CuGenDBv2

Gene ID	MS026866
Organism	Momordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Description	aquaporin PIP2-2-like
Genome location	scaffold943_2:389398..390166
RNA-Seq Expression	MS026866
Synteny	MS026866
Gene Ontology terms	GO:0006833 - water transport (biological process) GO:0055085 - transmembrane transport (biological process) GO:0005886 - plasma membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0015250 - water channel activity (molecular function)
InterPro domains	IPR000425 - Major intrinsic protein IPR023271 - Aquaporin-like IPR034294 - Aquaporin transporter

Homology

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GenBank top hits

e value

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NP_001274397.1 aquaporin PIP2-1-like [Cucumis sativus]

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XP_008449255.1 PREDICTED: aquaporin PIP2-2-like [Cucumis melo]

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XP_022143819.1 aquaporin PIP2-2-like [Momordica charantia]

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XP_023517214.1 aquaporin PIP2-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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XP_038881499.1 aquaporin PIP2-2-like [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

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A0A1S3BLM5 aquaporin PIP2-2-like

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A0A5A7TWC6 Aquaporin PIP2-2-like

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A0A6J1CQG7 aquaporin PIP2-2-like

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A0A6J1I6I0 aquaporin PIP2-1-like

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V5RE85 Aquaporin

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SwissProt top hits

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P43286 Aquaporin PIP2-1

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P43287 Aquaporin PIP2-2

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Q7XUA6 Probable aquaporin PIP2-3

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Q8GRT8 Aquaporin PIP2-4

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Q9ATM5 Aquaporin PIP2-6

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Arabidopsis top hits

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AT2G37170.1 plasma membrane intrinsic protein 2

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AT3G53420.1 plasma membrane intrinsic protein 2A

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AT3G53420.2 plasma membrane intrinsic protein 2A

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AT3G54820.1 plasma membrane intrinsic protein 2;5

2.7e-28

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AT5G60660.1 plasma membrane intrinsic protein 2;4

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79.45

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Sequences

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CDS sequence

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ATGGTGGCTCAGAGTTTGGGTGCGATTTGTGGGTGTGCGTTGGTTAAATCTTTTCAGAAGGGTCTCTACCATCGCTACAACGGTGGAGCCAATCAGCTCGCCGACGGCTA
CAGCACCGGCACCGGCTTGGCCGCGGAGATCATCGGAACTTTCGTTCTTGTGTACACTGTCTTCTCTGCTACAGATCCCAAGAGAAGTGCCAGAGATTCTCACGTTCCTC
AGGAGCAGTTAAAGCTCTGGGATCGTTCAGGAGTTCCCACAGTGTCTGATGAACTTCCTTCTTCTGCGTTAATGGAGGAATCGCTATGGTTTTGGATCTAA

mRNA sequence

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Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVAQSLGAICGCALVKSFQKGLYHRYNGGANQLADGYSTGTGLAAEIIGTFVLVYTVFSATDPKRSARDSHVPQEQLKLWDRSGVPTVSDELPSSALMEESLWFWI

MS026866 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome