| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_022138348.1 uncharacterized protein LOC111009544 [Momordica charantia] | 2.2e-63 | 87.1 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKV PSEYKVYDYLNQT AC+Q RESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRP TPVEIFPIIEDSDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELTEMVE VFPPPQTQ PKEGKE E M EQE GE DGEPME T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| XP_022930221.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9-like [Cucurbita moschata] | 3.4e-56 | 81.7 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQT A +QTRE+IIEFVDKSKKYDLAKAEILNI+NLRPITPVEIFPIIE+SDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQT----QPKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELT+MVEQVFP Q+ PKE KEAE ME++E AD E M T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQT----QPKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| XP_022958741.1 uncharacterized protein LOC111459926 [Cucurbita moschata] | 1.5e-59 | 83.87 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAG LTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQT AC+QTRE+IIEFVDKSKKYDLAKAE+LNI+NLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELTEMVEQVFP PQT+ P EGKEAE M EQE A EPME T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| XP_023006759.1 uncharacterized protein LOC111499396 [Cucurbita maxima] | 9.4e-59 | 83.23 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAG LTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQT AC+QTRE+IIEFVDKSKKYDLAKAE+LNI+NLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELTEMVEQVFP PQT+ P EGKEAE M EQ A EPME T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| XP_023548749.1 uncharacterized protein LOC111807313 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.5e-59 | 83.87 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAG LTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQT AC+QTRE+IIEFVDKSKKYDLAKAE+LNI+NLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELTEMVEQVFP PQT+ P EGKEAE M EQE A EPME T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1CCS4 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 1.0e-63 | 87.1 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKV PSEYKVYDYLNQT AC+Q RESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRP TPVEIFPIIEDSDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELTEMVE VFPPPQTQ PKEGKE E M EQE GE DGEPME T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| A0A6J1EQC1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 1.6e-56 | 81.7 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQT A +QTRE+IIEFVDKSKKYDLAKAEILNI+NLRPITPVEIFPIIE+SDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQT----QPKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELT+MVEQVFP Q+ PKE KEAE ME++E AD E M T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQT----QPKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| A0A6J1H2X6 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 7.0e-60 | 83.87 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAG LTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQT AC+QTRE+IIEFVDKSKKYDLAKAE+LNI+NLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELTEMVEQVFP PQT+ P EGKEAE M EQE A EPME T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| A0A6J1KG58 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 4.7e-56 | 86.23 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQT A +QTRE+IIEFVDKSKKYDLAKAEILNI+NLRPITPVEIFPIIE+SDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQPKEG--KEAEGMEEQE
GDDGIQELTEMVEQVFP PQ+ + KEAE ME++E
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQPKEG--KEAEGMEEQE
|
|
| A0A6J1L324 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 4.6e-59 | 83.23 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+LEANAG LTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQT AC+QTRE+IIEFVDKSKKYDLAKAE+LNI+NLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
GDDGIQELTEMVEQVFP PQT+ P EGKEAE M EQ A EPME T
Subjt: GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQ------PKEGKEAEGMEEQEVGEPADGEPMEET
