; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS026462 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS026462
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionmucin-1
Genome locationscaffold263:94869..95258
RNA-Seq ExpressionMS026462
SyntenyMS026462
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAD2169675.1 unnamed protein product [Meloidogyne enterolobii]1.9e-0943.65Show/hide
Query:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQG-PVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAA-VALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAP
        ++GP      PV+GP A++ G PV+GP  +  APV  P       V+GP  +  APV+GP      PV+GPA    A V+GPAV    PV+GP V+  AP
Subjt:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQG-PVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAA-VALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAP

Query:  IEGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP
        ++GP V   AP +GPA    APV+GP
Subjt:  IEGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP

CAD2169676.1 unnamed protein product [Meloidogyne enterolobii]8.5e-1043.2Show/hide
Query:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAA-VALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPI
        ++GP      PV+GP      PV+GP  +  APV  P       V+GP  +  APV+GP      PV+GPA    A VEGPAV    PV+GP V+  AP+
Subjt:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAA-VALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPI

Query:  EGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP
        +GP V   AP +GPA    APV+GP
Subjt:  EGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP

RWW52669.1 hypothetical protein BHE74_00040897 [Ensete ventricosum]2.9e-1043.55Show/hide
Query:  EGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAV-ALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPIE
        EGP  +   P EGP      PVEGP     APV +P        EGP     AP EGP      P EGP  +  A  EGP      PVEGP     AP E
Subjt:  EGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAV-ALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPIE

Query:  GPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP
        GP    AAP EGP  T  AP EGP
Subjt:  GPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP

THU57569.1 hypothetical protein C4D60_Mb03t04900 [Musa balbisiana]3.3e-1448.39Show/hide
Query:  EGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAVAL-VEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPIE
        EGP ++   P EGP +    P EGP  I  APV+ P       VEGP  I  APVEGP      PVEGP    A  VEGP      PVEGP  I  AP+E
Subjt:  EGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAVAL-VEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPIE

Query:  GPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP
        GP    AAP EGP     APVEGP
Subjt:  GPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP

XP_042189141.1 protein ELYS [Callorhinchus milii]4.5e-1153.49Show/hide
Query:  MEGPTATVEGP---VEGPNADVQGP---VEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAP---VEGPNADVEGP---VEGPAAAVALVEGPAVALEGP-
        +EGP A VEGP   VEGP A+V+GP   VEGP A VE P           VEGP A VE P   VEGP A+VEGP   VEGPAA    VEGPA  +EGP 
Subjt:  MEGPTATVEGP---VEGPNADVQGP---VEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAP---VEGPNADVEGP---VEGPAAAVALVEGPAVALEGP-

Query:  --VEGPVVIGVAPIEGPVVAGAAPEGPAA
          VEGP     A +EGP    A  EGPAA
Subjt:  --VEGPVVIGVAPIEGPVVAGAAPEGPAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A444CZU8 Uncharacterized protein2.0e-0938.52Show/hide
Query:  EGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAV------------ALVEGPAVALEGPVE
        EGP  +   P EGP      PVEGP     APV +P        EGP     AP EGP      P EGP  +             A  EGP  +   P E
Subjt:  EGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAV------------ALVEGPAVALEGPVE

Query:  GPVVIGVAPIEGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP
        GP     AP+EGP  +  AP EGP  T  AP EGP
Subjt:  GPVVIGVAPIEGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP

A0A4S8J8N7 FAS1 domain-containing protein1.6e-1448.39Show/hide
Query:  EGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAVAL-VEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPIE
        EGP ++   P EGP +    P EGP  I  APV+ P       VEGP  I  APVEGP      PVEGP    A  VEGP      PVEGP  I  AP+E
Subjt:  EGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAVAL-VEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPIE

Query:  GPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP
        GP    AAP EGP     APVEGP
Subjt:  GPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP

A0A6P4I610 mucin-11.0e-0848.03Show/hide
Query:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAV-ALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPI
        +EG TA    PVEG  A    PVEG TA   APV+   A     VEG TA   APVEG  A    PVEG  AA  A VEG   A   PVEG      AP+
Subjt:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAV-ALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPI

Query:  EGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGPVA
        EG   A  AP EG  A   APVEG  A
Subjt:  EGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGPVA

A0A6V7V443 Hypothetical protein9.1e-1043.65Show/hide
Query:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQG-PVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAA-VALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAP
        ++GP      PV+GP A++ G PV+GP  +  APV  P       V+GP  +  APV+GP      PV+GPA    A V+GPAV    PV+GP V+  AP
Subjt:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQG-PVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAA-VALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAP

Query:  IEGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP
        ++GP V   AP +GPA    APV+GP
Subjt:  IEGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP

A0A6V7V628 Hypothetical protein4.1e-1043.2Show/hide
Query:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAA-VALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPI
        ++GP      PV+GP      PV+GP  +  APV  P       V+GP  +  APV+GP      PV+GPA    A VEGPAV    PV+GP V+  AP+
Subjt:  MEGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAA-VALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPI

Query:  EGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP
        +GP V   AP +GPA    APV+GP
Subjt:  EGPVVAGAAP-EGPAATGVAPVEGP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGGTCCCACTGCCACCGTGGAAGGTCCAGTGGAAGGTCCCAACGCAGACGTGCAAGGTCCAGTGGAGGGTCCCACCGCCATTGTGGAAGCCCCAGTGAAAAGTCC
CAATGCAGACGTGGAAGGTCTAGTGGAGGGTCCCACCGCCATCGTGGAAGCCCCAGTGGAGGGTCCCAACGCAGACGTGGAAGGTCCAGTGGAGGGTCCCGCCGCTGCCG
TGGCCCTCGTGGAGGGTCCTGCCGTCGCCTTGGAAGGTCCAGTGGAGGGTCCCGTTGTCATCGGAGTAGCGCCAATCGAGGGTCCCGTCGTTGCCGGAGCAGCCCCAGAG
GGTCCCGCCGCCACCGGAGTAGCTCCTGTGGAAGGTCCCGTCGCAGGAGCAGCAATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGGGTCCCACTGCCACCGTGGAAGGTCCAGTGGAAGGTCCCAACGCAGACGTGCAAGGTCCAGTGGAGGGTCCCACCGCCATTGTGGAAGCCCCAGTGAAAAGTCC
CAATGCAGACGTGGAAGGTCTAGTGGAGGGTCCCACCGCCATCGTGGAAGCCCCAGTGGAGGGTCCCAACGCAGACGTGGAAGGTCCAGTGGAGGGTCCCGCCGCTGCCG
TGGCCCTCGTGGAGGGTCCTGCCGTCGCCTTGGAAGGTCCAGTGGAGGGTCCCGTTGTCATCGGAGTAGCGCCAATCGAGGGTCCCGTCGTTGCCGGAGCAGCCCCAGAG
GGTCCCGCCGCCACCGGAGTAGCTCCTGTGGAAGGTCCCGTCGCAGGAGCAGCAATGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGPTATVEGPVEGPNADVQGPVEGPTAIVEAPVKSPNADVEGLVEGPTAIVEAPVEGPNADVEGPVEGPAAAVALVEGPAVALEGPVEGPVVIGVAPIEGPVVAGAAPE
GPAATGVAPVEGPVAGAAM