CuGenDBv2

Gene ID	MS025902
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	scaffold391:783371..785970
RNA-Seq Expression	MS025902
Synteny	MS025902
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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e value

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A0A0A0L1X8 Uncharacterized protein

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A0A5D3BD54 Uncharacterized protein

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Query:  VPNDSAGRKQYVLRSITDPNYVVGFVDRTESECFDLQASRNDRMVSALERTRLQDGYVSYPWERRMHETLSVPYSSSFLSILLLPKASNEVATHYNDLED
        VPNDS G+KQYVLRSITDPNYVVGFVDRTESECFDLQASR+DRMVSAL R+RLQDGYVSY WERRMHE+LSVP SSSFLSILLLPKA+NEVAT YNDLED
Subjt:  VPNDSAGRKQYVLRSITDPNYVVGFVDRTESECFDLQASRNDRMVSALERTRLQDGYVSYPWERRMHETLSVPYSSSFLSILLLPKASNEVATHYNDLED

Query:  TLARANAWLNSAQTSGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYAPLGGELPLEIKLKEGDSKLG
        TLARANAWLNSAQ +GVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYAPLGGELP+EIKLKEGDSKLG
Subjt:  TLARANAWLNSAQTSGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYAPLGGELPLEIKLKEGDSKLG

Query:  FAISRTEEGFIYVSSVMDEDDNAPSTRSGLDHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVSIFLHVFLWDRELAS
        F+I RTEEGFIYV++V DED N+PSTRSGL++LYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKV IFLH+FLWDREL +
Subjt:  FAISRTEEGFIYVSSVMDEDDNAPSTRSGLDHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVSIFLHVFLWDRELAS

Query:  SI-GAAPSRQRPTPSQPAAPARLALPPEVQLARHPNDNQIQPLPADAFSESGSNNTDESSIRMERDTAGDLSFRFHEFSLSSNW
        S+  AA +RQRPT SQPAAP RLALP EVQL R PNDNQIQPLPADAFSESGS +TDESSIR ERDTAG+LSFRFHEFSLSSNW
Subjt:  SI-GAAPSRQRPTPSQPAAPARLALPPEVQLARHPNDNQIQPLPADAFSESGSNNTDESSIRMERDTAGDLSFRFHEFSLSSNW

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G12070.1 unknown protein

4.4e-166

62.47

Show/hide

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        MDRT    ESP++R    +VLSI+C+KGSS+++EW+GDMLQTGDIVEE+ IGS   S   ++PFK G++ +Q++LHNSF++K+TSIVVRVRRG D FS+L
Subjt:  MDRTQATSESPSSR---VMVLSIECIKGSSRADEWTGDMLQTGDIVEELTIGS---SLCVRSPFKNGRSGIQRILHNSFKDKQTSIVVRVRRGRDQFSEL

Query:  HACIVPNDSAGRKQYVLRSITDPNYVVGFVDRTESECFDLQASRNDRMVSALERTRLQDGYVSYPWERRMHETLSVPYSSSFLSILLLPKAS--NEVATH
         ACIVPN+SAG++QY+LRSI DPNY VGF DRTES+C  LQ SR  RMV AL + +LQDGYVSYPWERRM E L +  SS+FLSIL LPKAS      + 
Subjt:  HACIVPNDSAGRKQYVLRSITDPNYVVGFVDRTESECFDLQASRNDRMVSALERTRLQDGYVSYPWERRMHETLSVPYSSSFLSILLLPKAS--NEVATH

Query:  YNDLEDTLARANAWLNSAQTSGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYAPLGGELPLEIKLKE
        YNDLEDTLARANAWL+ +Q +GVPIVFMNIQTESLLTKISG+TAS+TV+  SLSDLSNLAN SLYGFEDYHGVDIGVVR+VRLW+APLG E PLEIKLK+
Subjt:  YNDLEDTLARANAWLNSAQTSGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYAPLGGELPLEIKLKE

Query:  GDSKLGFAISRTEEGFIYVSSVMD-EDDNAPSTRSGLDHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVSIFLHVFL
         D+KLGF+ISRTEEGFIYVSSV D ED++AP+ RSGL  LY+EA  AS+ L++SRV NQKVLPW+VSSTGAIRC+DTVSLSQKLSLHRHAKV I LHVFL
Subjt:  GDSKLGFAISRTEEGFIYVSSVMD-EDDNAPSTRSGLDHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVSIFLHVFL

Query:  WDRELASSIGAAPSRQRP-----TPSQPAAPARLALPPEVQLARHPNDNQIQPLPADAFSESGSNNTDESSIRMERDTAGDLSFRFHEFSLSS
        WD    +   + P            ++           EV   R   D Q+ PLP            DE   R ER+ AG+ SF+F E   ++
Subjt:  WDRELASSIGAAPSRQRP-----TPSQPAAPARLALPPEVQLARHPNDNQIQPLPADAFSESGSNNTDESSIRMERDTAGDLSFRFHEFSLSS

Sequences

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CDS sequence

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CATGCTCCAGACCGGCGACATAGTGGAGGAGCTAACCATCGGGTCGTCGCTGTGCGTGAGATCCCCCTTTAAAAACGGGCGCTCCGGAATCCAAAGAATTCTCCACAATT
CCTTCAAGGACAAGCAGACGTCCATCGTGGTCCGGGTCCGCCGAGGCCGGGACCAGTTCTCGGAGCTCCACGCCTGTATCGTACCCAACGACTCCGCCGGAAGAAAGCAG
TACGTTCTCCGCTCCATCACTGACCCGAATTACGTCGTCGGGTTCGTGGATCGAACCGAATCCGAATGCTTCGACCTTCAAGCATCGAGGAATGACAGAATGGTAAGTGC
ATTAGAGAGGACAAGGCTTCAAGATGGATATGTATCATATCCATGGGAAAGAAGGATGCACGAAACCTTGTCTGTTCCATATTCCAGCTCTTTTCTCTCCATTCTTCTGC
TTCCAAAAGCTTCAAATGAAGTGGCCACTCACTACAATGACTTGGAAGACACCCTTGCCAGAGCCAATGCCTGGCTCAACTCTGCCCAGACCAGCGGCGTCCCCATTGTC
TTCATGAACATTCAGACTGAGTCTCTCTTAACCAAGATATCTGGAGATACAGCCTCTTCCACTGTCAGTGCTGGTTCCTTGTCTGATTTGTCCAACCTCGCCAATGCCAG
TCTCTACGGTTTCGAGGATTACCATGGGGTCGATATTGGTGTTGTTCGATCTGTTCGTCTATGGTATGCTCCTCTTGGAGGAGAGCTTCCTCTGGAAATCAAGCTAAAAG
AAGGAGATTCCAAGCTGGGGTTTGCCATTAGTCGCACAGAGGAGGGATTTATCTATGTTTCATCTGTGATGGATGAAGATGACAATGCGCCTTCCACAAGGTCAGGGCTG
GACCATCTGTACAAGGAAGCTGAAAATGCATCGAAATTGCTTATAATCTCAAGAGTTTCGAATCAGAAGGTGCTCCCATGGATAGTGTCTTCTACAGGGGCAATTCGATG
CTTCGACACAGTTTCACTCAGCCAGAAGCTGTCGTTGCATAGGCACGCCAAGGTCTCCATTTTCTTGCACGTCTTTTTATGGGACAGAGAATTGGCTTCTTCAATCGGCG
CCGCCCCAAGTAGGCAAAGACCCACGCCGTCGCAGCCGGCGGCTCCAGCGCGGTTGGCCTTGCCTCCAGAAGTCCAATTGGCTCGCCACCCAAATGACAACCAAATACAG
CCACTGCCGGCGGACGCGTTCAGCGAGAGCGGAAGCAATAACACTGATGAGTCGTCGATCAGAATGGAACGAGACACCGCCGGTGACCTCTCCTTTAGATTTCATGAGTT
TTCTCTATCGAGCAACTGGGTATGA

mRNA sequence

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YVLRSITDPNYVVGFVDRTESECFDLQASRNDRMVSALERTRLQDGYVSYPWERRMHETLSVPYSSSFLSILLLPKASNEVATHYNDLEDTLARANAWLNSAQTSGVPIV
FMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLANASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYAPLGGELPLEIKLKEGDSKLGFAISRTEEGFIYVSSVMDEDDNAPSTRSGL
DHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVSIFLHVFLWDRELASSIGAAPSRQRPTPSQPAAPARLALPPEVQLARHPNDNQIQ
PLPADAFSESGSNNTDESSIRMERDTAGDLSFRFHEFSLSSNWV

MS025902 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome