; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS026463 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS026463
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionCytochrome c5 family protein
Genome locationscaffold263:108742..109104
RNA-Seq ExpressionMS026463
SyntenyMS026463
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAD2169676.1 unnamed protein product [Meloidogyne enterolobii]7.6e-0546.22Show/hide
Query:  SPVEGPAA--ASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGPAPVEGPAT-GAAPMEGP----
        +PV+GPA    +P+DGP     +P++GPA    + V+GPA    +PV+GP A+    PV+GPAV  G P  G A ++G APV+GPA    AP++GP    
Subjt:  SPVEGPAA--ASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGPAPVEGPAT-GAAPMEGP----

Query:  -APVEGPA-AGVAPVEGPA
         APV+GPA    APV+GPA
Subjt:  -APVEGPA-AGVAPVEGPA

HBP28686.1 cytochrome c5 family protein [Advenella kashmirensis]3.4e-0554.31Show/hide
Query:  EGPAAASPMDGPVAGAASPIEG--PAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFG-GPAAGAAPIEGPAPVEG--PATGAAPMEGPAPVEG
        EG  AA+P +G     A+P EG  PA GAA     PA GAA P EG      A+P EG A A G  PA GAAP EG AP EG  PA GAAP EG AP EG
Subjt:  EGPAAASPMDGPVAGAASPIEG--PAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFG-GPAAGAAPIEGPAPVEG--PATGAAPMEGPAPVEG

Query:  --PAAGVAPVEGPAGG
          PA G AP EG A G
Subjt:  --PAAGVAPVEGPAGG

KAF7281211.1 hypothetical protein GWI33_005002 [Rhynchophorus ferrugineus]1.7e-0445.86Show/hide
Query:  GPAAA-SPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASF---------VEGPAAGAAS---PVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGP--------APVEGP
        GPAA  + + GP+ GAAS + GPAAG A+          V GPAAG AS   P+ GP A+    P+ GPA +  GP AGAA I GP         P+ GP
Subjt:  GPAAA-SPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASF---------VEGPAAGAAS---PVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGP--------APVEGP

Query:  ATGAAPMEGPAPVEGPAAGVAPVEGPAGGTTPV
        A+   P+ GPA + GPAAG A V GPA G   V
Subjt:  ATGAAPMEGPAPVEGPAAGVAPVEGPAGGTTPV

THU57569.1 hypothetical protein C4D60_Mb03t04900 [Musa balbisiana]2.4e-0647.29Show/hide
Query:  SPVEGP--AAASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAG-----AAPIEGP-----APVEGPATGA-
        +P EGP  +A +P +GP + A +P EGP +GA +  EGP + A +P EGP +  A +P EGP    G PA G      AP EGP     AP EGP +GA 
Subjt:  SPVEGP--AAASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAG-----AAPIEGP-----APVEGPATGA-

Query:  APMEGP-----APVEGP--AAGVAPVEGP
        AP EGP     AP EGP  +AGV P EGP
Subjt:  APMEGP-----APVEGP--AAGVAPVEGP

WP_084701099.1 Hsp70 family protein [Cryptosporangium arvum]3.0e-0952.99Show/hide
Query:  SPVEGPAA-----------ASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGPAPVEGPATGAAP
        +PV GPAA           A+P+ GP AGAA PI G AA AA  V G A GAA PV GP A   A+PV GPA +  G AAGAAP+ GPA     A GAAP
Subjt:  SPVEGPAA-----------ASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGPAPVEGPATGAAP

Query:  MEGPA----PVEGPAAGVAPVEGPAGGTTPVQSS
        + GPA    PV GPAAG  PV GPAG   PV  +
Subjt:  MEGPA----PVEGPAAGVAPVEGPAGGTTPVQSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2M9TZ19 Cytochrome c5 family protein3.1e-0451.22Show/hide
Query:  PAAASPMDGPVAGAASPIEG--PAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFG-GPAAGAAPIEGPAPVEG--PATGAAPMEGPAPVEG--
        PAA        A  A+P EG  PA GAA     PA GAA P EG      A+P EG A A G  PA GAAP EG AP EG  PA GAAP EG AP EG  
Subjt:  PAAASPMDGPVAGAASPIEG--PAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFG-GPAAGAAPIEGPAPVEG--PATGAAPMEGPAPVEG--

