YSPPP VYHSPPPPV
Subjt:  PPPV-YYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPV-YYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPP-PKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV

Query:  YYSPPPPIYHSPPPPKKYE-----YSSPPPPPPHY
        +YSPPP +YHSPPPP  Y      Y SPPPP  HY
Subjt:  YYSPPPPIYHSPPPPKKYE-----YSSPPPPPPHY

Q9FS16 Extensin-37.4e-3965.27Show/hide
Query:  YGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP----IYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPP--VYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPP----VYHSPPPPV-YYS
        Y Y SPPPP   Y   PPPVY+SPPPP    +Y SPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H  PPP+YHSPPPP    VY SPPPPV +YS
Subjt:  YGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP----IYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPP--VYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPP----VYHSPPPPV-YYS

Query:  PPPPKKSPPPP----VYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPK-----KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPP----VYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPP----V
        PPP   SPPPP    VY SPPPP+ H  PPPVY+SPPPPK     KSPPPPV +  PPPVY SPPPP    VY SPPPP K   PPPVY+SPPPP    V
Subjt:  PPPPKKSPPPP----VYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPK-----KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPP----VYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPP----V

Query:  YHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPK-KYEYSSPPPPPPHY
        Y SPPPPV +  PPP+YHSPPPPK KY Y SPPPPP H+
Subjt:  YHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPK-KYEYSSPPPPPPHY

Q9LJ64 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 11.0e-2767.82Show/hide
Query:  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYS
        SPPPPPP + SPPPPV +SPPPP++ SPPPPV YSPPPPV HSPPPPP   +SPPPPV HSPPPP+ HSPPPPV HSPPPPV +SPPPP  SPPPPV   
Subjt:  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYS

Query:  PPPPIYHSPPP-PVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPP
        PPPP++  PPP P+Y  PPPP  SPPPPV+  PPPPV+ SPPPPV +SPPPP  SPPPPV +SPPPPV+  PPP   YSPPPP++  PP P      +P 
Subjt:  PPPPIYHSPPP-PVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPKKYEYSSPP

Query:  PP
        PP
Subjt:  PP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 32.2e-2760.5Show/hide
Query:  YSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPP-------PVYYS--PPPP
        YS PPPPPP    PPPP  YSPPPP  P PPPP  YSPPPP   SPPPPPP  YSPPPP    PPPP+Y  PPPPVY SPPP       PVY +  PPPP
Subjt:  YSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPP-------PVYYS--PPPP

Query:  KKSPPPPVYYSPPP-PIYHSPPPPVYYSP----PPPKKSPPPPV--YYSPPPPVYP--SPPPPVYYSPPPP----KKSPPPP-VYYSPPPP---VYHS--
          SPPPP +  PPP P Y+S PPP + SP    PPP  SPPPP+  Y SPPPP  P  SPPP   YSPPPP    +  PPPP + YSPPPP   V++S  
Subjt:  KKSPPPPVYYSPPP-PIYHSPPPPVYYSP----PPPKKSPPPPV--YYSPPPPVYP--SPPPPVYYSPPPP----KKSPPPP-VYYSPPPP---VYHS--

Query:  PPPPVYYS--PPPPIYH-SPPPPKKYEYSSPPPPPPHY
        PPPPVYYS  PPPP+Y+ SPPPP    YSSPPPP  HY
Subjt:  PPPPVYYS--PPPPIYH-SPPPPKKYEYSSPPPPPPHY

Q9XIL9 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 38.8e-3267.92Show/hide
Query:  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIY-PSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYY
        SPPPPP     PP P++  PPPP+Y P PPPPVY  PPPP  +SPPPPPPV +SPPPPV HSPPPP+ HSPPPPV HSPPPPV +SPPPP  SPPPPV Y
Subjt:  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIY-PSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYY

Query:  SPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPP--------PPK
        SPPPP  HSPPPPV +SPPPP  SPPPPVY  PPPP   SPPPPV +SPPPP  SPPPPV YSPPPPVY  PPPPV   PPPP+Y SPP        PP 
Subjt:  SPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPP--------PPK

Query:  KYEYSSPPPPPP
        +   +SPPP  P
Subjt:  KYEYSSPPPPPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21310.1 extensin 35.3e-4065.27Show/hide
Query:  YGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP----IYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPP--VYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPP----VYHSPPPPV-YYS
        Y Y SPPPP   Y   PPPVY+SPPPP    +Y SPPPPV +  PPPVYHSPPPP    VY SPPPPV H  PPP+YHSPPPP    VY SPPPPV +YS
Subjt:  YGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP----IYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPP--VYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPP----VYHSPPPPV-YYS

Query:  PPPPKKSPPPP----VYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPK-----KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPP----VYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPP----V
        PPP   SPPPP    VY SPPPP+ H  PPPVY+SPPPPK     KSPPPPV +  PPPVY SPPPP    VY SPPPP K   PPPVY+SPPPP    V
Subjt:  PPPPKKSPPPP----VYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPK-----KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPP----VYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPP----V

Query:  YHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPK-KYEYSSPPPPPPHY
        Y SPPPPV +  PPP+YHSPPPPK KY Y SPPPPP H+
Subjt:  YHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPK-KYEYSSPPPPPPHY

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein7.3e-3468.5Show/hide
Query:  YGYSSPPPPPPKYKSPPPP--VYYSPPPP--IYPSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPPPPVYYSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPP-
        Y YSSPPPPP  YKSPPPP  VY SPPPP  IY SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPPP VY SPPPP  VY SPPPP  +Y+SPPPP  VY SPPPP 
Subjt:  YGYSSPPPPPPKYKSPPPP--VYYSPPPP--IYPSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPPPPVYYSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPP-

