; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS025556 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS025556
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptioncaldesmon-like
Genome locationscaffold703:725628..726599
RNA-Seq ExpressionMS025556
SyntenyMS025556
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR006668 - Magnesium transporter, MgtE intracellular domain
IPR021455 - Protein of unknown function DUF3106
IPR038076 - MgtE, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
OLC33750.1 hypothetical protein AUH81_13245 [Candidatus Rokubacteria bacterium 13_1_40CM_4_69_5]1.1e-1226.69Show/hide
Query:  GAAVEQVKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREKTRAAFNEGK----------VKEI--WSKMTSEEREKTLVAFK--
        G  +E +  +  A  E+  E W +MTP+ER++ +  +R       W  MTPEERE  R  F   +          +++I  W+++ ++ R++   A++  
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Query:  -----EGKVKEI-----WSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGK----------VKEI-
             EG+ + +     +  + PEERE+    +      E W KMTPEER++    +        W  MTPEERE  +  F   +          +++I 
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Query:  -WSKMTPEEREKTQASFN-------EGKVKEI-----WSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREK
         W+++  + R++ Q ++        EG+ + +     +  + PEERE+    +      E W KMTPEER+         +++E W  MT EERE+
Subjt:  -WSKMTPEEREKTQASFN-------EGKVKEI-----WSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREK

SPP84183.1 blast:Myosin-2 heavy chain [Drosophila guanche]1.5e-1433.33Show/hide
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        K+    A EQ  E     LE      + KE+ S+ T    +K+ A   E K KE+ S+M    +    +K+ A  NE K KE+ SK T ++ E T     
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Query:  EGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQASFNEGKV
        E K KE+ S+M  ++ E T    KE K KE+ SK T ++ E T    N+ + KE  ++      +K++A  NE K KE+ SK T    +K++A+ NE K 
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Query:  KEIWSKM----TPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEERE----KTQAAFNEGKVKEIWSKMTSEERE----KTLAAFKEGKEK
        KE+ S+M    +    +K++A  NE K KE+ S+M   + E    K++A  NE K KE+ S++   + E    K+ A   E K K
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VDK82255.1 unnamed protein product [Dibothriocephalus latus]5.5e-1234.39Show/hide
Query:  EKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQVKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREKTRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVA
        EK   E      ++    A ++ KEK E    +AKE   K   +++EK   A +E K KE   KM  +ERE+               K   E++EK   A
Subjt:  EKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQVKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREKTRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVA

Query:  FKEGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEER-EKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGKV----KEIWSKMTPEEREKTQA
         KE K +E   +M  +ERE+   A KE K KE   KM  +ER EK +    E + K    K   EE+EK +A   EGK     KE   K   E++E+ + 
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Query:  SFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTSE-----EREKTLAAFKEGKEK
           E K +E   K   E++EK + A  E K KE  +K   EE+E+ + A  E K KE   K   E     EREK   A KE KEK
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XP_022157814.1 caldesmon-like [Momordica charantia]3.1e-5565.71Show/hide
Query:  MIRTTSVVVVLWVVLAMGICLEKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQ-------VKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREK
        MIRTTSVVVVL V+LA+GIC EKC  ED L SGKD SGAAVE+        KEKVEAFL++AKEIWSKMT +ERE+ LAAF+EGKVKEIWSKMTPEEREK
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Query:  TRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSK---MTPEEREKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKT
         + AF +GKVKEIWSKMT EEREKTL AFKEGKVKEIWSKMTP+EREK LA FK GK KE  +K   +  +  EK +TA NE K K    K      EK 
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Query:  QAPFNEGKVK
        +    E K K
Subjt:  QAPFNEGKVK

XP_022158313.1 uncharacterized protein LOC111024823 [Momordica charantia]3.6e-5670.95Show/hide
Query:  MIRTTSVVVVLWVVLAMGICLEKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQV-------KEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLA--AFREGKVKEIWSKMTPEER
        +IRTTSVVVVLWVVLA+GIC+EKC C+  L S KDASG  V  +       KEKVEAFL  A EIWSKMTP+EREKTLA  A+ EG  K+IWS MTP+ER
Subjt:  MIRTTSVVVVLWVVLAMGICLEKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQV-------KEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLA--AFREGKVKEIWSKMTPEER