Query:  PAAGVAPVEG--PAGGTTPVQSS
        PA G  P EG  PA G TP + +
Subjt:  PAAGVAPVEG--PAGGTTPVQSS

A0A356LCG2 Cytochrome c5 family protein1.7e-0554.31Show/hide
Query:  EGPAAASPMDGPVAGAASPIEG--PAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFG-GPAAGAAPIEGPAPVEG--PATGAAPMEGPAPVEG
        EG  AA+P +G     A+P EG  PA GAA     PA GAA P EG      A+P EG A A G  PA GAAP EG AP EG  PA GAAP EG AP EG
Subjt:  EGPAAASPMDGPVAGAASPIEG--PAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFG-GPAAGAAPIEGPAPVEG--PATGAAPMEGPAPVEG

Query:  --PAAGVAPVEGPAGG
          PA G AP EG A G
Subjt:  --PAAGVAPVEGPAGG

A0A4S8J8N7 FAS1 domain-containing protein1.1e-0647.29Show/hide
Query:  SPVEGP--AAASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAG-----AAPIEGP-----APVEGPATGA-
        +P EGP  +A +P +GP + A +P EGP +GA +  EGP + A +P EGP +  A +P EGP    G PA G      AP EGP     AP EGP +GA 
Subjt:  SPVEGP--AAASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAG-----AAPIEGP-----APVEGPATGA-

Query:  APMEGP-----APVEGP--AAGVAPVEGP
        AP EGP     AP EGP  +AGV P EGP
Subjt:  APMEGP-----APVEGP--AAGVAPVEGP

A0A6V7V628 Hypothetical protein3.7e-0546.22Show/hide
Query:  SPVEGPAA--ASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGPAPVEGPAT-GAAPMEGP----
        +PV+GPA    +P+DGP     +P++GPA    + V+GPA    +PV+GP A+    PV+GPAV  G P  G A ++G APV+GPA    AP++GP    
Subjt:  SPVEGPAA--ASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGPAPVEGPAT-GAAPMEGP----

Query:  -APVEGPA-AGVAPVEGPA
         APV+GPA    APV+GPA
Subjt:  -APVEGPA-AGVAPVEGPA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTCCGGTGGAGGGTCCTGCAGCCGCAAGTCCGATGGATGGTCCAGTTGCAGGAGCAGCGAGTCCCATTGAGGGTCCAGCCGCAGGAGCAGCGAGTTTCGTTGAGGG
TCCAGCCGCAGGAGCAGCGAGTCCCGTTGAGGGTCCCACCGCCATAGGGGCAGCGAGTCCCGTTGAGGGTCCCGCCGTCGCATTTGGGGGTCCCGCTGCAGGAGCCGCTC
CCATTGAGGGTCCTGCTCCAGTTGAGGGTCCCGCCACAGGAGCCGCTCCCATGGAGGGTCCCGCTCCAGTTGAGGGTCCCGCCGCAGGGGTCGCTCCAGTTGAGGGTCCC
GCTGGAGGGACAACTCCAGTGCAGAGTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTCCGGTGGAGGGTCCTGCAGCCGCAAGTCCGATGGATGGTCCAGTTGCAGGAGCAGCGAGTCCCATTGAGGGTCCAGCCGCAGGAGCAGCGAGTTTCGTTGAGGG
TCCAGCCGCAGGAGCAGCGAGTCCCGTTGAGGGTCCCACCGCCATAGGGGCAGCGAGTCCCGTTGAGGGTCCCGCCGTCGCATTTGGGGGTCCCGCTGCAGGAGCCGCTC
CCATTGAGGGTCCTGCTCCAGTTGAGGGTCCCGCCACAGGAGCCGCTCCCATGGAGGGTCCCGCTCCAGTTGAGGGTCCCGCCGCAGGGGTCGCTCCAGTTGAGGGTCCC
GCTGGAGGGACAACTCCAGTGCAGAGTTCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPVEGPAAASPMDGPVAGAASPIEGPAAGAASFVEGPAAGAASPVEGPTAIGAASPVEGPAVAFGGPAAGAAPIEGPAPVEGPATGAAPMEGPAPVEGPAAGVAPVEGP
AGGTTPVQSS