; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS027355 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS027355
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
Descriptionextensin-like
Genome locationscaffold1336:110222..110614
RNA-Seq ExpressionMS027355
SyntenyMS027355
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF5807643.1 putative Extensin domain-containing protein [Helianthus annuus]6.7e-0744.03Show/hide
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        ++I   L+ + + +VSL LPS        A Y +SSPP  P +  P  P + HY +K  PPP   ++ P P +HKSP PP   +SPPP    PP  K  Y
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         +KSPPPPPP  +SPPP  Y+ P   ++KSPPPP
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XP_018837437.2 extensin-3-like [Juglans regia]2.1e-0846.9Show/hide
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        HY H SPP    ++    P   HYR+K  PPPS   RP P+I+KSP PP  SPPP     SPPPP P     Y +KSPPPP P  PPPY +         
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Query:  -PKRFIHKSPPPP
         P  +++KSPPPP
Subjt:  -PKRFIHKSPPPP

XP_022039696.1 extensin-3-like isoform X1 [Helianthus annuus]6.7e-0744.03Show/hide
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        ++I   L+ + + +VSL LPS        A Y +SSPP  P +  P  P + HY +K  PPP   ++ P P +HKSP PP   +SPPP    PP  K  Y
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Query:  RFKSPPPPPP--ESPPP--YQWPKRFIHKSPPPP
         +KSPPPPPP  +SPPP  Y+ P   ++KSPPPP
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XP_022141654.1 extensin-like [Momordica charantia]5.4e-5796.92Show/hide
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        MGAAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIH    SLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPPSPPPPPLAKMQYR
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        FKSPPPPPPESPPPYQWPKRFIHKSPPPPF
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XP_035846318.1 extensin-3-like isoform X2 [Helianthus annuus]6.7e-0744.03Show/hide
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        ++I   L+ + + +VSL LPS        A Y +SSPP  P +  P  P + HY +K  PPP   ++ P P +HKSP PP   +SPPP    PP  K  Y
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Query:  RFKSPPPPPP--ESPPP--YQWPKRFIHKSPPPP
         +KSPPPPPP  +SPPP  Y+ P   ++KSPPPP
Subjt:  RFKSPPPPPP--ESPPP--YQWPKRFIHKSPPPP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2I4G0K9 extensin-3-like1.0e-0846.9Show/hide
Query:  HYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPP-----SPPPP-PLAKMQYRFKSPPPPPPESPPPYQW---------
        HY H SPP    ++    P   HYR+K  PPPS   RP P+I+KSP PP  SPPP     SPPPP P     Y +KSPPPP P  PPPY +         
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Query:  -PKRFIHKSPPPP
         P  +++KSPPPP
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A0A2J6M0Y5 Uncharacterized protein5.6e-0745.65Show/hide
Query:  AAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPP-YASPPP------SPPPPPLA
        +++V  L+ + + +VSL LPS    +  AA+   S PP  P ++ P  P + HY +K  PPP Y+  P P +HKSP PP Y SPPP      SPPPP   
Subjt:  AAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPP-YASPPP------SPPPPPLA

Query:  KMQYRFKSPPPPPP--ESPPP--YQWPKRFIHKSPPPP
        K  Y +KSPPPP P  +SPPP  Y+ P   +HKSPPPP
Subjt:  KMQYRFKSPPPPPP--ESPPP--YQWPKRFIHKSPPPP

A0A2R6QKS2 Integumentary mucin C.1 like3.3e-0746.43Show/hide
Query:  YIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPP------SPPPPPLAKMQYRFKSPPPPPPESPPPYQW----------
        YI+ SPP LP    P+ P    Y+    PPPS    P P+I+KSP PP  SPPP       PPPPP     Y +KSPPPPPP  PPPY +          
Subjt:  YIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPP------SPPPPPLAKMQYRFKSPPPPPPESPPPYQW----------

Query:  PKRFIHKSPPPP
        P  +I+KSPPPP
Subjt:  PKRFIHKSPPPP

A0A5J5B5J7 Uncharacterized protein4.3e-0743.17Show/hide
Query:  MGAAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPP--YASPPP------SPPPP
        MG+ +   +  + M +VSL LPSK       A Y +SSPP  P +  P  P   HY +K  PPP       P +H  P PP  Y SPPP      SPPPP
Subjt:  MGAAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPP--YASPPP------SPPPP

Query:  PLAKMQYRFKSPPPPPP--ESPPPYQWPKRFIHKSPPPP
        P  +  Y++KSPPPPPP  +SPPP    + + +KSPPPP
Subjt:  PLAKMQYRFKSPPPPPP--ESPPPYQWPKRFIHKSPPPP

A0A6J1CJD0 extensin-like2.6e-5796.92Show/hide
Query:  MGAAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPPSPPPPPLAKMQYR
        MGAAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIH    SLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPPSPPPPPLAKMQYR
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Query:  FKSPPPPPPESPPPYQWPKRFIHKSPPPPF
        FKSPPPPPPESPPPYQWPKRFIHKSPPPPF
Subjt:  FKSPPPPPPESPPPYQWPKRFIHKSPPPPF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FS16 Extensin-32.3e-0540.17Show/hide
Query:  HYIHSSPP------SLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPP----YASPPP-----SPPP----PPLAKMQYRFKSPPPPPPESPP
        HY++ SPP      S P       P + HY +K  PPP   + P P  H  P P     Y SPPP     SPPP    PP  K +Y +KSPPPPP     
Subjt:  HYIHSSPP------SLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPP----YASPPP-----SPPP----PPLAKMQYRFKSPPPPPPESPP