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0JN61 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 3.2e-09 | 28.87 | Show/hide |
Query: EANAGPLTNFEVLDFL------RSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDS
+ANA L+N+EV L R + + + Y+ Y+++T HQ+ E + EF+ K + L KAE L ++N RP+T VEI ++E+S
Subjt: EANAGPLTNFEVLDFL------RSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDS
Query: DVRMGDDGIQELTEMVEQVFP--PPQTQPKEGKEAEGMEEQE
+ R+ ++ I+ L V + P P Q + + M+E++
Subjt: DVRMGDDGIQELTEMVEQVFP--PPQTQPKEGKEAEGMEEQE
|
|
| O35427 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 2.7e-08 | 29.58 | Show/hide |
Query: EANAGPLTNFEVLDFL------RSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDS
+ANA L+N+EV L R + + + Y+ Y+++T +Q+ + EF+ K + L KAE L ++N RP+T VEI ++E+S
Subjt: EANAGPLTNFEVLDFL------RSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDS
Query: DVRMGDDGIQELTEMVEQVFP--PPQTQPKEGKEAEGMEEQE
+ R+ ++ I+ L V + P P Q K MEE+E
Subjt: DVRMGDDGIQELTEMVEQVFP--PPQTQPKEGKEAEGMEEQE
|
|
| O75575 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 9.3e-09 | 28.87 | Show/hide |
Query: EANAGPLTNFEVLDFL------RSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDS
+AN+ L+N+EV L R + + + Y+ Y+++T HQ+ E + EF+ K + L KAE L ++N RP+T VEI ++E+S
Subjt: EANAGPLTNFEVLDFL------RSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDS
Query: DVRMGDDGIQELTEMVEQVFP--PPQTQPKEGKEAEGMEEQE
+ R+ ++ I+ L V + P P Q K M+E++
Subjt: DVRMGDDGIQELTEMVEQVFP--PPQTQPKEGKEAEGMEEQE
|
|
| Q60482 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 1.0e-07 | 30.77 | Show/hide |
Query: EANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPS---------EYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPII
+AN+ L+N+EV L KD R K+ S Y+ YL++T HQ+ E + EF+ K + L KAE L ++N RP+T VEI ++
Subjt: EANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPS---------EYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPII
Query: EDSDVRM-GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQPKEGKEAEGMEEQ
E+++ R ++ I+ L V + P + + ++ E MEE+
Subjt: EDSDVRM-GDDGIQELTEMVEQVFPPPQTQPKEGKEAEGMEEQ
|
|
| Q8VHM6 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9 | 2.1e-08 | 29.58 | Show/hide |
Query: EANAGPLTNFEVLDFL------RSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDS
+ANA L+N+EV L R + + + Y+ Y+++T +Q+ + EF+ K + L KAE L ++N RP+T VEI ++E+S
Subjt: EANAGPLTNFEVLDFL------RSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDS
Query: DVRMGDDGIQELTEMVEQVFP--PPQTQPKEGKEAEGMEEQE
+ R+ ++ I+ L V + P P Q K MEE+E
Subjt: DVRMGDDGIQELTEMVEQVFP--PPQTQPKEGKEAEGMEEQE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G28956.1 RNA polymerase II, Rpb4, core protein | 1.2e-30 | 57.97 | Show/hide |
Query: LEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRMG
++ANAG LTNFE+LDFL S+GA+KD TRV+A +A SEYKVYDYL +TAA QTRES+ + DK K + LAKAEILNIINL P + VE+ PIIE+ D R
Subjt: LEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRMG
Query: D-DGIQELTEMVEQVFPPPQT--QPKEGKEAEGMEEQE
D DGI EL V+ + PP T PK+ E E E E
Subjt: D-DGIQELTEMVEQVFPPPQT--QPKEGKEAEGMEEQE
|
|
| AT5G62950.1 RNA polymerase II, Rpb4, core protein | 1.2e-32 | 60.56 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+++ANAG LTNFEVLDFL S+GA+KD TRV+A +A SEYKVYDYL +TAA QTRESI +F DK K + LAKAEILNIINLRP + VE+ PIIE+ D R
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GD-DGIQELTEMVEQVFPPPQT--QPKEGKEAEGMEEQEVGE
D DGI EL V+ + PP T PK+ E EE E GE
Subjt: GD-DGIQELTEMVEQVFPPPQT--QPKEGKEAEGMEEQEVGE
|
|
| AT5G62950.2 RNA polymerase II, Rpb4, core protein | 1.8e-28 | 69.23 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFP
+++ANAG LTNFEVLDFL S+GA+KD TRV+A +A SEYKVYDYL +TAA QTRESI +F DK K + LAKAEILNIINLRP + VE+ P
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFP
|
|
| AT5G62950.3 RNA polymerase II, Rpb4, core protein | 1.2e-32 | 60.56 | Show/hide |
Query: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
+++ANAG LTNFEVLDFL S+GA+KD TRV+A +A SEYKVYDYL +TAA QTRESI +F DK K + LAKAEILNIINLRP + VE+ PIIE+ D R
Subjt: LLEANAGPLTNFEVLDFLRSKGAAKDPTRVLAKVAPSEYKVYDYLNQTAACHQTRESIIEFVDKSKKYDLAKAEILNIINLRPITPVEIFPIIEDSDVRM
Query: GD-DGIQELTEMVEQVFPPPQT--QPKEGKEAEGMEEQEVGE
D DGI EL V+ + PP T PK+ E EE E GE
Subjt: GD-DGIQELTEMVEQVFPPPQT--QPKEGKEAEGMEEQEVGE
|
|
