| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0046553.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.8e-67 | 45.48 | Show/hide |
Query: DTNPFSEVESHFTDPKFYSKNDEVEETMPTE---------NMDNSSSRRSTNKIEELTKEVN-TFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSR
D+ PF++ ESHF D KFY+K+++V E + TE N + + TNK + L + N + + K +KEV + +LRYI LSR
Subjt: DTNPFSEVESHFTDPKFYSKNDEVEETMPTE---------NMDNSSSRRSTNKIEELTKEVN-TFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSR
Query: RKKSESPFIEYSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKL
RKK ESPF E SKNL + E+LK+NFT PLTKI K E KK + ++ LPE+ T +G DPKAYKL+AKAGYDFT+ TE S++IFD++ ELS T+KKL
Subjt: RKKSESPFIEYSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKL
Query: LKEGYNIPASKAGL---------------------------------------------------------DDISEEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEV
K+GY+IP S+AG+ DI EED E AP LEDG QST+DELKEV
Subjt: LKEGYNIPASKAGL---------------------------------------------------------DDISEEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEV
Query: NLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
NL+T EEPRPTFIS+ LS + ENEY++LL +Y+D+FAWSYKE+ LDPKV VH LAIK +RPVK
Subjt: NLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
|
|
| KAA0061113.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.6e-57 | 38.75 | Show/hide |
Query: FSEVESHFTDPKFYSKNDEVEET----MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIE
F++ D KFY KND E +P N +++ +S E K TF + +EASTS++K+ E + ILRY+ LSRRKK ESPF+E
Subjt: FSEVESHFTDPKFYSKNDEVEET----MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIE
Query: YSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPAS
+ + LK D+E+LK++FT PLTKI+KQEIK DL ++ +LP++ TKDG DPKAYK +AKAGYDFT+HTEF SL+I + + LS+T+KKLL+EG+ IP S
Subjt: YSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPAS
Query: KAGLD-----------------------------------------------------------------------------------------------
+ GL
Subjt: KAGLD-----------------------------------------------------------------------------------------------
Query: --------------------------------------DISEEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRD
+I EED E+AP SLEDG QS VD+LKEVNL T EEP PTFIS+SLS + E +YMSLLT Y+D
Subjt: --------------------------------------DISEEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRD
Query: IFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
IFAWSYKEM DPKV VHHLAIK GYRP+K
Subjt: IFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
|
|
| TYJ99655.1 uncharacterized protein E5676_scaffold562G00360 [Cucumis melo var. makuwa] | 9.0e-58 | 48.17 | Show/hide |
Query: ESHFTDPKFYSKNDEVEET----MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIEYSKN
ESHF + KFY KND E +P N +++ +S E K TF + E STS++K+ E + IL Y+ +SRRKK ESPF+E K
Subjt: ESHFTDPKFYSKNDEVEET----MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIEYSKN
Query: LKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPASKAGL
LK D+E+LK++FT PLTKI+KQ+IK DL + +LP+ TKDG + KAYKL+AK GYDF +HTEF SL++ ++ ELS+ +KKLL+EG+ IP S+ GL
Subjt: LKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPASKAGL
Query: D-------------------------------DIS----------EEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLT
+ DI+ EED E+ P SLEDG QSTVDELKEVNL T EEPRPTFIS+SL E +YMSLLT
Subjt: D-------------------------------DIS----------EEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLT
Query: SYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIK
YRDIFA SYKEM L PKV VHHL IK
Subjt: SYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIK
|
|
| TYK06279.1 uncharacterized protein E5676_scaffold157G00630 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.9e-63 | 52.26 | Show/hide |
