; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Moc03g22830 (gene) of Bitter gourd (OHB3-1) v2 genome

Gene IDMoc03g22830
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationchr3:16126981..16134054
RNA-Seq ExpressionMoc03g22830
SyntenyMoc03g22830
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022142671.1 homeobox protein vnd-like [Momordica charantia]2.9e-12799.59Show/hide
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XP_022967102.1 uncharacterized protein LOC111466606 [Cucurbita maxima]1.3e-9582.85Show/hide
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XP_023522766.1 uncharacterized protein LOC111786770 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.2e-9783.68Show/hide
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XP_038894579.1 uncharacterized protein LOC120083099 [Benincasa hispida]3.7e-9882.93Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT40 Uncharacterized protein5.4e-9581.3Show/hide
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A0A1S4E4F1 uncharacterized protein LOC1034998847.8e-9480.89Show/hide
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A0A6J1CMW3 homeobox protein vnd-like1.4e-12799.59Show/hide
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A0A6J1G2B0 uncharacterized protein LOC1114500334.0e-9883.68Show/hide
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A0A6J1HPU4 uncharacterized protein LOC1114666066.4e-9682.85Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G27385.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein6.0e-2236.36Show/hide
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        K    K+   +      +C +            + SKTVDLP+P EWGLAP+SYY+P LPIIGIP
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AT2G27385.2 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein6.0e-2236.36Show/hide
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        FL    L++        +  K+SC DC ++YD+SG  + V C          T   G F + LPS         SNC A+L G   QLYAS+ ++ S ++
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        K    K+   +      +C +            + SKTVDLP+P EWGLAP+SYY+P LPIIGIP
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AT2G27385.3 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein6.0e-2236.36Show/hide
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        FL    L++        +  K+SC DC ++YD+SG  + V C          T   G F + LPS         SNC A+L G   QLYAS+ ++ S ++
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        K    K+   +      +C +            + SKTVDLP+P EWGLAP+SYY+P LPIIGIP
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AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5842.8e-3551.49Show/hide
Query:  FSSTAAPVNGADD-ENELNEDDVFWTGDFAAESGHHTHSTPSS-SSSSTPRHHIHHLQHKGFPQPETFGILAALPENEASSSLRSSSYFYHK--------
        FSS ++    +D  + ELNEDD+F   D +       HS  SS +   TP   +      G    E  GILAALPE+  SSS   S  F+HK        
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Query:  -ASISSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPIS--ASLKY-QSAPVNVPIMSKP-VQRHQE----LDV--DDIDEGDGEMLPPHEFVARSL
         +S +SSSSSS       S SS+R IPT PKPP ERLP   S     KY QSAPV VP++S   + RH++     DV  DD +E +GEMLPPHE VARSL
Subjt:  -ASISSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPIS--ASLKY-QSAPVNVPIMSKP-VQRHQE----LDV--DDIDEGDGEMLPPHEFVARSL

Query:  AQSPLLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRTG
        AQS LLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAV+RRTG
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AT5G22430.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.2e-2237.8Show/hide
Query:  LMVLATTQAAQCYTLRAKISCLDCRSNYDFSGNKIVVKCEKVKNLAVAITRTDGSFETTLPSDASNSQSPPSNCIAKLVGGPHQLYASRKDMASIVIKAT
        L V +  + +    +  KISCLDC  ++DFSG K+++KC+  K    A+   DGSF + LP   +  +    NC+AKL+GGP QLYA + ++ S ++K+ 
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Query:  -NSKFFTIATALKFS-TCKQHNKCQAMKDQFIADSKTVDLPLPREWGLAPSSYYLPELPIIGIP
         +SK  T +  L FS +C + ++        I DSKT++ P    +G  P+S++ P LPIIGIP
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGTCAATGTTGGCTCCGCCGCCCGTTTCCGCCACCGCAAATCCTCATCCACCGAACGATTTCTCGGTTCCCTCTCATCTCCGGCCTCCCGCCATGGAAACCCTAG
CTTCAGCTCCACCGCCGCCCCTGTCAACGGAGCCGACGATGAGAACGAGCTCAACGAGGACGACGTCTTCTGGACCGGCGATTTCGCTGCCGAATCCGGCCACCATACCC
ACTCCACTCCCTCCTCCTCTTCCTCTTCCACTCCTCGCCACCACATCCACCACCTTCAGCACAAGGGTTTCCCCCAGCCGGAGACCTTCGGAATCCTCGCCGCTCTCCCC
GAAAACGAGGCCTCGTCCAGTCTCCGCAGCTCTTCCTATTTCTACCACAAGGCGTCCATTTCCTCCTCGTCGTCTTCTTCCTCCCCTTCGTCTTCCCGTATGATTCCCAC
CATTCCGAAACCTCCTCTGGAACGATTGCCCCTTCCGATTTCTGCCTCGTTGAAGTACCAGTCGGCCCCGGTGAATGTGCCGATAATGTCGAAGCCGGTTCAGAGACACC
AGGAGTTGGACGTGGATGACATTGATGAAGGAGATGGTGAGATGTTGCCGCCGCACGAGTTTGTGGCCAGAAGTTTGGCCCAATCGCCATTGTTGTCATGCTCAGTGCTC
GAGGGCGCAGGAAGGACGTTAAAGGGCAGGGATCTCCGCCAGGTTCGCAACGCAGTTTGGAGACGAACAGGGGTGACCTCTCTCCTGTCGGGCATTGGCCGAGTTTCAGC
TACTCCATTTTCGCCATTAATGCCCTCTGCTTCCCAAGTCTCACAGAGAAACAAGCTATGGATTCTGTTTGAGCCACAGCTTCCTTTGATTCTACGGTTACAACTTTTGA
TTCGTGGAAATCCTGTTAACATGCTTCTCCCAATCGAATACGGCAGAAATTTGGCTGCACACCATTGGATTAGACAGGTCCAGAAACTGCTCCTCACTCTTCCTTTTCTC
TTGCTCATGGTTCTTGCAACAACTCAAGCTGCCCAATGCTACACTTTGAGGGCCAAGATCTCCTGCCTCGACTGTCGATCTAACTACGACTTCTCTGGAAACAAGATCGT
GGTGAAGTGCGAGAAAGTGAAAAACCTAGCCGTAGCAATCACCAGAACCGATGGATCATTCGAAACTACGCTTCCTTCGGACGCCTCCAACTCTCAGTCGCCTCCTTCCA
ACTGCATTGCCAAACTTGTTGGGGGACCTCACCAACTGTATGCTTCAAGGAAAGACATGGCTTCCATTGTCATCAAGGCAACCAACTCCAAATTCTTCACCATTGCCACA
GCTCTCAAGTTCTCCACTTGCAAACAACACAACAAATGCCAAGCCATGAAAGATCAGTTTATTGCAGATTCAAAGACCGTTGATTTGCCTCTGCCACGTGAGTGGGGGCT
GGCACCTTCCAGCTACTATCTTCCTGAGCTCCCGATCATAGGCATTCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CTTCAGCTCCACCGCCGCCCCTGTCAACGGAGCCGACGATGAGAACGAGCTCAACGAGGACGACGTCTTCTGGACCGGCGATTTCGCTGCCGAATCCGGCCACCATACCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ENEASSSLRSSSYFYHKASISSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLERLPLPISASLKYQSAPVNVPIMSKPVQRHQELDVDDIDEGDGEMLPPHEFVARSLAQSPLLSCSVL
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