; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS025486 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS025486
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionBifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein
Genome locationscaffold13:1072208..1072639
RNA-Seq ExpressionMS025486
SyntenyMS025486
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG0710782.1 PH and SEC7 domain-containing protein 3 [Chionoecetes opilio]1.0e-0843.3Show/hide
Query:  HAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPH
        H P + T RA  H P + T RA  H P + T RA  H P + T RA  H P + TLRA    P + T RA  H P + T RA  H P + TLRA  H
Subjt:  HAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPH

XP_013719218.2 non-classical arabinogalactan protein 30-like [Brassica napus]1.9e-1042.27Show/hide
Query:  PAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAP
        P  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP
Subjt:  PAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAP

XP_013776489.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 2 [Limulus polyphemus]1.1e-1036.05Show/hide
Query:  PMAPDCRTFF---NVRFCLDHGIPANGIPTFNLRA----APGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHA
        P AP C T     +  +C +  +P    P  N+      AP       P HAP   T  +P HAP   T  +P HAP      +  HAP   T  +P HA
Subjt:  PMAPDCRTFF---NVRFCLDHGIPANGIPTFNLRA----APGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHA

Query:  PRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPH
        P   T  +PP  P   T  +PPHAP   T  +PPHAP   T  +PPH
Subjt:  PRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPH

XP_022574007.1 non-classical arabinogalactan protein 31-like [Brassica napus]6.5e-1140.57Show/hide
Query:  APGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRI
        AP    +  P  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP +
Subjt:  APGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRI

Query:  TTLRAP
        + L+AP
Subjt:  TTLRAP

XP_033146313.1 non-classical arabinogalactan protein 31-like [Brassica rapa]7.2e-1040.57Show/hide
Query:  APGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRI
        AP    +  P  AP  + L+AP  AP ++ L+AP  AP +  L+AP  AP +  L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP ++ L+AP  AP +
Subjt:  APGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRI

Query:  TTLRAP
        + L+AP
Subjt:  TTLRAP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A093GR73 Protein FAM186A (Fragment)6.1e-0740.57Show/hide
Query:  APGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRI
        AP   +   P  APR+    AP  APR+    AP  APR+    AP  APR+    AP  APR+    AP  APR+    AP  APR+    AP  APR+
Subjt:  APGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRI

Query:  TTLRAP
            AP
Subjt:  TTLRAP

A0A1X7S2M2 Uncharacterized protein6.3e-0436.44Show/hide
Query:  ANGIPTFNLRAAPGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRIT
        + G P     AAP       P  AP +    AP  AP +    AP  AP +    AP  AP +    AP  AP +    APP AP +    APP AP   
Subjt:  ANGIPTFNLRAAPGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRIT

Query:  TLRAPPHAPRITTLRAPP
          RAPP AP ++   APP
Subjt:  TLRAPPHAPRITTLRAPP

A0A3B4FB13 Centrosomal protein of 295 kDa-like6.3e-0444.12Show/hide
Query:  CPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHA---PRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRA
        C  H  R+    AP HAP +    AP  AP    L+ P HAP +  L  P HA   P + T RAPP AP     RAPPHAP     +APP AP    L+A
Subjt:  CPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHA---PRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRA

Query:  PP
        PP
Subjt:  PP

A0A6A5EMU3 Uncharacterized protein1.2e-0741.94Show/hide
Query:  PRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAP
        P  TT +AP   P+ TT +AP   P+ TT +AP   P+ TT +AP   P+ TT +AP   P+ TT +AP   P+ TT +AP   P+ TT + P
Subjt:  PRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G22505.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein5.7e-0535.29Show/hide
Query:  PAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLR----APAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRA
        P  AP ++  R P ++P  T   +P  AP +   R    AP  AP ++  R P  +P  T   +PP+ P  +  RAPP +P  T   +PP AP I+  R 
Subjt:  PAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLR----APAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRA

Query:  PP
        PP
Subjt:  PP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACCCCTATGGCTCCGGACTGTCGAACATTCTTCAATGTTAGGTTCTGTCTTGATCACGGGATTCCAGCCAATGGGATTCCTACCTTCAACTTGAGGGCGGCTCCGGG
TTATTGCGTTGTCTTCTGTCCGGCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCGGCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCGGCTCATGCTCCTCGAA
TAACGACGTTGAGGGCTCCTGCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCTGCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCTCCTCTTGCTCCTCGAATA
ACGACATTGAGGGCTCCTCCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCTCCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCTCCTCATCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACCCCTATGGCTCCGGACTGTCGAACATTCTTCAATGTTAGGTTCTGTCTTGATCACGGGATTCCAGCCAATGGGATTCCTACCTTCAACTTGAGGGCGGCTCCGGG
TTATTGCGTTGTCTTCTGTCCGGCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCGGCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCGGCTCATGCTCCTCGAA
TAACGACGTTGAGGGCTCCTGCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCTGCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCTCCTCTTGCTCCTCGAATA
ACGACATTGAGGGCTCCTCCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCTCCTCATGCTCCTCGAATAACGACGTTGAGGGCTCCTCCTCATCCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTPMAPDCRTFFNVRFCLDHGIPANGIPTFNLRAAPGYCVVFCPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPAHAPRITTLRAPPLAPRI
TTLRAPPHAPRITTLRAPPHAPRITTLRAPPHP