Query:  PYQWPKRFIHKSPPPPF
        P   P  +++KSPPPP+
Subjt:  PYQWPKRFIHKSPPPPF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21310.1 extensin 31.6e-0640.17Show/hide
Query:  HYIHSSPP------SLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPP----YASPPP-----SPPP----PPLAKMQYRFKSPPPPPPESPP
        HY++ SPP      S P       P + HY +K  PPP   + P P  H  P P     Y SPPP     SPPP    PP  K +Y +KSPPPPP     
Subjt:  HYIHSSPP------SLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPP----YASPPP-----SPPP----PPLAKMQYRFKSPPPPPPESPP

Query:  PYQWPKRFIHKSPPPPF
        P   P  +++KSPPPP+
Subjt:  PYQWPKRFIHKSPPPPF

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein9.4e-0743.59Show/hide
Query:  YIHSSPPSLP-LQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWR---PYPFIHKSPSPP---YASPPP------SPPPPPLAKMQYRFKSPPPPP----PESPPPYQ
        YI+ SPP  P + + P  P    Y +K  PPP Y +    P P+I+KSP PP   Y+SPPP      SPPPPP     Y + SPPPPP       PPPY 
Subjt:  YIHSSPPSLP-LQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWR---PYPFIHKSPSPP---YASPPP------SPPPPPLAKMQYRFKSPPPPP----PESPPPYQ

Query:  W----PKRFIHKSPPPP
        +    P  +++KSPPPP
Subjt:  W----PKRFIHKSPPPP

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein8.0e-0641.38Show/hide
Query:  YIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWR---PYPFIHKSPSPP---YASPPP------SPPPPPLAKMQYRFKSPPPPP----PESPPPYQW
        YI+SSPP  P            Y +   PPP Y +    P P+++ SP PP   Y SPPP      SPPPPP     Y +KSPPPPP       PPPY +
Subjt:  YIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWR---PYPFIHKSPSPP---YASPPP------SPPPPPLAKMQYRFKSPPPPP----PESPPPYQW

Query:  ----PKRFIHKSPPPP
            P  +++KSPPPP
Subjt:  ----PKRFIHKSPPPP

AT1G76930.1 extensin 45.7e-0440.41Show/hide
Query:  MGAAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPP-----SPPP----
        MGA +  FLV+ F         S   V+   A+Y +SSPP          P   HY    SPPP Y+  P P  H SP P Y SPPP     SPPP    
Subjt:  MGAAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPP-----SPPP----

Query:  PPLAKMQYR----FKSPPPPPPESPPP----YQWPKRFIHKSPPPP
        PP     Y     +KSPPPP  +SPPP    Y  P   ++KSPPPP
Subjt:  PPLAKMQYR----FKSPPPPPPESPPP----YQWPKRFIHKSPPPP

AT2G43150.1 Proline-rich extensin-like family protein3.3e-0439.84Show/hide
Query:  MAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEM---HYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPP----SPPPPPLAK--MQYRFKSP
        +AM++L++ S    A+A   Y +SSPP       P  P +     Y +K SPPP  +  P P+ + SP PP  SPPP    S PPPP+      Y + SP
Subjt:  MAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEM---HYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPP----SPPPPPLAK--MQYRFKSP

Query:  PPPPPESPPPYQW--PKRFIHKSPPPPF
        PPP    PPPY +  P   + KSPPPP+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGGCTGCAATTGTTTTGTTCCTCGTGATCATATTCATGGCAATGGTGTCTTTAATTCTGCCATCAAAATTTGCTGTTGCAGTTGCTGCTGCACACTACATCCACTC
CTCTCCGCCGTCGTTGCCTCTACAGGCAAGGCCGACACTGCCGGAAGAGATGCATTACAGATTCAAGTTATCACCACCGCCGTCATACCAATGGCGGCCATACCCCTTCA
TCCATAAATCCCCCTCACCTCCTTATGCGTCGCCGCCTCCGTCGCCTCCACCGCCACCGCTGGCAAAGATGCAATACAGATTCAAGTCACCGCCACCGCCACCTCCGGAA
TCACCACCCCCATATCAATGGCCAAAGAGGTTCATCCATAAATCGCCCCCGCCCCCTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGGCTGCAATTGTTTTGTTCCTCGTGATCATATTCATGGCAATGGTGTCTTTAATTCTGCCATCAAAATTTGCTGTTGCAGTTGCTGCTGCACACTACATCCACTC
CTCTCCGCCGTCGTTGCCTCTACAGGCAAGGCCGACACTGCCGGAAGAGATGCATTACAGATTCAAGTTATCACCACCGCCGTCATACCAATGGCGGCCATACCCCTTCA
TCCATAAATCCCCCTCACCTCCTTATGCGTCGCCGCCTCCGTCGCCTCCACCGCCACCGCTGGCAAAGATGCAATACAGATTCAAGTCACCGCCACCGCCACCTCCGGAA
TCACCACCCCCATATCAATGGCCAAAGAGGTTCATCCATAAATCGCCCCCGCCCCCTTTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGAAIVLFLVIIFMAMVSLILPSKFAVAVAAAHYIHSSPPSLPLQARPTLPEEMHYRFKLSPPPSYQWRPYPFIHKSPSPPYASPPPSPPPPPLAKMQYRFKSPPPPPPE
SPPPYQWPKRFIHKSPPPPF