Query: MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIEYSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQ
M T N + ++ + E T E+ + + K +KEV + T+LRYI LSRR+K ESPF E SKNL + E+LK+NFT PLTKI K
Subjt: MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIEYSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQ
Query: EIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPASKAGL----------------DDISEED
E KK + ++ LPE+ T +G DPKAYKL+AKAGYDFT+ TE S++IFD++ ELS T+KKL K+GY+IP S+A + DI EED
Subjt: EIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPASKAGL----------------DDISEED
Query: VEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
+ AP SLEDG QST+DELKEVNL T EEPRPTFIS+ LS + ENEY++LL +Y+D+FAWSYKEM LDPKVVVH LAIK + PVK
Subjt: VEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
|
|
| TYK16284.1 uncharacterized protein E5676_scaffold21G00550 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.6e-57 | 46.85 | Show/hide |
Query: DTNPFSEVESHFTDPKFYSKNDEVEETMPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIE
D+NPFSE ESHF D KFY KND E +P E EASTS++K+ E + ILRYI LS KK ESPF+E
Subjt: DTNPFSEVESHFTDPKFYSKNDEVEETMPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIE
Query: YSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTE-FTSLRIFDDKRELSATRKKLL--------
+ LK D+++LK++FT LTKI+KQEIK DL ++ LP++ TKDG DP AYKL+ KAGYDFT+HTE R+ + R + ++K++
Subjt: YSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTE-FTSLRIFDDKRELSATRKKLL--------
Query: -------KEGYNI------------PASKAGL-DDISEEDVE-----EAP-SSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSY
KEG ++ P S+ + I DVE E P SL+DG QST+DELKE+NL T EEPRPTFIS+SLS + E++YMSLLT Y
Subjt: -------KEGYNI------------PASKAGL-DDISEEDVE-----EAP-SSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSY
Query: RDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
+DIFAWSYKEM LDPKV +HHLAIK GYRP+K
Subjt: RDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TSN4 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 1.3e-67 | 45.48 | Show/hide |
Query: DTNPFSEVESHFTDPKFYSKNDEVEETMPTE---------NMDNSSSRRSTNKIEELTKEVN-TFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSR
D+ PF++ ESHF D KFY+K+++V E + TE N + + TNK + L + N + + K +KEV + +LRYI LSR
Subjt: DTNPFSEVESHFTDPKFYSKNDEVEETMPTE---------NMDNSSSRRSTNKIEELTKEVN-TFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSR
Query: RKKSESPFIEYSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKL
RKK ESPF E SKNL + E+LK+NFT PLTKI K E KK + ++ LPE+ T +G DPKAYKL+AKAGYDFT+ TE S++IFD++ ELS T+KKL
Subjt: RKKSESPFIEYSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKL
Query: LKEGYNIPASKAGL---------------------------------------------------------DDISEEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEV
K+GY+IP S+AG+ DI EED E AP LEDG QST+DELKEV
Subjt: LKEGYNIPASKAGL---------------------------------------------------------DDISEEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEV
Query: NLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
NL+T EEPRPTFIS+ LS + ENEY++LL +Y+D+FAWSYKE+ LDPKV VH LAIK +RPVK
Subjt: NLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
|
|
| A0A5D3BMW4 Uncharacterized protein | 4.3e-58 | 48.17 | Show/hide |
Query: ESHFTDPKFYSKNDEVEET----MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIEYSKN
ESHF + KFY KND E +P N +++ +S E K TF + E STS++K+ E + IL Y+ +SRRKK ESPF+E K
Subjt: ESHFTDPKFYSKNDEVEET----MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIEYSKN
Query: LKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPASKAGL
LK D+E+LK++FT PLTKI+KQ+IK DL + +LP+ TKDG + KAYKL+AK GYDF +HTEF SL++ ++ ELS+ +KKLL+EG+ IP S+ GL
Subjt: LKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPASKAGL
Query: D-------------------------------DIS----------EEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLT
+ DI+ EED E+ P SLEDG QSTVDELKEVNL T EEPRPTFIS+SL E +YMSLLT
Subjt: D-------------------------------DIS----------EEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLT
Query: SYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIK
YRDIFA SYKEM L PKV VHHL IK
Subjt: SYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIK
|
|
| A0A5D3BY54 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 1.3e-57 | 38.75 | Show/hide |
Query: FSEVESHFTDPKFYSKNDEVEET----MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIE
F++ D KFY KND E +P N +++ +S E K TF + +EASTS++K+ E + ILRY+ LSRRKK ESPF+E
Subjt: FSEVESHFTDPKFYSKNDEVEET----MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIE
Query: YSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPAS
+ + LK D+E+LK++FT PLTKI+KQEIK DL ++ +LP++ TKDG DPKAYK +AKAGYDFT+HTEF SL+I + + LS+T+KKLL+EG+ IP S
Subjt: YSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPAS
Query: KAGLD-----------------------------------------------------------------------------------------------
+ GL
Subjt: KAGLD-----------------------------------------------------------------------------------------------
Query: --------------------------------------DISEEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRD
+I EED E+AP SLEDG QS VD+LKEVNL T EEP PTFIS+SLS + E +YMSLLT Y+D
Subjt: --------------------------------------DISEEDVEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRD
Query: IFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
IFAWSYKEM DPKV VHHLAIK GYRP+K
Subjt: IFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
|
|
| A0A5D3C7G5 Uncharacterized protein | 9.0e-64 | 52.26 | Show/hide |
Query: MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIEYSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQ
M T N + ++ + E T E+ + + K +KEV + T+LRYI LSRR+K ESPF E SKNL + E+LK+NFT PLTKI K
Subjt: MPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIEYSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQ
Query: EIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPASKAGL----------------DDISEED
E KK + ++ LPE+ T +G DPKAYKL+AKAGYDFT+ TE S++IFD++ ELS T+KKL K+GY+IP S+A + DI EED
Subjt: EIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTEFTSLRIFDDKRELSATRKKLLKEGYNIPASKAGL----------------DDISEED
Query: VEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
+ AP SLEDG QST+DELKEVNL T EEPRPTFIS+ LS + ENEY++LL +Y+D+FAWSYKEM LDPKVVVH LAIK + PVK
Subjt: VEEAPSSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSYRDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
|
|
| A0A5D3CZ99 Reverse transcriptase domain-containing protein | 1.3e-57 | 46.85 | Show/hide |
Query: DTNPFSEVESHFTDPKFYSKNDEVEETMPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIE
D+NPFSE ESHF D KFY KND E +P E EASTS++K+ E + ILRYI LS KK ESPF+E
Subjt: DTNPFSEVESHFTDPKFYSKNDEVEETMPTENMDNSSSRRSTNKIEELTKEVNTFEALPNEASTSSSKTGAFKKEVPQSSTILRYILLSRRKKSESPFIE
Query: YSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTE-FTSLRIFDDKRELSATRKKLL--------
+ LK D+++LK++FT LTKI+KQEIK DL ++ LP++ TKDG DP AYKL+ KAGYDFT+HTE R+ + R + ++K++
Subjt: YSKNLKSDDVEMLKDNFTLPLTKISKQEIKKSKDLQMKQALPEKCTKDGCDPKAYKLVAKAGYDFTSHTE-FTSLRIFDDKRELSATRKKLL--------
Query: -------KEGYNI------------PASKAGL-DDISEEDVE-----EAP-SSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSY
KEG ++ P S+ + I DVE E P SL+DG QST+DELKE+NL T EEPRPTFIS+SLS + E++YMSLLT Y
Subjt: -------KEGYNI------------PASKAGL-DDISEEDVE-----EAP-SSLEDGSQSTVDELKEVNLNTAEEPRPTFISSSLSRDAENEYMSLLTSY
Query: RDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
+DIFAWSYKEM LDPKV +HHLAIK GYRP+K
Subjt: RDIFAWSYKEMLRLDPKVVVHHLAIKQGYRPVK
|
|
