CuGenDBv2

Gene ID	Moc02g01200
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	Unknown protein
Genome location	chr2:909315..911945
RNA-Seq Expression	Moc02g01200
Synteny	Moc02g01200
Gene Ontology terms	NA
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Homology

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A0A0A0L1X8 Uncharacterized protein

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G12070.1 unknown protein

2.2e-165

62.27

Show/hide

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        MDRT    ESP++R    +VLSI+C+KGSS+++EW+GDMLQTGDIVEE+ IGS   S   ++PFK G++ +Q++LHNSF++K+TSIVVRVRRG D FS+L
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Query:  HACIVPNDSAGRKQYVLRSITDPNYVVGFVDRTESECFDLQASRNDRMVSALERTRLQDGYVSYPWERRMHETLSVPYSSSFLSILLLPKAS--NEVATH
         ACIVPN+SAG++QY+LRSI DPNY VGF DRTES+C  LQ SR  RMV AL + +LQDGYVSYPWERRM E L +  SS+FLSIL LPKAS      + 
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Query:  YNDLEDTLARANAWLNSAQASGVPIVFMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLTNASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYAPLGGELPLEIKLKE
        YNDLEDTLARANAWL+ +QA+GVPIVFMNIQTESLLTKISG+TAS+TV+  SLSDLSNL N SLYGFEDYHGVDIGVVR+VRLW+APLG E PLEIKLK+
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Query:  GDSKLGFAISRTEEGFIYVSSVMD-EDDNAPSTRSGLDHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVSIFLHVFL
         D+KLGF+ISRTEEGFIYVSSV D ED++AP+ RSGL  LY+EA  AS+ L++SRV NQKVLPW+VSSTGAIRC+DTVSLSQKLSLHRHAKV I LHVFL
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        WD    +   + P            ++           EV   R   D Q+ PLP            D    R ER+ AG+ SF+F E   ++
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Sequences

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CDS sequence

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CCTTCAAGGACAAGCAGACGTCCATCGTGGTCCGGGTCCGCCGAGGCCGGGACCAGTTCTCGGAGCTCCACGCCTGTATCGTACCCAACGACTCCGCCGGAAGAAAGCAG
TACGTTCTCCGCTCCATCACTGACCCGAATTACGTCGTCGGGTTCGTGGATCGAACCGAATCCGAATGCTTCGACCTTCAAGCATCGAGGAATGACAGAATGGTAAGTGC
ATTAGAGAGGACAAGGCTTCAAGATGGATATGTATCATATCCATGGGAAAGAAGGATGCACGAAACCTTGTCTGTTCCATATTCCAGCTCTTTTCTCTCCATTCTGCTGC
TTCCAAAAGCTTCAAATGAAGTGGCCACTCACTACAATGACTTGGAAGACACCCTTGCCAGAGCCAATGCCTGGCTCAACTCTGCCCAGGCCAGCGGCGTCCCCATTGTC
TTCATGAACATTCAGACTGAGTCTCTCTTAACCAAGATATCTGGAGATACAGCCTCTTCCACTGTCAGTGCTGGTTCCTTGTCTGATCTGTCCAACCTCACCAATGCCAG
TCTCTACGGTTTCGAGGATTACCATGGGGTCGATATTGGTGTCGTTCGATCTGTTCGTCTATGGTATGCTCCTCTTGGAGGAGAGCTTCCTCTGGAAATCAAGCTAAAAG
AAGGAGATTCCAAGCTGGGGTTTGCCATTAGTCGCACAGAGGAGGGATTTATCTATGTTTCATCTGTGATGGATGAAGATGACAATGCGCCTTCCACAAGGTCAGGGCTG
GACCATCTGTACAAGGAAGCTGAAAATGCATCGAAATTGCTTATAATCTCAAGAGTTTCGAATCAGAAGGTGCTCCCATGGATAGTGTCTTCTACAGGGGCAATTCGATG
CTTCGACACAGTTTCACTCAGCCAGAAGCTGTCGTTGCATAGGCACGCCAAGGTCTCCATTTTCTTGCACGTCTTTTTATGGGACAGAGAATTGGCTTCTTCAATCGGCG
CCGCCCCAAGTAGGCAAAGACCCACGCCGTCGCAGCCGGCGGCTCCAGCGCGGTTGGCCTTGCCTCCAGAAGTCCAATTGGCTCGCCACCCAAACGACAACCAAATACAG
CCACTGCCGGCGGACGCGTTCAGCGAGAGCGGAAGTAATAACACTGATGGGTCGTCGATCAGAATGGAACGAGACACCGCCGGTGACCTCTCCTTTAGATTTCATGAGTT
TTCTCTATCGAGCAACTGGGTATGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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YVLRSITDPNYVVGFVDRTESECFDLQASRNDRMVSALERTRLQDGYVSYPWERRMHETLSVPYSSSFLSILLLPKASNEVATHYNDLEDTLARANAWLNSAQASGVPIV
FMNIQTESLLTKISGDTASSTVSAGSLSDLSNLTNASLYGFEDYHGVDIGVVRSVRLWYAPLGGELPLEIKLKEGDSKLGFAISRTEEGFIYVSSVMDEDDNAPSTRSGL
DHLYKEAENASKLLIISRVSNQKVLPWIVSSTGAIRCFDTVSLSQKLSLHRHAKVSIFLHVFLWDRELASSIGAAPSRQRPTPSQPAAPARLALPPEVQLARHPNDNQIQ
PLPADAFSESGSNNTDGSSIRMERDTAGDLSFRFHEFSLSSNWV

Moc02g01200 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome