; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS025624 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS025624
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRibonuclease E
Genome locationscaffold4:3859288..3860342
RNA-Seq ExpressionMS025624
SyntenyMS025624
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CDJ91739.1 unnamed protein product [Haemonchus contortus]1.3e-0943.87Show/hide
Query:  VVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLE---VVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERV
        VV   +V VG   VV E   +V+E   VVG+  VVVE   VVVE + + VVG+  VVVE+  VVVE + + VVGS  VVVE+  VV+E +V  VVGS  V
Subjt:  VVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLE---VVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERV

Query:  VVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVE----IGRVEVEIGPVGVGIG---PEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVV
        VVE+  V VE+   VV S  VV E+  V VE    +G V V +   GV +      VV +  VVVE+   VVE   VVV     VV  G  VV     VV
Subjt:  VVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVE----IGRVEVEIGPVGVGIG---PEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVV

Query:  ESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVEI
         + +VVVE+   VVE    VV     VV E+  VVVE     VV     VVE  G VVVG+ +V  VEI
Subjt:  ESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVEI

KAF8355620.1 hypothetical protein PRIPAC_97243 [Pristionchus pacificus]6.6e-1142.86Show/hide
Query:  VVAETGPEAVVNGPKAVVNGPEEGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVG
        VV   GP  VV     VV G        VVV    V V   PVV   G +V  VV +  VVV+ G VVV E  + VV    VVV+   VVV+  V  VV 
Subjt:  VVAETGPEAVVNGPKAVVNGPEEGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVG

Query:  SERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVET
           VVV  G VVV +  + VV    VVVE   V VE    VV+++ VV +   V VE   V VE   V V     VV+ A VVVE    VVE A VVV+ 
Subjt:  SERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVET

Query:  GPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVE
           VV+    VVE+   VVE A+VVV+    VV+   VVVE    VVE  G VVV  A VAVVV  A VV  +G VVV    V VV+
Subjt:  GPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVE

PKS12642.1 hypothetical protein jhhlp_000850 [Lomentospora prolificans]7.1e-1338.96Show/hide
Query:  VVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVV
        +V ETG         ERV V  GRV     V   +   +V+VE GRV+VE        +  V VE GRV VE        +  V VE GRV VE     V
Subjt:  VVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVV

Query:  ESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEI
        ++ RV  +  RV+V+ GRV VE   V V  G   VE++RV V+ G   VE++ V+VE G  +VE+    VE+GR  VE+A V VE    +VE+  V+V+ 
Subjt:  ESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEI

Query:  EPAVVE------EIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRV
            VE      E  RV VE++   V VE++RV  E  RV V +  VRV
Subjt:  EPAVVE------EIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRV

XP_013297483.1 hypothetical protein NECAME_00667 [Necator americanus]1.7e-1454.26Show/hide
Query:  VEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVE
        +E+G  VVE   VV E+G V VE+G V VE+G V V +G  VVE   VVVE+G  VVE   VVVE G  VVE G  VVE G  VVE A VVVE+G  VVE
Subjt:  VEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVE

Query:  SGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVV
         G VVV ++ AVV ++G VVVE   V +V
Subjt:  SGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVV

XP_014369222.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC106719400 [Papilio machaon]2.6e-1546.54Show/hide
Query:  EGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEV----VGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVL
        E  R+ V   R  V  GR  V  E G++ +E     V + RV VE GRV VE   ++V    RV VE GRV VE   ++V    RV VE GRV VE   +
Subjt:  EGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEV----VGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVL

Query:  EVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAV
        +V    RV VE GRV+VE G   VE+ RV  E GRV+VE GRV+VE G V V  G   VE+ RV VE G   VE+ +V VE G   VE+GR  VE+GR  
Subjt:  EVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAV

Query:  VESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVV
        VE+  V VE G   VE+GRV VE     V E GRV VE+    V VE+ RV  E GR V+
Subjt:  VESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2A6CTN9 Uncharacterized protein3.2e-1142.86Show/hide
Query:  VVAETGPEAVVNGPKAVVNGPEEGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVG
        VV   GP  VV     VV G        VVV    V V   PVV   G +V  VV +  VVV+ G VVV E  + VV    VVV+   VVV+  V  VV 
Subjt:  VVAETGPEAVVNGPKAVVNGPEEGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVG

Query:  SERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVET
           VVV  G VVV +  + VV    VVVE   V VE    VV+++ VV +   V VE   V VE   V V     VV+ A VVVE    VVE A VVV+ 
Subjt:  SERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVET

Query:  GPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVE
           VV+    VVE+   VVE A+VVV+    VV+   VVVE    VVE  G VVV  A VAVVV  A VV  +G VVV    V VV+
Subjt:  GPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVE

A0A2N3NJV7 Uncharacterized protein3.4e-1338.96Show/hide
Query:  VVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVV
        +V ETG         ERV V  GRV     V   +   +V+VE GRV+VE        +  V VE GRV VE        +  V VE GRV VE     V
Subjt:  VVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVV

Query:  ESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEI
        ++ RV  +  RV+V+ GRV VE   V V  G   VE++RV V+ G   VE++ V+VE G  +VE+    VE+GR  VE+A V VE    +VE+  V+V+ 
Subjt:  ESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEI

Query:  EPAVVE------EIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRV
            VE      E  RV VE++   V VE++RV  E  RV V +  VRV
Subjt:  EPAVVE------EIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRV

A0A4X3PSW1 Uncharacterized protein3.2e-1142.86Show/hide
Query:  VVAETGPEAVVNGPKAVVNGPEEGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVG
        VV   GP  VV     VV G        VVV    V V   PVV   G +V  VV +  VVV+ G VVV E  + VV    VVV+   VVV+  V  VV 
Subjt:  VVAETGPEAVVNGPKAVVNGPEEGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVG

Query:  SERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVET
           VVV  G VVV +  + VV    VVVE   V VE    VV+++ VV +   V VE   V VE   V V     VV+ A VVVE    VVE A VVV+ 
Subjt:  SERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVET

Query:  GPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVE
           VV+    VVE+   VVE A+VVV+    VV+   VVVE    VVE  G VVV  A VAVVV  A VV  +G VVV    V VV+
Subjt:  GPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVE

W2T229 Uncharacterized protein8.2e-1554.26Show/hide
Query:  VEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVE
        +E+G  VVE   VV E+G V VE+G V VE+G V V +G  VVE   VVVE+G  VVE   VVVE G  VVE G  VVE G  VVE A VVVE+G  VVE
Subjt:  VEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVE

Query:  SGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVV
         G VVV ++ AVV ++G VVVE   V +V
Subjt:  SGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVV

W6ND12 Uncharacterized protein (Fragment)8.2e-1542.8Show/hide
Query:  VGSERVVVEIGRVVVE-EIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGR
        VG+E  VV++G VVV+  IV+  VG+E  VV++G VVV ++ + VV    VVV++G  VV ++  EVV    VVV++G V V++G  VV+   VV ++G 
Subjt:  VGSERVVVEIGRVVVE-EIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGR

Query:  VEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRV
        V V++G V V++G V V +G +VV+    VV++G  VV+   VVV+ G  VV+ G  VV+ G  VV+  +VVV++G  VV+ G VVV++   VV ++G V
Subjt:  VEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVVVEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRV

Query:  VVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVEIG
        VV+   V VVV  A  V ++G VVV   +V VV++G
Subjt:  VVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVEIG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGAGGAGGTGATGAGTACTCAAAGCCAATATTTGGTGGAAGAACGATATCCTCTAGCGGAGGCGGTGGAGAGGCGACTGGTGGAGGAGGAGAGGGAGAAGGAGAT
GGTGGTGGCGGAGACTGGACCGGAGGCGGTGGTGAATGGACCGAAGGCGGTGGTGAATGGACCGGAGGAGGGGGAGAGAATACCGGTGGTGGTGGAGAGAAAACTGGTGG
GGGTGGGGAGAAAACCGGTGGTGGAGGAGACTGGACAGATTGTACTGGAGGTGGTGGGGAGTGAACGGGTGGTGGTGGAGATTGGACGGGTGGTGGTGGAGGAGATTGTA
CTGGAGGTGGTGGGGAGTGAACGGGTGGTGGTGGAGATTGGACGGGTGGTGGTGGAGGAGATTGTACTGGAGGTGGTGGGGAGTGAACGGGTGGTGGTGGAGATTGGACG
GGTGGTGGTGGAGGAGATTGTACTGGAGGTGGTGGGGAGTGAACGGGTGGTGGTGGAGATTGGACGGGTGGAGGTGGAGATTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGCACGGG
TGGTGGAGGAGATTGGACGGGTGGAGGTGGAGATTGGACGGGTGGAGGTGGAGATTGGACCGGTGGGGGTGGGGATTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGCACGGGTGGTG
GTGGAGATTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGCACAGGTGGTGGTGGAGACTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGGACGGGCGGTGGTGGAGAGTGGACGGGCGGTGGTGGA
GAGTGCACTGGTGGTGGTGGAGATTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGGACGGGTGGTGGTGGAGATTGAACCGGCGGTGGTGGAGGAGATTGGACGGGTGGTGGTGGAGA
GTGCACCAGTGGCGGTGGTGGTAGAGAGTGCACGGGTGGTTGAGGAGATTGGACGCGTGGTGGTGGGGAGTGAACTGGTGCGGGTGGTGGAGATTGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGAGGAGGTGATGAGTACTCAAAGCCAATATTTGGTGGAAGAACGATATCCTCTAGCGGAGGCGGTGGAGAGGCGACTGGTGGAGGAGGAGAGGGAGAAGGAGAT
GGTGGTGGCGGAGACTGGACCGGAGGCGGTGGTGAATGGACCGAAGGCGGTGGTGAATGGACCGGAGGAGGGGGAGAGAATACCGGTGGTGGTGGAGAGAAAACTGGTGG
GGGTGGGGAGAAAACCGGTGGTGGAGGAGACTGGACAGATTGTACTGGAGGTGGTGGGGAGTGAACGGGTGGTGGTGGAGATTGGACGGGTGGTGGTGGAGGAGATTGTA
CTGGAGGTGGTGGGGAGTGAACGGGTGGTGGTGGAGATTGGACGGGTGGTGGTGGAGGAGATTGTACTGGAGGTGGTGGGGAGTGAACGGGTGGTGGTGGAGATTGGACG
GGTGGTGGTGGAGGAGATTGTACTGGAGGTGGTGGGGAGTGAACGGGTGGTGGTGGAGATTGGACGGGTGGAGGTGGAGATTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGCACGGG
TGGTGGAGGAGATTGGACGGGTGGAGGTGGAGATTGGACGGGTGGAGGTGGAGATTGGACCGGTGGGGGTGGGGATTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGCACGGGTGGTG
GTGGAGATTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGCACAGGTGGTGGTGGAGACTGGACCGGAGGTGGTGGAGAGTGGACGGGCGGTGGTGGAGAGTGGACGGGCGGTGGTGGA
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GTGCACCAGTGGCGGTGGTGGTAGAGAGTGCACGGGTGGTTGAGGAGATTGGACGCGTGGTGGTGGGGAGTGAACTGGTGCGGGTGGTGGAGATTGGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAEEVMSTQSQYLVEERYPLAEAVERRLVEEEREKEMVVAETGPEAVVNGPKAVVNGPEEGERIPVVVERKLVGVGRKPVVEETGQIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIV
LEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVVVEEIVLEVVGSERVVVEIGRVEVEIGPEVVESARVVEEIGRVEVEIGRVEVEIGPVGVGIGPEVVESARVV
VEIGPEVVESAQVVVETGPEVVESGRAVVESGRAVVESALVVVEIGPEVVESGRVVVEIEPAVVEEIGRVVVESAPVAVVVESARVVEEIGRVVVGSELVRVVEIG