; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS027592 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS027592
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionRING/U-box superfamily protein
Genome locationscaffold89:63074..67158
RNA-Seq ExpressionMS027592
SyntenyMS027592
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
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InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022951417.1 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A isoform X2 [Cucurbita moschata]0.0e+0087.84Show/hide
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XP_038885464.1 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A [Benincasa hispida]0.0e+0088.04Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BPJ4 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A isoform X20.0e+0096.99Show/hide
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A0A6J1BQ98 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A isoform X10.0e+0096.85Show/hide
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A0A6J1GHK1 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A isoform X20.0e+0087.84Show/hide
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A0A6J1GIQ0 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A isoform X10.0e+0087.71Show/hide
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A0A6J1KMU0 probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A isoform X20.0e+0087.54Show/hide
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        +RDADGPVTE RLCEPSNNP+LGHVN SP+IIQNSNSNA+PH+LNLNASFASHGG+SSRVNEGSN+YKS+G EEGR LCSSASDPLLLPSG SGLP  AN
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49500 E3 ubiquitin-protein ligase MBR21.7e-5132.65Show/hide
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        MQG RS+ G  S  IN+  G    +  N     NN+ NP + +      P +   +G   Y SS SH  ++ + W+ GE SS               LG 
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        S    +++G  T+ +L         G   +            +P    L  S +SH    S VN G +M   SG +   ++    +    L S +     
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         + G  GSSL G  + CKRKA+EG  + S    S       E+GA    +    +Y+  S L++  P    P   NQ+        + G   +T+++F  
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            E+     R         +   SF  +G++VR       QLPA   P    LD R  P    + S  GQP MIH+PAL R++  + W+ SS+SR+ S
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                  +  E +   +  R  SE P+F  PANE RN V++      T  N S  G+     R GSSSG+H   P+  W+ P N       R++E  
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           LF S  SES   G          S S+ +    SGS  R H   Q RS L +ER+ D  L L +  R+L A ++G   NRL+S              
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Query:  ---EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHV-NAVESQVEEEPCCVCQE
           ED M+ D  ++ GMA+++DRHRDMRLDVDNMSYEELLAL ERIG+V+TGLSEE I+  +KQ KH  +A  S  + EPCCVCQE
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Q5QLR5 Probable E3 ubiquitin-protein ligase ZFP14.8e-1446.24Show/hide
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        L  E   I+D S  + ++++ D HRDMRLD+D+M+YEELLALEE+IG+VNTGL++  IV +LK    V         + ES +E + C +CQE
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Q7XTV7 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HIP14.2e-5833.14Show/hide
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        MQGQ++SV  L++   F+H SSS NP  +Q  YWNN+    E + +Q Y +  SD    Y + V      L  W  GE S+          +E KAE   
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Query:  SSMTRDADG--PVTENRLCEPSN----NPSLG-HVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPS
            R+  G   + E RL    N    N  +G ++N + L  +NSN N       L      HGG S   + G        P    IL +   +P    +
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Query:  GT-------SGLPAANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPA------PPVRGNQAPVRGA-
        G+       S +P   D R GSSLDGRR  CKRK IEG   Q S   S+++S   +S      ++ S  +N      +P+      P     Q P  GA 
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Query:  -GELTSNSFSEPIVAESSDSSQRNYRIRISSSNAQESFA--SAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRP--APAVDNISAQGQPIMIHVPALPRSLQ
           L+S+S+       +S  SQR++R R S +     +    + +T+RH    + Q P    P +   D  P   P V +++ Q Q  M  VP +P+   
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Query:  PYRWNGSSTSRSGSSSSSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVP--ANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVHPPSG-PWMPPE
         +   G+S+SR+G+      E +++  EE    N+    +  P  VP  A ++R+L+  PSS  +     +IPGNV S+SR  ++S V+PP+G P++  +
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Query:  NSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSESGGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSDNNRL--VSE
        N   + PR L+E + R                   SG+              RGH   + RS   +ER+GD   G+P S R+          N L  +  
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Query:  DVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVN-AVESQVEEEPCCVCQE
           +  +S+F+G  DI+DRHRDMRLD+DNMSYEELLALEERIGNV+TGLSEE +   LKQ+K  +  +E+ VEEEPCC+CQE
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Q9FMM4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHG1A3.3e-7937.01Show/hide
Query:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVYWNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVIP-DEQKAELGWSS
        MQG+R+S+G LSE +NFEHGSSS+N      +W N+ +  +N +Q+Y++  S+ NT   +SV HEQ+ L R++LGE SS   + E    +EQ+ E     
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Query:  MTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPSGTSGLPAAN
         TR  DG   E              ++L P+  Q S +N    N+NLNA +         ++E  N Y+      GR     A+ P    S        N
Subjt:  MTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPSGTSGLPAAN

Query:  DGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRGNQAPVRGAGELTSNSFSEPIVAESSDSSQRN
            GSS++GRRA CKRKA+EG+++QSS  G  ++ +   S   P  +VF      G+ L I      G +  V G       S     V+  ++SS RN
Subjt:  DGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRGNQAPVRGAGELTSNSFSEPIVAESSDSSQRN

Query:  YRIRISSSNAQE----SFASAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPA-EHLLDLRPAPA-VDNISAQGQPIMIHVPALPRSLQPYRWNGSSTSRSGSSSSSAGER
          +R + S+ QE    S  +AGT VR P   S    +R LPA +H LDLRP  + V + +    P+ I  P     L P+RW GSS    G+S+S+A   
Subjt:  YRIRISSSNAQE----SFASAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPA-EHLLDLRPAPA-VDNISAQGQPIMIHVPALPRSLQPYRWNGSSTSRSGSSSSSAGER

Query:  QVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVHPPSGP-----WMPPENSPTQFPRRL--TEYVRRQL
        + +  +E R+ +I  N  E PMF  A E+ N  R+ SSR +T+ NL+   + +S SR GS++ V PP  P     W   +NSP    RR   +E  RR L
Subjt:  QVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVHPPSGP-----WMPPENSPTQFPRRL--TEYVRRQL

Query:  FSSATSE-----SGGRTSNYSRSGSTSAQDMVLS-SGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEG-------------------SDNN
         SS  ++     SG   +  S +   S+  +VL   G   + H+    R+    +R+GDS +G+P+ LRAL A+S G                   ++NN
Subjt:  FSSATSE-----SGGRTSNYSRSGSTSAQDMVLS-SGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEG-------------------SDNN

Query:  RLVSEDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVEEEPCCVCQEMQT
         L  EDVM+L+ S+ F  A  +DR+RDMRLDVDNMSYEELLALEERIG+V TG++EE I  RLKQ+K+ +  +S  + EPCCVCQE  T
Subjt:  RLVSEDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVEEEPCCVCQEMQT

Q9ZQF9 E3 ubiquitin-protein ligase MBR11.7e-4329.76Show/hide
Query:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVY-----WNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVI--------
        MQG RS  GS +E          N    + +Y      N M NPA+        P+      Y SS SH  +  + W  GE SS    ++ +        
Subjt:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVY-----WNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVI--------

Query:  ----PDEQKAELGWSSMTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSAS
             D     +G+ S  R        N +       +  H+   P  ++ S+SN +P +++++        DS   N  ++         G  L SS  
Subjt:  ----PDEQKAELGWSSMTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSAS

Query:  DPLLLPSGTSGLPAANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRG-NQAPVRGAGELTSN
                +S  PA+  G  GSS       CKRKA+EG+ +      + N     E+ A         +Y   S L++  P     N     G  E    
Subjt:  DPLLLPSGTSGLPAANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRG-NQAPVRGAGELTSN

Query:  SFSEPIVAESSDSSQRNYRI------RISSSNAQESFA----SAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRPAPAVD-NISAQGQPIMIHVPALPRSLQ
        S     VA S+  S RN         R++    QES A      GT+VR  G     LP    P     D+R +     + + + Q  ++H+PAL R++ 
Subjt:  SFSEPIVAESSDSSQRNYRI------RISSSNAQESFA----SAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRPAPAVD-NISAQGQPIMIHVPALPRSLQ

Query:  PYRWNGSSTSRSGSSS--SSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRN-----PSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVH--PPSG
         Y W+ S +SR+ + S      ER   Q E  R++       E P+F PA ++R  V +       S G +  +L +P       R G SS +H   P+ 
Subjt:  PYRWNGSSTSRSGSSS--SSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRN-----PSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVH--PPSG

Query:  PWMPPENSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSES---GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSD
         W+PP+N+P   P R +E     LF S  S S   GG         S S+ ++ + S S  R H     RS L +ER+ +  L L +  R+L A  +G+ 
Subjt:  PWMPPENSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSES---GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSD

Query:  NNRLVS-----------------EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVE----
         N+++S                 ED M+ D  ++ GM D++DRHR+MRLDVDNMSYEELLAL ERIG+V+TGLSEE I+  +KQ KH ++  S VE    
Subjt:  NNRLVS-----------------EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVE----

