; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc01g17410 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc01g17410
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptiontranscription factor ORG2-like
Genome locationchr1:11795121..11798388
RNA-Seq ExpressionMoc01g17410
SyntenyMoc01g17410
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:2000112 - regulation of cellular macromolecule biosynthetic process (biological process)
GO:0090575 - RNA polymerase II transcription factor complex (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR015660 - Achaete-scute transcription factor-related
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7033594.1 Transcription factor ORG2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-10280.31Show/hide
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XP_022932848.1 transcription factor ORG2-like [Cucurbita moschata]1.3e-10280.71Show/hide
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XP_023543484.1 transcription factor ORG2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-10381.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C272 transcription factor bHLH100-like9.9e-9377.56Show/hide
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A0A6J1DIV6 transcription factor bHLH101-like isoform X21.7e-13299.61Show/hide
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A0A6J1DM57 transcription factor bHLH101-like isoform X11.8e-134100Show/hide
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A0A6J1F2W7 transcription factor ORG2-like6.2e-10380.71Show/hide
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A0A6J1HY06 transcription factor ORG2-like1.1e-10281.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WZ60 Protein IRON-RELATED TRANSCRIPTION FACTOR 29.4e-2444.05Show/hide
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        S G  +  S   +KLSHNA ERDRRK++N LYSSLRALLP AD  KKLS P T+SR+L YIPELQ+QVE L RKK+EL    T     G       +  +
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           + ++SA+ ++  E+ VQ+S   N  G    LS+ +  LE EGL  +++S+   F  + F+++H+Q
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Q9FYE6 Transcription factor bHLH1011.7e-2844Show/hide
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        + KKL+HNASERDRR+K+N+LYSSLRALLP +DQ +KLS P T++R++ YIPE +Q+++ L R+KEEL+  ++ +  +     KA   +  SSSS  I+A
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Query:  SRVSQQEMAVQISTDINDGHRNSLSEILVWLEEEGLSLLNASSFETFDGKVFHNLHVQMESSCRMEPEMLSNKLL
        + ++  E+AVQI+T        S+S++L+ LEE GL++++ SS  +   ++F+ LH+QM   C++  E L N +L
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Q9M1K0 Transcription factor ORG38.3e-2845.25Show/hide
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        + KKL+HNASERDRR+KINSL+SSLR+ LP++ Q KKLS PAT+SR L YIPELQ+QV+ L++KKEEL+  ++GQ       ++  K  A+  S+V SA+
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        R+   E+ VQIS+  +  H  S+S +L  LEE+   L++ SS  +   ++F+ LH+Q+E   + ++  E LS ++L ++
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Q9M1K1 Transcription factor ORG24.8e-2841.15Show/hide
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        P  +E+ H+ +S   +  S G     +  + KKL+HNASERDRRKKIN+L+SSLR+ LP++DQ KKLS P T+S+ L YIPELQQQV+ L++KKEE++  
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        ++GQ + E  ++++ K  A +S  S +SA+R+   E+ VQ+S+  +  H  S+S +L  +EE+G  L++ SS  +   ++F+ LH+Q+E+    ++  E 
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        LS ++L ++
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Q9ZVB5 Transcription factor bHLH1002.7e-2642.05Show/hide
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        KKL+HNASER+RRKKIN+++SSLR+ LP  +Q KKLS  AT+S+ L YIPELQ+QV+ LM+KKEEL   ++GQ ++   ++    +   +S +S +S++R
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        +S+ E+ VQIS+      + S   +L  +EE+GL L+ ASS  +   ++F+++H+Q+++  ++  E L ++LL ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41240.1 basic helix-loop-helix protein 1001.9e-2742.05Show/hide
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AT2G41240.2 basic helix-loop-helix protein 1001.8e-2541.48Show/hide
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AT3G56970.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.4e-2941.15Show/hide
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        P  +E+ H+ +S   +  S G     +  + KKL+HNASERDRRKKIN+L+SSLR+ LP++DQ KKLS P T+S+ L YIPELQQQV+ L++KKEE++  
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Query:  MTGQ-EVEGGEERKAKKCAASSSSSVISASRVSQQEMAVQISTDINDGHRNSLSEILVWLEEEGLSLLNASSFETFDGKVFHNLHVQMES--SCRMEPEM
        ++GQ + E  ++++ K  A +S  S +SA+R+   E+ VQ+S+  +  H  S+S +L  +EE+G  L++ SS  +   ++F+ LH+Q+E+    ++  E 
Subjt:  MTGQ-EVEGGEERKAKKCAASSSSSVISASRVSQQEMAVQISTDINDGHRNSLSEILVWLEEEGLSLLNASSFETFDGKVFHNLHVQMES--SCRMEPEM

