; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS026464 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS026464
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionAAI domain-containing protein
Genome locationscaffold263:121067..121597
RNA-Seq ExpressionMS026464
SyntenyMS026464
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAD2169675.1 unnamed protein product [Meloidogyne enterolobii]1.9e-1247.78Show/hide
Query:  PVEGPAAGASAPVKGPTA-VGSTSSVEGPIVLGGA----------APVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVV
        PV GPA    APV GP   VG  +SV+ P VL GA          APV+GPA     +PV+GP V   APV+GP V    PV+GP A    +PV+GP V+
Subjt:  PVEGPAAGASAPVKGPTA-VGSTSSVEGPIVLGGA----------APVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVV

Query:  GGAAPVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGP-VAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGP
         G APV+G  V+ G  APV+GP V+ G APV+GPAV   APV+GP V  G+   V+GP     APV+GP     +PV+GP
Subjt:  GGAAPVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGP-VAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGP

CAD2169676.1 unnamed protein product [Meloidogyne enterolobii]7.7e-1447.78Show/hide
Query:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGA-------
        +PV+GPA    APV GP AV     V+GP VL G APVEGPA     +PV+GP V   APV+GP V    PV+GP A    +PV+GP  + GA       
Subjt:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGA-------

Query:  ---APVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGP-VAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGP
           APV+G  V+ G  APV+GP V+ G APV+GPAV   APV+GP V  G+   V+GP     APV+GP     +PV+GP
Subjt:  ---APVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGP-VAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGP

THU57569.1 hypothetical protein C4D60_Mb03t04900 [Musa balbisiana]2.5e-1243.35Show/hide
Query:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEGLV
        +P EGP + A AP +GP +  + +  EGP   G  AP EGP ++   +P EGP  G  AP EGP      P EGP ++   +P EGP  +  AAPVEG  
Subjt:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEGLV

Query:  VVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGPTARA
         +    APVEGP  +  AAPVEGP     AP EGP +       EGP +   AP EGP +GA +P EGP + A
Subjt:  VVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGPTARA

XP_017024337.2 collagen alpha-1(III) chain [Drosophila kikkawai]2.1e-1150.29Show/hide
Query:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEGLV
        +PVEG  A   APV+G TAV   + VEG     G APVEG  AA   +PVEG TV   APVEG T     PVEG  AA   +PVEG     G APVEG  
Subjt:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEGLV

Query:  VVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGPTA
           G  APVEG     G APVEG      APVEG  A      VEG TA   APVEG  A   +PVEG TA
Subjt:  VVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGPTA

XP_037615808.1 uncharacterized protein LOC119482413 isoform X1 [Sebastes umbrosus]3.0e-1042.17Show/hide
Query:  MSPVEGPAAGA---SAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGP-TVGGAAPVEGP-TVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAA
        +SP+EGP  G      P+ GP  V     +EGP  L G  P+EGP      SP+EGP  V G  P+EGP  + G  P+EGP      SPVEG   V G +
Subjt:  MSPVEGPAAGA---SAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGP-TVGGAAPVEGP-TVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAA

Query:  PVEGL-VVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPA-VRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGP
        PVEG       G  PVEGP  V G  PVEGP  V G  P+EGP  G            G  P+E P
Subjt:  PVEGL-VVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPA-VRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A448YN24 DEKNAAC103651 (Fragment)1.1e-0841.81Show/hide
Query:  MSPVEGPAAG-ASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEG
        + PV+GP  G    PV GP        V GP+      PV+GP   G   PV+GP  G   PV+GP VG   PV+GPV      PV+GPV      PV+G
Subjt:  MSPVEGPAAG-ASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEG

Query:  LV---VVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAV-RGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGA-APVEGPVAG-AASPVEGP
         V   VVG    PV+GP V     PV+GP V     PV GP+ G     V+GP  G    PV+GPV G    PV+GP
Subjt:  LV---VVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAV-RGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGA-APVEGPVAG-AASPVEGP

A0A4S8J8N7 FAS1 domain-containing protein1.2e-1243.35Show/hide
Query:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEGLV
        +P EGP + A AP +GP +  + +  EGP   G  AP EGP ++   +P EGP  G  AP EGP      P EGP ++   +P EGP  +  AAPVEG  
Subjt:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEGLV

Query:  VVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGPTARA
         +    APVEGP  +  AAPVEGP     AP EGP +       EGP +   AP EGP +GA +P EGP + A
Subjt:  VVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGPTARA

A0A674NK59 Uncharacterized protein1.2e-0740.66Show/hide
Query:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAA--GSTSPVEGPT-VGGAAPVEGPT---VGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAA
        +PV  P +G SAPV  P  V  ++ V G   + G+APV  P +A    ++PV G   V G+APV  P    V G+ PV  PV+A  ++PV G   V G+A
Subjt:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAA--GSTSPVEGPT-VGGAAPVEGPT---VGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAA

Query:  PVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGA---APVEGPVAGA--ASPVEGPTA
        PV   V     +APV  P  V G+APV G A  G+APV  PV+G +   V  P +G A   APV  PV+G+  ++PV  P +
Subjt:  PVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGA---APVEGPVAGA--ASPVEGPTA

A0A6V7V443 Hypothetical protein9.2e-1347.78Show/hide
Query:  PVEGPAAGASAPVKGPTA-VGSTSSVEGPIVLGGA----------APVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVV
        PV GPA    APV GP   VG  +SV+ P VL GA          APV+GPA     +PV+GP V   APV+GP V    PV+GP A    +PV+GP V+
Subjt:  PVEGPAAGASAPVKGPTA-VGSTSSVEGPIVLGGA----------APVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVV

Query:  GGAAPVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGP-VAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGP
         G APV+G  V+ G  APV+GP V+ G APV+GPAV   APV+GP V  G+   V+GP     APV+GP     +PV+GP
Subjt:  GGAAPVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGP-VAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGP

A0A6V7V628 Hypothetical protein3.7e-1447.78Show/hide
Query:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGA-------
        +PV+GPA    APV GP AV     V+GP VL G APVEGPA     +PV+GP V   APV+GP V    PV+GP A    +PV+GP  + GA       
Subjt:  SPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGA-------

Query:  ---APVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGP-VAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGP
           APV+G  V+ G  APV+GP V+ G APV+GPAV   APV+GP V  G+   V+GP     APV+GP     +PV+GP
Subjt:  ---APVEGLVVVGGGTAPVEGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGP-VAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTCCGGTGGAGGGTCCCGCCGCAGGAGCATCAGCTCCAGTGAAGGGTCCCACAGCAGTAGGATCAACGAGTTCGGTGGAGGGTCCTATCGTATTAGGAGGAGCAGC
TCCAGTGGAGGGTCCTGCTGCAGCAGGATCAACAAGTCCGGTGGAGGGTCCTACCGTTGGAGGAGCAGCTCCAGTAGAGGGTCCTACCGTTGGAGGAGCTCCTCCAGTGG
AGGGTCCTGTTGCAGCAGGATCAACGAGTCCGGTGGAGGGTCCTGTCGTAGTAGGAGGAGCAGCTCCAGTGGAGGGTCTCGTCGTAGTAGGAGGAGGAACAGCTCCAGTG
GAGGGTCCTGTCGTAGTAGGAGGAGCAGCTCCGGTGGAGGGTCCTGCCGTTAGAGGAGCAGCTCCGGTGGAGGGTCCTGTTGCAGGAGGATCAACGAGTCTAGTGGAGGG
TCCTACCGCTGGAGGAGCAGCTCCGGTGGAGGGTCCTGTTGCAGGAGCAGCGAGTCCGGTGGAGGGTCCTACCGCAAGAGCACCGATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTCCGGTGGAGGGTCCCGCCGCAGGAGCATCAGCTCCAGTGAAGGGTCCCACAGCAGTAGGATCAACGAGTTCGGTGGAGGGTCCTATCGTATTAGGAGGAGCAGC
TCCAGTGGAGGGTCCTGCTGCAGCAGGATCAACAAGTCCGGTGGAGGGTCCTACCGTTGGAGGAGCAGCTCCAGTAGAGGGTCCTACCGTTGGAGGAGCTCCTCCAGTGG
AGGGTCCTGTTGCAGCAGGATCAACGAGTCCGGTGGAGGGTCCTGTCGTAGTAGGAGGAGCAGCTCCAGTGGAGGGTCTCGTCGTAGTAGGAGGAGGAACAGCTCCAGTG
GAGGGTCCTGTCGTAGTAGGAGGAGCAGCTCCGGTGGAGGGTCCTGCCGTTAGAGGAGCAGCTCCGGTGGAGGGTCCTGTTGCAGGAGGATCAACGAGTCTAGTGGAGGG
TCCTACCGCTGGAGGAGCAGCTCCGGTGGAGGGTCCTGTTGCAGGAGCAGCGAGTCCGGTGGAGGGTCCTACCGCAAGAGCACCGATGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPVEGPAAGASAPVKGPTAVGSTSSVEGPIVLGGAAPVEGPAAAGSTSPVEGPTVGGAAPVEGPTVGGAPPVEGPVAAGSTSPVEGPVVVGGAAPVEGLVVVGGGTAPV
EGPVVVGGAAPVEGPAVRGAAPVEGPVAGGSTSLVEGPTAGGAAPVEGPVAGAASPVEGPTARAPM