; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

MS028554 (gene) of Bitter gourd (TR) v1 genome

Gene IDMS028554
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionATP synthase subunit beta
Genome locationscaffold29:348404..350496
RNA-Seq ExpressionMS028554
SyntenyMS028554
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsIPR008686 - RNA-dependent RNA polymerase, mitoviral


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAA3001520.1 Hypothetical predicted protein [Olea europaea subsp. europaea]8.9e-2698.36Show/hide
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KAB1225125.1 hypothetical protein CJ030_MR1G018002 [Morella rubra]1.0e-3791.49Show/hide
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KAG2481283.1 hypothetical protein PVAP13_J684028 [Panicum virgatum]5.1e-2975.25Show/hide
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QXO86974.1 hypothetical protein [Stipa capillata]3.7e-4079.83Show/hide
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YP_588362.1 hypothetical protein ZeamMp101 [Zea mays subsp. mays]1.0e-2976.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2Z2C4R3 Uncharacterized protein3.8e-2279.52Show/hide
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A0A5A7PZ71 ATP synthase subunit beta2.8e-2570.65Show/hide
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A0A6A1WIL1 Uncharacterized protein4.9e-3891.49Show/hide
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Q5M9X3 Uncharacterized protein3.8e-2270.83Show/hide
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Q6R9E6 Uncharacterized protein4.9e-3076.24Show/hide
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Query:  F
        F
Subjt:  F

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTACCAGTCCTAGCTGGCACCGAAGCCAAGGGAAAGCATTTGAACAAGAGGAATGAAAGAAGAGCTTATTCGTATTCAATGCGGGACGACCCAGCCTCCCAGATCCG
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ATGCGATATCCGAGACTCTTTCTCAAGTAGGTATGAGATATCCGGTTCAAGTCACACTTTTGGCTTGCTACAAGCTGGGCTCAGGGACTGCAGTCAGCCGCTTCCCCTGT
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ACTCCATACGGCCTTGTTTTGGACGGTAGAACGGGGAGAGGGGGAAGGGAGAAGCAGGGCTCGAAGAACGAGCCGAGCCGTGCAAGAACGCGGGGATATAGCAAGTAAGC
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GGCGAACGCTTCTGTAACCTTAGACTCGTTACGCTGTTCGACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GERFCNLRLVTLFD