Query:  LSNKLLGMF
        LS ++L ++
Subjt:  LSNKLLGMF

AT3G56980.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein5.9e-2945.25Show/hide
Query:  MAKKLSHNASERDRRKKINSLYSSLRALLPSADQMKKLSNPATISRILSYIPELQQQVEGLMRKKEELMGAMTGQEVEGGEERKAKKCAASSSSSVISAS
        + KKL+HNASERDRR+KINSL+SSLR+ LP++ Q KKLS PAT+SR L YIPELQ+QV+ L++KKEEL+  ++GQ       ++  K  A+  S+V SA+
Subjt:  MAKKLSHNASERDRRKKINSLYSSLRALLPSADQMKKLSNPATISRILSYIPELQQQVEGLMRKKEELMGAMTGQEVEGGEERKAKKCAASSSSSVISAS

Query:  RVSQQEMAVQISTDINDGHRNSLSEILVWLEEEGLSLLNASSFETFDGKVFHNLHVQME--SSCRMEPEMLSNKLLGMF
        R+   E+ VQIS+  +  H  S+S +L  LEE+   L++ SS  +   ++F+ LH+Q+E   + ++  E LS ++L ++
Subjt:  RVSQQEMAVQISTDINDGHRNSLSEILVWLEEEGLSLLNASSFETFDGKVFHNLHVQME--SSCRMEPEMLSNKLLGMF

AT5G04150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.2e-2944Show/hide
Query:  MAKKLSHNASERDRRKKINSLYSSLRALLPSADQMKKLSNPATISRILSYIPELQQQVEGLMRKKEELMGAMTGQEVEGGEERKAKKCAASSSSSV-ISA
        + KKL+HNASERDRR+K+N+LYSSLRALLP +DQ +KLS P T++R++ YIPE +Q+++ L R+KEEL+  ++ +  +     KA   +  SSSS  I+A
Subjt:  MAKKLSHNASERDRRKKINSLYSSLRALLPSADQMKKLSNPATISRILSYIPELQQQVEGLMRKKEELMGAMTGQEVEGGEERKAKKCAASSSSSV-ISA

Query:  SRVSQQEMAVQISTDINDGHRNSLSEILVWLEEEGLSLLNASSFETFDGKVFHNLHVQMESSCRMEPEMLSNKLL
        + ++  E+AVQI+T        S+S++L+ LEE GL++++ SS  +   ++F+ LH+QM   C++  E L N +L
Subjt:  SRVSQQEMAVQISTDINDGHRNSLSEILVWLEEEGLSLLNASSFETFDGKVFHNLHVQMESSCRMEPEMLSNKLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGGCTGTTTCCTCTCCTTTGTTTTCTCCTCATCAATGGCCTTTGGAAGATCCCATCTCTCTCAATCACCATCACAACTCTCTCTTCCCTCCCATTGAAGCT
TCTGATTCCTTTCACCTTCATCAATTCGCTCCGCCACCGCCGTTGCAACCACCGCCCTTCGAGCTCGACCACTATCCCTCTTCCACTACTCCGTCGCCAGGAGGC
AGCGCCACGGTCTCGAAGATGGCTAAGAAGCTTAGCCATAATGCAAGCGAGCGGGATCGTCGAAAGAAGATCAACTCTCTCTACTCCTCTTTGCGCGCCCTCCTT
CCCTCCGCTGATCAAATGAAGAAGCTGAGTAACCCGGCGACAATTTCGAGGATATTGAGCTACATACCGGAGCTACAACAGCAAGTCGAGGGGCTGATGAGGAAG
AAAGAAGAGCTTATGGGAGCCATGACTGGACAGGAAGTTGAGGGTGGTGAAGAGAGGAAAGCAAAGAAATGCGCAGCTTCGAGCTCCTCATCGGTCATTTCGGCA
AGTCGGGTCAGTCAACAGGAAATGGCGGTTCAAATATCGACCGATATTAACGACGGTCACCGGAATTCCTTGTCGGAGATCTTGGTTTGGTTGGAGGAAGAAGGT
CTTTCTTTGTTGAATGCTTCTTCTTTTGAGACTTTTGATGGGAAGGTTTTCCATAATTTGCATGTTCAGATGGAAAGCAGCTGCAGAATGGAGCCTGAAATGCTG
AGCAATAAGCTCTTGGGGATGTTCCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CCCTCCGCTGATCAAATGAAGAAGCTGAGTAACCCGGCGACAATTTCGAGGATATTGAGCTACATACCGGAGCTACAACAGCAAGTCGAGGGGCTGATGAGGAAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PSADQMKKLSNPATISRILSYIPELQQQVEGLMRKKEELMGAMTGQEVEGGEERKAKKCAASSSSSVISASRVSQQEMAVQISTDINDGHRNSLSEILVWLEEEG
LSLLNASSFETFDGKVFHNLHVQMESSCRMEPEMLSNKLLGMFP