Query:  -VYYSPPPPK---KSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP--VYYSPPPP--VYPSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP-
         VY SPPPP    KSPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  VY SPPPP    KSPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP    KSPPPP 
Subjt:  -VYYSPPPPK---KSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP--VYYSPPPP--VYPSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP-

Query:  -VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPHY
         VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  Y YSSPPPPP  Y
Subjt:  -VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPPKKYEYSSPPPPPPHY

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein3.6e-3367.59Show/hide
Query:  YGYSSPPPPPPKYKSPPPP--VYYSPPPP--IYPSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPPPPVYYSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPPV
        Y YSSPPPPP  Y SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPPP VY SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  VY SPPPP 
Subjt:  YGYSSPPPPPPKYKSPPPP--VYYSPPPP--IYPSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPPPPVYYSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPPV

Query:  Y-YSPPPPK----KSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP--VYYSPPPP--VYPSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP-
        Y YSPPPP     +SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  VY SPPPP    KSPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP    KSPPPP 
Subjt:  Y-YSPPPPK----KSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP--VYYSPPPP--VYPSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP-

Query:  -VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYYSPPPPIY-HSPPPPKKYEYSSPPPPPPHY
         VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP Y +S PPP  Y YSSPPPPP  Y
Subjt:  -VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYYSPPPPIY-HSPPPPKKYEYSSPPPPPPHY

AT2G15880.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein6.2e-3367.92Show/hide
Query:  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIY-PSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYY
        SPPPPP     PP P++  PPPP+Y P PPPPVY  PPPP  +SPPPPPPV +SPPPPV HSPPPP+ HSPPPPV HSPPPPV +SPPPP  SPPPPV Y
Subjt:  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIY-PSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYY

Query:  SPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPP--------PPK
        SPPPP  HSPPPPV +SPPPP  SPPPPVY  PPPP   SPPPPV +SPPPP  SPPPPV YSPPPPVY  PPPPV   PPPP+Y SPP        PP 
Subjt:  SPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPP--------PPK

Query:  KYEYSSPPPPPP
        +   +SPPP  P
Subjt:  KYEYSSPPPPPP

AT2G43150.1 Proline-rich extensin-like family protein4.8e-3362.33Show/hide
Query:  LVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPP
        +V + AL + SA A    Y S PPPP +YKSPPPPV   PPP  Y SPPPPV  SPPPP Y         Y+SPPPPV   PPP +Y SPPPPV   PPP
Subjt:  LVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPP

Query:  PVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYY-SPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYY-SPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYS
          Y+SPPPP KSPPPP YY  PPP   SPPPP YY SPPPP KSPPPP YY  PPP   SPPPP YY SPPPP KSPPPP  YS PPP   SPPPPVY  
Subjt:  PVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYY-SPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYY-SPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYS

Query:  PPPPIYHSPPPPKKY
            IY SPPPP  Y
Subjt:  PPPPIYHSPPPPKKY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATCGTCTTCAATGGCTTCCCTTCTTATTCTAGTCTTGGTGGCAGCTCTAAGCTTGCCGTCGGCCACCGCGGGAGGCTACGGTTACTCTTCCCCTCCTCCGCCACC
TCCTAAATATAAATCACCGCCGCCGCCGGTGTACTACTCTCCTCCTCCACCAATTTATCCCTCTCCCCCACCTCCGGTGTATTACTCTCCTCCCCCACCAGTTTATCATT
CTCCTCCGCCACCACCTCCTGTTTACTACTCTCCACCACCACCAGTTTATCACTCTCCTCCACCTCCCATCTATCATTCTCCTCCACCACCAGTCTACCACTCTCCTCCA
CCACCGGTTTATTACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCCGTGTACTACTCTCCTCCACCACCGATCTACCACTCTCCTCCACCGCCGGTCTATTACTC
TCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCAGTATACTACTCTCCTCCACCACCAGTCTACCCGTCTCCTCCACCGCCAGTCTATTATTCTCCTCCACCTCCTAAGA
AGTCACCACCACCTCCCGTGTACTACTCTCCCCCGCCACCAGTTTACCACTCCCCTCCTCCACCAGTTTACTACTCTCCTCCCCCACCGATTTATCACTCTCCCCCACCA
CCAAAAAAGTACGAGTACTCGTCACCCCCGCCACCTCCTCCCCACTATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGATCGTCTTCAATGGCTTCCCTTCTTATTCTAGTCTTGGTGGCAGCTCTAAGCTTGCCGTCGGCCACCGCGGGAGGCTACGGTTACTCTTCCCCTCCTCCGCCACC
TCCTAAATATAAATCACCGCCGCCGCCGGTGTACTACTCTCCTCCTCCACCAATTTATCCCTCTCCCCCACCTCCGGTGTATTACTCTCCTCCCCCACCAGTTTATCATT
CTCCTCCGCCACCACCTCCTGTTTACTACTCTCCACCACCACCAGTTTATCACTCTCCTCCACCTCCCATCTATCATTCTCCTCCACCACCAGTCTACCACTCTCCTCCA
CCACCGGTTTATTACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCCGTGTACTACTCTCCTCCACCACCGATCTACCACTCTCCTCCACCGCCGGTCTATTACTC
TCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCAGTATACTACTCTCCTCCACCACCAGTCTACCCGTCTCCTCCACCGCCAGTCTATTATTCTCCTCCACCTCCTAAGA
AGTCACCACCACCTCCCGTGTACTACTCTCCCCCGCCACCAGTTTACCACTCCCCTCCTCCACCAGTTTACTACTCTCCTCCCCCACCGATTTATCACTCTCCCCCACCA
CCAAAAAAGTACGAGTACTCGTCACCCCCGCCACCTCCTCCCCACTATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPIYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPP
PPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPIYHSPPP
PKKYEYSSPPPPPPHY