; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS027345 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS027345
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionextensin-1-like
Genome locationscaffold1336:32140..32964
RNA-Seq ExpressionMS027345
SyntenyMS027345
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578896.1 hypothetical protein SDJN03_23344, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.6e-11289.17Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A L+F A +A+LSLNLPST +ANYVYASPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YYPPPVYHSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV   PPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY
        PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY
Subjt:  PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY

Query:  YPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPPP
        YPPPVYHSPPPP KVYYPPPVY SPPPPK  YYPPP+Y SPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YY    Y SPPPPP
Subjt:  YPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPPP

KAG7016424.1 hypothetical protein SDJN02_21533, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-11088.73Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A LLF A +A+LSLNLPST +ANYVYASPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YYPPPVYHSP PP KVYYPPPVYHS PPPKKVYYPPPV   PPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY
        PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVY
Subjt:  PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY

Query:  YPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP
        YPPPVY  PPP KVYYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YY    Y SPPPP
Subjt:  YPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP

XP_022939251.1 extensin-1-like [Cucurbita moschata]5.1e-11389.45Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A LLF A +A+LSLNLPST +ANYVYASPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YYPPPVYHSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV   PPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY
        PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY
Subjt:  PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY

Query:  YPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP
        YPPPVY  PPP KVYYPPPVY SPPPPK  YYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YY    Y SPPPP
Subjt:  YPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP

XP_022993905.1 extensin-1-like [Cucurbita maxima]6.6e-11390.25Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A LLF A +A+LSLNLPST  ANYVYASPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV
        P KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV
Subjt:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV

Query:  YYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP
        YYPPPVYHSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YY    Y SPPPP
Subjt:  YYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP

XP_023551298.1 extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.4e-10981.52Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYAS-PPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK-------------
        MGSS A LLF A +A+LSLNLPST +ANYVYAS PPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YYPPPVYHSPPPP KVYYPPP YHSPPPPK             
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYAS-PPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPK-------------

Query:  -KVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY
         KVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY
Subjt:  -KVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY

Query:  PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVY--------------HSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSS
        PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY  PPP KVYYPPPVY              +SPPPPK  YYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YY    YS 
Subjt:  PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVY--------------HSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSS

Query:  PPP
        PPP
Subjt:  PPP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3DG54 Extensin-1-like isoform X25.5e-10587.32Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A  LFAA VALLSL LPS+A ANY+YASPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV
        P KVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKV
Subjt:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV

Query:  YYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPP
        YYPPPVY SPPPP KVYYPPPVY SPPPPK  YYPPPVY SPPPPK  YYPPPVY SPPPPKK YY    YS PPP
Subjt:  YYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPP

A0A6J1FFE0 extensin-1-like2.5e-11389.45Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A LLF A +A+LSLNLPST +ANYVYASPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YYPPPVYHSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV   PPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY
        PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY
Subjt:  PKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY

Query:  YPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP
        YPPPVY  PPP KVYYPPPVY SPPPPK  YYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YY    Y SPPPP
Subjt:  YPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP

A0A6J1HCA1 extensin-1-like2.4e-10081.73Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A LLF A VALLSL+LPST  ANY YASPPPPK   YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV
        P KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKV
Subjt:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV

Query:  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVY--------------HSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKK-------------PYYYSSPPPPP
        YYPPPVY  PPP KVYYPPPVY SPPPPK  YYPPPVY              +SPPPPK  YYPPPVY SPPPPKK              YYYSSPPPP 
Subjt:  YYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVY--------------HSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKK-------------PYYYSSPPPPP

Query:  Y
        Y
Subjt:  Y

A0A6J1JMV9 extensin-1-like1.2e-10784Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A LLF A VALLSL+ PST  ANYVYASPPPPK   YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV
        P KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV
Subjt:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV

Query:  YYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVY--------------HSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPP------PPPYH
        YYPPPVYHSPPPP KVYYPPPVY SPPPPK  YYPPPVY              +SPPPPK  YYPPPVY SPPPPKK YY    YS PP      PPP H
Subjt:  YYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVY--------------HSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPP------PPPYH

A0A6J1JZT6 extensin-1-like3.2e-11390.25Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
        MGSS A LLF A +A+LSLNLPST  ANYVYASPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPP
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPP

Query:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV
        P KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPV  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV
Subjt:  P-KVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKV

Query:  YYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP
        YYPPPVYHSPPPP KVYYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPK  YYPPPVYHSPPPPKK YY    Y SPPPP
Subjt:  YYPPPVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYY----YSSPPPP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65375 Leucine-rich repeat extensin-like protein 12.8e-2960Show/hide
Query:  PPPPKSPYYPPP-VYHSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP--VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH
        PPPP SP  PPP VY SPPPP     PPP   VY SPPP      PP VY SPPPP     PPP  VY SPPPP    PPP   S PPP  VYY  PV  
Subjt:  PPPPKSPYYPPP-VYHSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP--VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH

Query:  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPP
        SPPPP  VYY PPV  SPPPP  VYY PPV +SPPPP  VYYPP  Y SPPPP  VYY P V  SPPPP  +YY PPV  SPPPP   Y PPV  SPPPP
Subjt:  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPP

Query:  KTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPP
         +P Y PPV  SPPPP   YYP     SPPPP + YY  S  PPP
Subjt:  KTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPP

P06599 Extensin1.5e-3051.58Show/hide
Query:  GSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY---YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP
        GS  +SL+ + LV L+SLNL S  TA Y Y+SPPPP+  + PPP  HSPPPP     PPP  HSPPPP  VY    PPP  HSPPPP     PPP  HSP
Subjt:  GSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVY---YPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSP

Query:  PPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVY---YPPPVYHSP----------PPPKKVYYPPPVYH------SPPPPKKVYY----PP
        PPP   Y    Y SPPPPK  + P PV+H    SPPPP  VY    PPP  HSP          PPP K ++P P +H      SPPPP  VY     PP
Subjt:  PPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVY---YPPPVYHSP----------PPPKKVYYPPPVYH------SPPPPKKVYY----PP

Query:  PV----YHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVY-YPPPVYHSPPPPKVYY----PPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPP
        P     Y SPPPPK  + P PV+H    SPPPP  VY  PPP  HSPPPP   Y    PPP  HSPPPP TP Y    Y SPPPP   + PPP  +SPPP
Subjt:  PV----YHSPPPPKKVYYPPPVYH----SPPPPKKVY-YPPPVYHSPPPPKVYY----PPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPP

Query:  PKKPYYYSSPPPPPYH
        PK  Y Y+SPPPP ++
Subjt:  PKKPYYYSSPPPPPYH

Q38913 Extensin-12.2e-6367.39Show/hide
Query:  LVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP---------KV
        LV   SL   S  TANY Y+SPPPP   Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP         K 
Subjt:  LVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPP---------KV

Query:  YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP
        Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP K Y PP
Subjt:  YYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPP

Query:  PVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPP----KKPYYYSSPPPPPYH
        PVY SPPPP K Y PPPVY SPPPP   Y PPPVY SPPPP     PP VYHSPPPP      P  Y SPPPP ++
Subjt:  PVYHSPPPP-KVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPP----KKPYYYSSPPPPPYH

Q9FS16 Extensin-35.9e-6452.17Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPP-------PPKSPYYPPPVYHSPPPPK------------KVYYPPPVYHSPPPPKKVYY-------
        MGS  ASL+   LV  +SL   S +TANY Y+SPP       PP   Y PPPVYHSPPPPK            K Y PPPVYHSPPPPKK Y        
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPP-------PPKSPYYPPPVYHSPPPPK------------KVYYPPPVYHSPPPPKKVYY-------

Query:  -----PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPP
             PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK +Y             PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPP
Subjt:  -----PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPP

Query:  KKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY-----------
        KK Y             PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y            
Subjt:  KKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY-----------

Query:  -PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYY------------PPPVYHSPPPPK
         PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK +Y   VY SPPPP   Y PPPVYHSPPPPK  Y             PPPVYHSPPPPK
Subjt:  -PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYY------------PPPVYHSPPPPK

Query:  KPYYYSSPPPPPYH
        + Y Y SPPPPP H
Subjt:  KPYYYSSPPPPPYH

Q9LJ64 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 14.1e-2558.05Show/hide
Query:  PPPPK-------SPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY
        PP P        SP  PP   HSPPP      PPPV HSPPPP  V+ PPP  HSPPPP  VY PPP  HSPPPP V+ PPP  HSPPPP  V+ PPP  
Subjt:  PPPPK-------SPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVY

Query:  HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY-PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPP
        HSPPPP  V+ PPP  HSPPPP +   PPPV+ SPPPP  +Y  PPP  HSPPPP     PPPV HSPPPP  V+ PPP  HSPPPP V+ PPP  HSPP
Subjt:  HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYY-PPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPP

Query:  PPKTPYYPPPVYHSPPP-PKTPYYP--PPVYHSPPP
        PP   Y PPP   SPPP P TP  P   P+ ++P P
Subjt:  PPKTPYYPPPVYHSPPP-PKTPYYP--PPVYHSPPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12040.1 leucine-rich repeat/extensin 12.0e-3060Show/hide
Query:  PPPPKSPYYPPP-VYHSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP--VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH
        PPPP SP  PPP VY SPPPP     PPP   VY SPPP      PP VY SPPPP     PPP  VY SPPPP    PPP   S PPP  VYY  PV  
Subjt:  PPPPKSPYYPPP-VYHSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP--VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYH

Query:  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPP
        SPPPP  VYY PPV  SPPPP  VYY PPV +SPPPP  VYYPP  Y SPPPP  VYY P V  SPPPP  +YY PPV  SPPPP   Y PPV  SPPPP
Subjt:  SPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPP

Query:  KTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPP
         +P Y PPV  SPPPP   YYP     SPPPP + YY  S  PPP
Subjt:  KTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPP

AT1G21310.1 extensin 34.2e-6552.17Show/hide
Query:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPP-------PPKSPYYPPPVYHSPPPPK------------KVYYPPPVYHSPPPPKKVYY-------
        MGS  ASL+   LV  +SL   S +TANY Y+SPP       PP   Y PPPVYHSPPPPK            K Y PPPVYHSPPPPKK Y        
Subjt:  MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPP-------PPKSPYYPPPVYHSPPPPK------------KVYYPPPVYHSPPPPKKVYY-------

Query:  -----PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPP
             PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK +Y             PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPP
Subjt:  -----PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKVYY-------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPP

Query:  KKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY-----------
        KK Y             PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPKK Y            
Subjt:  KKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKKVYY-----------

Query:  -PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYY------------PPPVYHSPPPPK
         PPPVYHSPPPPKK Y             PPPVYHSPPPPK +Y   VY SPPPP   Y PPPVYHSPPPPK  Y             PPPVYHSPPPPK
Subjt:  -PPPVYHSPPPPKKVYY------------PPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYY------------PPPVYHSPPPPK

Query:  KPYYYSSPPPPPYH
        + Y Y SPPPPP H
Subjt:  KPYYYSSPPPPPYH

AT1G23720.1 Proline-rich extensin-like family protein1.3e-2653.79Show/hide
Query:  YVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVY-YPPPVYHSPPPPKKVYYPPP
        YVY SPPPP     P P Y SPPPP     PPP Y+S P PK VY  PP   VY SPPPP     P P Y SPPPP VY  PPP Y+S P PK +Y  PP
Subjt:  YVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVY-YPPPVYHSPPPPKKVYYPPP

Query:  ---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPP
           VY+SPPPP     P P Y SPPPP    +PPP Y+S P PK VY  PP   VY+SPPPP     P P Y SPPPP     PPP Y+SP P   Y  P
Subjt:  ---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP---VYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPP

Query:  P---VYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPP------PKKPYYYSSPPPPPY
        P   VY SPPPP     P PVY SPPPP     PPP Y+SP P      P  PY YSSPPPP Y
Subjt:  P---VYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPP------PKKPYYYSSPPPPPY

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein1.5e-3355.52Show/hide
Query:  YVYASPPPP----KSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKVYY-----PP
        YVY+SPPPP    KSP  PP VY SPPPP  +Y  PP    VY SPPPP  +Y  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY+SPPPP   Y     PP
Subjt:  YVYASPPPP----KSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKVYY-----PP

Query:  PVYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP---
         VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP   
Subjt:  PVYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP---

Query:  -VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKVYY-----PPPVYHSPPPP----KTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPPY
         VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP   Y     PP VY SPPPP    K+P  PP VY SPPP      PP VY SPPPP  PY Y+SPPPPPY
Subjt:  -VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKVYY-----PPPVYHSPPPP----KTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPPY

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein1.4e-3156.49Show/hide
Query:  YVYASPPPPKSPYYPPP-VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPP
        YVY SP PP   Y PPP +Y SPPPP  VY  PP    VY+SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPP     PP VY SPPP
Subjt:  YVYASPPPPKSPYYPPP-VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPP

Query:  PKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPP
        P  VY  PP    VY SPPPP  VY PPP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPPP  VY  PP    VY SPPP
Subjt:  PKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPPPKKVYYPPP----VYHSPPP

Query:  PKKVYY---PPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPP----KTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPPY
        P  VY    PPP  +  PPP    PP VY SPPPP    K+P  PP VY SPPP      PP VY SPPPP  PY YSSPPPPPY
Subjt:  PKKVYY---PPPVYHSPPPPKVYYPPPVYHSPPPP----KTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPPY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATCTTCAGCGGCTTCCCTTCTTTTTGCTGCTTTGGTTGCTCTCCTCTCCCTAAACTTGCCTTCAACAGCCACTGCTAACTACGTCTACGCCTCGCCTCCCCCTCC
CAAGTCGCCCTACTACCCGCCTCCCGTCTACCACTCTCCGCCCCCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTCTACCACTCTCCGCCCCCTCCCAAGAAGGTGTACT
ACCCACCTCCCGTCTACCACTCTCCGCCCCCTCCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCACCACCTCCTAAGGTGTACTACCCACCTCCAGTTTAC
CACTCTCCACCACCGCCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTTTACCACTCCCCACCACCTCCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCAGTCTACCATTCCCCGCCACC
ACCAAAGAAGGTATACTATCCACCTCCCGTCTACCATTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGTGTACTATCCACCTCCCGTCTACCATTCTCCTCCACCACCGAAGAAGGTAT
ACTACCCACCTCCAGTCTACCACTCTCCGCCACCACCCAAGAAGGTATACTATCCACCTCCCGTCTACCACTCTCCGCCACCACCCAAGGTGTACTACCCACCTCCCGTC
TACCATTCTCCGCCACCGCCGAAGACGCCATACTACCCGCCTCCCGTCTACCACTCCCCGCCACCACCGAAGACGCCATACTACCCACCCCCAGTATACCACTCCCCACC
ACCACCAAAGAAGCCATACTACTACTCATCACCACCACCTCCTCCCTATCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGATCTTCAGCGGCTTCCCTTCTTTTTGCTGCTTTGGTTGCTCTCCTCTCCCTAAACTTGCCTTCAACAGCCACTGCTAACTACGTCTACGCCTCGCCTCCCCCTCC
CAAGTCGCCCTACTACCCGCCTCCCGTCTACCACTCTCCGCCCCCACCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTCTACCACTCTCCGCCCCCTCCCAAGAAGGTGTACT
ACCCACCTCCCGTCTACCACTCTCCGCCCCCTCCCAAGAAGGTGTACTACCCACCTCCAGTCTACCATTCTCCACCACCTCCTAAGGTGTACTACCCACCTCCAGTTTAC
CACTCTCCACCACCGCCCAAGAAGGTATACTACCCACCTCCCGTTTACCACTCCCCACCACCTCCCAAGAAGGTCTACTACCCACCTCCAGTCTACCATTCCCCGCCACC
ACCAAAGAAGGTATACTATCCACCTCCCGTCTACCATTCCCCTCCACCACCAAAGAAGGTGTACTATCCACCTCCCGTCTACCATTCTCCTCCACCACCGAAGAAGGTAT
ACTACCCACCTCCAGTCTACCACTCTCCGCCACCACCCAAGAAGGTATACTATCCACCTCCCGTCTACCACTCTCCGCCACCACCCAAGGTGTACTACCCACCTCCCGTC
TACCATTCTCCGCCACCGCCGAAGACGCCATACTACCCGCCTCCCGTCTACCACTCCCCGCCACCACCGAAGACGCCATACTACCCACCCCCAGTATACCACTCCCCACC
ACCACCAAAGAAGCCATACTACTACTCATCACCACCACCTCCTCCCTATCACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSSAASLLFAALVALLSLNLPSTATANYVYASPPPPKSPYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPVY
HSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKKVYYPPPVYHSPPPPKVYYPPPV
YHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKTPYYPPPVYHSPPPPKKPYYYSSPPPPPYH