Query:  EKTRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAF
        EKT+AA+ E KVK+IWS +T EE+EKT VAF EGKVKEIW KMT EEREKTL AFKEGKVKEIWSKMTPEER+KT ++F
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1Q7G3E2 Uncharacterized protein5.3e-1326.69Show/hide
Query:  GAAVEQVKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREKTRAAFNEGK----------VKEI--WSKMTSEEREKTLVAFK--
        G  +E +  +  A  E+  E W +MTP+ER++ +  +R       W  MTPEERE  R  F   +          +++I  W+++ ++ R++   A++  
Subjt:  GAAVEQVKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREKTRAAFNEGK----------VKEI--WSKMTSEEREKTLVAFK--

Query:  -----EGKVKEI-----WSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGK----------VKEI-
             EG+ + +     +  + PEERE+    +      E W KMTPEER++    +        W  MTPEERE  +  F   +          +++I 
Subjt:  -----EGKVKEI-----WSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGK----------VKEI-

Query:  -WSKMTPEEREKTQASFN-------EGKVKEI-----WSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREK
         W+++  + R++ Q ++        EG+ + +     +  + PEERE+    +      E W KMTPEER+         +++E W  MT EERE+
Subjt:  -WSKMTPEEREKTQASFN-------EGKVKEI-----WSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREK

A0A3B0JT43 Blast:Myosin-2 heavy chain7.4e-1533.33Show/hide
Query:  KDASGAAVEQVKEKVEAFLE------QAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKM----TPEEREKTRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVAFK
        K+    A EQ  E     LE      + KE+ S+ T    +K+ A   E K KE+ S+M    +    +K+ A  NE K KE+ SK T ++ E T     
Subjt:  KDASGAAVEQVKEKVEAFLE------QAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKM----TPEEREKTRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVAFK

Query:  EGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQASFNEGKV
        E K KE+ S+M  ++ E T    KE K KE+ SK T ++ E T    N+ + KE  ++      +K++A  NE K KE+ SK T    +K++A+ NE K 
Subjt:  EGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQASFNEGKV

Query:  KEIWSKM----TPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEERE----KTQAAFNEGKVKEIWSKMTSEERE----KTLAAFKEGKEK
        KE+ S+M    +    +K++A  NE K KE+ S+M   + E    K++A  NE K KE+ S++   + E    K+ A   E K K
Subjt:  KEIWSKM----TPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEERE----KTQAAFNEGKVKEIWSKMTSEERE----KTLAAFKEGKEK

A0A3P6TMJ7 Uncharacterized protein2.6e-1234.39Show/hide
Query:  EKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQVKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREKTRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVA
        EK   E      ++    A ++ KEK E    +AKE   K   +++EK   A +E K KE   KM  +ERE+               K   E++EK   A
Subjt:  EKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQVKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREKTRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVA

Query:  FKEGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEER-EKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGKV----KEIWSKMTPEEREKTQA
         KE K +E   +M  +ERE+   A KE K KE   KM  +ER EK +    E + K    K   EE+EK +A   EGK     KE   K   E++E+ + 
Subjt:  FKEGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEER-EKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGKV----KEIWSKMTPEEREKTQA

Query:  SFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTSE-----EREKTLAAFKEGKEK
           E K +E   K   E++EK + A  E K KE  +K   EE+E+ + A  E K KE   K   E     EREK   A KE KEK
Subjt:  SFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTSE-----EREKTLAAFKEGKEK

A0A6J1DVR1 uncharacterized protein LOC1110248231.8e-5670.95Show/hide
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        +IRTTSVVVVLWVVLA+GIC+EKC C+  L S KDASG  V  +       KEKVEAFL  A EIWSKMTP+EREKTLA  A+ EG  K+IWS MTP+ER
Subjt:  MIRTTSVVVVLWVVLAMGICLEKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQV-------KEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLA--AFREGKVKEIWSKMTPEER

