; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc02g03330 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc02g03330
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Descriptiontranscription factor TCP15-like
Genome locationchr2:2483230..2483760
RNA-Seq ExpressionMoc02g03330
SyntenyMoc02g03330
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005333 - Transcription factor, TCP
IPR017887 - Transcription factor TCP subgroup


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004145813.1 transcription factor TCP7 [Cucumis sativus]6.9e-6378.14Show/hide
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        L  C+    PSSSN  S TTS F++ET   NNY FPM N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN EQ+   D D
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XP_008465370.1 PREDICTED: transcription factor TCP7 [Cucumis melo]2.0e-6278.69Show/hide
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        MRVKK TS+SPRNAPK   NSP ASESK +PSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA L+
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        L  C+    PSSSN+ S TTS F++ET   NNY FP  N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN EQ  +DG D
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XP_022140679.1 transcription factor TCP15-like [Momordica charantia]1.0e-90100Show/hide
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XP_022996075.1 transcription factor TCP14-like [Cucurbita maxima]8.7e-5873.71Show/hide
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        MRVKKATS+SPR         PNASESKP+PSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA  
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        L  C P+  SS+ + TT+    + NNY FP     +PLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN E++   D
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XP_038900506.1 transcription factor TCP16-like [Benincasa hispida]2.1e-6478.45Show/hide
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        M+VKKATS+SPRNAPK   NSPNASESK +PSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGKDIASA L+
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        L  C P    SSSNLS TT+ F++  + NNY FPM N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI  LQEVAEN E++   D D
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KDC7 TCP domain-containing protein3.3e-6378.14Show/hide
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        MRVK+ TS+SPRNAPK   NSP ASESK +PSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA L+
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        L  C+    PSSSN  S TTS F++ET   NNY FPM N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN EQ+   D D
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A0A1S3CNQ2 transcription factor TCP79.7e-6378.69Show/hide
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        MRVKK TS+SPRNAPK   NSP ASESK +PSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA L+
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        L  C+    PSSSN+ S TTS F++ET   NNY FP  N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN EQ  +DG D
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A0A5A7T0X8 Transcription factor TCP79.7e-6378.69Show/hide
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        MRVKK TS+SPRNAPK   NSP ASESK +PSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIA+TGK+IASA L+
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        L  C+    PSSSN+ S TTS F++ET   NNY FP  N  IPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN EQ  +DG D
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A0A6J1CGC4 transcription factor TCP15-like4.9e-91100Show/hide
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        LAACNPSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPNIPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHITTLQEVAENLEQDDGQDSDC
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A0A6J1K5P6 transcription factor TCP14-like4.2e-5873.71Show/hide
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        MRVKKATS+SPR         PNASESKP+PSKA KDRHAKV GRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAA  
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        L  C P+  SS+ + TT+    + NNY FP     +PLPNYEFDLVSDFDMELFAHHI TLQEVAEN E++   D
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q93Z00 Transcription factor TCP142.2e-1958.24Show/hide
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        A++  PL   + KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEPS+IA TG     A  N  + N S  SS  S
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Q9C518 Transcription factor TCP87.0e-1846.61Show/hide
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        V  + S  PR+ P  +S   + +++ +     ++ KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP+I+A TG     A  +
Subjt:  VKKATSSSPRNAPKSNSN--SPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALN

Query:  LAACNPSPSSSNLSATTS
          + +   S S LSA  S
Subjt:  LAACNPSPSSSNLSATTS

Q9C9L2 Transcription factor TCP152.0e-2047.66Show/hide
Query:  TSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSK-APKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACN
        +SSS   A  S ++ PN+   KP P + + KDRH KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP++IA TG     A  N  + N
Subjt:  TSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSK-APKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACN

Query:  PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPN
         S  SS  S + +  +   ++Y F  P+
Subjt:  PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPN

Q9FTA2 Transcription factor TCP211.1e-1857.14Show/hide
Query:  SNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPS
        SN    NA +  P      KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+ + A+ + S
Subjt:  SNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPS

Q9LSD5 Transcription factor TCP205.4e-1854Show/hide
Query:  NSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDI--ASAALNLAACNPSPSSSNLSA
        N  S N ++  P  S + KDRH KV GR RRIR+P LCAAR+FQLTRELG+K+DG+T++WLL++AEPSIIA TG     ASA  + AA +      +L+A
Subjt:  NSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDI--ASAALNLAACNPSPSSSNLSA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G58100.1 TCP family transcription factor5.0e-1946.61Show/hide
Query:  VKKATSSSPRNAPKSNSN--SPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALN
        V  + S  PR+ P  +S   + +++ +     ++ KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP+I+A TG     A  +
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Query:  LAACNPSPSSSNLSATTS
          + +   S S LSA  S
Subjt:  LAACNPSPSSSNLSATTS

AT1G69690.1 TCP family transcription factor1.4e-2147.66Show/hide
Query:  TSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSK-APKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACN
        +SSS   A  S ++ PN+   KP P + + KDRH KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEP++IA TG     A  N  + N
Subjt:  TSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSK-APKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACN

Query:  PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPN
         S  SS  S + +  +   ++Y F  P+
Subjt:  PSPSSSNLSATTSCFQQETNNYTFPMPN

AT3G27010.1 TEOSINTE BRANCHED 1, cycloidea, PCF (TCP)-domain family protein 203.8e-1954Show/hide
Query:  NSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDI--ASAALNLAACNPSPSSSNLSA
        N  S N ++  P  S + KDRH KV GR RRIR+P LCAAR+FQLTRELG+K+DG+T++WLL++AEPSIIA TG     ASA  + AA +      +L+A
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AT3G47620.1 TEOSINTE BRANCHED, cycloidea and PCF (TCP) 141.5e-2058.24Show/hide
Query:  ASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPSPSSSNLS
        A++  PL   + KDRH KV GR RRIR+P LCAARVFQLTRELG+K+DG+T+EWLL++AEPS+IA TG     A  N  + N S  SS  S
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AT5G08330.1 TCP family transcription factor7.7e-2057.14Show/hide
Query:  SNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPS
        SN    NA +  P      KDRH+KV GR RRIR+P +CAARVFQLTRELG+K+DGQT+EWLL++AEPSIIA TG     A+ + A+ + S
Subjt:  SNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAGTCAAGAAGGCTACATCTAGCTCTCCAAGAAATGCACCAAAATCCAATTCCAATTCACCAAATGCCTCAGAGTCTAAGCCCCTGCCTTCCAAAGCTCCGAAAGA
TCGCCACGCTAAGGTTCACGGGCGTGATCGTCGTATCCGCCTTCCACCGTTGTGTGCAGCTCGAGTGTTTCAGCTCACTCGAGAGCTCGGAAACAAAACGGATGGTCAGA
CTGTGGAGTGGCTGTTGAAGAAGGCTGAGCCATCCATTATTGCTATAACTGGTAAAGATATTGCCTCTGCTGCTCTAAACTTGGCTGCCTGCAACCCCTCTCCATCTTCA
TCAAACCTTTCTGCTACTACAAGTTGTTTTCAACAAGAAACTAACAACTACACGTTCCCAATGCCTAACATACCTTTGCCAAATTATGAATTCGATTTGGTCTCCGATTT
TGATATGGAGCTTTTTGCTCATCATATCACCACGCTGCAAGAAGTGGCAGAAAATTTGGAGCAGGACGACGGCCAAGATTCAGATTGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAGTCAAGAAGGCTACATCTAGCTCTCCAAGAAATGCACCAAAATCCAATTCCAATTCACCAAATGCCTCAGAGTCTAAGCCCCTGCCTTCCAAAGCTCCGAAAGA
TCGCCACGCTAAGGTTCACGGGCGTGATCGTCGTATCCGCCTTCCACCGTTGTGTGCAGCTCGAGTGTTTCAGCTCACTCGAGAGCTCGGAAACAAAACGGATGGTCAGA
CTGTGGAGTGGCTGTTGAAGAAGGCTGAGCCATCCATTATTGCTATAACTGGTAAAGATATTGCCTCTGCTGCTCTAAACTTGGCTGCCTGCAACCCCTCTCCATCTTCA
TCAAACCTTTCTGCTACTACAAGTTGTTTTCAACAAGAAACTAACAACTACACGTTCCCAATGCCTAACATACCTTTGCCAAATTATGAATTCGATTTGGTCTCCGATTT
TGATATGGAGCTTTTTGCTCATCATATCACCACGCTGCAAGAAGTGGCAGAAAATTTGGAGCAGGACGACGGCCAAGATTCAGATTGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRVKKATSSSPRNAPKSNSNSPNASESKPLPSKAPKDRHAKVHGRDRRIRLPPLCAARVFQLTRELGNKTDGQTVEWLLKKAEPSIIAITGKDIASAALNLAACNPSPSS
SNLSATTSCFQQETNNYTFPMPNIPLPNYEFDLVSDFDMELFAHHITTLQEVAENLEQDDGQDSDC