; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc01g28070 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc01g28070
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein ATHB-40 isoform X1
Genome locationchr1:19945694..19946878
RNA-Seq ExpressionMoc01g28070
SyntenyMoc01g28070
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7026804.1 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-21 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-6264.86Show/hide
Query:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKE----GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDP
        D++ +LIS LY+   + +++LPQ            AAEGNK  +RRRR+SK KE     GLKKRKLS EQV+LLEMNFG+EHKLESERKDRLASELGLDP
Subjt:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKE----GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDP

Query:  RQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDV
        RQVAVWFQNRRARWKNKKL++EYSTLKKAHDS++L  SHL+S+M KL E+L EAK EI++LVE SE I SNS +SS TMD      P  GELF+  YEDV
Subjt:  RQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDV

Query:  FYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        FY MQ Q  NY+QG++WLNLYM
Subjt:  FYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

XP_004143500.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 [Cucumis sativus]1.2e-6467.09Show/hide
Query:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEG----GLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKD
        MAAVNLRP  D N++L+S LYN      +VLPQ              EG+K  +RRRR+SK KEG    GLKKRKLS EQV+LLEMNFGNEHKLESERKD
Subjt:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEG----GLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKD

Query:  RLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSE--GISSNSRSSSVTMD-LEGAQPP
        RLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKL++EYSTLKKAHDS+VL KSHL+S++MK+KE+L EAK EI+++VE SE    SSNS SSSVTM+ +E A   
Subjt:  RLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSE--GISSNSRSSSVTMD-LEGAQPP

Query:  FLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDW-LNL
         LGELF E YEDVFY   MQDNNY QG++W LNL
Subjt:  FLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDW-LNL

XP_022133113.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 isoform X1 [Momordica charantia]5.1e-119100Show/hide
Query:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
        MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
Subjt:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS

Query:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV
        ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV
Subjt:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV

Query:  EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
Subjt:  EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

XP_022133114.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 isoform X2 [Momordica charantia]3.2e-11397.37Show/hide
Query:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
        MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVL      PQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
Subjt:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS

Query:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV
        ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV
Subjt:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV

Query:  EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
Subjt:  EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

XP_023518445.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-6364.86Show/hide
Query:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKE----GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDP
        D+N +LIS LY+   +++++LPQ            AAEGNK  +RRRR+SK KE     GLKKRKLS EQV+LLEMNFG+EHKLESERKDRLASELGLDP
Subjt:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKE----GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDP

Query:  RQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDV
        RQVAVWFQNRRARWKNKKL++EYSTLKKAHDS++L  SHL+ +M KL E+L EAK EI++LVE SE I SNS +SS TMD      P  GELF+  YEDV
Subjt:  RQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDV

Query:  FYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        FY MQ Q  NY+QG++WLNLYM
Subjt:  FYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KGE8 Homeobox domain-containing protein6.0e-6567.09Show/hide
Query:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEG----GLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKD
        MAAVNLRP  D N++L+S LYN      +VLPQ              EG+K  +RRRR+SK KEG    GLKKRKLS EQV+LLEMNFGNEHKLESERKD
Subjt:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEG----GLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKD

Query:  RLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSE--GISSNSRSSSVTMD-LEGAQPP
        RLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKL++EYSTLKKAHDS+VL KSHL+S++MK+KE+L EAK EI+++VE SE    SSNS SSSVTM+ +E A   
Subjt:  RLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSE--GISSNSRSSSVTMD-LEGAQPP

Query:  FLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDW-LNL
         LGELF E YEDVFY   MQDNNY QG++W LNL
Subjt:  FLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDW-LNL

A0A6J1BV20 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 isoform X21.6e-11397.37Show/hide
Query:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
        MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVL      PQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
Subjt:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS

Query:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV
        ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV
Subjt:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV

Query:  EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
Subjt:  EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

A0A6J1BY52 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 isoform X12.5e-119100Show/hide
Query:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
        MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
Subjt:  MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS

Query:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV
        ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV
Subjt:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV

Query:  EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
Subjt:  EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

A0A6J1HF68 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like1.1e-6163.96Show/hide
Query:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKE----GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDP
        D+N +L+S LY+   + +++L Q            AAEGNK  +RRRR+SK KE     GLKKRKLS EQV+LLEMNFG+EHKLESERKDRLASELGLDP
Subjt:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKE----GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDP

Query:  RQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDV
        RQVAVWFQNRRARWKNKKL++EYSTLKKAHDS++L  SHL+S+M KL E+L EAK EI++LVE SE I S+S +SS TMD      P  GELF+  YEDV
Subjt:  RQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDV

Query:  FYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        FY MQ Q  NY+QG++WLNLYM
Subjt:  FYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

A0A6J1KN43 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like1.3e-6264.41Show/hide
Query:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKE----GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDP
        D+N +LIS LY+   +++++L Q             AEGNK  +RRRR+SK KE     GLKKRKLS EQV+LLEMNFG+EHKLESERKDRLASELGLDP
Subjt:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKE----GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDP

Query:  RQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDV
        RQVAVWFQNRRARWKNKKL++EYSTLKKAHDS++L  SHL+S+M+KL E+L EAK EI++LVE SE I SNS +SS TMD      P  GELF+  YEDV
Subjt:  RQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDV

Query:  FYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        FY MQ Q  NY+QG++WLNLYM
Subjt:  FYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YN17 Homeobox-leucine zipper protein HOX149.1e-2652.59Show/hide
Query:  GAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGG----------LKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTL
        G V  E  +A RRRRR ++   GG           KKR+LS EQVE+LE++F  E KLE+ RK  LASELGLDP+QVAVWFQNRRAR K+K L++E+S L
Subjt:  GAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGG----------LKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTL

Query:  KKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQL
        K AHD+ +L K HL++++++LKE L+ A+ E+++L
Subjt:  KKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQL

O23208 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-401.8e-4548.91Show/hide
Query:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGK----EGG---LKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELG
        D N   ISQLY   +++++++         QPG V     K  +RRR+K+KG     +GG    +KRKL+ EQV +LEM+FG+EHKLESERKDRLA+ELG
Subjt:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGK----EGG---LKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELG

Query:  LDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV---
        LDPRQVAVWFQNRRARWKNK+L++EY+ LK +HD++V+DK  L+S++++LKE+L +A+REI++L ER EG SSNS  SS ++ +E  + PF G+  V   
Subjt:  LDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV---

Query:  -EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
         + Y+ +FY   + +N+Y    +W++LY+
Subjt:  -EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

Q7XI85 Homeobox-leucine zipper protein HOX143.1e-2640.57Show/hide
Query:  GAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGG----------LKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTL
        G V  E  +A RRRRR ++   GG           KKR+LS EQVE+LE++F  E KLE+ RK  LASELGLDP+QVAVWFQNRRAR K+K L++E+S L
Subjt:  GAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGG----------LKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTL

Query:  KKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGA-----------------QPPFLGELFVEGYEDVFYYMQMQDN
        K AHD+ +L K HL++++++LKE L+ A+ E+++L   + G  + S      M L G+                 QPP  G     G +D+ Y  +    
Subjt:  KKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGA-----------------QPPFLGELFVEGYEDVFYYMQMQDN

Query:  NYTQGIDWLNLY
             ++W +LY
Subjt:  NYTQGIDWLNLY

Q9LVR0 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-531.2e-3851.3Show/hide
Query:  EGNKAGRRRRRKSKGKE-----------GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAH
        E     RRR+R+SKG             G L+KRKL+ EQV +LE +FGNEHKLES RK+++A ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKL++EY+ LK  H
Subjt:  EGNKAGRRRRRKSKGKE-----------GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAH

Query:  DSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGID-WLNLYM
        D++VL +  L+SQ++KL E+L EA+ EI++L ER E + +NS SSS++++   A   F  EL  E   ++ +Y  M DNNY Q ++ W  LY+
Subjt:  DSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGID-WLNLYM

Q9ZU70 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-214.9e-4046.29Show/hide
Query:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKG----------KEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
        D+N +LISQLY    +++ ++PQ   + +P             RRR+RKSK             G  +KRKLS EQV +LE++F ++HKLESERKDRLAS
Subjt:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKG----------KEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS

Query:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSR-SSSVTMDLEGAQPPFLGELF
        ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNK+++DEY+ LK A+++ V++K  L S+++ LKE+L EA+REI++L +R EG  SNS  SSSVT++      PF G+  
Subjt:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSR-SSSVTMDLEGAQPPFLGELF

Query:  VEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        + G++       +   +Y  G+DW++ +M
Subjt:  VEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G69780.1 Homeobox-leucine zipper protein family2.0e-2042.24Show/hide
Query:  PQPGAVAAE-GNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDS
        P  G    E GN           G + G KKR+L+ EQV+ LE NF   +KLE ERK +LA  LGL PRQ+A+WFQNRRARWK K+L+ +Y TLK+  D+
Subjt:  PQPGAVAAE-GNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDS

Query:  LVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKR----EIKQLVERSEGISSN---SRSSSVTMDLEGAQP
        L  +   LQ+   KL+ E+M  K     E   L + +EG  SN   + S ++ +D+  A P
Subjt:  LVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKR----EIKQLVERSEGISSN---SRSSSVTMDLEGAQP

AT2G18550.1 homeobox protein 213.5e-4146.29Show/hide
Query:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKG----------KEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS
        D+N +LISQLY    +++ ++PQ   + +P             RRR+RKSK             G  +KRKLS EQV +LE++F ++HKLESERKDRLAS
Subjt:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKG----------KEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLAS

Query:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSR-SSSVTMDLEGAQPPFLGELF
        ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNK+++DEY+ LK A+++ V++K  L S+++ LKE+L EA+REI++L +R EG  SNS  SSSVT++      PF G+  
Subjt:  ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSR-SSSVTMDLEGAQPPFLGELF

Query:  VEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
        + G++       +   +Y  G+DW++ +M
Subjt:  VEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

AT3G01470.1 homeobox 15.8e-2053.4Show/hide
Query:  KKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKA-------HDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEA
        KKR+L+ EQV LLE +F  E+KLE ERK +LA +LGL PRQVAVWFQNRRARWK K+L+ +Y  LK         +DS+V+D   L+S++  L E+L + 
Subjt:  KKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKA-------HDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEA

Query:  KRE
        K+E
Subjt:  KRE

AT4G36740.1 homeobox protein 401.2e-4648.91Show/hide
Query:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGK----EGG---LKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELG
        D N   ISQLY   +++++++         QPG V     K  +RRR+K+KG     +GG    +KRKL+ EQV +LEM+FG+EHKLESERKDRLA+ELG
Subjt:  DNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGK----EGG---LKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELG

Query:  LDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV---
        LDPRQVAVWFQNRRARWKNK+L++EY+ LK +HD++V+DK  L+S++++LKE+L +A+REI++L ER EG SSNS  SS ++ +E  + PF G+  V   
Subjt:  LDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFV---

Query:  -EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM
         + Y+ +FY   + +N+Y    +W++LY+
Subjt:  -EGYEDVFYYMQMQDNNYTQGIDWLNLYM

AT5G66700.1 homeobox 538.7e-4051.3Show/hide
Query:  EGNKAGRRRRRKSKGKE-----------GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAH
        E     RRR+R+SKG             G L+KRKL+ EQV +LE +FGNEHKLES RK+++A ELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKL++EY+ LK  H
Subjt:  EGNKAGRRRRRKSKGKE-----------GGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVAVWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAH

Query:  DSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGID-WLNLYM
        D++VL +  L+SQ++KL E+L EA+ EI++L ER E + +NS SSS++++   A   F  EL  E   ++ +Y  M DNNY Q ++ W  LY+
Subjt:  DSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQGID-WLNLYM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCGCCGTGAATCTCCGACCACAACCCGACAACAACGCAATTCTCATCTCCCAGCTCTACAACCACGCCGAAATTCACTCGCGAGTGCTCCCTCAACCCCAACCCCA
GCCCCAGCCCCAACCAGGTGCGGTGGCGGCGGAGGGGAACAAGGCCGGGAGACGGCGGCGGAGGAAGAGCAAAGGGAAAGAAGGGGGGCTGAAGAAGAGGAAGCTGAGTA
GGGAGCAGGTGGAGCTTCTGGAGATGAACTTTGGAAACGAACACAAATTGGAATCGGAGAGGAAGGATCGGCTGGCGTCGGAATTGGGGCTTGATCCGCGGCAGGTGGCG
GTGTGGTTTCAGAACCGGCGTGCCCGCTGGAAGAACAAGAAGCTGCAGGACGAATATTCCACTCTCAAAAAAGCCCACGATTCCCTCGTTTTGGACAAATCCCATCTCCA
ATCTCAGATGATGAAACTGAAAGAGGAATTGATGGAGGCGAAGAGGGAGATAAAGCAATTGGTGGAACGGAGCGAGGGGATTTCGAGCAACAGCCGAAGCTCGTCGGTGA
CAATGGATTTGGAAGGAGCGCAGCCGCCATTTTTGGGAGAGCTGTTTGTGGAAGGATATGAAGATGTATTCTATTACATGCAAATGCAAGACAACAATTACACTCAAGGA
ATCGACTGGCTTAACCTTTATATGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCGCCGTGAATCTCCGACCACAACCCGACAACAACGCAATTCTCATCTCCCAGCTCTACAACCACGCCGAAATTCACTCGCGAGTGCTCCCTCAACCCCAACCCCA
GCCCCAGCCCCAACCAGGTGCGGTGGCGGCGGAGGGGAACAAGGCCGGGAGACGGCGGCGGAGGAAGAGCAAAGGGAAAGAAGGGGGGCTGAAGAAGAGGAAGCTGAGTA
GGGAGCAGGTGGAGCTTCTGGAGATGAACTTTGGAAACGAACACAAATTGGAATCGGAGAGGAAGGATCGGCTGGCGTCGGAATTGGGGCTTGATCCGCGGCAGGTGGCG
GTGTGGTTTCAGAACCGGCGTGCCCGCTGGAAGAACAAGAAGCTGCAGGACGAATATTCCACTCTCAAAAAAGCCCACGATTCCCTCGTTTTGGACAAATCCCATCTCCA
ATCTCAGATGATGAAACTGAAAGAGGAATTGATGGAGGCGAAGAGGGAGATAAAGCAATTGGTGGAACGGAGCGAGGGGATTTCGAGCAACAGCCGAAGCTCGTCGGTGA
CAATGGATTTGGAAGGAGCGCAGCCGCCATTTTTGGGAGAGCTGTTTGTGGAAGGATATGAAGATGTATTCTATTACATGCAAATGCAAGACAACAATTACACTCAAGGA
ATCGACTGGCTTAACCTTTATATGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAVNLRPQPDNNAILISQLYNHAEIHSRVLPQPQPQPQPQPGAVAAEGNKAGRRRRRKSKGKEGGLKKRKLSREQVELLEMNFGNEHKLESERKDRLASELGLDPRQVA
VWFQNRRARWKNKKLQDEYSTLKKAHDSLVLDKSHLQSQMMKLKEELMEAKREIKQLVERSEGISSNSRSSSVTMDLEGAQPPFLGELFVEGYEDVFYYMQMQDNNYTQG
IDWLNLYM