Query:  EEPCCVCQE
         EPCC+CQE
Subjt:  EEPCCVCQE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G45180.1 RING/U-box superfamily protein2.8e-7034.68Show/hide
Query:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNP-GNQPVYWNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVIPDEQKAELGWSS
        MQG+R+S+GSLS+ +NFE GS+S+N   +Q + W N+ N  +N +Q+Y+   +D N  + +SV HE+R L R+N+GE SS   + E            +S
Subjt:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNP-GNQPVYWNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVIPDEQKAELGWSS

Query:  MTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPSGTSGLPAAN
        +T    G     R  E  N+     + LSPL +Q SN + +  ++NLNA +  H  D + V      ++ +G     +L +S                  
Subjt:  MTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPSGTSGLPAAN

Query:  DGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRGNQAPVRGAGELTSNSFSEPIVAESSDSSQRN
          RAGSS+DGRRA CKRKA++ +  QSS +G     Q   S +      +     T + L I     R      RG       + S P + E   SS RN
Subjt:  DGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRGNQAPVRGAGELTSNSFSEPIVAESSDSSQRN

Query:  YRIRISSSNAQESFASAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEH-LLDLRPAPAVDNISAQG-QPIMIHVPALPRSLQPYRWNGSSTSRSGSSSSSAG-ERQVV
        Y + ++ +  QE+ ++   ++  PG         L+PA+H  + +R   A+ N ++Q       H+P  P S   ++WN S  +   SSSS+   +R V+
Subjt:  YRIRISSSNAQESFASAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEH-LLDLRPAPAVDNISAQG-QPIMIHVPALPRSLQPYRWNGSSTSRSGSSSSSAG-ERQVV

Query:  QREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVHP-PSGPWMPP-ENSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSES
         R   R  +   N  E P+FVPA ELRN+     SR  + A      +VAS+S   S + V P PS P + P +N+     RRL+E  RR L SS  ++ 
Subjt:  QREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVHP-PSGPWMPP-ENSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSES

Query:  GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSDN----------------NRLVSEDVMILDQSLFFG
          + +  S +   S  + VL SG G     +    S+    R+G    G+ +SLR L ++S G                     L  EDVM+L+QS+  G
Subjt:  GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSDN----------------NRLVSEDVMILDQSLFFG

Query:  MADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVEEEPCCVCQE
         ADI+DR+RDMRLDVDNM+YEELL+LEERIG+V TGL+EE I  RLKQ+K+ ++  S  E EPCCVCQE
Subjt:  MADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVEEEPCCVCQE

AT2G15530.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-4429.76Show/hide
Query:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVY-----WNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVI--------
        MQG RS  GS +E          N    + +Y      N M NPA+        P+      Y SS SH  +  + W  GE SS    ++ +        
Subjt:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVY-----WNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVI--------

Query:  ----PDEQKAELGWSSMTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSAS
             D     +G+ S  R        N +       +  H+   P  ++ S+SN +P +++++        DS   N  ++         G  L SS  
Subjt:  ----PDEQKAELGWSSMTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSAS

Query:  DPLLLPSGTSGLPAANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRG-NQAPVRGAGELTSN
                +S  PA+  G  GSS       CKRKA+EG+ +      + N     E+ A         +Y   S L++  P     N     G  E    
Subjt:  DPLLLPSGTSGLPAANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRG-NQAPVRGAGELTSN

Query:  SFSEPIVAESSDSSQRNYRI------RISSSNAQESFA----SAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRPAPAVD-NISAQGQPIMIHVPALPRSLQ
        S     VA S+  S RN         R++    QES A      GT+VR  G     LP    P     D+R +     + + + Q  ++H+PAL R++ 
Subjt:  SFSEPIVAESSDSSQRNYRI------RISSSNAQESFA----SAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRPAPAVD-NISAQGQPIMIHVPALPRSLQ

Query:  PYRWNGSSTSRSGSSS--SSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRN-----PSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVH--PPSG
         Y W+ S +SR+ + S      ER   Q E  R++       E P+F PA ++R  V +       S G +  +L +P       R G SS +H   P+ 
Subjt:  PYRWNGSSTSRSGSSS--SSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRN-----PSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVH--PPSG

Query:  PWMPPENSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSES---GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSD
         W+PP+N+P   P R +E     LF S  S S   GG         S S+ ++ + S S  R H     RS L +ER+ +  L L +  R+L A  +G+ 
Subjt:  PWMPPENSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSES---GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSD

Query:  NNRLVS-----------------EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVE----
         N+++S                 ED M+ D  ++ GM D++DRHR+MRLDVDNMSYEELLAL ERIG+V+TGLSEE I+  +KQ KH ++  S VE    
Subjt:  NNRLVS-----------------EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVE----

Query:  EEPCCVCQE
         EPCC+CQE
Subjt:  EEPCCVCQE

AT2G15530.2 RING/U-box superfamily protein1.2e-4429.76Show/hide
Query:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVY-----WNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVI--------
        MQG RS  GS +E          N    + +Y      N M NPA+        P+      Y SS SH  +  + W  GE SS    ++ +        
Subjt:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVY-----WNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVI--------

Query:  ----PDEQKAELGWSSMTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSAS
             D     +G+ S  R        N +       +  H+   P  ++ S+SN +P +++++        DS   N  ++         G  L SS  
Subjt:  ----PDEQKAELGWSSMTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSAS

Query:  DPLLLPSGTSGLPAANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRG-NQAPVRGAGELTSN
                +S  PA+  G  GSS       CKRKA+EG+ +      + N     E+ A         +Y   S L++  P     N     G  E    
Subjt:  DPLLLPSGTSGLPAANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRG-NQAPVRGAGELTSN

Query:  SFSEPIVAESSDSSQRNYRI------RISSSNAQESFA----SAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRPAPAVD-NISAQGQPIMIHVPALPRSLQ
        S     VA S+  S RN         R++    QES A      GT+VR  G     LP    P     D+R +     + + + Q  ++H+PAL R++ 
Subjt:  SFSEPIVAESSDSSQRNYRI------RISSSNAQESFA----SAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRPAPAVD-NISAQGQPIMIHVPALPRSLQ

Query:  PYRWNGSSTSRSGSSS--SSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRN-----PSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVH--PPSG
         Y W+ S +SR+ + S      ER   Q E  R++       E P+F PA ++R  V +       S G +  +L +P       R G SS +H   P+ 
Subjt:  PYRWNGSSTSRSGSSS--SSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRN-----PSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVH--PPSG

Query:  PWMPPENSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSES---GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSD
         W+PP+N+P   P R +E     LF S  S S   GG         S S+ ++ + S S  R H     RS L +ER+ +  L L +  R+L A  +G+ 
Subjt:  PWMPPENSPTQFPRRLTEYVRRQLFSSATSES---GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSD

Query:  NNRLVS-----------------EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVE----
         N+++S                 ED M+ D  ++ GM D++DRHR+MRLDVDNMSYEELLAL ERIG+V+TGLSEE I+  +KQ KH ++  S VE    
Subjt:  NNRLVS-----------------EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVE----

Query:  EEPCCVCQE
         EPCC+CQE
Subjt:  EEPCCVCQE

AT4G34040.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-5232.65Show/hide
Query:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVYWNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTG---YVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVIPDEQKAELGW
        MQG RS+ G  S  IN+  G    +  N     NN+ NP + +      P +   +G   Y SS SH  ++ + W+ GE SS               LG 
Subjt:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVYWNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTG---YVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVIPDEQKAELGW

Query:  SSMTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPSGTSGLPA
        S    +++G  T+ +L         G   +            +P    L  S +SH    S VN G +M   SG +   ++    +    L S +     
Subjt:  SSMTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPSGTSGLPA

Query:  ANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAP----PVRGNQA-------PVRGAGELTSNSFSE
         + G  GSSL G  + CKRKA+EG  + S    S       E+GA    +    +Y+  S L++  P    P   NQ+        + G   +T+++F  
Subjt:  ANDGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAP----PVRGNQA-------PVRGAGELTSNSFSE

Query:  PIVAESSDSSQRNYRIRISSSNAQESFASAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRPAPAV-DNISAQGQPIMIHVPALPRSLQPYRWNGSSTSRSGS
            E+     R         +   SF  +G++VR       QLPA   P    LD R  P    + S  GQP MIH+PAL R++  + W+ SS+SR+ S
Subjt:  PIVAESSDSSQRNYRIRISSSNAQESFASAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPAEHLLDLRPAPAV-DNISAQGQPIMIHVPALPRSLQPYRWNGSSTSRSGS

Query:  SSSSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMF-VPANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVH--PPSGPWMPPENSPTQFPRRLTEYV
                  +  E +   +  R  SE P+F  PANE RN V++      T  N S  G+     R GSSSG+H   P+  W+ P N       R++E  
Subjt:  SSSSAGERQVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMF-VPANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVH--PPSGPWMPPENSPTQFPRRLTEYV

Query:  RRQLFSSATSES---GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSDNNRLVS--------------
           LF S  SES   G          S S+ +    SGS  R H   Q RS L +ER+ D  L L +  R+L A ++G   NRL+S              
Subjt:  RRQLFSSATSES---GGRTSNYSRSGSTSAQDMVLSSGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEGSDNNRLVS--------------

Query:  ---EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHV-NAVESQVEEEPCCVCQE
           ED M+ D  ++ GMA+++DRHRDMRLDVDNMSYEELLAL ERIG+V+TGLSEE I+  +KQ KH  +A  S  + EPCCVCQE
Subjt:  ---EDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHV-NAVESQVEEEPCCVCQE

AT5G42940.1 RING/U-box superfamily protein2.3e-8037.01Show/hide
Query:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVYWNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVIP-DEQKAELGWSS
        MQG+R+S+G LSE +NFEHGSSS+N      +W N+ +  +N +Q+Y++  S+ NT   +SV HEQ+ L R++LGE SS   + E    +EQ+ E     
Subjt:  MQGQRSSVGSLSETINFEHGSSSNNPGNQPVYWNNMWNPAENRIQEYLLPTSDINTGYVSSVSHEQRSLSRWNLGEPSSCDMQTEVIP-DEQKAELGWSS

Query:  MTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPSGTSGLPAAN
         TR  DG   E              ++L P+  Q S +N    N+NLNA +         ++E  N Y+      GR     A+ P    S        N
Subjt:  MTRDADGPVTENRLCEPSNNPSLGHVNLSPLIIQNSNSNAIPHNLNLNASFASHGGDSSRVNEGSNMYKSSGPEEGRILCSSASDPLLLPSGTSGLPAAN

Query:  DGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRGNQAPVRGAGELTSNSFSEPIVAESSDSSQRN
            GSS++GRRA CKRKA+EG+++QSS  G  ++ +   S   P  +VF      G+ L I      G +  V G       S     V+  ++SS RN
Subjt:  DGRAGSSLDGRRAPCKRKAIEGNVAQSSLSGSSNYSQHIESGAEPPLSVFSGRYNTGSRLTIPAPPVRGNQAPVRGAGELTSNSFSEPIVAESSDSSQRN

Query:  YRIRISSSNAQE----SFASAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPA-EHLLDLRPAPA-VDNISAQGQPIMIHVPALPRSLQPYRWNGSSTSRSGSSSSSAGER
          +R + S+ QE    S  +AGT VR P   S    +R LPA +H LDLRP  + V + +    P+ I  P     L P+RW GSS    G+S+S+A   
Subjt:  YRIRISSSNAQE----SFASAGTTVRHPGVSSSQLPARLLPA-EHLLDLRPAPA-VDNISAQGQPIMIHVPALPRSLQPYRWNGSSTSRSGSSSSSAGER

Query:  QVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVHPPSGP-----WMPPENSPTQFPRRL--TEYVRRQL
        + +  +E R+ +I  N  E PMF  A E+ N  R+ SSR +T+ NL+   + +S SR GS++ V PP  P     W   +NSP    RR   +E  RR L
Subjt:  QVVQREEVRTSNIGRNVSEHPMFVPANELRNLVRNPSSRGLTSANLSIPGNVASTSRVGSSSGVHPPSGP-----WMPPENSPTQFPRRL--TEYVRRQL

Query:  FSSATSE-----SGGRTSNYSRSGSTSAQDMVLS-SGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEG-------------------SDNN
         SS  ++     SG   +  S +   S+  +VL   G   + H+    R+    +R+GDS +G+P+ LRAL A+S G                   ++NN
Subjt:  FSSATSE-----SGGRTSNYSRSGSTSAQDMVLS-SGSGRRGHHLLQPRSTLWMERRGDSGLGLPYSLRALGASSEG-------------------SDNN

Query:  RLVSEDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVEEEPCCVCQEMQT
         L  EDVM+L+ S+ F  A  +DR+RDMRLDVDNMSYEELLALEERIG+V TG++EE I  RLKQ+K+ +  +S  + EPCCVCQE  T
Subjt:  RLVSEDVMILDQSLFFGMADIYDRHRDMRLDVDNMSYEELLALEERIGNVNTGLSEEAIVARLKQKKHVNAVESQVEEEPCCVCQEMQT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGGCAAAGGAGTAGTGTTGGTTCCTTGTCAGAAACCATAAACTTTGAACATGGATCTTCATCAAATAATCCTGGTAACCAGCCAGTTTACTGGAATAACATGTG
GAATCCGGCAGAAAACCGGATACAAGAATATTTACTACCTACTTCTGATATAAATACTGGATATGTGAGTTCTGTGAGCCATGAGCAACGAAGTTTAAGTAGATGGAATT
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