Query:  EKTRAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLVAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAF
        EKT+AA+ E KVK+IWS +T EE+EKT VAF EGKVKEIW KMT EEREKTL AFKEGKVKEIWSKMTPEER+KT ++F
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A0A6J1DXM4 caldesmon-like1.5e-5565.71Show/hide
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         + AF +GKVKEIWSKMT EEREKTL AFKEGKVKEIWSKMTP+EREK LA FK GK KE  +K   +  +  EK +TA NE K K    K      EK 
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Query:  QAPFNEGKVK
        +    E K K
Subjt:  QAPFNEGKVK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCAGAACGACGTCGGTTGTGGTAGTTTTGTGGGTGGTTCTTGCGATGGGGATTTGTCTGGAGAAATGCAGCTGCGAAGATCATTTACCTTCTGGAAAAGATGCGAG
TGGAGCGGCAGTGGAACAAGTCAAAGAGAAAGTAGAAGCATTTCTTGAGCAAGCGAAAGAGATATGGTCTAAAATGACCCCGGACGAGAGAGAGAAAACACTAGCAGCTT
TTAGGGAAGGGAAAGTGAAAGAGATATGGTCCAAAATGACCCCGGAGGAGAGAGAGAAAACACGAGCAGCTTTTAATGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATG
ACCTCGGAAGAGAGAGAGAAAACACTAGTAGCTTTTAAGGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCCCGGAAGAGAGAGAGAAAACACTAGCAGCTTTTAA
GGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACTCCGGAAGAGAGAGAGAAAACACAAACAGCTTTTAATGAAGGAAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCC
CCGAAGAGAGAGAGAAAACACAAGCCCCTTTTAATGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCCCGGAAGAGAGAGAGAAAACACAAGCATCTTTTAATGAA
GGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCCCGGAAGAGAGAGAGAAAACACAAGCAGCTTTTAATGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCCCGGA
AGAGAGAGAGAAAACACAAGCAGCTTTTAATGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACTTCGGAAGAAAGAGAGAAAACACTAGCAGCTTTTAAGGAGGGGA
AAGAGAAAGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCAGAACGACGTCGGTTGTGGTAGTTTTGTGGGTGGTTCTTGCGATGGGGATTTGTCTGGAGAAATGCAGCTGCGAAGATCATTTACCTTCTGGAAAAGATGCGAG
TGGAGCGGCAGTGGAACAAGTCAAAGAGAAAGTAGAAGCATTTCTTGAGCAAGCGAAAGAGATATGGTCTAAAATGACCCCGGACGAGAGAGAGAAAACACTAGCAGCTT
TTAGGGAAGGGAAAGTGAAAGAGATATGGTCCAAAATGACCCCGGAGGAGAGAGAGAAAACACGAGCAGCTTTTAATGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATG
ACCTCGGAAGAGAGAGAGAAAACACTAGTAGCTTTTAAGGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCCCGGAAGAGAGAGAGAAAACACTAGCAGCTTTTAA
GGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACTCCGGAAGAGAGAGAGAAAACACAAACAGCTTTTAATGAAGGAAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCC
CCGAAGAGAGAGAGAAAACACAAGCCCCTTTTAATGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCCCGGAAGAGAGAGAGAAAACACAAGCATCTTTTAATGAA
GGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCCCGGAAGAGAGAGAGAAAACACAAGCAGCTTTTAATGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACCCCGGA
AGAGAGAGAGAAAACACAAGCAGCTTTTAATGAAGGGAAAGTGAAAGAGATCTGGTCCAAAATGACTTCGGAAGAAAGAGAGAAAACACTAGCAGCTTTTAAGGAGGGGA
AAGAGAAAGCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIRTTSVVVVLWVVLAMGICLEKCSCEDHLPSGKDASGAAVEQVKEKVEAFLEQAKEIWSKMTPDEREKTLAAFREGKVKEIWSKMTPEEREKTRAAFNEGKVKEIWSKM
TSEEREKTLVAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTLAAFKEGKVKEIWSKMTPEEREKTQTAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAPFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQASFNE
GKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTPEEREKTQAAFNEGKVKEIWSKMTSEEREKTLAAFKEGKEKA